New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 2250162 = | 50 (1.350) | 4 (0.110) | 3/250 | 3.4 | 7.3% | coding (446/1050 nt) | yeiH | UPF0324 family inner membrane protein |
? | NC_000913 | 2250201 = | 54 (1.540) | coding (485/1050 nt) | yeiH | UPF0324 family inner membrane protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
GGTATCAGTGGGATCATCATTGACGTGTTGACGCTGTCCAGTACCTTCCTGCTGGCTTGCTTCCTGGGGCAGAAAGTGTTTGGTCTGGATAAGCACACCAGCTGGTTGATCGGTGCCGGTAGCAGTATCTGTGGTGCTGCCGCGGTACTGGCGACTGAGCCGGTAGTGAAAGCGGAAGCCAGTAAAGTAACCGTGGCTGTTGCAACCGTTGTTATCTTCGGGACCGTCGCGATTTTCCTCTACCCGGCGATATATCCGCTGATGTCTCAATGGTTTAGTCCGGAAACTTTCGG > NC_000913/2250017‑2250309 | ggTATCAGTGGGATCATCATTGACGTGTTGACGCTGTCCAGTACCTTCCTGCTGGCTTGCTTCCTGGGGCAGAAAGTGTTTGGTCTGGATAAGCACACCAGCTGGTTGATCGGTGCCGGTAGCAGTATCTGTGGTGCTGCCGCGGTACt < 6:163961/149‑1 (MQ=255) ggTATCAGTGGGATCATCATTGACGTGTTGACGCTGTCCAGTACCTTCCTGCTGGCTTGCTTCCTGGGGCAGAAAGTGTTTGGTCTGGATAAGCACACCAGCTGGTTGATCGGTGCCGGTAGCAGTATCTGTGGTGCTGCCGCGGTACt < 6:161620/149‑1 (MQ=255) ggTATCAGTGGGATCATCATTGACGTGTTGACGCTGTCCAGTACCTTCCTGCTGGCTTGCTTCCTGGGGCAGAAAGTGTTTGGTCTGGATAAGCACACCAGCTGGTTGATCGGTGCCGGTAGCAGTATCTGTGGTGCTGCCGCGGTACt > 5:163961/1‑149 (MQ=255) ggTATCAGTGGGATCATCATTGACGTGTTGACGCTGTCCAGTACCTTCCTGCTGGCTTGCTTCCTGGGGCAGAAAGTGTTTGGTCTGGATAAGCACACCAGCTGGTTGATCGGTGCCGGTAGCAGTATCTGTGGTGCTGCCGCGGTACt > 5:161620/1‑149 (MQ=255) gTATCAGTGGGATCATCATTGACGTGTTGACGCTGTCCAGTACCTTCCTGCTGGCTTGCTTCCTGGGGCAGAAAGTGTTTGGTCTGGATAAGCACACCAGCTGGTTGATCGGTGCCGGTAGCAGTATCTGTGGTGCTGCCGCGGTACTg > 8:73614/1‑149 (MQ=255) tCAGTGGGATCATCATTGACGTGTTGACGCTGTCCAGTACCTTCCTGCTGGCTTGCTTCCTGGGGCAGAAAGTGTTTGGTCTGGATAAGCACACCAGCTGGTTGATCGGTGCCGGTAGCAGTATCTGTGGTGCTGCCGCGGTACTGGCg > 5:128113/1‑149 (MQ=255) ggATCATCATTGACGTGTTGACGCTGTCCAGTACCTTCCTGCTGGCTTGCTTCCTGGGGCAGAAAGTGTTTGGTCTGGATAAGCACACCAGCTGGTTGATCGGTGCCGGTAGCAGTATCTGTGGTGCTGCCGCGGTACTGGCGACTGAg > 8:2936/1‑149 (MQ=255) gACGTGTTGACGCTGTCCAGTACCTTCCTGCTGGCTTGCTTCCTGGGGCAGAAAGTGTTTGGTCTGGATAAGCACACCAGCTGGTTGATCGGTGCCGGTAGCAGTATCTGTGGTGCTGCCGCGGTACTGGCGACTGAGCCGGTAGTGa < 6:128113/148‑1 (MQ=255) gtgtTGACGCTGTCCAGTACCTTCCTGCTGGCTTGCTTCCTGGGGCAGAAAGTGTTTGGTCTGGATAAGCACACCAGCTGGTTGATCGGTGCCGGTAGCAGTATCTGTGGTGCTGCCGCGGTACTGGCGACTGAGCCGGTAGTGAAAGc < 7:30369/149‑1 (MQ=255) gACGCTGTCCAGTACCTTCCTGCTGGCTTGCTTCCTGGGGCAGAAAGTGTTTGGTCTGGATAAGCACACCAGCTGGTTGATCGGTGCCGGTAGCAGTATCTGTGGTGCTGCCGCGGTACTGGCGACTGAGCCGGTAGTGAAAGCgg > 1:169998/1‑146 (MQ=255) gACGCTGTCCAGTACCTTCCTGCTGGCTTGCTTCCTGGGGCAGAAAGTGTTTGGTCTGGATAAGCACACCAGCTGGTTGATCGGTGCCGGTAGCAGTATCTGTGGTGCTGCCGCGGTACTGGCGACTGAGCCGGTAGTGAAAGCgg < 2:169998/146‑1 (MQ=255) tCCAGTACCTTCCTGCTGGCTTGCTTCCTGGGGCAGAAAGTGTTTGGTCTGGATAAGCACACCAGCTGGTTGATCGGTGCCGGTAGCAGTATCTGTGGTGCTGCCGCGGTACTGGCGACTGAGCCGGTAGTGAAAGCGGAAGCCagta < 8:63033/148‑1 (MQ=255) tCCAGTACCTTCCTGCTGGCTTGCTTCCTGGGGCAGAAAGTGTTTGGTCTGGATAAGCACACCAGCTGGTTGATCGGTGCCGGTAGCAGTATCTGTGGTGCTGCCGCGGTACTGGCGACTGAGCCGGTAGTGAAAGCGGAAGCCagta > 1:19263/1‑148 (MQ=255) cTTCCTGCTGGCTTGCTTCCTGGGGCAGAAAGTGTTTGGTCTGGATAAGCACACCAGCTGGTTGATCGGTGCCGGTAGCAGTATCTGTGGTGCTGCCGCGGTACTGGCGACTGAGCCGGTAGTGAAAGCTGAAGCCAGTAAAGTAACCg > 3:2380/1‑149 (MQ=255) aGAAAGTGTTTGGTCTGGATAAGCACACCAGCTGGTTGATCGGTGCCGGTAGCAGTATCTGTGGTGCTGCCGCGGTACTGGCGACTGAGCCGGTAGTGAAAGCGGAAGCCAGTAAAGTAACCGTGGCTGTTGCAACCgttgtt < 3:53325/143‑1 (MQ=255) aGAAAGTGTTTGGTCTGGATAAGCACACCAGCTGGTTGATCGGTGCCGGTAGCAGTATCTGTGGTGCTGCCGCGGTACTGGCGACTGAGCCGGTAGTGAAAGCGGAAGCCAGTAAAGTAACCGTGGCTGTTGCAACCgttgtt > 4:53325/1‑143 (MQ=255) aGAAAGTGTTTGGTCTGGATAAGCACACCAGCTGGTTGATCGGTGCCGGTAGCAGTATCTGTGGTGCTGCCGCGGTACTGGCGACTGAGCCGGTAGTGAAAGCGGAAGCCAGTAAAGTAACCGTGGCTGTTGCAACCGTTGTTATCTTc < 3:140297/149‑1 (MQ=255) aaaGTGTTTGGTCTGGATAAGCACACCAGCTGGTTGATCGGTGCCGGTAGCAGTATCTGTGGTGCTGCCGCGGTACTGGCGACTGAGCCGGTAGTGAAAGCGGAAGCCAGTAAAGTAACCGTGGCTGTTGCAACCGTTGTTATCTTCgg < 7:73614/149‑1 (MQ=255) tGGTCTGGATAAGCACACCAGCTGGTTGATCGGTGCCGGTAGCAGTATCTGTGGTGCTGCCGCGGTACTGGCGACTGAGCCGGTAGTGAAAGCGGAAGCCAGTAAAGTAACCGTGGCTGTTGCAACCGTTGTTATCTTCGGGACCGTcg > 1:68488/1‑149 (MQ=255) gTCTGGATAAGCACACCAGCTGGTTGATCGGTGCCGGTAGCAGTATCTGTGGTGCTGCCGCGGTACTGGCGACTGAGCCGGTAGTGAAAGCGGAAGCCAGTAAAGTAACCGTGGCTGTTGCAACCGTTGTTATCTTCGGGACCGTcgc > 3:94896/1‑148 (MQ=255) tGGATAAGCACACCAGCTGGTTGATCGGTGCCGGTAGCAGTATCTGTGGTGCTGCCGCGGTACTGGCGACTGAGCCGGTAGTGAAAGCGGAAGCCAGTAAAGTAACCGTGGCTGTTGCAACCGTTGTTATCTTCGGGACCGTCGCGAtt > 2:95107/1‑149 (MQ=255) gATAAGCACACCAGCTGGTTGATCGGTGCCGGTAGCAGTATCTGTGGTGCTGCCGCGGTACTGGCGACTGAGCCGGTa < 6:1311/78‑1 (MQ=255) gATAAGCACACCAGCTGGTTGATCGGTGCCGGTAGCAGTATCTGTGGTGCTGCCGCGGTACTGGCGACTGAGCCGGTa > 5:1311/1‑78 (MQ=255) gATAAGCACACCAGCTGGTTGATCGGTGCCGGTAGCAGTATCTGTGGTGCTGCCGCGGTACTGGCGACTGAGCCGGTAGTGAAAGCGGAAGCCAGTAAAGTAACCGTGGCTGTTGCAACCgtt > 8:39296/1‑123 (MQ=255) gATAAGCACACCAGCTGGTTGATCGGTGCCGGTAGCAGTATCTGTGGTGCTGCCGCGGTACTGGCGACTGAGCCGGTAGTGAAAGCGGAAGCCAGTAAAGTAACCGTGGCTGTTGCAACCgtt < 7:39296/123‑1 (MQ=255) atatGCACACCAGCTGGTTGATCGGTGCCGGTAGCAGTATCTGTGGTGCTGCCGCGGTACTGGCGACTGAGCCGGTAGTGAAAGCGGAAGCCAGTAAAGTAACCGTGGCTGTTGCAACCGTTGTTATCTTCGGGACCGTCGCGATTTTc < 8:11314/149‑1 (MQ=255) gCACACCAGCTGGTTGATCGGTGCCGGTAGCAGTATCTGTGGTGCTGCCGCGGTACTGGCGACTGAGCCGGTAGTGAAAGCGGAAGCCAGTAAAGTAACCGTGGCTGTTGCAACCGTTGTTATCTTCGGGACCGTCGCGATTTTCctc > 4:134403/1‑148 (MQ=255) acacCAGCTGGTTGATCGGTGCCGGTAGCAGTATCTGTGGTGCTGCCGCGGTACTGGCGACTGAGCCGGTAGTGAAAGCGGAAGCCAGTAAAGTAACCGTGGCTGTTGCAACCGTTGTTATCTTCGGGACCGTCGCGATTTTCCTCTAc > 6:48998/1‑149 (MQ=255) aTCGGTGCCGGTAGCAGTATCTGTGGTGCTGCCGCGGTACTGGCGACTGAGCCGGTAGTGAAAGCGGAAGCCAGTAAAGTAACCGTGGCTGTTGCAACCGTTGTTATCTTCgg > 5:85157/1‑113 (MQ=255) aTCGGTGCCGGTAGCAGTATCTGTGGTGCTGCCGCGGTACTGGCGACTGAGCCGGTAGTGAAAGCGGAAGCCAGTAAAGTAACCGTGGCTGTTGCAACCGTTGTTATCTTCgg < 6:85157/113‑1 (MQ=255) gTGCCGGTAGCAGTATCTGTGGTGCTGCCGCGGTACTGGCGACTGAGCCGGTAGTGAAAGCGGAAGCCAGTAAAGTAACCGTGGCTGTTGCAACCGTTGTTATCTTCGGGACCGTCGCGATTTTCCTCTACCCGGCGATATATCCGCTg < 7:2936/149‑1 (MQ=255) gCCGGTAGCAGTATCTGTGGTGCTGCCGCGGTACTGGCGACTGAGCCGGTAGTGAAAGCGGAAGCCAGTAAAGTAACCGTGGCTGTTGCAACCGTTGTTATCTTCGGGACCGTCGCGATTTTCCTCTACCCGGCGATATATCCGCTGAt < 3:134403/149‑1 (MQ=255) ccGGTAGCAGTATCTGTGGTGCTGCCGCGGTACTGGCGACTGAGCCGGTAGTGAAAGCGGAAGCCAGTAAAGTAACCGTGGCTGTTGCAACCGTTGTTATCTTCGGGACCGTCGCGATTTTCCTCTACCCGGCGATATATCCGCTGAt < 4:2380/148‑1 (MQ=255) gTAGCAGTATCTGTGGTGCTGCCGCGGTACTGGCGACTGAGCCGGTAGTGAAAGCGGAAGCCAGTAAAGTAACCGTGGCTGTTGCAACCgttgtt > 4:63070/1‑95 (MQ=255) gTAGCAGTATCTGTGGTGCTGCCGCGGTACTGGCGACTGAGCCGGTAGTGAAAGCGGAAGCCAGTAAAGTAACCGTGGCTGTTGCAACCgttgtt < 3:63070/95‑1 (MQ=255) aGTATCTGTGGTGCTGCCGCGGTACTGGCGACTGAGCCGGTAGTGAAAGCGGAAGCCAGTAAAGTAACCGTGGCTGTTGCAACCGTTGTTATCTTCGGGACCGTCGCGATTTTCATCTACCCGGCGATATATCCGCTGATGTCTCAATg > 8:145137/1‑149 (MQ=255) tgtgGTGCTGCCGCGGTACTGGCGACTGAGCCGGTAGTGAAAGCGGAAGCCAGTAAAGTAACCGTGGCTGTTGCAACCGTTGTTATCTTCGGGACCGTCGCGATTTTCCTCTACCCGGCGATATATCCGCTGATGTCTCAATGGTTTAg > 1:106941/1‑149 (MQ=255) tgtgGTGCTGCCGCGGTACTGGCGACTGAGCCGGTAGTGAAAGCGGAAGCCAGTAAAGTAACCGTGGCTGTTGCAACCGTTGTTATCTTCGGGACCGTCGCGATTTTCCTCTACCCGGCGATATATCCGCTGATGTCTCAATGGTTTAg > 5:158890/1‑149 (MQ=255) tggtgCTGCCGCGGTACTGGCGACTGAGCCGGTAGTGAAAGCGGAAGCCAGTAAAGTAACCGTGGCTGTTGCAACCGTTGTTATCTTCGGGACCGTCGCGATTTTCCTCTACCCGGCGATATATCCGCTGATGTCTCAATGGTTTa < 2:68488/146‑1 (MQ=255) gtgCTGCCGCGGTACTGGCGACTGAGCCGGTAGTGAAAGCGGAAGCCAGTAAAGTAACCGTGGCTGTTGCAACCGTTGTTATCTTCGGGACCGTCGCGATTTTCCTCTACCCGGCGATATATCCGCTGATGTCTCAATGGTTTAGTCCg < 2:19263/149‑1 (MQ=255) tgcCGCGGTACTGGCGACTGAGCCGGTAGTGAAAGCGGAAGCCAGTAAAGTAACCGTGGCTGTTGCAACCGTTGTTATCTTCGGGACCGTCGCGATTTTCCTCTACCCGGCGa > 1:72841/1‑113 (MQ=255) tgcCGCGGTACTGGCGACTGAGCCGGTAGTGAAAGCGGAAGCCAGTAAAGTAACCGTGGCTGTTGCAACCGTTGTTATCTTCGGGACCGTCGCGATTTTCCTCTACCCGGCGa < 2:72841/113‑1 (MQ=255) tgcCGCGGTACTGGCGACTGAGCCGGTAGTGAAAGCGGAAGCCAGTAAAGTAACCGTGGCTGATGCAACCGGTGTTATCTTCGGGACCGTCGCGATTTTCCTCTACCCGGCGATATATCCGCTGTTGTCTCTATGGTTTAGTCCGGaag > 7:116174/1‑148 (MQ=255) gcCGCGGTACTGGCGACTGAGCCGGTAGTGAAAGCGGAAGCCAGTAAAGTAACCGTGGCTGTTGCAACCGTTGTTATCTTCGGGACCGTCGCGATTTTCCTCTACCCGGCGATATATCCGCTGATGtctc < 4:3570/130‑1 (MQ=255) gcCGCGGTACTGGCGACTGAGCCGGTAGTGAAAGCGGAAGCCAGTAAAGTAACCGTGGCTGTTGCAACCGTTGTTATCTTCGGGACCGTCGCGATTTTCCTCTACCCGGCGATATATCCGCTGATGtctc > 3:3570/1‑130 (MQ=255) gcCGCGGTACTGGCGACTGAGCCGGTAGTGAAAGCGGAAGCCAGTAAAGTAACCGTGGCTGTTGCAACCGTTGTTATCTTCGGGACCGTCGCGATTTTCCTCTACCCGGCGATATATCCGCTGATGTCTCAATGGTTTAGTCCGGAAAc > 5:55099/1‑149 (MQ=255) gcCGCGGTACTGGCGACTGAGCCGGTAGTGAAAGCGGAAGCCAGTAAAGTAACCGTGGCTGTTGCAACCGTTGTTATCTTCGGGACCGTCGCGATTTTCCTCTACCCGGCGATATATCCGCTGATGTCTCAATGGTTTAGTCCGGAAAc > 5:21232/1‑149 (MQ=255) ggTACTGGCGACTGAGCCGGTAGTGAAAGCGGAAGCCAGTAAAGTAACCGTGGCTGTTGCAACCGTTGTTATCTTCGGGACCGTCGCGATTTTCCTCTACCCGGCGATATATCCGCTGATGTCTCAATGGTTTAGTCCGGAAACTTTCg > 2:1038/1‑149 (MQ=255) gTACTGGCGACTGAGCCGGTAGTGAAAGCGGAAGCCAGTAAAGTAACCGTGGCTGTTGCAACCGTTGTTATCTTCGGGACCGTCGCGATTTTCCTCTACCCGGCGATATATCCGCTGATGTCTCAATGGTTTAGTCCGGAAACTTTCgg < 6:55099/149‑1 (MQ=255) gTACTGGCGACTGAGCCGGTAGTGAAAGCGGAAGCCAGTAAAGTAACCGTGGCTGTTGCAACCGTTGTTATCTTCGGGACCGTCGCGATTTTCCTCTACCCGGCGATATATCCGCTGATGTCTCAATGGTTTAGTCCGGAAACTTTCgg < 4:94896/149‑1 (MQ=255) | GGTATCAGTGGGATCATCATTGACGTGTTGACGCTGTCCAGTACCTTCCTGCTGGCTTGCTTCCTGGGGCAGAAAGTGTTTGGTCTGGATAAGCACACCAGCTGGTTGATCGGTGCCGGTAGCAGTATCTGTGGTGCTGCCGCGGTACTGGCGACTGAGCCGGTAGTGAAAGCGGAAGCCAGTAAAGTAACCGTGGCTGTTGCAACCGTTGTTATCTTCGGGACCGTCGCGATTTTCCTCTACCCGGCGATATATCCGCTGATGTCTCAATGGTTTAGTCCGGAAACTTTCGG > NC_000913/2250017‑2250309 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |