| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 3483935 | 80 (0.950) | coding (734/1023 nt) | yheT | UPF0017 family putative hydrolase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 136 total aligned reads displayed.
ATCATATGGAAAAGGGCTTTTCCCGCGTTTATCAGCGTTACTTGCTGAACCTGTTAAAAGCCAATGCCGCGCGCAAGCTGGCAGCCTACCCCGGAACGCTGCCGATTAATCTCGCGCAGTTAAAATCGGTACGTCGCATCCGTGAATTTGACGATCTCATCACCGCCAGAATTCACGGCTACGCCGACGCTATCGACTATTATCGTCAGTGTAGCGCCATGCCGATGCTGAACCGGATCGCCAAACCGACGCTGATTATTCACGCCAAAGACGATCCGTTTATGGATCATCAGGT > NC_000913/3483767‑3484061 | aTCATATGGAAAAGGGCTTTTCCCGCGTTTATCAGCGTTACTTGGTGAACCTGTTAAAAGCCAATGCCGCGCGCAAGCTGGCAGCCTACCCCGGAAAGCTGCCGATTAATCTCGCGCAGTTAAAATCGGTACGTCGCCTCCGTGAATT > 6:392482‑M1/1‑148 (MQ=255) cATATGGAAAAGGGCTTTTCCCGCGTTTATCAGAGTTACTTGCTGAACCTGTTAAAAGCCAATGCCGCGCGCAAGCTCGCAGCCTACCCCGGAACGCTGCCGATTAATCTCGCGCAGTTAAAATCGGTACGTCGCATCCGTGAAttt > 5:374095/1‑147 (MQ=255) atGGAAAAGGGCTTTTCCCGCGTTTATCAGCGTTACTTGCTGAACCTGTTAAAAGCCAATGCCGCGCGCAAGCTGGCAGCCTACCCCGGAACGCTGCCGATTAATCTCGCGCAGTTAAAATCGGTACGTCGCATCCGTGAATTTGAc > 2:244751/1‑147 (MQ=255) tGGAAAAGGGCTTTTCCCGCGTTTATCAGCGTTACTTGCTGAACCTGTTAAAAGCCAATGCCGCGCGCAAGCTTGAAGCCTACCCCGGAACGCTGCCGATTAATCTCGCGCAGTTAAAATCGGTACGTCGCATCCGTGAATTTGACg < 3:80176/147‑1 (MQ=255) tGGAAAAGGGCTTTTCCCGCGTTTATCAGCGTTACTTGCTGAACCTGTTAAAAGCCAATGCCGCGCGCAAGCTGGCAGCCTACCCCGGAACGCTGCCGATTAATCTCGCGCAGTTAAAATCGGTACGTCGCATCCGTGAATTTGACGa < 5:97018/148‑1 (MQ=255) taaaaGGGCTTTTCCCGCGTTTATCCGCGTTACTTGCTGAACCTGTTAAAAGCCAATGCCGCGCGCAAGCTGGCAGCCTACCCCGGAACGCTGCCGATTAATCTCGCGCAGTTAAAATCGGTACGTCGCATCCGTGAATTTGACGAt < 6:413459/146‑1 (MQ=255) aaaGTGCTTTTCCCGCGTTTATCAGCGTTACTTGCTGAACCTGTTAAAAGCCAATGCCGCGCGCAAGCTGGCAGCCTACACCGGAACGCTGACGATTAATCTAGCGCAGTTTAAATGGGTACGTCGCATCCGTGAATTTGACGAtctc < 7:430179/148‑1 (MQ=255) tttCCCGCGTTTATCAGCGTTACTTGCTGAACCTGTTAAAAGCCAATGCCGCGCGCAAGCTGGCAGCCTACCCCGGAACGCTGCCGATTAATCTCGCGCAGTTAAAATCGGTACGTCGCATCCGTGAATTTGACGATCTCATCACCGc > 3:10144/1‑148 (MQ=255) tttCCCGCGTTTATCAGCGTTACTTGCTGAACCTGTTAAAAGCCAATGCCGCGCGCAAGCTGGCAGCCTACCCCGGAACGCTGCCGATTAATATCGCGCAGTTAAAATCGGTACGTCGCATCCGTGAATTTGACGATCTCATCACCGc > 1:38382/1‑148 (MQ=255) ccGCGTTTATCAGCGTTACTTGCTGCACCTGTTAAAAGCCAATGCCGCGCGCAAGCTGGCAGCCTACCCCGGCACGCTGCCGATTAATCTCGCGCAGTTAAAATCGGTACGTCGCATCCGTGACTTTGACGATCTCATCACCGCCAg > 4:24493/1‑147 (MQ=255) cgcgTTTATCAGCGTTACTTGCTGAACCTGTTAAAAGCCAATGCCGCGCGCAAGCTGGCAGCCTACCCCGGAACGCTGCCGATTAATCTCGCGCAGTTAAAATCGGTACGTCGCATCCGTGAATTTGACGATCTCATCACCGCCAGaa < 7:361320‑M2/148‑3 (MQ=255) gcgTTTATCAGCGTTACTTGCTGAACCTGTTAAAAGCCAATGCCGCGCGCAAGCTGGCAGCCTACCCCGGAACGCTGCCGATTAATCTCGCGCAGTTAAAATCGGTACGTCGCATCCGTGAATTTGACGATCTCATCACCGCCAGaat < 4:247217‑M2/148‑4 (MQ=255) cgTTTATCAGCGTTACTTGCTGAACCTGTTAAAAGCCAATGCCGCGCGCAAGCTGGCAGCCTACCCCGGAACGCTGCCGATTAATCTCGCGCAGTTAAAATCGGTACGTAGCATCCGTGAATTTGACGATCTCATCACCGCCAGaatt < 2:173376‑M2/148‑5 (MQ=255) gTTTATCAGCGTTACTTGCTGAACCTGTTAAAAGCCAATGCCGCGCGCAAGCTGGCAGCCTACCCCGGAACGCTGCCGATTAATCTCGCGCAGTTAAAATCGGTACGTCGCATCCGTGAATTTGACGATCTCATCACCGcc > 3:206746/1‑141 (MQ=255) 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cGCATCCGTGAATTTGACGATCTCATCACCGCCAGaattcacggatgcgacgtaccgattttaactgcgcgagattaatcggcagcgttccggggta > 5:343907‑M2/1‑35 (MQ=255) ccGTGAATTctggcggtgatgagatcgtcaaattcacggatgcgacgtaccgattttaactgcgcgagattaatcggcagcgttccggggtaggctgccagcttgcgcgcggcattggcttttaacaggttcagcaagtaacgctgat < 5:65166‑M1/148‑140 (MQ=255) ccGTGAATTctggcggtgatgagatcgtcaaattcacggatgcgacgtaccgattttaactgcgcgagattaatcggcagcgttccggggtaggctgccagcttgcgcgcggc < 4:20991‑M1/113‑105 (MQ=255) cGTGAATTctggcggtgatgagatcgtcaaattcacggatgcgacgtaccgattttaactgcgcgagattaatcggcagcgttccggggt < 3:178150‑M1/90‑83 (MQ=255) cGTGAATTctggcggtgatgagatcgtcaaattcacggatgcgacgtaccgattttaactgcgcgagattaatcggcagcgttccggggt > 4:178150‑M1/1‑8 (MQ=255) cGTGAATTTGACGATCTCATCACCGCCAGAATTCACGGCTACGCCGACGCTATCGACTATTATCGTCAGTGTAGCGCCATGCCGATGCTGAACCGGATCGCCAAACCGACGCTGATTATTCACGCCAAAGACGATCCGTTTATGGat < 1:173376/147‑1 (MQ=255) tGAATTctggcggtgatgagatcgtcaaattcacggatgcgacgtaccgatttttactgcgcgagattattcggcagcgttccggggtaggctgcctgcttgcgcgcggcattgtcttttaacaggttcagcaagtaacgc < 3:360004‑M1/141‑136 (MQ=255) tGAATTctggcggtgatgagatcgtcaaattcacggatgcgacgtaccgattttaactgcgcgagattaatcggcagcgttccggggtaggctgccagcttgcgcgcggcattggcttttaacaggttcagcaagtaacgctgataaa > 5:297587‑M1/1‑6 (MQ=255) tGAATTctggcggtgatgagatcgtcaaattcacggatgcgacgtaccgattttaactgcgcgagattaatcggcagcgttccggggtaggctgccagcttgcgcgcggcattggcttttaacaggttcagcaagtaacgctgataaa > 6:71573‑M1/1‑6 (MQ=255) tGAATTctggcggtgatgagatcgtcaaattcacggatgcgacgtaccgattttaactgcgcgagattaatcggcagcgttccggggtag > 7:36245‑M1/1‑6 (MQ=255) tGAATTctggcggtgatgagatcgtcaaattcacggatgcgacgtaccgattttaactgcgcgagattaatcggcagcgttccggggtag < 8:36245‑M1/90‑85 (MQ=255) tGAATTTGACGATCTCATCACCGCCAGAATTCACGGCTACGCCGACGCTATCGACTATTATCGTCAGTGTAGCGCCATGCCGATGCTGAACCGGATCGCCAAACCGACGCTGATTATTCACGCCAAAGACGATCCTTTTATGGatcat > 6:182527/1‑148 (MQ=255) tGAATTTGACGATCTCATCACCGCCAGAATTCACGGCTACGCCGACGCTATCGACTATTATCGTCAGTGTAGCGCCATGCCGATGCTGAACCGGATCGCCAAACCGACGCTGATTATTCACGCCAAAGACGATCCGTTTATGGatcat > 3:246491/1‑148 (MQ=255) gAATTctggcggtgatgagatcgtcaaattcacggatgcgacgtaccgattttaactgcgcgagattaatcggcagcgttccggggtaggctgccagcttgcgcgcggcattggcttttaacagggtcagcaagtaacgctgataaac < 8:29351‑M1/148‑144 (MQ=255) aaTTctggcggtgatgagatcgtcaaattcacggatgctacgtaccgattttaactgcgcgagattaatcggcagcgttccggggtaggctgccagcttgcgcgcggcattggcttttaacaggttcagcaagtaacgctgataaacg < 2:173376‑M1/148‑145 (MQ=255) aaTTctggcggtgatgagatcgtcaaattcacggatgcgacgtaccgattttaactgcgcgagattaatcggcagcgttccggggtaggctgccagcttgcgcgcggcattggcttttaacaggttcagcaagtaacgctgataaacg < 6:398361‑M1/148‑145 (MQ=255) aTTctggcggtgatgagatcgtcaaattcacggatgcgacgtaccgattttaactgcgcgagattaatcggcagcgttccggggtaggctgccagcttgcgcgcggcattggcttttaacaggttcagcaagtaacgctgataaacgc < 4:247217‑M1/148‑146 (MQ=255) | ATCATATGGAAAAGGGCTTTTCCCGCGTTTATCAGCGTTACTTGCTGAACCTGTTAAAAGCCAATGCCGCGCGCAAGCTGGCAGCCTACCCCGGAACGCTGCCGATTAATCTCGCGCAGTTAAAATCGGTACGTCGCATCCGTGAATTTGACGATCTCATCACCGCCAGAATTCACGGCTACGCCGACGCTATCGACTATTATCGTCAGTGTAGCGCCATGCCGATGCTGAACCGGATCGCCAAACCGACGCTGATTATTCACGCCAAAGACGATCCGTTTATGGATCATCAGGT > NC_000913/3483767‑3484061 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |