New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 2325633 = | 85 (0.930) | 3 (0.040) | 3/244 | NT | 3.6% | coding (878/1323 nt) | atoE | short chain fatty acid transporter |
? | NC_000913 | 2325660 = | 83 (0.970) | coding (905/1323 nt) | atoE | short chain fatty acid transporter | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
GCATTCTGACGTTGATCATCGGCGCACTCGGTATCGCTTACCTTGCGATGTACTTCAGCGAACATGGCTTCAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATCCAACTGATGATGGAGCATTCCGGTCTGGGCGGACTCATTACCGAATTCTTCATCAATGTTGCGAACAAAGACACC > NC_000913/2325486‑2325778 | cagaactaaaaaaggtcattaccgggaaggtgtctttgttcgcaacattgatgaagaattcggtaatgagtccgcccagaccggaatgctccatcatcagttggatcccagcgtagaaggggaattgcaccagaataccggcagtacTg < 3:37238‑M1/2‑1 (MQ=255) aTTCTGACGTTGATCATCGGCGCACTCGGTATCGCTTACCTTGCGATGTACTTCAGCGAACATGGCTTCAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCg < 6:70775/149‑1 (MQ=255) actaaaaaagggcattaccgggaaggtgtctttgttcgcaacattgatgaagaattcggtaatgagtccgcccagcccggaatgctccatcatcagttggatcccagcgtagaaggggaattgcaccagaataccggcagtacTGCGTg > 6:236979‑M1/144‑149 (MQ=255) ctaaaaaaggtcattacagggaaggtgtctttgttcgcaacattgatgaagaattcggtaatgagtccgcccagacctgaatgctcaatcatcagttggatcccagcgtagaaggggaattgcaccagaaaaccggcagtacTGCGTGc < 1:160434‑M1/7‑1 (MQ=255) cTGACGTTGATCATCGGCGCACTCGGTATCGCTTACCTTGCGATGTACTTCAGCGAACATGGCTTCAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTg < 4:213585/148‑1 (MQ=255) taaaaaaggtcattaccgggaaggtgtctttgttcgaaacattgatgaagaattcggtaatgagtccgcccagaccggaatgctccatcatcagttggatcccagcgtagaaggggaattgcaccagaataccggcagtacTGCGTGCt < 5:11886‑M1/8‑1 (MQ=255) tGACGTTGATCATCGGCGCACTCGGTATCGCTTACCTTGCGATGTACTTCAGCGAACATGGCTTCAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTga > 5:204336/1‑147 (MQ=255) tGACGTTGATCATCGGCGCACTCGGTATCGCTTACCTTGCGATGTACTTCAGCGAACATGGCTTCAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGc > 6:255230/1‑148 (MQ=255) aCGTTGATCATCGGCGCACTCGGTATCGCTTACCTTGCGATGTACTTCAGCGAACATGGCTTCAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTAt < 6:230386/149‑1 (MQ=255) aCGTGGATCAGCGGCGCACTCGGTATCGCTTAGCTTGCGATGTACTTCAGCGAACATGGCTTCACAATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGTTTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGAGTGCTAt < 3:119826/149‑1 (MQ=255) aggtcattaccgggaaggtgtctttgttcgcaacattgatgaagaattcggtaatgagtccgcccagaccggaatgctccatcatcagttggatcccagcgtagaaggggaattgcaccagaataccggcagtacTGCGTg > 1:222854‑M1/136‑141 (MQ=255) aggtcattaccgggaaggtgtctttgttcgcaacattgatgaagaattcggtaatgagtccgcccagaccggaatgctccatcatcagttggatcccagcgtagaaggggaattgcaccagaataccggcagtacTGCGTg < 2:222854‑M1/6‑1 (MQ=255) gATCATCGGCGCACTCGGTATCGCTTACCTTGCGATGTACTTCAGCGAACATGGCTTCAACATCCCCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAgcg > 4:31042/1‑149 (MQ=255) tcatcGGCGCACTCGGTATCGCTTTCCTTGCGATGTACTTCAGCGAACATGGCTTCAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGGGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAgcgc < 2:378630/148‑1 (MQ=255) tcatcGGCGCACTCGGTATCGCTTACCTTGCGATGTACTTCAGCGAACATGGCTTCAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGcgcg > 2:236563/1‑149 (MQ=255) tcatcGGCGCACTCGGTATCGCTTACCTTGCGATGTACTTCAGCGAACATGGCTTCAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGcgcg > 1:340781/1‑149 (MQ=255) tcatcGGCGCACTCGGTATCGCTTACCTTGCGATGTACTTCAGCGAACATGGCTTCAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGcgcg < 2:40807/149‑1 (MQ=255) tcGGCGCACTCGGTATCGCTTACCTTGCGATGTACTTCAGCGAACATGGCTTCAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCgg > 2:149974/1‑147 (MQ=255) 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gTACTTCAGCGAACATGGCTTCAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGt > 2:218914/1‑144 (MQ=255) gTACTTCAGCGAACATGGCTTCAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGGCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGt < 1:218914/144‑1 (MQ=255) agtattcgtaaatgagtccgcccagaccggaattctccatcatcagttggatcccagcgtagaaggggaattgcaccagaataccggctgtacTGCGTGCTATCTGCGCGGCAGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTccc > 6:360377‑M1/94‑148 (MQ=255) ggCTTCAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGAAGTACTGCCGGAATTCTGGTGCAATTCCCCTTCAACGCTgg > 8:241518/1‑149 (MQ=255) gCTTCAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTggg < 2:340781/149‑1 (MQ=255) 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tCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATCCAACTGatgatg > 6:333133/1‑149 (MQ=255) aTACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATCCAACTGATGATGGAg > 5:66255/1‑149 (MQ=255) tACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATCCAACTGATGATGGAg > 3:310144/1‑148 (MQ=255) aCCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATCCAACTGATGATGGAGCa > 5:62448/1‑149 (MQ=255) tCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCt < 7:102513/114‑1 (MQ=255) tCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCt > 8:102513/1‑114 (MQ=255) tCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATCCAACTGATGATGGAGCATTcc > 4:1702/1‑149 (MQ=255) aaCCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATCCAACTGATGATGGAGCATTCCgg > 7:386310/1‑149 (MQ=255) ccTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATCCAACTGATGATGGAGCATTCCGGTc < 7:241518/149‑1 (MQ=255) ccTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATCCAACTGATGATGGAGCATTCCGGTc > 4:265724/1‑149 (MQ=255) cTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATCCAACTGATGATgg < 8:193406/136‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) aTAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATCCAACTGATGATGGAGCATTCCGGTCTGGGCGGACTCATTACCGAATTCTTCATCAAt < 2:8516/149‑1 (MQ=255) aaCGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATCCAACTGATGATGGAGCATTCCGGTCTg < 4:20012/115‑1 (MQ=255) aaCGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATCCAACTGATGATGGAGCATTCCGGTCTg > 3:20012/1‑115 (MQ=255) aaCGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATCCAACTGATGATGGAGCATTCCGGTCTGGGCGGACTCATTACCGAATTCTTCATCACTGTTg < 2:260013/149‑1 (MQ=255) aaCGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATCCAACTGATGATGGAGCATTCCGGTCTGGGCGGACTCATTACCGAATTCTTCATCAATGTTg > 4:342913/1‑149 (MQ=255) cGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATCCAACTGATGATGGAGCATTCCGGTCTGGGCGGACTCATTACCGAATTCTTCATCAATGTTGCg < 5:230139/149‑1 (MQ=255) cGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATCCAACTGATGATGGAGCATTCCGGTCTGGGCGGACTCATTACCGAATTCTTCATCAATGTTGCg < 4:310144/149‑1 (MQ=255) aaTGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATCCAACTGATGATGGAGCATTCCGGTCTGGGCGGACTCATTACCGAATTCTTCATCAATGTTGCGAACa < 5:333133/149‑1 (MQ=255) tGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATCCAACTGATGATGGAGCATTCCGGTCTGGGCGGACTCATTACCGAATTCTTCATCAATGTTGCGAACaaa < 7:256996/149‑1 (MQ=255) tGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATCCAACTGATGATGGAGCATTCCGGTCTGGGCGGACTCATTACCGAATTCTTCATCAATGTTGCGAACa > 1:102523/1‑147 (MQ=255) cggcgcatacGCGTGCCAGCACCGCGGCAGCACGCAGTACTGCCGGGACGCCGCCGCCCACCCCCCTCTCCGCAGGCATCCAACTCATCCTGGAGCACTCCCGTCCGGGCGGACTCATTACCGACTTCTTCATCAATCTCGCGAACaaa < 8:386310/143‑1 (MQ=255) gCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATCCAACTGATGATGGAGCATTCCGGTCTGGGCGGACTCATTACCGAATTCTTCATCAATGTTGCGAACAAAGa > 8:250181/1‑149 (MQ=255) gCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATCCAACTGATGATGGAGCATTCCGGTCTGGGCGGACTCATTACCGAATTCTTCATCAATGTTGCGAACAAAGa > 5:306489/1‑149 (MQ=255) ttATATGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATCCAACTGATGATGGAGCATTCCGGTCTGGGCGGACTCATTACCGAATTCTTCATCAATGTTGCGAACAAAGaca > 6:353473/1‑149 (MQ=255) tataTGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATCCAACTGATGATGGAGCATTCCGGTCTGGGCGGACTCATTACCGAATTCTTCATCAATGTTGCGAACAAAGacac > 2:311452/1‑149 (MQ=255) atatGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATCCAACTGATGATGGAGCATTCCGGTCTGGGCGGACTCATTACCGAATTCTTCATCAATGTTGCGAACAAAGACAcc > 6:11886/1‑149 (MQ=255) | GCATTCTGACGTTGATCATCGGCGCACTCGGTATCGCTTACCTTGCGATGTACTTCAGCGAACATGGCTTCAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATCCAACTGATGATGGAGCATTCCGGTCTGGGCGGACTCATTACCGAATTCTTCATCAATGTTGCGAACAAAGACACC > NC_000913/2325486‑2325778 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |