Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,353,935 | G→A | 5.9% | R430H (CGT→CAT) | glpA → | anaerobic sn‑glycerol‑3‑phosphate dehydrogenase, large FAD/NAD(P)‑binding subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,353,935 | 0 | G | A | 5.9% | 214.7 / 2.4 | 67 | R430H (CGT→CAT) | glpA | anaerobic sn‑glycerol‑3‑phosphate dehydrogenase, large FAD/NAD(P)‑binding subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (32/31); new base A (2/2); total (34/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.53e-01 |
TGCCGATCTGGCACTGCCTGGTTCACAAGAACCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAATAGCCTGCTGGATTTACGCCGTCGTACCCGTGTGGGGATGGGCACCTGCCAGGGCGAACTCTGCGCCTGCCGC > NC_000913/2353789‑2354080 | tGCCGATCTGGCACTGCCTGGTTCACAAGAACCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCg > 4:325347/1‑147 (MQ=255) ccGATCTGGCACTGCCTGGTTCACAAGAACCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGc > 2:416124/1‑149 (MQ=255) gATCTGGCACTGCCTGGTTCACAAGAACCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCt > 1:130588/1‑149 (MQ=255) tGGCACTGCCTGGTTCACAAGAACCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTa > 7:128915/1‑149 (MQ=255) cACTGCCTGGTTCACAAGAACCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTAtgt < 5:330350/149‑1 (MQ=255) cACTGCCTGGTTCACAAGAACCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTAtgt < 7:313592/149‑1 (MQ=255) aCTGCCTGGTTCACAAGAACCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTAtgt > 3:370067/1‑148 (MQ=255) cTGCCTGGTTCACAAGAACCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGa < 8:71495/149‑1 (MQ=255) tGCCTGGTTCACAAGAACCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAg > 7:150973/1‑149 (MQ=255) gCCTGGTTCACAAGAACCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGa < 7:30724/147‑1 (MQ=255) gCCTGGTTCACAAGAACCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGa > 8:30724/1‑147 (MQ=255) ccTGGTTCACAAGAACCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTa < 7:46276/133‑1 (MQ=255) ccTGGTTCACAAGAACCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTa > 8:46276/1‑133 (MQ=255) gTTCACAAGAACCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGaa < 8:389697/149‑1 (MQ=255) ttCACAAGAACCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAg < 6:7913/149‑1 (MQ=255) caAGAACCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGt < 3:18920/149‑1 (MQ=255) caAGAACCCGCCGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCgg > 8:176172/1‑148 (MQ=255) aaGAACCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGt > 8:121473/1‑148 (MQ=255) cccGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGc < 4:370067/149‑1 (MQ=255) cccGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGc > 2:9509/1‑149 (MQ=255) ccGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCg < 5:187136/149‑1 (MQ=255) cGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCCCCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCgg > 4:141727/1‑149 (MQ=255) cGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCgg > 2:54427/1‑149 (MQ=255) cGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCgg < 8:128915/149‑1 (MQ=255) cGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCACGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCt > 1:224514/1‑120 (MQ=255) cGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCACGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCt < 2:224514/120‑1 (MQ=255) ttACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTg < 7:176172/149‑1 (MQ=255) ttACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTg < 2:130588/149‑1 (MQ=255) ttACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTg < 1:416124/149‑1 (MQ=255) ttACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTg > 2:372092/1‑149 (MQ=255) tAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCgg < 8:125826/149‑1 (MQ=255) tAAAGTCAACTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCgg > 2:36771/1‑149 (MQ=255) tCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGa > 2:236082/1‑148 (MQ=255) tcCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCg > 7:290496/1‑111 (MQ=255) tcCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCg < 8:290496/111‑1 (MQ=255) cctgcctgCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTa < 3:325347/148‑1 (MQ=255) cctgcctgCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGG‑TTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTaaa < 4:200677/149‑1 (MQ=255) gcctgccCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACg > 2:263663/1‑149 (MQ=255) cctgccCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTTTCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGGATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGt > 3:209514/1‑149 (MQ=255) ccccGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGTCGATCGCACGCCTGACTGGCTGAGCGAAGGCCGTATGCAACGTAGCCTGTTATGTTAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAAt < 3:370948/149‑1 (MQ=255) gcgGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAATAGCctgctg > 1:382705/1‑149 (MQ=255) gTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCTCGCCTGCCTGGCTGAGCGTAGGCCGTCTGCACCGTAGCGTGGTATGTGAGTGGGAAGCGGTAAGTGCGGGTTAAGTTGAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAATAGCCTGCTGGAt < 1:36771/149‑1 (MQ=255) cTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAATAGCCTGCTGGAttt < 7:47224/148‑1 (MQ=255) tGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCATAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAATAGCctgct < 4:240770/141‑1 (MQ=255) tGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCATAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAATAGCctgct > 3:240770/1‑141 (MQ=255) tGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCATAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAATAGCctgct < 2:344705/141‑1 (MQ=255) tGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCATAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAATAGCctgct > 1:344705/1‑141 (MQ=255) cGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAATAGCCTGCTGGATTTACGc > 4:132891/1‑149 (MQ=255) gTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAATAGCCTGCTGGATTTACGCcg < 1:372092/149‑1 (MQ=255) tCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAATAGCCTGCTGGATTTACGCCGTCGTa > 4:286538/1‑149 (MQ=255) gTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAATAGCCTGCTGGATTTACGCCGTCGTAcc > 8:41826/1‑149 (MQ=255) tCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAAc > 1:317753/1‑115 (MQ=255) tCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAAc < 2:317753/115‑1 (MQ=255) tCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAATAGCCTGCTGGATTTACGCCGTCGTAccc > 6:303515/1‑149 (MQ=255) aTGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGACGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGGATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAATAGCCTGCTGGATTTACGCCGTCGTACCCgt > 2:354376/1‑149 (MQ=255) gCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAATAGCCTGCTGGATTTACGCCGTCGTACCCGTGTGGGGATg > 8:159736/1‑149 (MQ=255) gCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAATAGCCTGCTGGATTTACGCCGTCGTACCCGTGTGGGGATg < 5:303515/149‑1 (MQ=255) aCGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAATAGCCTGCTGGATTTACGCCGTCGTACCCGTGTGGGGATggg < 7:121473/149‑1 (MQ=255) gcctgcctGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAATAGCCTGCTGGATTTACGCCGTCGTACCCGTGTGGGGATGGGCa > 1:323581/1‑149 (MQ=255) ggCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGATAATTTAAACGGTAATAGCCTGCTGGATTTACGCCGTCGTACCCGTGTGGGGATGGGCACCTGCCAg > 3:377878/1‑149 (MQ=255) gCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAATAGCCTGCTGGATTTACGCCGTCGTACCCGTGTGGGGATGGGCACCTGCCa < 8:150973/147‑1 (MQ=255) gCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAATAGCCTGCTGGATTTACGCCGTCGTACCCGTGTGGGGATGGGCACCTGCCAgg < 7:89038/149‑1 (MQ=255) gCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAATAGCCTGCTGGATTTACGCCGTCGTACCCGTGTGGGGATGGGCACCTGCCAgg < 3:132891/149‑1 (MQ=255) gCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAATAGCCTGCTGGATTTACGCCGTCGTACCCGTGTGGGGATGGGCACCTGCCAGGGCGaa < 2:323581/149‑1 (MQ=255) gCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAATAGCCTGCTGGATTTACGCCGTCGTACCCGTGTGGGGATGGGCACCTGCCAGGGCGAACTCTgc < 4:369200/149‑1 (MQ=255) gCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAATAGCCTGCTGGATTTACGCCGTCGTACCCGTGTGGGGATGGGCACCTGCCAGGGCGAACTCTgc > 3:369200/1‑149 (MQ=255) tCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAATAGCCTGCTGGATTTACGCCGTCGTACCCGTGTGGGGATGGGCACCTGCCAGGGCGAACTCTGCGCCt > 6:268613/1‑149 (MQ=255) aCCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAATAGCCTGCTGGATTTACGCCGTCGTACCCGTGTGGGGATGGGCACCTGCCAGGGCGCACTCTGCGCCTGCcgc > 6:236583/1‑149 (MQ=255) | TGCCGATCTGGCACTGCCTGGTTCACAAGAACCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAATAGCCTGCTGGATTTACGCCGTCGTACCCGTGTGGGGATGGGCACCTGCCAGGGCGAACTCTGCGCCTGCCGC > NC_000913/2353789‑2354080 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |