| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 910,542 | C→T | 64.8% | E170K (GAA→AAA) | poxB ← | pyruvate dehydrogenase, thiamine triphosphate‑binding, FAD‑binding |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 910,542 | 0 | C | T | 64.8% | 106.4 / 104.2 | 108 | E170K (GAA→AAA) | poxB | pyruvate dehydrogenase, thiamine triphosphate‑binding, FAD‑binding |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (19/19); new base T (34/36); total (53/55) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
CTCTTTATGCGCCCCCGCGCAGCCGCTGCCACACATCAGGGCGATATTGCTGGAATAACGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTCTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCATGGCAATCGCCAGTACTTGTGGGATCTGCTCCGGGCTGGAAACCAGCTCGCAATAGTGACTACATTCGCG > NC_000913/910396‑910686 | ctctTTATGCGCCCCCGCGCAGCCGCTGCCACACATCAGGGCGATATTGCTGGAATAACGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTCTg < 1:247405/149‑1 (MQ=255) tctTTATGCGCCCCCGCGCAGCCGCTGCCACACATCAGGGCGATATTGCTGGAATAACGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTgg > 5:331251/1‑149 (MQ=255) tttATGCGCCCCCGCGCAGCCGCTGCCACACATCAGGGCGATATTGCTGGAATAACGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGgcg > 5:365085/1‑149 (MQ=255) ttATGCGCCCCCGCGCAGCCGCTGCCACACATCAGGGCGATATTGCTGGAATAACGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGgcgc < 6:103466/149‑1 (MQ=255) tGCGCCCCCGCGCAGCCGCTGCCACACATCAGGGCGATATTGCTGGAATAACGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAgg > 2:328853/1‑149 (MQ=255) tGCGCCCCCGCGCAGCCGCTGCCACACATCAGGGCGATATTGCTGGAATAACGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAgg < 7:96845/149‑1 (MQ=255) tGCGCCCCCGCGCAGCCGCTGCCACACATCAGGGCGATATTGCTGGAATAACGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAg < 6:365085/148‑1 (MQ=255) gcCCCCGCGCAGCCGCTGCCACACATCAGGGCGATATTGCTGGAATAACGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGttt > 8:371757/1‑149 (MQ=255) gcCCCCGCGCAGCCGCTGCCACACATCAGGGCGATATTGCTGGAATAACGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGttt > 4:145778/1‑149 (MQ=255) cccccTCGCAGCAGCTGCCACACATCAGGGCGATCTTGCTGGAATAACGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGGGGAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGGGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGtttt < 2:65695/149‑1 (MQ=255) cccccGCGCAGCCGCTGCCACACATCAGGGCGATATTGCTGGAATAACGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGtttt < 7:221758/149‑1 (MQ=255) ccacctcgcAGCAGCTGCCACCAATCAGGGCGATATTGCTGTAATAACGCAGAAGTTGCGACAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATCCCCGTGCATGTGTGCCCCTTTTGGCGCAGTtttt < 2:59496/143‑1 (MQ=255) ccccGCGCAGCCGCTGCCACACATCAGGGCGATATTGCTGGAATACCGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTCTGGCGCAGGtttt > 3:272483/1‑148 (MQ=255) ccGCGCAGCCGCTGCCACACATCAGGGCGATATTGCTGGAATAACGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAAc < 5:67929/149‑1 (MQ=255) ccGCGCAGCCGCTGCCACACATCAGGGCGATATTGCTGGAATAACGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAAc < 8:282588/149‑1 (MQ=255) cgcAGCCGCTGCCACACATCAGGGCGATATTGCTGGAATAACGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAACGcc < 6:93308/149‑1 (MQ=255) aGCCGCTGCCACACATCAGGGCGATATTGCTGGAATAACGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTCTGGCGCAGGTTTTAAc < 6:310162/143‑1 (MQ=255) aGCCGCTGCCACACATCAGGGCGATATTGCTGGAATAACGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTCTGGCGCAGGTTTTAAc > 5:310162/1‑143 (MQ=255) gCCACACATCAGGGCGATATTGCTGGAATAACGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTg > 6:130522/1‑149 (MQ=255) ccAGACATCAGGGCGATATTGCTGGATAAACGCTGCAGGTGCGCGAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCTGCGGCACGACTTGTTGTGGCGCTTGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAACGCCACTTCGCCt < 2:87368/147‑1 (MQ=255) ccACACATCAGGGCGATATTGCTGGAATAACGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCt < 6:331251/147‑1 (MQ=255) ccACACATCAGGGCGATATTGCTGGAATAACGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTgg > 1:115422/1‑149 (MQ=255) acacaTCAGGGCGATATTGCTGGAATAACGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGt > 3:345853/1‑148 (MQ=255) acacaTCAGGGCGATATTGCTGGAATAACGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTCTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGt > 5:71808/1‑148 (MQ=255) aTCAGGCCGATATTGATGGAATAACGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGCGTAACTATTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTTGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTCTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAacac > 1:412982/1‑149 (MQ=255) aGGGCGATATTGCTGGAATAACGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTCTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGAc < 6:71808/149‑1 (MQ=255) gggCGATATTGCTGGAATAACGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTCTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGAc > 7:398787/1‑148 (MQ=255) ggCGATATTGCTGGAATAACGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACaa > 3:258826/1‑149 (MQ=255) cGATATTGCTGGAATAACGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAAcc > 6:179175/1‑149 (MQ=255) tatTGCTGGAATAACGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGa > 7:292270/1‑148 (MQ=255) atTGCTGGAATAACGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTgg > 6:339368/1‑105 (MQ=255) atTGCTGGAATAACGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTgg < 5:339368/105‑1 (MQ=255) ttGCTGGAATAACGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGaaa < 6:366595/148‑1 (MQ=255) ttGCTGGAATAACGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGaaa > 5:366595/1‑148 (MQ=255) ttGCTGGAATAACGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAAc < 1:328853/149‑1 (MQ=255) cTGGAATAAAGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTTGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCCTGTTTTACCGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGc > 6:243874/1‑148 (MQ=255) gAATAACGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCa < 7:395148/147‑1 (MQ=255) gAATAACGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTCTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACg < 5:161205/149‑1 (MQ=255) aaTAACGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGG‑TTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGt > 4:82835/1‑149 (MQ=255) aaTAACGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTCTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACgg < 1:375766/149‑1 (MQ=255) aCGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTCTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTaa < 7:91344/149‑1 (MQ=255) cGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTCTGGCGCAGGTTTTAAc < 5:367157/105‑1 (MQ=255) cGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTCTGGCGCAGGTTTTAAc > 6:367157/1‑105 (MQ=255) cagcagTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGTTACCAGTGCATGGTTGCCCCTTCTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCAc > 8:150334/1‑140 (MQ=255) cagcagTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGTTACCAGTGCATGGTTGCCCCTTCTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCAc < 7:150334/140‑1 (MQ=255) cagcagTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCa < 5:179175/149‑1 (MQ=255) gcagTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCCTCAAGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCATGtt > 1:301481/1‑96 (MQ=255) ttGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTCTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCtt < 5:74444/149‑1 (MQ=255) gcgcCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGGCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAGCGCCCCGTGGCCTGGTAACACGACAACCGACACGCCACGGTTAAGCACCGCTATg > 2:303977/1‑149 (MQ=255) gcCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTCTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTgcg > 5:56394/1‑149 (MQ=255) ccAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTGGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTgcgc < 8:370759/149‑1 (MQ=255) cAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTCTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCa < 4:272483/149‑1 (MQ=255) aGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGG‑TTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCATg < 3:82835/149‑1 (MQ=255) tttGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTg < 8:287227/74‑1 (MQ=255) tttGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTg > 7:287227/1‑74 (MQ=255) cGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCATGGCAAt > 3:149913/1‑149 (MQ=255) gTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCATGGCAATc < 2:115422/149‑1 (MQ=255) aCTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCATGGCAATCGc < 5:168862/148‑1 (MQ=255) ctctTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCATGGCAATCGc > 3:267434/1‑147 (MQ=255) tcttcttctTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTCTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCATGGCAATCGCCAg > 2:328148/1‑149 (MQ=255) ttcttcttcCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTCTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTgc > 6:231395/1‑131 (MQ=255) cttcttcCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAAc < 4:43578/74‑1 (MQ=255) cttcttcCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAAc > 3:43578/1‑74 (MQ=255) cttcttcCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTCTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCAcc < 2:290971/122‑1 (MQ=255) cttcttcCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTCTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCAcc > 1:290971/1‑122 (MQ=255) cttcCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCATGGCAATCGCCAGTACTtgt > 4:156996/1‑149 (MQ=255) ttcCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCATg > 5:22548/1‑130 (MQ=255) ttcCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCATg < 6:22548/130‑1 (MQ=255) ccGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCATGGCAATCGCCAGTACTtgtg < 7:371757/147‑1 (MQ=255) ccGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCATGGCAATCGCCAGTACTtgt < 8:292270/146‑1 (MQ=255) ggCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCATg > 8:279143/1‑126 (MQ=255) ggCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCATg < 7:279143/126‑1 (MQ=255) ggCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTCTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCATGGCAATCGCCAGTACTtgtg > 1:152987/1‑145 (MQ=255) ggCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTCTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCATGGCAATCGCCAGTACTtgtg < 2:152987/145‑1 (MQ=255) ggCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTCTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCATGGCAATCGCCAGTACTTGTGGGa > 2:205093/1‑148 (MQ=255) aCGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCATGGCAATCGCCAGTACTTGTGGGATCTGCTc > 4:402388/1‑149 (MQ=255) gACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTCTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGa < 2:55148/80‑1 (MQ=255) gACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTCTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGa > 1:55148/1‑80 (MQ=255) gACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTCTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCATGGCAATCGCCAGTACTTGTGGGATCTGCTCCg > 6:12918/1‑149 (MQ=255) tGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCATGGCAATCGCCAGTACTTGTGGGATCTGCTCCg < 7:15417/146‑1 (MQ=255) tGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCATGGCAATCGCCAGTACTTGTGGGATCTGCTCCg > 8:15417/1‑146 (MQ=255) gTTGTGGCGGATGATACCAGTTCATGGTTGCCCCTTCTGTCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTTGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCATGGCAATATCCAGTACTTTTGGGATCTGCTCCGGGCt < 2:412982/148‑1 (MQ=255) gTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCATGGCAATCGCCAGTACTTGTGGGATCTGCTCCGGGc < 3:145778/147‑1 (MQ=255) tgGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCATGGCAATCGCCAGTACTTGTGGGATCTGCTCCGGGCTGGaaa < 1:125291/149‑1 (MQ=255) ggCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCATGGCAATCGCCAGTACTTGTGGGATCTGCTCCGGGCTGGAAAc < 4:303495/149‑1 (MQ=255) ggCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCATGGCAATCGCCAGTACTTGTGGGATCTGCTCCGGGCTGGAAAc > 2:264778/1‑149 (MQ=255) gcgcATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCATGGCAATCGCCAGTACTTGTGGGATCTGCTCCGGGCTGGAAAcc < 4:149913/149‑1 (MQ=255) gcATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCATGGCAATCGCCAGTACTTGTGGGATCTGCTCCGGGCTGGAAACCAg > 3:48527/1‑149 (MQ=255) gcATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTCTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCATGGCAATCGCCAGTACTTGTGGGATCTGCTCCGGGCTGGAAACCAg > 7:305441/1‑149 (MQ=255) aCCAGTGCATGGTTGCCCCTTCTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCATGGCAATCGCCAGTACTTGTGGGATCTGCTCCGGGCTGGAAACCAGCTCGCaa > 3:200121/1‑149 (MQ=255) cAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACCCGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCATGGCAATCGCCAGTACTTGTGGGATCTGCTCCGGGCTGGAAACCAGCTCGCaa > 6:336541/1‑147 (MQ=255) cAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCATGGCAATCGCCAGTACTTGTGGGATCTGCTCCGGGCTGGAAACCAGCt > 7:237547/1‑142 (MQ=255) cAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCATGGCAATCGCCAGTACTTGTGGGATCTGCTCCGGGCTGGAAACCAGCTCGCAATa < 4:267434/149‑1 (MQ=255) cAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCATGGCAATCGCCAGTACTTGTGGGATCTGCTCCGGGCTGGAAACCAGCTCGCAATa < 6:223916/149‑1 (MQ=255) gCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTATGCACCGCTTTGCGCATGGCAATCGCCAGTACTTGTGGGATCTGCTCCGGGCTGGAAACCAGCTCGCAATAGTGa < 7:83758/149‑1 (MQ=255) cATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCATGGCAATCGCCAGTACTTGTGGGATCTGCTCCGGGCTGGAAACCAGc > 4:396190/1‑136 (MQ=255) cATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCATGGCAATCGCCAGTACTTGTGGGATCTGCTCCGGGCTGGAAACCAGc < 3:396190/136‑1 (MQ=255) cATGGTTGCCCCTTCTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCATGGCAATCGCCAGTACTTGTGGGATCTGCTCCGGGCTGGAAACCAGCTCGCAATAGTGAc < 4:200121/149‑1 (MQ=255) ttGCCCCTTCTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCATGGCAATCGCCAGTACTTGTGGGATCTGCTCCGGGCTGGAAACCAGCTCGCAATAGTGACTACAt < 8:305441/149‑1 (MQ=255) ccTTCTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCATGGCAATCGCCAGTACTTGTGGGATCTGCTCCGGGCTGGAAACCAGCTCGCAATAGTGACTACATTcgcg < 5:12918/149‑1 (MQ=255) | CTCTTTATGCGCCCCCGCGCAGCCGCTGCCACACATCAGGGCGATATTGCTGGAATAACGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTCTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCATGGCAATCGCCAGTACTTGTGGGATCTGCTCCGGGCTGGAAACCAGCTCGCAATAGTGACTACATTCGCG > NC_000913/910396‑910686 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |