| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,799,134 | G→T | S60* (TCG→TAG) | waaU ← | lipopolysaccharide core biosynthesis |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,799,134 | 0 | G | T | 99.4% | 528.2 / ‑4.9 | 155 | S60* (TCG→TAG) | waaU | lipopolysaccharide core biosynthesis |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base T (74/79); total (76/79) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.87e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.60e-01 | |||||||||||
Only 100 of 155 total aligned reads displayed.
CATAGAGTAAGCATTTCAAGAAAACCGGTTGATTCTTTAATACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCGAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAACTTGTGCTGGATCTGTAATTTGATTATTTATTTTATTACGAAATAAAAAAGAAAGGAAATTAATCTTGATTTTGTTTATATA > NC_000913/3798990‑3799276 | aTAGAGTAAGCATTTCAAGAAAACCGGTTGATTCTTTAATACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACt > 1:63595/1‑148 (MQ=255) agTAAGCATTTCAAGAAAACCGGTTGATTCTTTAATACAGAACTCAAATATATTATTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAATAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATa > 5:11836/1‑149 (MQ=255) tAAGCATTTCAAGAAAACCGGTTGATTCTTTAATACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATAc > 3:328154/1‑148 (MQ=255) aGCATTTCAAGAAAACCGGTTGATTCTTTAATACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAAt > 2:95206/1‑149 (MQ=255) aGCATTTCAAGAAAACAGGTTGATTCTTTAATACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCATTCTATTTGTTAGAAGATTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAAt > 3:361585/1‑149 (MQ=255) aGCATTTCAAGAAAAACGGTTGATTCTTTAATACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAAt < 8:336689/149‑1 (MQ=255) tcATTTCAAGAAAACCGGTTGATTCTTTAATACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTAGACAGAAATTCCCCACACTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAAtt < 5:291295/148‑1 (MQ=255) gCATTTCAAGAAAACCGGTTGATTCTTTAATACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAAtt < 2:63595/149‑1 (MQ=255) gCATTTCAAGAAAACCGGTTGATTCTTTAATACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAAt > 6:57397/1‑148 (MQ=255) gCATTTCAAGAAAACCGGTTGATTCTTTAATACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACACCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAAt > 1:316553/1‑148 (MQ=255) aTTTCAAGAAAACCGGTTGATTCTTTAATACAGAACTCAAATATATTTTTCTTATTAGAGAGAATTTCCCCACCCTTTCTATTTGTGTGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTTCTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAg < 6:235293/149‑1 (MQ=255) tCAAGAAAACCGGTTGATTCTTTAATACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGAt > 1:193338/1‑148 (MQ=255) gAAAACCGGTTGATTCTTTAATACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCAcc > 3:7058/1‑148 (MQ=255) gAAAACCGGTTGATTCTTTAATACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCAcc > 7:377675/1‑148 (MQ=255) aaaCCTGTTGATTCTTTAATACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAg < 3:264946/149‑1 (MQ=255) aaaCCGGTTGATTCTTTAATACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCaa < 5:57397/148‑1 (MQ=255) ccggtgcttCTTTAATACAGCACTAAAATTTTATTTTATTAATAGAGTTTAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTtta < 4:83201/142‑1 (MQ=255) atgTTGATTCTTTAATACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAATAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTtta < 8:74140/147‑1 (MQ=255) ggTTGATTCTTTAATACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTttat > 8:33627/1‑149 (MQ=255) ggTTGATTCTTTAATACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTttat > 3:268956/1‑149 (MQ=255) gTTGATTCTTTAATACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTttatt < 2:277752/149‑1 (MQ=255) gTTGATTCTTTAATACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTttat > 5:242601/1‑148 (MQ=255) ttGATTCTTTAATACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTttatta < 2:366870/149‑1 (MQ=255) aTTCTTTAATACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCCTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTttattatt < 8:286334/148‑1 (MQ=255) aTTCTTTAAAACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTCGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGCAGAGTTATTTTACCCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTttattatta < 4:87289/149‑1 (MQ=255) ttCTTTAATACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTa > 6:172848/1‑128 (MQ=255) ttCTTTAATACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTa < 5:172848/128‑1 (MQ=255) ttCTTTAATACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTttattatta > 2:164308/1‑148 (MQ=255) cTTTAATACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATc < 2:316553/148‑1 (MQ=255) cTTTAATACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATc < 7:8332/148‑1 (MQ=255) cTTTAATACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACACCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCa > 1:367046/1‑149 (MQ=255) tttAATACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATc > 8:84961/1‑147 (MQ=255) tttAATACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATc < 7:84961/147‑1 (MQ=255) ttAATACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCAt > 5:91109/1‑148 (MQ=255) tAATACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATc > 2:365256/1‑127 (MQ=255) tAATACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCAt < 6:309981/147‑1 (MQ=255) tAATACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGACAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATc < 5:339088/127‑1 (MQ=255) tAATACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGACAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATc > 6:339088/1‑127 (MQ=255) aTACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGaat < 1:122641/149‑1 (MQ=255) tACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGaat > 1:289528/1‑148 (MQ=255) aGAACTCAAATATATTTTTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTttatt < 7:297875/133‑1 (MQ=255) aGAACTCAAATATATTTTTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTttatt > 8:297875/1‑133 (MQ=255) aaCTCAAATATATTTTTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAg > 6:219083/1‑149 (MQ=255) tCAAATATATTTTTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCa > 8:233409/1‑149 (MQ=255) aaaTATATTTTTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCAt > 7:267885/1‑148 (MQ=255) aaaTATATTTTTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCAt < 2:254006/148‑1 (MQ=255) aaaTATATTTTTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCAt > 3:41118/1‑148 (MQ=255) aaaTATATTTTTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCAt > 8:211560/1‑148 (MQ=255) atatatTTTTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGAt > 6:276357/1‑149 (MQ=255) atatTTTTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGAtt > 7:334235/1‑148 (MQ=255) atatTTTTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGAtt > 7:77118/1‑148 (MQ=255) tttttATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAAc > 7:325795/1‑149 (MQ=255) ttattattaGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAACtt < 8:377675/148‑1 (MQ=255) ttaGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAGGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAACTTGTGCTg > 4:251531/1‑148 (MQ=255) ttaGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAACTTGTGCTg < 5:171043/148‑1 (MQ=255) gagagaAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTtta > 1:118292/1‑105 (MQ=255) gagagaAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAACTTGTGCTGGAt < 7:90564/148‑1 (MQ=255) gagagaAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAACTTGTGCTGGAt < 2:289528/148‑1 (MQ=255) gagagaAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAACTTGTGCTGGATc > 6:199839/1‑149 (MQ=255) agagaAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAACTTGTGCTGGATCt > 1:18497/1‑149 (MQ=255) agagaAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAACTTGTGCTGGATCt < 4:328154/149‑1 (MQ=255) gaAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAACTTGTGCTGGATCTGt < 5:219390/148‑1 (MQ=255) ttCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATACAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAACTTGTGCTGGATCTGTAAttt < 4:13868/149‑1 (MQ=255) ccccACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAACTTGTGCTGGATCTGTAATTTg < 4:284437/148‑1 (MQ=255) ccACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTAACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAACTTGTGATGTATCTGTAATTTg > 5:123577/1‑146 (MQ=255) ccACCCTTTCTATATGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAACTTGTGCTGGATCTGTAATTTGatt < 4:361585/149‑1 (MQ=255) caacacTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCACTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAACTTGTGCTGGATCTGTAATTTg < 6:123577/141‑1 (MQ=255) cACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTtta > 8:356102/1‑92 (MQ=255) cTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAACTTGTGCTGGATCTGTAATTTGAttattta > 8:128640/1‑149 (MQ=255) tCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAACTTGTGCTGGATCTGTAATTTGATtatttatt < 1:334871/148‑1 (MQ=255) cTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAACTTGTGCTGGATCTGTAATTTGATTatttattt < 3:149838/148‑1 (MQ=255) tttGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAACTTGTGCTGGATCTGTAATTTGATTAtttatttt < 7:46140/146‑1 (MQ=255) tgAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAACTTGTGCTGGATCTGTAATTTGATTATTTATTTTATTACg > 7:303332/1‑148 (MQ=255) agaagaGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAACTTGTGCTGGATCTGTAATTTGATTATTTATTTTATTACGaaa < 4:7058/149‑1 (MQ=255) atagTTATTTAAACCCCTTTACTATAAGGTTCACTATAAATCGAACTTTATACAATTAGATCACAAAGTTTTTTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAACTTGTGCTGTTTCTGTAATTTGTTTATTTATTTTATTTCGAtata > 1:221563/3‑148 (MQ=255) gTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAACTTGTGCTGGATCTGTAATTTGATTATTTATTTTATTACGAAATaaaa > 2:97239/1‑148 (MQ=255) ttATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAACTTGTGCTGGATCTGt > 6:2806/1‑115 (MQ=255) ttATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAACTTGTGCTGGATCTGt < 5:2806/115‑1 (MQ=255) ttATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAACTTGTGCTGGATCTGTAATTTGATTATTTATTTTATTACGAAATaaaa > 2:109520/1‑147 (MQ=255) tATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAACTTGTGCTGGATCTGTAATTTGATTATTTATTTTATTACGAAATaaaaaa < 4:41118/148‑1 (MQ=255) aTTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAACTTGTGCTGGATCTGTAATTTGATTATTTATTTTATTACGAAATAAAaaag < 2:32014/148‑1 (MQ=255) tttAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAACTTGTGCTGGAt < 1:71720/107‑1 (MQ=255) tttAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAACTTGTGCTGGAt > 2:71720/1‑107 (MQ=255) tAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAACTTGTGCTGGATCTGTAATTTGATTATTTATTTTATTACGAAATAAAaaagaaag > 8:2256/1‑148 (MQ=255) cccTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAACTTGTGCTGGATCTGTAATTTGATTATTTATTTTATTACGAAATAAAAAAGAAAGGAAAt > 1:263125/1‑149 (MQ=255) tACTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAACTTGTGCTGGATCTGTAATTTGATTATTTATTTTATTACGAAATAAAAAAGAAAGGAAATTAAt < 7:233409/148‑1 (MQ=255) cTATAAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAACTTGTGCTGGATCTGTAATTTGATTATTTATTTTATTACGAAATAAAAAAGAAAGGAAATTAATCtt < 8:73867/149‑1 (MQ=255) tataAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAACTTGTGCTGGATCTGTAATTTGATTATTTATTTTATTACGAAATAAAAAAGAAAGGAAATTAATCtt > 3:296815/1‑148 (MQ=255) taAAGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAACTTGTGCTGGATCTGTAATTTGATTATTTATTTTATTACGAAATAAAAAAGAAAGGAAATTAATCTTg < 4:238512/147‑1 (MQ=255) aGTTCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAACTTGTGCTGGATCTGTAATTTGATTATTTATTTTATTACGAAATAAAAAAGAAAGGAAATTAATCTTGAtttt < 2:18497/149‑1 (MQ=255) ttCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAACTTGTGCTGGATCTGTAATTTGATTATTTATTTTATTACGAAATAAAAAAGAAAGGa < 7:228660/131‑1 (MQ=255) ttCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAACTTGTGCTGGATCTGTAATTTGATTATTTATTTTATTACGAAATAAAAAAGAAAGGAAATTAATCTTGATTTTGt < 6:120680/149‑1 (MQ=255) ttCACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAACTTGTGCTGGATCTGTAATTTGATTATTTATTTTATTACGAAATAAAAAAGAAAGGAAATTAATCTTGATTTTGt > 7:129348/1‑149 (MQ=255) cACGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAACTTGTGCTGGATCTGTAATTTGATTATTTATTTTATTACGAAATAAAAAAGAAAGGAAATTAATCTTGATTTTGtt < 2:263125/148‑1 (MQ=255) aCGATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAACTTGTGCTGGATCTGTAATTTGATTATTTATTTTATTACGAAATAAAAAAGAAAGGAAATTAATCTTGATTTTGTTta > 3:78165/1‑149 (MQ=255) gATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAACTTGTGCTGGATCTGTAATTTTATTATTTATTTTATTACGAAATAAAAAAGAAAGTAAATTAATATTGATTTTGTTtata > 1:41770/1‑149 (MQ=255) gATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAACTTGTGCTGGATCTGTAATTTGATTATTTATTTTATTACGAAATAAAAAAGAAAGGAAATTaa < 8:130265/132‑1 (MQ=255) gATAAATCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAACTTGTGCTGGATCTGTAATTTGATTATTTATTTTATTACGAAATAAAAAAGAAAGGAAATTaa > 7:130265/1‑132 (MQ=255) aTCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAACTTGTGCTGGATCTGTAATTTGATTATTTATTTTATTACGAAATAAAAAAGAAAGGAAATTAATCtt > 2:199894/1‑131 (MQ=255) aTCTAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAACTTGTGCTGGATCTGTAATTTGATTATTTATTTTATTACGAAATAAAAAAGAAAGGAAATTAATCtt < 1:199894/131‑1 (MQ=255) | CATAGAGTAAGCATTTCAAGAAAACCGGTTGATTCTTTAATACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTAGAGAGAAATTCCCCACCCTTTCTATTTGTGAGAAGAGTTATTTTAACCCCTTTACTATAAAGTTCACGATAAATCGAACTTAATACAATTAGATCACCAAGTTTATTATTATCATGAATAATAAGGCATGATTTAACTTGTGCTGGATCTGTAATTTGATTATTTATTTTATTACGAAATAAAAAAGAAAGGAAATTAATCTTGATTTTGTTTATATA > NC_000913/3798990‑3799276 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |