| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,296,381 | +GC | intergenic (+587/+55) | gltP → / ← yjcO | glutamate/aspartate:proton symporter/Sel1 family TPR‑like repeat protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,296,380 | 1 | . | C | 98.8% | 272.2 / ‑5.1 | 84 | intergenic (+586/+56) | gltP/yjcO | glutamate/aspartate:proton symporter/Sel1 family TPR‑like repeat protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/0); major base C (39/43); minor base T (1/0); total (41/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.82e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.65e-01 | |||||||||||
| * | NC_000913 | 4,296,380 | 2 | . | G | 98.8% | 279.1 / NA | 84 | intergenic (+586/+56) | gltP/yjcO | glutamate/aspartate:proton symporter/Sel1 family TPR‑like repeat protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/0); major base G (40/42); minor base C (0/1); total (41/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑A‑‑CCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGCAGCGCCTT > NC_000913/4296294‑4296519 || gCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAAcc < 1:40688/150‑1 (MQ=9) cGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCg < 1:267242/150‑1 (MQ=255) aCGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTCTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCTCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGtt < 1:1021761/150‑1 (MQ=11) cGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCTCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTg < 3:36411/150‑1 (MQ=11) cGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTg < 3:3210/150‑1 (MQ=255) cGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTg < 3:3264/150‑1 (MQ=255) gCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAAAGGGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTgg > 1:25179/1‑150 (MQ=11) ttAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGtt > 4:4250/1‑150 (MQ=255) aaCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTaa > 3:183409/1‑150 (MQ=255) aCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTCAt > 2:1058871/1‑150 (MQ=255) cgcgTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAAtt < 1:1335443/150‑1 (MQ=255) cgcgTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAAtt < 1:136276/150‑1 (MQ=255) gcgTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGCTTTAGCGTGATTTTGTAGGACGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGACGCTA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGTGTCTTATCAGGCCTATATTAACCGTTGGTTAAttt > 4:319130/1‑150 (MQ=11) gcgTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAAttt > 4:398856/1‑150 (MQ=255) gcgTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAAttt > 2:789672/1‑150 (MQ=255) gTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAAttttt > 3:325861/1‑150 (MQ=255) gTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAAttttt > 2:40429/1‑150 (MQ=255) tCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTc > 1:1114997/1‑150 (MQ=255) cTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCa > 4:558052/1‑150 (MQ=255) ttATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCaa > 1:45213/1‑150 (MQ=255) tATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCaaa < 3:476841/150‑1 (MQ=255) tATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCaaa < 1:579490/150‑1 (MQ=255) tATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCaaa < 4:514636/150‑1 (MQ=255) aTCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAAc > 2:365130/1‑150 (MQ=255) aTCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGCGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAAc > 2:1288705/1‑150 (MQ=255) tCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAAct < 3:14311/150‑1 (MQ=255) tCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAAct > 2:1314976/1‑150 (MQ=255) cAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAActc < 1:1314976/150‑1 (MQ=255) aGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTCGGTTAATTCTTCAATctct > 2:161630/1‑150 (MQ=11) ggCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCtt < 2:712123/150‑1 (MQ=255) ggCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGACTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCtt < 3:319130/150‑1 (MQ=255) ggCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGACGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCtt < 1:367538/150‑1 (MQ=255) gCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTc > 3:21709/1‑150 (MQ=255) gCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTc < 4:69760/150‑1 (MQ=255) cTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTcac > 1:1112858/1‑150 (MQ=255) tACTCCAGACAGCGCAACGGCCTCATCTAGCGTGATCTTGTAGGTCGGCTCACTCTCTC‑‑ACCCCGCCTCCCACACCAACGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTcaca < 2:980752/150‑1 (MQ=12) gCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATTCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACAccc > 2:978381/1‑150 (MQ=255) ccAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACAccag < 1:736712/150‑3 (MQ=255) ccAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCg < 1:955356/150‑1 (MQ=255) cAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCgg > 2:1012899/1‑150 (MQ=255) cAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCgg > 3:106677/1‑150 (MQ=255) gACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTa < 1:1049274/150‑1 (MQ=255) gACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCCTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTa > 2:616936/1‑150 (MQ=255) cgcAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCaaa < 4:136862/150‑1 (MQ=255) cgcAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCaaa < 2:1338731/150‑1 (MQ=255) cgcAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCaaa > 2:972877/1‑150 (MQ=255) cgcAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCaaa < 2:184448/150‑1 (MQ=255) gcAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAAc < 1:334374/150‑1 (MQ=255) aaTAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTAt > 4:109488/1‑150 (MQ=17) aaTAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAAGCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAAccc > 4:548121/1‑150 (MQ=255) aaTAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAAccc > 1:33827/1‑150 (MQ=255) tGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATa < 1:338599/150‑1 (MQ=255) tGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATa < 4:21709/150‑1 (MQ=255) gATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATAc < 2:47568/150‑1 (MQ=255) gATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATAc > 2:1362811/1‑150 (MQ=255) ttAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATATTAAACGTTGGCTCATTTATCATATTATTCTCAACCGGAATCTAACCCTTCCATACAGc > 3:562102/1‑150 (MQ=14) gCGTGACTTTGTAGGTCGCATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGACTATCTGTACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACCGCTCa < 4:199819/150‑1 (MQ=21) cGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAg > 1:781128/1‑150 (MQ=255) cGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAg < 4:439964/150‑1 (MQ=255) tGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTc > 2:1021140/1‑136 (MQ=255) tGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTc < 1:1021140/136‑1 (MQ=255) tGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGt > 1:1091186/1‑150 (MQ=255) tGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGt > 3:141153/1‑150 (MQ=255) tGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGt < 1:161630/150‑1 (MQ=255) aTTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTc > 2:144703/1‑150 (MQ=255) ttttGTAGGTCGGATAAGGCGTTTCCG‑‑CCGCATCCGACATCGATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACTCACGGTGCCAGACCCTTCCATACAGCTCAGGTCCa > 2:616055/1‑150 (MQ=18) ttGTAGGTCGGATAAGGCGTCT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGC‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCCCGTCCTATCAGGCACATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAACCTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAAc < 1:816114/150‑1 (MQ=255) tAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAg < 3:504438/150‑1 (MQ=255) tAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAg < 1:932059/150‑1 (MQ=255) aGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACCCCCCGTATCCAACCGTTCCATACCGCACAGGTTCAACCaat > 1:736739/1‑148 (MQ=21) aGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGt < 1:307294/150‑1 (MQ=255) aGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGt < 1:40429/150‑1 (MQ=255) gTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATNCGACATCAATGCNTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCATAGCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGc > 3:499639/1‑150 (MQ=37) gTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGc > 1:988454/1‑150 (MQ=255) gTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGc > 3:432716/1‑150 (MQ=255) gTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGc > 1:168748/1‑150 (MQ=255) gTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGc > 1:568438/1‑150 (MQ=255) tCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACTCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGCa > 2:576316/1‑150 (MQ=255) tCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGCa < 1:789672/150‑1 (MQ=255) ggATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGCAgc < 3:185340/150‑1 (MQ=255) ggATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGCAgc < 2:984232/150‑1 (MQ=255) aTAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCCTCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGCAgcgc < 2:916081/150‑1 (MQ=255) aTAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGCAgcgc < 1:1310539/150‑1 (MQ=255) aGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGCAGCGCCtt < 1:1061993/150‑1 (MQ=255) || GCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑A‑‑CCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGA‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGCAGCGCCTT > NC_000913/4296294‑4296519 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |