| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3114381 = | NA (NA) | 3 (0.100) +GTCCTACGGTTCTGTGCTCGGGACC |
3/214 | 3.1 | NA | noncoding (4/168 nt) | REP219 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 3 REP sequences | REP219 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 3 REP sequences |
| ? | NC_000913 | = 4285379 | NA (NA) | intergenic (‑166/+34) | yjcH/acs | DUF485 family inner membrane protein/acetyl‑CoA synthetase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
CAGCATGATTGGGTAACGCCAAATCACCACATTCAAAAAACTGCCGATGATCAATCCTCCGACGGTTGCCAGGACGGGCAT‑CGCCGTGGGGTATTGCTGAAAAACATCAAAAAGCATGGTTAAAGGTTGTTTGTTGTAACTTGCTGGATGCGGCGTAAAACGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATGCGGC > NC_000913/3114236‑3114523 | cagcaTGATTGGGTAACGCCAAATCACCACATTCAAAAAACTGCCGATGATCAATCCTCCGACGGTTGCCAGGACGGGCAT‑CGCCGTGGGGTATTGCTGAAAAACATCAAAAAGCATGGTTAAAGGTTGTTTGTTGTAACTTGCTGGAt < 3:136883/149‑1 (MQ=255) aTGATTGGGTAACGCCAAATCACCACATTCAAAAAACTGCCGATGATCAATCCTCCGACGGTTGCCAGGACGGGCAT‑CGCCGTGGGGTATTGCTGAAAAACATCAAAAAGCATGGTTAAAGGTTGTTTGTTGTAACTTGCTGGATgcgg < 4:34463/149‑1 (MQ=255) gggTAACGCCAAATCACCACATTCAAAAAACTGCCGATGATCAATCCTCCGACGGTTGCCAGGACGGGCAT‑CGCCGTGGGGTATTGCTGAAAAACATCAAAAAGCATGGTTAAAGGTTGTTTGTTGTAACTTGCTGGATGCGGCGTaa > 5:140976/1‑148 (MQ=255) tAACGCCAAATCACCACATTCAAAAAACTGCCGATGATCAATCCTCCGACGGTTGCCAGGACGGGCAT‑CGCCGTGGGGTATTGCTGAAAAACATCAAAAAGCATGGTTAAAGGTTGTTTGTTGTAGCTTGCTGGATGCGGCGTAAAACg > 5:78171/1‑149 (MQ=255) caccacATTCAAAAAACTGCCGATGATCAATCCTCCGACGGTTGCCAGGACGGGCAT‑CGCCGTGGGGTATTGCTGAAAAACATCAAAAAGCATGGTTAAAGGTTGTTTGTTGTAACTTGCTGGATGCGGCGTAAAACGCCTTATCCGTc > 4:137273/1‑149 (MQ=255) accacATTCAAAAAACTGCCGATGATCAATCCTCCGACGGTTGCCAGGACGGGCAT‑CGCCGTGGGGTATTGCTGAAAAACATCAAAAAGCATGGTTAAAGGTTGTTTGTTGTAACTTGCTGGATGCGGCGTAAAACGCCTTATCCGTcc < 3:137273/149‑1 (MQ=255) cacaTTCAAAAAACTGCCGATGATCAATCCTCCGACGGTTGCCAGGACGGGCAT‑CGCCGTGGGGTATTGCTGAAAAACATCAAAAAGCATGGTTAAAGGTTGTTTGTTGTAACTTGCTGGATGCGGCGTAAAACGCCTTATCCGTCCTa > 2:12533/1‑149 (MQ=255) aTTCAAAAAACTGCCGATGATCAATCCTCCGACGGTTGCCAGGACGGGCAT‑CGCCGTGGGGTATTGCTGAAAAACATCAAAAAGCATGGTTAAAGGTTGTTTGTTGTAACTTGCTGGATGCGGCGTAAAACGCCTTATCCGTCCTACgg < 6:22369/149‑1 (MQ=255) aTTCAAAAAACTGCCGATGATCAATCCTCCGACGGTTGCCAGGACGGGCAT‑CGCCGTGGGGTATTGCTGAAAAACATCAAAAAGCATGGTTAAAGGTTGTTTGTTGTAACTTGCTGGATGCGGCGTAAAACGCCTTATCCGTCCTACga < 6:107546/149‑2 (MQ=255) cAAAAAACTGCCGATGATCAATCCTCCGACGGTTGCCAGGACGGGCAT‑CGCCGTGGGGTATTGCTGAAAAACATCAAAAAGCATGGTTAAAGGTTGTTTGTTGTAGCTTGCTGGATGCGGCGTAAAACGCCTTATCCGTCCTACGGgt < 6:78171/148‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCCGATGATCAATCCTCCGACGGTTGCCAGGACGGGCAT‑CGCCGTGGGGTATTGCTGAAAAACATCAAAAAGCATGGTTAAAGGTTGTTTGTTGTACATTGCTGGATGCGGCGTAAAACGCCTTAGCCGTCATACGGGTGTc > 3:24823/1‑149 (MQ=255) aaaaaCTGCCGATGATCAATCCTCCGACGGTTGCCAGGACGGGCAT‑CGCCGTGGGGTATTGCTGAAAAACATCAAAAAGCATGGTTAAAGGTTGTTTGTTGTAACTTGCTGGATGCGGCGTAAAACGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTc < 4:8361/149‑1 (MQ=255) aaaaCTGCCGATGATCAATCCTCCGACGGTTGCCAGGACGGGCAT‑CGCCGTGGGGTATTGCTGAAAAACATCAAAAAGCATGGTTAAAGGTTGTTTGTTGTAACTTGCTGGATGCGGCGTAAAACGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCt < 6:83606/149‑1 (MQ=255) ccGATGATCAATCCTCCGACGGTTGCCAGGACGGGCAT‑CGCCGTGGGGTATTGCTGAAAAACATCAAAAAGCATGGTTAAAGGTTGTTTGTTGTAACTTGCTGGATGCGGCGTAAAACGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAgcg > 3:94569/1‑149 (MQ=255) gatgatCAATCCTCCGACGGTTGCCAGGACGGGCAT‑CGCCGTGGGGTATTGCTGAAAAACATCAAAAAGCATGGTTAAAGGTTGTTTGTTGTAACTTGCTGGATGCGGCGTAAAACGc < 1:164015/118‑1 (MQ=255) gatgatCAATCCTCCGACGGTTGCCAGGACGGGCAT‑CGCCGTGGGGTATTGCTGAAAAACATCAAAAAGCATGGTTAAAGGTTGTTTGTTGTAACTTGCTGGATGCGGCGTAAAACGc > 2:164015/1‑118 (MQ=255) gatCAATCCTCCGACGGTTGCCAGGAC‑GGCATACCCCGT‑GGGTATTTCAGCAAAAAAAGAAAAAGGAAGGTTAAAGGTTGGTTTTTGTTACATTCATGAATCCGCCTTAAACCCCGTAAACGGCCTACGGGTGTAATCCAGCGCAaat > 4:131671/1‑148 (MQ=255) aTCCTCCGACGGTTGCCAGGACGGGCAT‑CGCCGTGGGGTATTGCTGAAAAACATCAAAAAGCATGGTTAAAGGTTGTTTGTTGTAACTTGCTGGATGCGGCGTAAAACGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATcg > 4:102767/1‑149 (MQ=255) tcctccGACGGTTGCCAGGACGGGCAT‑CGCCGTGGGGTATTGCTGAAAAACATCAAAAAGCATGGTTAAAGGTTGTTTGTTGTAACTTGCTGGATGCGGCGTAACACGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATcgc > 3:84362/1‑149 (MQ=255) gACGGTTGCCAGGACGGGCAT‑CGCCGTGGGGTATTGCTGAAAAACATCAAAAAGCATGGTTAAAGGTTGTTTGTTGTAACTTGCTGGATGCGGCGTAAAACGCCTTATCCGt > 3:24079/1‑112 (MQ=255) gACGGTTGCCAGGACGGGCAT‑CGCCGTGGGGTATTGCTGAAAAACATCAAAAAGCATGGTTAAAGGTTGTTTGTTGTAACTTGCTGGATGCGGCGTAAAACGCCTTATCCGt < 4:24079/112‑1 (MQ=255) aGGACGGGCAT‑CGCCGTGGGGTATTGCCGAAAAACATCAAAAAGCATGGTTAAAGGTTGTTTGTTGTAACTTGCTGGATgcg < 3:53483/82‑1 (MQ=255) aGGACGGGCAT‑CGCCGTGGGGTATTGCCGAAAAACATCAAAAAGCATGGTTAAAGGTTGTTTGTTGTAACTTGCTGGATgcg > 4:53483/1‑82 (MQ=255) gCAT‑CGCCGTGGGGTATTGCTGAAAAACATCAAAAAGCATGGTTAAAGGTTGTTTGTTGTAACTTGCTGGATGCGGCGTAAAACGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGcc > 6:42176/1‑147 (MQ=255) gCAT‑CGCCGTGGGGTATTGCTGAAAAACATCAAAAAGCATGGTTAAAGGTTGTTTGTTGTAACTTGCTGGATGCGGCGTAAAACGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGcc < 5:42176/147‑1 (MQ=255) gggTATTGCTGAAAAACATCAAAAAGCATGGTTAAAGGTTGTTTGTTGTAACTTGCTGGATGCGGCGTAAAACGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCaa < 6:4324/107‑1 (MQ=255) gggTATTGCTGAAAAACATCAAAAAGCATGGTTAAAGGTTGTTTGTTGTAACTTGCTGGATGCGGCGTAAAACGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCaa > 5:4324/1‑107 (MQ=255) ggTATTGCTGAAAAACATCAAAAAGCATGGTTAAAGGTTGTTTGTTGTAACTTGCTGGATGCGGCGTAAAACGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGgcg > 2:15907/1‑148 (MQ=255) gTATTGCTGAAAAACATCAAAAAGCATGGTTAAAGGTTGTTTGTTGTAACTTGCTGGATGCGGCGTAAAACGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCa > 6:65949/1‑149 (MQ=255) ttGCTGAAAAACATCAAAAAGCATGGTTAAAGGTTGTTTGTTGTAACTTGCTGGATGCGGCGTAAAACGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCATCg < 3:102767/149‑1 (MQ=255) cTGAAAAACATCAAAAAGCATGGTTAAAGGTTGTTTGTTGTAACTTGCTGGATGCGGCGTAAAACGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTcccc > 8:97609/1‑117 (MQ=255) cTGAAAAACATCAAAAAGCATGGTTAAAGGTTGTTTGTTGTAACTTGCTGGATGCGGCGTAAAACGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTcccc < 7:97609/117‑1 (MQ=255) cTGAAAAACATCAAAAAGCATGGTTAAAGGTTGTTTGTTGTAACTTGCTGGATGCGGCGTAAAACGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCATCggg > 6:9964/1‑148 (MQ=255) cTGAAAAACATCAAAAAGCATGGTTAAAGGTTGTTTGTTGTAACTTGCTGGATGCGGCGTAAAACGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCATCGGGc < 5:65949/149‑1 (MQ=255) aaaaaCATCAAAAAGCATGGTTAAAGGTTGTTTGTTGTAACTTGCTGGATGCGGCGTAAAACGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGgc < 8:129884/137‑1 (MQ=255) aaaaaCATCAAAAAGCATGGTTAAAGGTTGTTTGTTGTAACTTGCTGGATGCGGCGTAAAACGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGgc > 7:129884/1‑137 (MQ=255) aaaaCATCAAAAAGCATGGTTAAAGGTTGTTTGTTGTAACTTGCTGGATGCGGCGTAAAACGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCATCGGGCAAAt < 6:140976/149‑1 (MQ=255) aCATCAAAAAGCATGGTTAAAGGTTGTTTGTTGTAACTTGCTGGATGCGGCGTAAAACGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCATCGGGCAAAtgtg > 6:51086/1‑149 (MQ=255) gTTAAAGGTTGTTTGTTGTAACTTGCTGGATGCGGCGTAAAACGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGcc < 5:9964/149‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) ggTTGTTTGTTGTAACTTGCTGGATGCGGCGTAAAACGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTAttt > 3:10449/1‑149 (MQ=255) gctgtatgttGGAACTTGCTGGATGCGGCGTAAAACGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCATCGGGCAAATGTGATAACCCGGTGCGCCTTATTTc < 4:84362/147‑1 (MQ=255) ttgtttgtTGTAACTTGCTGGATGCGGCGTAAAACGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCATCGGGCAAAt > 5:154502/1‑123 (MQ=255) ttgtttgtTGTAACTTGCTGGATGCGGCGTAAAACGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCATCGGGCAAAt < 6:154502/123‑1 (MQ=255) ttgtAACTTGCTGGATGCGGCGTAAAACGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCgg < 5:51086/148‑1 (MQ=255) ttgtAACTTGCTGGATGCGGCGTAAAACGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGa > 8:136726/1‑149 (MQ=255) aaCTTGCTGGATGCGGCGTAAAACGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTAt < 3:132396/134‑1 (MQ=255) aaCTTGCTGGATGCGGCGTAAAACGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTAt > 4:132396/1‑134 (MQ=255) aaCTTGCTGGATGCGGCGTAAAACGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATgcg > 8:103916/1‑149 (MQ=255) cTTGCTGGATGCGGCGTAAAACGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATgcggc < 1:15907/149‑1 (MQ=255) | CAGCATGATTGGGTAACGCCAAATCACCACATTCAAAAAACTGCCGATGATCAATCCTCCGACGGTTGCCAGGACGGGCAT‑CGCCGTGGGGTATTGCTGAAAAACATCAAAAAGCATGGTTAAAGGTTGTTTGTTGTAACTTGCTGGATGCGGCGTAAAACGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATGCGGC > NC_000913/3114236‑3114523 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |