New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 4287069 | 97 (1.070) | 4 (0.050) | 4/252 | NT | 3.9% | coding (303/1959 nt) | acs | acetyl‑CoA synthetase |
? | NC_000913 | = 4287100 | 104 (1.180) | coding (272/1959 nt) | acs | acetyl‑CoA synthetase | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
CGCAACCGCGGCTTCCGGCACCATCGGCATATAAATCGCCACCACATCACCTTTTTTAATGCCCAGCTCGAGCAGGGTATTGGCGAAGCGGCAGACGTCGCGGTGCAGCTCTTTATAGCTGATATGTTTGCTCTGGCTGGCGTCGTCGCCTTCCCAGATGATGGCGGTACGATCGCCGTTTTCTTGCAGATGGCGGTCAAGGCAGTTTGCCGCCAGATTCAGCGTGCCGTCCTCGTACCATTTAATGGACACATTACCGGGGGCAAAGGAGGTGTTTTTCACCTTCTGG > NC_000913/4286928‑4287216 | cGCAACCGCGGCTTCCGGCACCATCGGCATATAAATCGCCACCACATCACCTTTTTTAATGCCCAGCTCGAGCAGGGTATTGGCGAAGCGGCAGACGTCGCGGTGCAGCTCTTTATAGCTGATATGTTTGCTCTGGCTGGCGTCGTCGc > 5:2304/1‑149 (MQ=255) aaCCGCGGCTTCCGGCACCATCGGCATATAAATCGCCACCACATCACCTTTTTTAATGCCCAGCTCGAGCAGGGTATTGGCGAAGCGGCAGACGTCGCGGTGCAGCTCTTTATAGCTGATATGTTTGCTCTGGCTGGCGTCGTCGCCtt < 1:348580/149‑1 (MQ=255) aCCGCGGCTTCCGGCACCATCGGCATATAAATCGCCACCACATCACCTTTTTTAATGCCCAGCTCGAGCAGGGTATTGGCGAAGCGGCAGACGTCGCGGTGCAGCTCTTTATAGCTGATATGTTTGCTCTGGCTGGCGTCGTCGCCTTc < 8:327980/149‑1 (MQ=255) ccGCGGCTTCCGGCACCATCGGCATATAAATCGCCACCACATCACCTTTTTTAATGCCCAGCTCGAGCAGGGTATTGGCGAAGCGGCAGACGTCGCGGTGCAGCTCTTTATAGCTGATATGTTTGCTCTGGCTGGCGTCGTCGCCTTcc < 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gCACCATCGGCATATAAATCGCCACCACATCACCTTTTTTAATGCCCAGCTCGAGCAGGGTATTGGCGAAGCGGCAGACGTCGCGGTGCAGCTCTTTATAGCTGATATGTTTGCTCTGGCTGGCgtcgtc < 2:95311/130‑1 (MQ=255) gCACCATCGGCATATAAATCGCCACCACATCACCTTTTTTAATGCCCAGCTCGAGCAGGGTATTGGCGAAGCGGCAGACGTCGCGGTGCAGCTCTTTATAGCTGATATGTTTGCTCTGGCTGGCGTCGTCGCCTTCCAAGATGATGGCg > 7:165226/1‑149 (MQ=255) cATCGGCATATAAATCGCCACCACATCACCTTTTTTAATGCCCAGCTCGAGCAGGGTATTGGCGAAGCGGCAGACGTCGCGGTGCAGCTCTTTATAGCTGATATGTTTGCTCTGGCTGGCGTCGTCGCCTTCCCAGATGATGGCGGTAc > 4:149148/1‑149 (MQ=255) cATCGGCATATAAATCGCCACCACATCACCTTTTTTAATGCCCAGCTCGAGCAGGGTATTGGCGAAGCGGCAGACGTCGCGGTGCAGCTCTTTATAGCTGATATGTTTGCTCTGGCTGGCGTCGTCGCCTTCCCAGATGATGGCGGTAc > 3:168839/1‑149 (MQ=255) gCATATAAATCGCCACCACATCACCTTTTTTAATGCCCAGCTCGAGCAGGGTATTGGCGAAGCGGCAGACGTCGCGGTGCAGCTCTTTATAGCTGATATGTTTGCTCTGGCTGGCGTCGTCGCCTTCCCAGATGATGGCGGTACGATcg < 6:268889‑M2/149‑3 (MQ=255) atatAAATCGCCACCACATCACCTTTTTTAATGCCCAGCTCGAGCAGGGTATTGGCGAAGCGGCAGACGTCGCGGTGCAGCTCTTTATAGCTGATATGTTTGCTCTGGCTGGCGTCGTCGCCTTCCCAGATGATGGCGGTACGATcgcc > 6:2304‑M2/1‑145 (MQ=255) atatAAATCGCCACCACATCACCTTTTTTAATGCCCAGCTCGAGCAGGGTATTGGCGAAGCGGCAGACGTCGCGGTGCAGCTCTTTATAGCTGATATGTTTGCTCTGGCTGGCGTCGTCGCCTTCCCAGATGATGGCGGTACGATcgcc < 1:201087‑M2/149‑5 (MQ=255) tataAATCGCCACCATATCACCTTTTTTAATGCCCAGCTCGAGCAGGGTATTGGCGAAGCGGCAGACGTCGCGGTGCAGCTCTTTATAGCTGATATGTTTGCTCTGGCTGGCGTCGTCGCCTTCCCAGATGATGGCGGTTCGATCGCCg > 1:166596/1‑149 (MQ=255) tataAATCGCCACCACATCACCTTTTTTAATGCCCAGCTCGAGCAGGGTATTGGCGAAGCGGCAGACGTCGCGGTGCAGCTCTTTATAGCTGATATGTTTGCTCTGGCTGGCGTCGTCGCCTTCCCAGATGATGGCGGTACGATCGCCg > 4:351154/1‑149 (MQ=255) ataAATCGCCACCACATCACCTTTTTTAATGCCCAGCTCGAGCAGGGTATTGGCGAAGCGGCAGACGTCGCGGTGCAGCTCTTTAAAGCTGATATGTTTGCTCTGGCTGGCGTCGTCGCCTTCCCAGATGATGGCGGTACGATCGCCGt > 6:89657/1‑149 (MQ=255) ttaaTCGCCACCACATCACCTTTTTTAATGGCCAGCTCGAGCAGGGTATTGGCGCAGCGGCAGACGTCGCGGTGCAGGTCTTTATAGCTGAGATGTTTGCTCTGGCTGGCGTCGTCGCCTTCCCAGATGATGGCGGTACGATCGCCGt < 6:15182/146‑1 (MQ=255) taAATCGCCACCACATCACCTTTTTTAATGCCCAGCTCGAGCAGGGTATTGGCGAAGCGGCAGACGTCGCGGTGCAGCTCTTTATAGCTGATATGTTTGCTCTGGCTGGCGTCGTCGCCTTCCCAGATGATGGCGGTACGATCGCCGt < 1:94656/148‑1 (MQ=255) aaaTCGCCACCACATCACCTTTTTTAATGCCCAGCTCGAGCAGGGTATTGGCGAAGCGGCAGACGTCGCGGTGCAGCTCTTTATAGCTGATATGTTTGCTCTGGCTGGCGTCGTCGCCTTCCCAGATGATGGCGGTACGATCGCCGttt > 6:159782/1‑149 (MQ=255) aaaTCGCCACCACATCACCTGTTTTAATGCCCAGCTCGAGCAGGGTATTGGCGAAGCGGCAGACGTCGCGGTGCAGCTCTTTATAGCTGATATGTTTGCTCTGGCTGGCGTCGTCGCCTTCCCAGATGATGGCGGTACGATCGCCGttt > 6:262255/1‑149 (MQ=255) aaTCGCCACCACATCAGCTTTTTTAATGCCCAGCTCGAGCCGGGTATTGGCGAAGCGGCAGACGTCGCGGTGCATCTCTTTATAGCTGATATGTTTGCTCTGGCTGGCGatcgtaccgccatcatctgggaaggcgacgacgccagcc < 5:36359‑M1/148‑40 (MQ=255) 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cTTTTTTAATGCCCAGCTCGAGCAGGGTATTGTCGAAGCGGCAGACGTCGCGGTGCAGCTCTTTATAGCTGATATGTTTGCTCTGGCTGGCGTCGTCGCCTTCCCAGATGATGGCGGTACGATCGCCGTGATCTTGCAGATGGAGGTc > 8:333977/1‑148 (MQ=255) ttttttAATGCCCAGCTCGAGCAGGGTATTGGCGAAGCGGCAGACGTCGCGGTGCAGCTCTTTATAGCTGATATGTTTGCTCTGGCTGGCGTCGTCGCCTTCCCAGATGATGGCGGTACGATCGCCGTTTTCTTGCAGATGGCGGTc > 8:548/1‑147 (MQ=255) tttttAATGCCCAGCTCGAGCAGGGTATTGGCGAAGCGGCAGACGTCGCGGTGCAGCTCTTTATAGCTGATATGTTTGCTCTGGCTGGCGTCGTCGCCTTCCCAGATGATGGCGGTACGATCGCCGTTTTCTTGCAGATGGCGGTCAAg > 4:368655/1‑149 (MQ=255) ccAGCTCGAGCAGGGTATTGGCGAAGCGGCAGACGTCGCGGTGCAGCTCTTTATAGCTGATATGTTTGCTCTGGCTGGCGTCGTCGCCTTCCCAGATGATGGCGGTACGATCGCCGTTTTCTTGCAGATGGCGGTCAAGGCAGTTTgcc > 8:268176/1‑149 (MQ=255) ccAGCTCGAGCAGGGTATTGGCGAAGCGGCAGACGTCGCGGTGCAGCTCTTTATAGCTGATATGTTTGCTCTGGCTGGCGTCGTCGCCTTCCCAGATGATGGCGGTACGATCGCCGTTTTCTTGCAGATGGCGGTCAAGGCAGTTTgcc > 3:68123/1‑149 (MQ=255) aGCTCGAGCAGGGTATTGGCGAAGCGGCAGACGTCGCGGTGCAGCTCTTTATAGCTGATATGTTTGCTCTGGCTGGCGTCGTCGCCTTCCCAGATGATGGCGGTACGATCGCCGtt > 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tatGTTTCCTCTGGCTGGCGTCGTCGCCTTCCCAGATGATGGCGGTACGATCGCCGTTTTCTTGCAGATGGCGGTCAAGGCAGTTTGCCGCAAGATTCAGCGTGCCGTCCTCGTACCATTTAATGGACACATTACCGGGGGCAAaggag > 4:157384/1‑149 (MQ=255) tttGCTCTGGCTGGCGTCGTCGCCTTCCCAGATGATGGCGGTACGATCGCCGTTTTCTTGCAGATGGCGGTCAAGGCAGTTTGCCGCCAGATTCAGCGTGCCGTCCTCGTACCATTTAATGGACACATTACCGGGGGCAAAGGAGgtgt > 6:37170/1‑149 (MQ=255) ttGCTCTGGCTGGCGTCGTCGCCTTCCCAGATGATGGCGGTACGATCGCCGTTTTCTTGCAGATGGCGGTCAAGGCAGTTTGCCGCCAGATTCAGCGTGCCGTCCTCGTACCATTTAATGGACACATTACCGGGGGCAAAGGAGGTGtt > 5:2781/1‑149 (MQ=255) tctGGCTGGCGTCGTCGCCTTCCCAGATGATGGCGGTACGATcgccagccagagcaaacatatcagctataaagagctgcaccgcgacgtctgccgcttcgccaataccctgctcgagctgggcattaaaaaaggtgatgtggtggcga < 2:206344‑M2/149‑108 (MQ=255) tctGGCTGGCGTCGTCGCCTTCCCAGATGATGGCGGTACGATCGCCGTTTTCTTGCAGATGGCGGTCAAGGCAGTTTGCCGCCAGATTCAGCGTGCCGTCCTCGTACCATTTAATGGACACATTACCGGGGGCAAAGGAGGTGttttt > 7:330532/1‑148 (MQ=255) tggctggcGTCGTCGCCTTCCCAGATGATGGCGGTACGATcgccagccagagcaaacatatcagctataaagagctgcaccgcgacgtctgccgcttcgccaataccctgctcgagctgggcattaaaaaaggtgatgtggtggcgatt < 7:181402‑M2/149‑110 (MQ=255) tggctggcGTCGTCGCCTTCCCAGATGATGGCGGTACGATCGCCGTTTTCTTGCAGATGGCGGTCAAGGCAGTTTGCCGCCAGATTCAGCGTGCCGTCCTCGTACCATTTAATGGACACATTACCGGGGGCAAAGGAGGTGTTTTTCa > 4:98812/1‑148 (MQ=255) tggctggcGTCGTCGCCTTCCCAGATGATGGCGGTACGATCGCCGGTTTCTTGCAGATGGCGGTCAAGGCAGTTTGCCGCCAGATTCAGCGTGCCGTCCTCGTACCATTTAATGGACACATTACCGGGGGCAAAGGAGGTGTTTTTc < 6:43589/147‑1 (MQ=255) ggctggcGTCGTCGCCTTCCCAGATGATGGCGGTACGATcgccagccagagcaaacatatcagctataaagagatgcaccgcgacgtctgccgcttcgccaatacccggctcgagctgggcattaaaaaagctgatgtggtggcgatt < 5:36359‑M2/148‑110 (MQ=255) gctggcGTCGTCGCCTTCCCAGATGATGGCGGTACGATCGCCGTTTTCTTGCAGATGGCGGTCAAGGCAGTTTGCCGCCAGATTCAGCGTGCTGTCCTCGTACCATTTAATGGACACATTACCGGGGGCAAAGGAGGTGTTTTTCACCt > 2:272840/1‑149 (MQ=255) gctggcGTCGTCGCCTTCCCAGATGATGGCGGTACGATCGCCGTTTTCTTGCAGATGGCGGTCAAGGCAGTTTGCCGCCAGATTCAGCGTGCCGTCCTCGTACCATTTAATGGACACATTACCGGGGGCAAAGGAGGTGTTTTTCa < 5:89657/146‑1 (MQ=255) gctggcGTCGTCGCCTTCCCAGATGATGGCGGTACGATCGCCGTTTTCTTGCAGATGGCGGTCAAGGCAGTTTGCCGCCAGATTCAGCGTGCCGTCCTCGTACCATTTAATGGACACATTACCGGGGGCAAAGGAGGTGTTTTTCa < 4:269877/146‑1 (MQ=255) ggcGatcgtaccgccatcatctgggaaggcgacgacgccagccagagcaaacatatcagctataaagagctgcaccgcgacgtctgccgcttcgccaataccctgctcgagctgggcattaaaaaaggtgatgtggtggcgatttatat < 1:201087‑M1/149‑146 (MQ=255) ggcGatcgtaccgccatcatctgggaaggcgacgacgccagccagagcaaacatatcagctataaagagctgcaccgcgacgtctgccgcttcgccaataccctgctcgagctgggcattaaaaaaggtgatgtggtggcgatttatat > 6:2304‑M1/1‑4 (MQ=255) gcGTCGTCGCCTTCCCAGATGATGGCGGTACGATCGCCGTTTTCTTGCAGATGGCGGTCAAGGCAGTTTGCCGCCAGATTCAGCGTGCCGTCCTCGTACCATTTAATGGACACATTACCGGGGGCAAAGGAGGTGTTTTTCACCTTc < 8:330532/147‑1 (MQ=255) cGatcgtaccgccatcatctgggaaggcgacgacgccagccagagcaaacatatcagctataaagagctgcaccgcgacgtctgccgcttcgccaataccctgctcgagctgggcattaaaaaaggtgatgtggtggcgatttatatgc < 6:268889‑M1/149‑148 (MQ=255) gtcgtcGCCTTCCCAGATGATGGCGGTACGATCGCCGTTTTCTTGCAGATGGCGGTCAAGGCAGTTTGCCGCCAGATTCAGCGTGCCGTCCTCGTACCATTTAATGGACACATTACCGGGGGCAAAGGAGGTGttt > 5:411416/1‑136 (MQ=255) gtcgtcGCCTTCCCAGATGATGGCGGTACGATCGCCGTTTTCTTGCAGATGGCGGTCAAGGCAGTTTGCCGCCAGATTCAGCGTGCCGTCCTCGTACCATTTAATGGACACATTACCGGGGGCAAAGGAGGTGttt < 6:411416/136‑1 (MQ=255) gtcgtcGCCTTCCCAGATGATGGCGGTACGATCGCCGTTTTCTTGCAGATGGCGGTCAAGGCAGTTTGCCGCCAGATTCAGCGTGCCGTCCTCGTACCATTTAATGGACACATTACCGGGGGCAAAGGAGGTGTTTTTCACCTTCTgg > 6:242107/1‑148 (MQ=255) | CGCAACCGCGGCTTCCGGCACCATCGGCATATAAATCGCCACCACATCACCTTTTTTAATGCCCAGCTCGAGCAGGGTATTGGCGAAGCGGCAGACGTCGCGGTGCAGCTCTTTATAGCTGATATGTTTGCTCTGGCTGGCGTCGTCGCCTTCCCAGATGATGGCGGTACGATCGCCGTTTTCTTGCAGATGGCGGTCAAGGCAGTTTGCCGCCAGATTCAGCGTGCCGTCCTCGTACCATTTAATGGACACATTACCGGGGGCAAAGGAGGTGTTTTTCACCTTCTGG > NC_000913/4286928‑4287216 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |