Predicted mutation | ||||||
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MC JC | NC_000913 | 257,908 | Δ776 bp | insB9–[crl] | insB9, insA9, [crl] |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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* | * | ÷ | NC_000913 | 257908–258674 | 258683 | 10–776 | 79 [0] | [0] 78 | insB9–[crl] | insB9,insA9,[crl] |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | = 257907 | 0 (0.000) | 76 (0.860) | 53/490 | 0.5 | 100% | intergenic (+8/+16) | crl/insB9 | RNA polymerase holoenzyme assembly factor Crl/IS1 transposase B |
? | NC_000913 | 258684 = | 0 (0.000) | pseudogene (9/331 nt) | crl | RNA polymerase holoenzyme assembly factor Crl |
CATCCAACGCCATTCATGGCCATATCAATGATTTTCTGGTGCGTACCGGGTTGAGAAGCGGTGTAAGTGAACTGCAGTTGCCATGTTTTACGGCAGTGAGAGCAGAGATAGCGCTGATGTCCGGCGGTGCTTTTGCCGTTACGCACCACCCCGTCAGTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTGAAGGTAAGTGCAAAGATAATCGATTCTTTTTCGATTGTCTGGCTGTATGCGTCAACGTGAAACCGGCACCGGAAGTGCGTGAATTCTGGGGCTGGTGGATGGAGCTGGAAGCGCAGGAATCCCGTTTTACCTACAGTTACCAGTTTGGTCTGTTCGATAAAGCAGGCGACTGGAAGAGTGTTCCGGTAAAAGACACTGAAGTGGTTGAACGACTGGAGCACACCCTGCGTGAGTTTCACGAGAAGCTGCGTGAACTGCTGACGACGCTGAATCTG > NC_000913/258424‑258952 | acgcttaatcacctcatcatctgctgacggtaaattattagagatcccatttaacccggtgtatcggaattttgacaacggtcttcaggaaatcaccgactggatcgaaaaacgcttgtgttaaaaatttgctaaattttgccaattgggtaaaacagttgcatcacaacatgagatagcaatgacgttaccgagtggacacccgaagagcagattgatcaaaaaatgtaccgcgctagtcccgtatattcgtgaaggtaAGTGCAAGGATAata > 2:143789‑M2/261‑274 (MQ=255) ctcatcatctgctgacggtaaattattagaaatcccatttaacccggtgtatcggaattttgacaaagttcttcaggaaatcaccgactggatcgaaaacggcttgtgttaaacatttgctaaattttgccaatttggtaaaacagttgcataacaacaggagatagcaatgacgttaccgagtggacacccgaagagcagattgaccaaaaaatttaccgcactaggcccgtatattcgtgaaggtaGGTGCAAAGATAATCGATTCTTTTtca > 1:190276‑M2/249‑274 (MQ=255) gctgacggtaaattattagagatcccatttaacccggtgtatcggaattttgacaaaggtcttcaggaaatcaccgactggatcgaaaaacgcttgtgttaaaaatttgctaaattttgccaatttggtaaaacagttgcatcacaacaggagatagcaatgacgttaccgagtggacacccgaagagcagattgatcaaaaaatttaccgcactaggcccgtatattcgtgaaggtaAGTGCAAAGATAATCGATTCTTTTTCGATTGTCTGGc > 1:514676‑M2/239‑275 (MQ=255) attagagatctcatttaacccggtgtatcggaattttgacaaaggtcttcaggaaatcaccgactggatcgaaaaacgcttgtgttaaaaatttgctaaattttgccaatttggtaaaacagttgtatcacaacaggagatagcaatgacgttaacgagtggaaccccgaagagcagattgactaaaaaaactacggcaataggcccccacattcgtgaaggtaAGTGGAAAGATCATCGATTATTATTCGTTGGTCTGGCTGTAGGCGGCAACg > 2:641855‑M2/225‑275 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |