| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,478,995 | A→G | 5.4% | K257R (AAA→AGA) | ynbB → | putative CDP‑diglyceride synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,478,995 | 0 | A | G | 5.4% | 230.4 / 2.1 | 74 | K257R (AAA→AGA) | ynbB | putative CDP‑diglyceride synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (39/31); new base G (2/2); total (41/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GGCGGCGTCATCACCATCATGATTGCGTCACTGATTATCGGACCGTTACTGACACCGCTAAATACATTACAGGCATTATTAGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAACTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTACTGAAGGAAAATAGAGAAAAT > NC_000913/1478856‑1479139 | ggcggcGTCATCACCATCATGATTGCGTCACTGATTATCGGACCGTTACTGACACCGCTAAATACATTACAGGCATTATTAGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGat < 1:272152/147‑1 (MQ=255) gcgTCATCACCATCATGATTGCGTCACTGATTATCGGACCGTTACTGACACCGCTAAATACATTACAGGCATTATTAGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTgg < 7:152432/148‑1 (MQ=255) catcaCCATCATGATTGCGTCACTGATTATCGGACCGTTACTGACACCGCTAAATACATTACAGGCATTATTAGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGgtgt > 7:223251/1‑147 (MQ=255) catcaCCATCATGATTGCGTCACTGATTATCGGACCGTTACTGACACCGCTAAATACATTACAGGCATTATTAGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGgtgt > 7:52942/1‑147 (MQ=255) catcaCCATCATGATTGCGTCACTGATTATCGGACCGTTACTGACACCGCTAAATACATTACAGGCATTATTAGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGgtgt > 7:59970/1‑147 (MQ=255) tcaCCATCATGACTGCGTCACTGATTATCGGACCGTTACTGACACCGCTAAATACATTACAGGCATTATTAGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGGGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTa > 7:421427/1‑147 (MQ=255) caCCATCATGATTGCGTCACTGATTATCGGACCGTTACTGACACCGCTATATACATTACAGGCTTTATTAGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGGTTTTGCGGCGATGTCGGGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGGGTTaa < 7:28972/147‑1 (MQ=255) aCCATCATGATTGCGTCACTGATTATCGGACCGTTACTGACACCGCTAAATACATTACAGGCATTATTAGCGGGTTTGTTAATTGGTATTATTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAACCGAGATATTGGTGTTAAAg > 8:28972/1‑148 (MQ=255) aCCATCATGATTGCGTCACTGATTATCGGACCGTTACTGACACCGCTAAATACATTACAGGCATTATTAGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTgg < 1:16378/140‑1 (MQ=255) 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6:216812/1‑124 (MQ=255) cACTGATTATCGGACCGTTACTGACACCGCTAAATACATTACAGGCATTATTAGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTgg < 5:216812/124‑1 (MQ=255) aTTATCGGACCGTTACTGACACCGCTAAATACATTACAGGCATTATTAGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGGGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAACTATTGcc < 8:421427/146‑1 (MQ=255) aTCGGACCGTTACTGACACCGCTAAATACATTACAGGCATTATTAGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAACTATTGCCAGGa < 8:290608/147‑1 (MQ=255) cGTTACTGACACCGCTAAATACATTACAGGCATTATTAGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAGACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAACTATTGCCAGGACATGGCgg < 1:90729/148‑1 (MQ=255) acacCGCTAAATACATTACAGGCATTATTAGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAGACGAGATATTGTTGTTAAAGATAGAGGAAAACTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCtt > 5:42411/1‑147 (MQ=255) 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1:86853/148‑1 (MQ=255) ttattaGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAACTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCa > 1:397593/1‑148 (MQ=255) tattaGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGaaa > 2:172400/1‑94 (MQ=255) tattaGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGaaa < 1:172400/94‑1 (MQ=255) tattaGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAACTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCAc > 6:368962/1‑148 (MQ=255) tattaGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAACTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCAc > 4:30826/1‑148 (MQ=255) taGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAACTATTGCCAGGACATg > 1:343967/1‑108 (MQ=255) 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8:93758/1‑148 (MQ=255) ggTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAACTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTttttat < 3:30826/147‑1 (MQ=255) ttAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGTAAAACTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCTTTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTtttattttat < 4:37331/148‑1 (MQ=255) ttAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAACTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTttttatttta > 3:96638/1‑147 (MQ=255) ttAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAACTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTtttattttat < 5:368962/148‑1 (MQ=255) tAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCCTGATGTCAGCCATCAAACGAGATAATGTTGTTAAAGATAGCGGAAAACTATTGCATTGACATGGCGGAATCATTGACAGGATTGAATCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTttatatattaa > 4:209847/1‑146 (MQ=255) 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aTGTCAGGCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAACTATTGCGAGGACATGTCTGACTCATTGACATTATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTACTGAAGGaaaa < 5:79112/148‑1 (MQ=255) aTGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATA‑‑GGAAAACTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTACTGAAGGAAAAt < 6:124085/147‑1 (MQ=255) tCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAACTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTACTGAAGGaaaa > 3:330223/1‑145 (MQ=255) cAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAACTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTACTGAAGGAAAATa > 8:180247/1‑146 (MQ=255) gCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAACTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTACTGAAGGAAAATagag > 8:332480/1‑147 (MQ=255) tCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAACTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCt > 2:429490/1‑117 (MQ=255) tCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAACTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCt < 1:429490/117‑1 (MQ=255) tCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAACTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTACTGAAGGAAAATAGAGAAAAt > 8:120266/1‑148 (MQ=255) aaCGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAACTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCt < 5:35655/114‑1 (MQ=255) aaCGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAACTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCt > 6:35655/1‑114 (MQ=255) | GGCGGCGTCATCACCATCATGATTGCGTCACTGATTATCGGACCGTTACTGACACCGCTAAATACATTACAGGCATTATTAGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAACTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTACTGAAGGAAAATAGAGAAAAT > NC_000913/1478856‑1479139 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |