| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2319747 = | 92 (1.000) | 4 (0.040) | 4/258 | NT | 4.2% | coding (130/2850 nt) | rcsC | hybrid sensory kinase in two‑component regulatory system with RcsB and YojN |
| ? | NC_000913 | = 2997691 | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
CGTCCACGCGGGGAAAGCACACCGTTTTCTGCCGATAAGCGATTTTCGGCGATGTACTTCAGCTCTTTCATCACATCAGAGGTGCGTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACTAA‑CGCCAATGCTCTGAACATGTAGCGCGAGGCTTTCAGGGTTGTACGAAAAGAAGCAAGGTATTTCAAAGGGGCGA > NC_000913/2319599‑2319884 | gatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctag < 1:170579‑M1/1‑1 (MQ=255)gatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctag < 1:368061‑M1/1‑1 (MQ=255) gTCCACGCGGGGAAAGCACACCGTTTTCTGCCGATAAGCGATTTTCGGCGATGTACTTCAGCTCTTTCATCACATCAGAGGTGCGTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGc < 6:194239/149‑1 (MQ=255) aCGCGGGGAAAGCACACCGTTTTCTGCCGATAAGCGATTTTCGGCGATGTACTTCAGCTCTTTCATCACATCAGAGGTGCGTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCTGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGAt < 2:114944/149‑1 (MQ=255) cgcgGGGAAAGCACACCGTTTTCTGCCGATAAGCGATTTTCGGCGATGTACTTCAGCTCTTTCATCACATCAGAGGTGCGTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATg < 7:231774/149‑1 (MQ=255) gcgGGGAAAGCACACCGTTTTCTGCCGATAAGCGATTTTCGGCGATGTACTTCAGCTCTTTCATCACATCAGAGGTGCGTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGa < 1:259899/146‑1 (MQ=255) gcgGGGAAAGCACACCGTTTTCTGCCGATAAGCGATTTTCGGCGATGTACTTCAGCTCTTTCATCACATCAGAGGTGCGTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATg > 8:397824/1‑148 (MQ=255) aGCACACCGTTTTCTGCCGATAAGCGATTTTCGGCGATGTACTTCAGCTCTTTCATCACATCAGAGGTGCGTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCAtt < 4:112324/149‑1 (MQ=255) acgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctag > 1:159075‑M1/131‑131 (MQ=255) acgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctag < 2:159075‑M1/1‑1 (MQ=255) acCGTTTTCTGCCGATAAGCGATTTTCGGCGATGTACTTCAGCTCTTTCATCACATCAGAGGTGCGTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGa > 3:268562/1‑149 (MQ=255) acCGTTTTCTGCCGATAAGCGATTTTCGGCGATGTACTTCAGCTCTTTCATCACATCAGAGGTGCGTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGa > 2:132438/1‑149 (MQ=255) ccGTTTTCTGCCGATAAGCGATTTTCGGCGATGTACTTCAGCTCTTTCATCACATCAGAGGTGCGTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGAt < 4:268562/149‑1 (MQ=255) ccGTTTTCTGCCGATAAGCGATTTTCGGCGATGTACTTCAGCTCTTTCATCACATCAGAGGTGAGTTGAATAATGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGAt < 7:90756/149‑1 (MQ=255) cGTTTTCTGCCGATAAGCGATTTTCGGCGATGTACTTCAGCTCTTTCATCACATCAGAGGTGCGTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATg > 2:107610/1‑149 (MQ=255) ctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaga > 4:307682‑M1/124‑124 (MQ=255) ctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaga < 3:307682‑M1/2‑2 (MQ=255) tGCCGATAAGCGATTTTCGGCGATGTACTTCAGCTCTTTCATCACATCAGAGGTGCGTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTaaaaaa > 4:389327/1‑149 (MQ=255) tGCCGATAAGCGATTTTCGGCGATGTACTTCAGCTCTTTCATCACATCAGAGGTGCGTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTaaaaaa > 1:406211/1‑149 (MQ=255) ccGATAAGCGATTTTCGGCGATGTACTTCAGCTCTTTCATCACATCAGAGGTGCGTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTTAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACg > 6:95992/1‑149 (MQ=255) ccGATAAGCGATTTTCGGCGATGTACTTCAGCTCTTTCATCACATCAGAGGTGCGTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACg > 1:21132/1‑149 (MQ=255) ccGATAAGCGATTTTCGGCGATGTACTTCAGCTCTTTCATCACATCAGAGGTGCGTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACg < 6:394264/149‑1 (MQ=255) ccGATAAGCGATTTTCGGCGATGTACTTCAGCTCTTTCATCACATCAGAGGTGCGTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACg > 2:284514/1‑149 (MQ=255) cGATAAGCGAATTTCGGCGATGTACTTCAGCTCTTTCATCACATCAGAGGTGCGTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACgg < 5:410682/149‑1 (MQ=255) aTAAGCGATTTTCGGCGATGTACTTCAGCTCTTTCATCACATCAGAGGTGCGTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGAt < 3:141432/149‑1 (MQ=255) aTAAGCGATTTTCGGCGATGTACTTCAGCTCTTTCATCACATCAGAGGTGCGTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGAt < 8:27518/149‑1 (MQ=255) tAAGCGATTTTCGGCGATGTACTTCAGCTCTTTCATCACATCAGAGGTGCGTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGAt < 2:431169/148‑1 (MQ=255) gCGATTTTCGGCGATGTACTTCAGCTCTTTCATCACATCAGAGGTGCGTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGaa > 5:382894/1‑148 (MQ=255) gCGATTTTCGGCGATGTACTTCAGCTCTTTCATCACATCAGAGGTGCGTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGaa > 1:138309/1‑148 (MQ=255) gCGATTTTCGGCGATCTACTTCAGCTCATTCATCACATCAGAGGTTCGTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGAAAGGAACTCATATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCACATCTAAAGCATTAACGAAGTAAAAAACCGATGaa > 3:333375/1‑148 (MQ=255) gATTTTCGGCGATGTACTTCAGCTCTTTCATCACATCAGAGGTGCGTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGaaaaa < 3:389327/149‑1 (MQ=255) gATTTTCGGCGATGTACTTCAGCTCTTTCATCACATCAGAGGTGCGTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGaaaaa < 8:335543/149‑1 (MQ=255) aTTTTCGGCGATGTACTTCAGCTCTTTCATCACATCAGAGGTGCGTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAg < 2:21132/149‑1 (MQ=255) ttttCGGCGATGTACTTCAGCTCTTTCATCACATCAGAGGTGCGTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGc < 2:138309/149‑1 (MQ=255) ttttCGGCGATGTACTTCAGCTCTTTCATCACATCAGAGGTGCGTTGAATAAAGCGCTGAGACTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAg > 6:294204/1‑148 (MQ=255) ggCGATGTACTTCAGCTCTTTCATCACATCAGAGGTGCGTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATc < 2:91292/148‑1 (MQ=255) gCGATGTACTTCAGCTCTTTCATCACATCAGAGGTGCGTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCaa < 1:284514/149‑1 (MQ=255) cTTCAGCTCTTTCATCACATCAGAGGTGCGTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGa > 3:357963/1‑97 (MQ=255) cTTCAGCTCTTTCATCACATCAGAGGTGCGTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGa < 4:357963/97‑1 (MQ=255) cTTCAGCTCTTTCATCACATCAGAGGTGCGTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCaga < 2:406211/149‑1 (MQ=255) cTTCAGCTCTTTCATCACATCAGAGGTGCGTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCa > 5:185004/1‑147 (MQ=255) cTTCAGCTCTTTCATCACATCAGAGGTGCGTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAAATCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCag < 2:200125/148‑1 (MQ=255) ttCAGCTGTTTCATCACATCAGAGGTGCGTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGaaa < 5:246399/130‑1 (MQ=255) ttCAGCTCTTTCATCACATCAGAGGTGCGTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGaaa > 6:246399/1‑130 (MQ=255) aGCTCTTTCATCACATCAGAGGTGCGTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCAc > 3:127565/1‑149 (MQ=255) aGCTCTTTCATCACATCAGAGGTGCGTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCAc < 1:132438/149‑1 (MQ=255) tttCATCACATCAGAGGTGCGTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGaaaaa < 8:188879/124‑1 (MQ=255) tttCATCACATCAGAGGTGCGTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGaaaaa > 7:188879/1‑124 (MQ=255) tttCATCACATCAGAGGTGCGTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAAt > 2:432693/1‑129 (MQ=255) atcacatcaGAGGTGCGTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACTAA‑CGCCaa > 2:122405/1‑149 (MQ=255) cacatcaGAGGTGCGTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACTAA‑CGCCAATg > 1:198416/1‑149 (MQ=255) atcaGAGGTGCGTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACTaa > 6:13079/1‑138 (MQ=255) atcaGAGGTGCGTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACTaa < 5:13079/138‑1 (MQ=255) taaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGAt > 7:319647‑M1/72‑106 (MQ=255) taaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGAt < 8:319647‑M1/35‑1 (MQ=255) gTGCGTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGaaaaa > 8:282034/1‑108 (MQ=255) gTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACTAA‑CGCCAATGCTCTGAACATGTAg > 2:150865/1‑149 (MQ=255) gTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACTAA‑CGCCAATGCTCTGAACATGTAg > 7:351400/1‑149 (MQ=255) ttGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACTAA‑CGCCAATGCTCTGAACATGTAgc > 2:78030/1‑149 (MQ=255) gAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACTAA‑CGCCAATGCTCTGAACATGTAgcgc > 4:69681/1‑149 (MQ=255) aTAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACTAA‑CGCCAATGCTCTGAACATGTAGCGCGa < 1:78030/149‑1 (MQ=255) aagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACTAA‑CGCCAATGCTCTGAACATGTAGCGCGAg < 4:59458‑M1/92‑1 (MQ=255) cTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGGAATCAACAGCCAGAGCACTAA‑CGACAATGCTCTGAACTTGTAGAGCGAGGGttt > 5:189227/1‑147 (MQ=255) cTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACTAA‑CGCCAATGCTCTGAACATGTAGCGCGAGGCttt > 1:315228/1‑147 (MQ=255) tGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCaa < 4:121248/98‑1 (MQ=255) tGAGCATGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCaa > 3:121248/1‑98 (MQ=255) aGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTGCGAATCTCGCTGATGTAACGCATTGACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACTAA‑CGCCAATGCTCTGAACATGTAGCGCGAGGCTTTCAggg > 3:179922/1‑149 (MQ=255) aGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACTAA‑CGCCAATGCTCTGAACATGTAGCGCGAGGCTTTCAggg < 5:294204/149‑1 (MQ=255) aGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACTAA‑CGCCAATGCTCTGAACATGTAGCGCGAGGCTTTCAgg < 2:198416/148‑1 (MQ=255) cTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAACCGGATGAAAAACCAAGAAACA‑CCAAAACAAGAACCCCCAATCAGCTGAACATTAACCGCGAGCCTTGCAGGGtgg > 2:198861/1‑147 (MQ=255) cTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACTAA‑CGCCAATGCTCTGAACATGTAGCGCGAGGCTTTCAGGGTTg > 4:19986/1‑149 (MQ=255) tGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACTAA‑CGCCAATGCTCTGaa > 4:16708/1‑122 (MQ=255) tGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACTAA‑CGCCAATGCTCTGaa < 3:16708/122‑1 (MQ=255) aTCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACTAA‑CGCCAATGCTCTGAACATGTAGCGCGAGGCTTTCAGGGTTGt < 7:397824/147‑1 (MQ=255) tCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACTAA‑CGCCAATGCTCTGAACATGTAGCGCGAGGCTTTCAGGGTTGTAc > 7:110411/1‑148 (MQ=255) ggAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACTAA‑CGCCAATGCTCTGAACATGTAGCGCGAGGCTTTCAgg > 5:222303/1‑139 (MQ=255) ggAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACTAA‑CGCCAATGCTCTGAACATGTAGCGCGAGGCTTTCAgg < 6:222303/139‑1 (MQ=255) aCTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACTAA‑CGCCAATGCTCTGAAc > 1:427398/1‑115 (MQ=255) aCTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACTAA‑CGCCAATGCTCTGAAc < 2:427398/115‑1 (MQ=255) ttggttgtctggagattcagggggccagtctaGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACTAA‑CGCCAATGCTCTGAACATGTAGCGCGAGGCTTTCAGGGTTGTACGAAaagaa > 3:59458‑M1/33‑148 (MQ=255) aGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAAGCCACGGCCAGAGCACTAA‑CGCCAATGCTCTGAACATGTAGCGCGAGGCTTTCAGGGTTGTACGAAaagaag < 4:341979/148‑1 (MQ=255) aTTAAATTCCTGAGGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACTAA‑CGCCAATGCTCTGAACATGTAGCGCGAGGCTTTCAGGGTTGTACGAAAAGAAGc > 5:244047/1‑147 (MQ=255) aTTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACTAA‑CGCCAATGCTCTGAACATGTAgc < 3:282167/116‑1 (MQ=255) aTTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACTAA‑CGCCAATGCTCTGAACATGTAgc > 4:282167/1‑116 (MQ=255) ttAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACTAA‑CGCCAATGCTCTGAACATGTAGCGCGAGGCTTTCAGGGTTGTACGAAAAGAAGCAAg < 6:185004/149‑1 (MQ=255) aaaTTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACTAA‑CGCCAATGCTCTGAACATGTAGCGCGAGGCTTTCAGGGTTGTACGAAAAGAAGCAAgg > 8:358456/1‑148 (MQ=255) ccTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACTAA‑CGCCAATGCTCTGAACATGTAGCGCGAGGCTTTCAGGGTTGTACGAAAAGAAGCAAGGTAttt < 3:337562/148‑1 (MQ=255) gACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGGATTAACGATGTAAAAACCGGATCAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGAACGAA‑CGCCAATCCTCTGAACATGTAGCGCCAGGCTTTCAGGGAAGTACGAAAAGAAGCAAGGTATTTaaac > 2:144931/1‑148 (MQ=255) gACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGACAGAGCACTAA‑CGCCaa > 3:176980/1‑88 (MQ=255) aCGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACTAA‑CGCCAATGCTCTGAACATGTAGCGCGAGGCTTTCAGGGTTGTACGAAAAGAAGCAAGGTATTTCaaa < 1:107610/148‑1 (MQ=255) aCGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACTAA‑CGCCAATGCTCTGAACATGTAGCGCGAGGCTTTCAGGGTTGTACGAAAAGAAGCAAGGTATTTCaaa < 1:57561/148‑1 (MQ=255) cGAATTTCCGCTTCTCCCTGATGTAACCCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCTCTCAACAGCCAGAGCACTAA‑CGCCAATGCTCTGAACATGTAGCGCGAGGCTTTCAGGGTTGTACGAAAAGAAGCAAGGTATTTCAAAg < 6:189227/148‑1 (MQ=255) gAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACTAA‑CGCCAATGCTCTGAACATGTAGCGCGAGGCTTTCAGGGTTGTACGAAAAGAAGCAAGGTATTTCAAAggg > 5:254972/1‑149 (MQ=255) gAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACTAA‑CGCCAATGCTCTGAACATGTAGCGCGAGGCTTTCAGGGTTGTACGAAAAGAAGCAAGGTATTTCAAAggg < 1:122405/149‑1 (MQ=255) tttCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACTAA‑CGCCAATGCTCTGAACATGTAGCGCGAGGCTTTCAGGGTTGTACGAAAAGAAGCa > 7:215716/1‑131 (MQ=255) tttCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACTAA‑CGCCAATGCTCTGAACATGTAGCGCGAGGCTTTCAGGGTTGTACGAAAAGAAGCa < 8:215716/131‑1 (MQ=255) tttCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCAAGAGCACTAA‑CGCCAATGCTCTGAACATGTAGCGCGAGGCTTTCAGGGTTGTACGAAAAGAAGCAAGGGATTTCAAAGGGGc > 1:278833/1‑148 (MQ=255) tCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACTAA‑CGCCAATGCTCTGAACATGTAGCGCGAGGCTTTCAGGGGTGTACGAAAAGAAGCAAGGTATTTCAAAGGGGCGa < 2:315228/148‑1 (MQ=255) ccGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACTAA‑CGCCAATGCTCTGAACATGTAGCGCGAGGCTTTCAGGGTTGTACGaaaa > 7:303016/1‑122 (MQ=255) ccGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACTAA‑CGCCAATGCTCTGAACATGTAGCGCGAGGCTTTCAGGGTTGTACGaaaa < 8:303016/122‑1 (MQ=255) | CGTCCACGCGGGGAAAGCACACCGTTTTCTGCCGATAAGCGATTTTCGGCGATGTACTTCAGCTCTTTCATCACATCAGAGGTGCGTTGAATAAAGCGCTGAGCCTGATCGGAACTCAGATTAAATTCCTGACGAATTTCCGATTCTCGCTGATGTAACGCATTAACGATGTAAAAAACGGATGAAAAAGCAATCAACAGCCAGAGCACTAA‑CGCCAATGCTCTGAACATGTAGCGCGAGGCTTTCAGGGTTGTACGAAAAGAAGCAAGGTATTTCAAAGGGGCGA > NC_000913/2319599‑2319884 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |