| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 2,819,278 | IS5 (+) +4 bp | intergenic (‑132/+100) | csrA ← / ← alaS | pleiotropic regulatory protein for carbon source metabolism/alanyl‑tRNA synthetase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2288919 = | NA (NA) | 48 (1.230) | 39/260 | 0.1 | 100% | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 2819278 = | 0 (0.000) | intergenic (‑132/+103) | csrA/alaS | pleiotropic regulatory protein for carbon source metabolism/alanyl‑tRNA synthetase | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 2290113 | NA (NA) | 70 (1.790) | 51/260 | 0.0 | 100% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 2819281 | 0 (0.000) | intergenic (‑135/+100) | csrA/alaS | pleiotropic regulatory protein for carbon source metabolism/alanyl‑tRNA synthetase | |||||
GGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2289967‑2290113‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACTGCTTAGATGTAATGTGTTTGTCATTGCTTACTTTTTGGCGTTATATGATGGATAATGCCGGGATACAGAGAGACCCGACTCTTTTAATCTTTCAAGGAGCAAAGAATGCTGATTCTGA < NC_000913/2819281‑2819134 GGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGACCCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT > 3:5256/1‑148GGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT < 1:29094/149‑1 GGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTA < 5:99406/149‑1 GGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGAGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCGTGTTCTATGGCTCAAGATGACAAACATGATCTCATATCTGGGACTTGTTCTCACCTTACTT > 8:127585/1‑148 GACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAG > 1:108588/1‑149 AAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCTCCTTCCT < 1:186766/143‑1 AAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCTCCTTCCT > 2:186766/1‑143 AAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTT > 8:57425/1‑149 GAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTT > 2:158085/1‑148 AAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAAC < 7:57425/149‑1 AATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTGCGCACCTTCCTTAGGTTTAACA < 3:123792/149‑1 TTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAAT < 1:122572/147‑1 TTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAA < 1:158085/146‑1 TGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGA > 6:67333/1‑149 ACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGA < 2:62152/147‑1 CGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACTGCTT < 5:115395/149‑1 CTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACTGCTTAGATGTAAT > 4:31223/1‑149 CTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACTGCTTAGATGTAAT > 5:59279/1‑149 CTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACTGCTTAGATGTAATGTGTTTGTC < 3:31223/149‑1 GTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGATCCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACT < 4:140172/125‑1 GTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACT > 3:140172/1‑125 TCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACTGCTTAGATGTAATGTGTTTGTCA < 6:59279/147‑1 GCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGA > 8:14659/1‑105 GCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGA < 7:14659/105‑1 AAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT < 7:96451/84‑1 AAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT > 8:96451/1‑84 ATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACTGCTTAGATGTAATGTGTTTGTCATTGCTTACTTTTTGGCGTTATATGAT > 1:61306/1‑149 TGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACTGCTTAGATGTAATGTGTTTGTCATTGC < 3:75690/126‑1 TGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACTGCTTAGATGTAATGTGTTTGTCATTGC > 4:75690/1‑126 ATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACTGCTTAGATGTAATGTGTTTGTCATTGCTTACTTTTTGGCGTTATATGATGGA > 8:118054/1‑149 TGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACTGCTTAGATGTAATGTGTTTGTCATTGCTTACTTTTTGGC > 3:72423/1‑135 TGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACTGCTTAGATGTAATGTGTTTGTCATTGCTTACTTTTTGGC < 4:72423/135‑1 CCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACTGCTTAGATGTAATGTGTTTGTCATTGCTTACT < 8:121250/124‑1 CCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACTGCTTAGATGTAATGTGTTTGTCATTGCTTACT > 7:121250/1‑124 CCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT > 8:131963/1‑62 TGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACTGCTTAGATGTAATGTGTTTGTCATTGCTTACTTTTTGGCGTTATATGATGGATAATGCCG > 1:180739/1‑149 GTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACTGCTTAGA < 7:4477/95‑1 GTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACTGCTTAGA > 8:4477/1‑95 TCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACTGCTTAGATGTAATGTGTTTGTCATT > 1:105984/1‑103 TCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACTGCTTAGATGTAATGTGTTTGTCATT < 2:105984/103‑1 CAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACTGCTTAGATGTAATGTGTTTGTCATTGCTTACTTTTTGGCGTTATATGATGGATAATGCCGGGATACAGAGAG < 2:180739/148‑1 GACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACTGCTTAGATGTAATGTGTTTGTCATTGCTTACTTTTTGGCGTTATATGATGGATAATGCCGGGATACAGAGAGACCCGA > 4:18928/1‑149 AAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACTGCTTAGATGTAATGTGTTTGTCATTGCTTACTTTTTGGCGTTATATGATGGATAATGCCGGGATACAGAGAGACCCGACTC > 1:85388/1‑149 AACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACTGCTTAGATGTAATGTGTTTGTCATTGCTTACTTTTTGGCGTTATATGATGGATAATGCCGGGATACAGAGAGAC < 5:53596/141‑1 AACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACTGCTTAGATGTAATGTGTTTGTCATTGCTTACTTTTTGGCGTTATATGATGGATAATGCCGGGATACAGAGAGAC < 5:56284/141‑1 AACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACTGCTTAGATGTAATGTGTTTGTCATTGCTTACTTTTTGGCGTTATATGATGGATAATGCCGGGATACAGAGAGAC > 6:53596/1‑141 AACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACTGCTTAGATGTAATGTGTTTGTCATTGCTTACTTTTTGGCGTTATATGATGGATAATGCCGGGATACAGAGAGAC > 6:56284/1‑141 ACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACTGCTTAGATGTAATGTGTTTGTCATTGC < 1:104921/93‑1 ACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACTGCTTAGATGTAATGTGTTTGTCATTGC > 2:104921/1‑93 ATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACTGCTTAGATGTAATGTGTTTGTCATTGCTTACTTTTTGGCGTTATATGATGGATAATGCCGGGATACAGAGAGACCCGACTCTTTT < 2:85388/149‑1 GATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACTGCTTAGATGTAATGTGTTTGTCATTGCTTACTTTTTGGCGTTATATGATGGATAATGCCGGGATACAGAGAGACCCGACTCTTTTAA > 8:108579/1‑149 CTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACTGCTTAGATGTAATGTGTTTGTCATTGCTTACTTTTTGGCGTTATATGATGGATAATGCCGGGATACA > 7:61293/1‑126 CTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACTGCTTAGATGTAATGTGTTTGTCATTGCTTACTTTTTGGCGTTATATGATGGATAATGCCGGGATACA < 8:61293/126‑1 TCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACTGCTTAGATGTAATGTGTTTGTCATTGCTTACTTTTTGGCGTTATATGATGGATAATGCCGGGATACAGAGAGACCCGACTCTTTTAATCTT > 7:115003/1‑149 ATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACTGCTTAGATGTAATGTGTTTGTCATTGCTTACTTTTTGGCGTTATATGATGGATAATGCCGGGATACAGAGAGACCCGACTCTTTTAATCTTTC > 4:75709/1‑147 ATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACTGCTTAGATGTAATGTGTTTG > 8:8880/1‑74 ATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACTGCTTAGATGTAATGTGTTTG < 7:8880/74‑1 ATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGAC < 6:107588/53‑1 ATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGAC > 5:107588/1‑53 TCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACTGCTTAGATGTAATGTGTTTGTCATTGCTTACTTTTTGGCGTTATATGATGGATAATGCCGGGATACAGAGAGACCCGACTCTTTTAATCTTTCAA < 7:118054/148‑1 TCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACTGCTTAGATGTAATGTGTTTGTCATTGCTTACTTTTTGGCGTT < 4:83453/95‑1 TCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACTGCTTAGATGTAATGTGTTTGTCATTGCTTACTTTTTGGCGTT > 3:83453/1‑95 TTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACTGCTTAGATGTAATGTGTTTGTCATTGCTTACTTTTTGGCGTTATATGATGGATAATGCCGGGATACAGAGAGACCCGA > 5:135063/1‑123 TTGTTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACTGCTTAGATGTAATGTGTTTGTCATTGCTTACTTTTTGGCGTTATATGATGGATAATGCCGGGATACAGAGAGACCCGA < 6:135063/123‑1 TTCGCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACTGCTTAGATGTAATGTGTTTGTCATTGCTTACTTTTTGGCGTTATATGATGGATAATGCCGGGATACAGAGAGACCCGACTCTTTTAATCTTTCAAGGAGCAAAGAA < 7:108579/148‑1 GCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACTGCTTAGATGTAATGTGTTTGTCATTGCTTACTTTTTGGCGTTATATGATGGATAATGCCGGGATACAGAGAGACCCGACTCTTTTAATCTTTCAAGGAGCAAAGAATGCT > 2:39333/1‑149 GCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACTGCTTAGATGTAATGTGTTTGTCATTGCTTACTTTTTGGCGTTATATGATGGATAATGCCGGGATACAGAGAGACCCGACTCTTTTAATCTTTCAAGGAGCAAAGAATGCT > 1:127234/1‑149 GCACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAACGCCATGACTGCTTAGATGTAATGTGTTTGTCATTGCTTACTTTTTGGCGTTATATGATGGATAATGCCGGGATACAGAGAGACCCGACTCTTTTAATCTTTCAAGGAGCAAAGAATGCT > 6:153434/1‑149 ACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACTGCTTAGATGTAATGTGTTTGTCATTGCTTACTTTTTGGCGTTATATGATGGATAATGCCGGGATACAGAGAGACCCGACTCTTTTAATCTTTCAAGGAGCAAAGAATGCTGA < 2:61306/149‑1 ACCTTCCTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACTGCTTAGATGTAATGTGTTTGTCATTGCTTACTTTTTGGCGTTATATGATGGATAATGCCGGGATACAGAGAGACCCGACTCTTTTAATCTTTCAAGGAGCAAAGAATGCTGA < 8:115003/149‑1 CTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACTGCTTAGATGTAATGTGTTTGTCATTGCTTACTTTTTGGCGTTATATGATGGATAATGCCGGGATACAGAGAGACCCGACTCTTTTAATCTTTCAAGGAGCAAAGAATGCTGATTCTGA < 3:18928/149‑1 GGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2289967‑2290113‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cTTAGGTTTAACAGAATGTAATGCCATGACTGCTTAGATGTAATGTGTTTGTCATTGCTTACTTTTTGGCGTTATATGATGGATAATGCCGGGATACAGAGAGACCCGACTCTTTTAATCTTTCAAGGAGCAAAGAATGCTGATTCTGA < NC_000913/2819281‑2819134 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |