Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,234,855 | C→T | 5.4% | N366N (AAC→AAT) | pgi → | glucosephosphate isomerase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,234,855 | 0 | C | T | 5.4% | 293.5 / 4.3 | 93 | N366N (AAC→AAT) | pgi | glucosephosphate isomerase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (43/44); new base T (2/3); total (46/47) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.30e-01 |
GCTGATTGGCATCTGGTACAACAATTTCTTTGGTGCGGAAACTGAAGCGATTCTGCCGTATGACCAGTATATGCACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGTCAGCACGCGTTCTACCAGCTGATCCACCAGGGAACCAAAATGGTACCGTGCGATTTCATCGCTCCGGCTATCACCCATAACCCGCTCTCTGAT > NC_000913/4234711‑4235002 | gcTGATTGGCATCTGGTACAACAATTTCTTTGGTGCGGAAACTGAAGCGATTCTGCCGTATGACCAGTATATGCACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTtg < 5:413347/149‑1 (MQ=255) cTGATTGGCATCTGGTACAACAATTTCTTTGGTGCGGAAACTGAAGCGATTCTGCCGTATGACCAGTATATGCACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTtgt > 1:209895/1‑149 (MQ=255) ttGGCATCTGGTACAACAATTTCTTTGGTGCGGATACTGAAGCGATTCTGCCGTATGACCAGTATATGCACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCATGGCTATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGAt < 8:285706/149‑1 (MQ=255) gCATCTGGTACAACAATTTCTTTGGTGCGGAAACTGAAGCGATTCTGCCGTATGACCAGTATATGCACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAATGTTGTGGATTa < 2:194219/148‑1 (MQ=255) gCATCTGGTACAACAATTTCTTTGGTGCGGAAACTGAAGCGATTCTGCCGTATGACCAGTATATGCACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTAc > 1:115569/1‑149 (MQ=255) gCATCTGGTACAACAATTTCTTTGGTGCGGAAACTGAAGCGATTCTGCCGTATGACCAGTATATGCACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTAc > 4:350333/1‑149 (MQ=255) gCATCTGGTACAACAATTTCTTTGGTGCGGAAACTGAAGCGATTCTGCCGTATGACCAGTATATGCACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTAc < 4:270607/149‑1 (MQ=255) acaacaATTTCTTTGGTGCGGAAACTGAAGCGATTCTGCCGTATGACCAGTATATGCACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGc > 8:367488/1‑149 (MQ=255) acaacaATTTCTTTGGTGCGGAAACTGAAGCGATTCTGCCGTATGACCAGTATATGCACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGc > 8:264595/1‑149 (MQ=255) caacaaTTTCTTTGGTGCGGAAACTGAAGCGATTCTGCCGTATGACCAGTATATGCACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGcc < 5:389181/149‑1 (MQ=255) aacaaTTTCTTTGGTGCGGAAACTGAAGCGATTCTGCCGTATGACCAGTATATGCACCGTTTTGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGccc > 6:159468/1‑149 (MQ=255) aacaaTTTCTTTGGTGCGGAAACTGAAGCGATTCTGCCGTATGACCAGTATATGCACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGccc < 7:162891/149‑1 (MQ=255) acaaTTTCTTTGGTGCGGAAACTGAAGCGATTCTGCCGTATGACCAGTATATGCACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGccc > 3:243529/1‑148 (MQ=255) caaTTTCTTTGGTGCGGAAACTGAAGCGATTCTGCCGTATGACCAGTATATGCACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGa < 6:248838/149‑1 (MQ=255) cTTTGGTGCGGAAACTGAAGCGATTCTGCCGTATGACCAGTATATGCACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTtgt < 4:252377/123‑1 (MQ=255) tttGGTGAGGAAACTGAAGCGATTCTGCCGTATGACCAGTATATGCACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACAGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTg > 1:260289/1‑149 (MQ=255) tGGTGCGGAAACTGAAGCGATTCTGCCGTATGACCAGTATATGCACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTg < 7:264595/147‑1 (MQ=255) tGGTGCGGAAACTGAAGCGATTCTGCCGTATGACCAGTATATGCACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTg < 7:367488/147‑1 (MQ=255) tGGTGCGGAAACTGAAGCGATTCTGCCGTATGACCAGTATATGCACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTg < 6:180513/147‑1 (MQ=255) cGGAAACTGCAGCGATTCTGCCGTATGACCAGTATATGCACCGTGTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATCTGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGaa < 2:292896/149‑1 (MQ=255) cGGAAACTGAAGCGATTCTGCCGTATGACCAGTATATGCACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTgggg < 8:27631/145‑1 (MQ=255) cGGAAACTGAAGCGATTCTGCCGTATGACCAGTATATGCACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACCGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTgggg > 7:27631/1‑145 (MQ=255) aCTGAAGCGATTCTGCCGTATGACCAGTATATGCACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAgg > 8:420461/1‑149 (MQ=255) tGAAGCGATTCTGCCGTATGACCAGTATATGCACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCa > 5:121391/1‑149 (MQ=255) gAAGCGATTCTGCCGTATGACCAGTATATGCACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCAc > 6:188990/1‑149 (MQ=255) aaGCGATTCTGCCGTATGACCAGTATATGCACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCa < 4:203351/147‑1 (MQ=255) gCGATTCTGCCGTATGACCAGTATATGCACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAATGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTaa > 8:141321/1‑149 (MQ=255) gCGATTCTGCCGTATGACCAGTATATGCACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAATGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTaa > 4:14511/1‑149 (MQ=255) ttCTGCCGTATGACCAGTATATGCACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGt < 5:188990/149‑1 (MQ=255) ttCTGCCGTATGACCAGTATATGCACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGAATATCTGGGGTGAACCAGGCGCTAAAGGt > 6:89422/1‑149 (MQ=255) cTGCCGTATGACCAGTATATGCACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGTc < 3:350333/148‑1 (MQ=255) cTGCCGTATGACCAGTATATGCACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGTc < 1:187761/148‑1 (MQ=255) cTGCCGGATGACCAGTATATGCACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTCGGGTGAACCAGGCACTAACGGTc < 8:117119/148‑1 (MQ=255) ccGTATGACCAGTATATGCACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAATGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGTCAGc < 7:141321/148‑1 (MQ=255) ccGTATGACCAGTATATGCACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAATGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGTCAGc < 3:14511/148‑1 (MQ=255) ccGTATGACCAGTATATGCACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTgggg < 6:378311/125‑1 (MQ=255) ccGTATGACCAGTATATGCACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTgggg > 5:378311/1‑125 (MQ=255) ccGTATGACCAGTATATGCACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAgg > 5:84536/1‑134 (MQ=255) ccGTATGACCAGTATATGCACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAgg < 6:84536/134‑1 (MQ=255) ccGTATGACCAGTATATGCACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGGGAACCAGGCACTAACGGTCa < 8:409780/146‑1 (MQ=255) cGTATGACCAGTATATGCACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGTAGTAAAACGGTAAGTATGTTGACCGTAAAGGTAACCTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACTGTCAGAAc > 7:416119/1‑149 (MQ=255) tATGACCAGTATATGCACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGTCAGCAcgc < 4:243529/149‑1 (MQ=255) ccAGTATATGCACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGTCAGCACGCGTTCt < 2:115569/149‑1 (MQ=255) aGTATATGCACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGTCAGCACGCGTTCTAc < 6:121391/149‑1 (MQ=255) tataTGCACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCa < 6:285682/120‑1 (MQ=255) tatGCACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGTCAGCACGCGTTCTACCa < 2:396435/147‑1 (MQ=255) gCACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGATAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACCTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGCTTATCTGGGGTGCACCAGCCACTAACGGTCAGCACGCGTTCGACCAGCTGa > 6:338603/1‑149 (MQ=255) cACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTggg < 6:414226/106‑1 (MQ=255) cACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTggg > 5:414226/1‑106 (MQ=255) cACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGTCAGCACGCGTTCTACCAGCTGAt > 5:218289/1‑149 (MQ=255) cACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGTCAGCACGCGTTCTACCAGCTGAt > 1:404122/1‑149 (MQ=255) cccGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGCCTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGTCAGCACGCGTTCTACCAGCTGATc < 7:392522/148‑1 (MQ=255) aCCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAAAGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGCACCAGGCACTAACGGTCAGCACGCGTTATACCAGCAGAta > 4:35498/1‑148 (MQ=255) tCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGTCAGCACGCGTTCTACCAGCTGATccacca < 2:260289/148‑1 (MQ=255) cgcgGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGTCAGCACGCGTTCTACCAGCTGATCCACCAg < 7:420461/148‑1 (MQ=255) ggcgTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACAGTAACGGTAACGGTGTGTATTTCCAGCCTGGCCCGATTATCTGGGGTGCACCAGGCCCTAACGGTCCGCACGCGTTCTACCAGCTGATCCACCAGGGaa > 7:291890/1‑149 (MQ=255) cTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGTCAGCACGCGTTCTACCAGCTGATCCACCAGGGAACCaaaa > 1:328437/1‑149 (MQ=255) cTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGTCAGCACGCGTTCTACCAGCTGATCCACCAGGGAACCaaaa > 4:205833/1‑149 (MQ=255) cTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGTCAGCACGCGTTCTACCAGCTGATCCACCAGGGAACCaaaa < 1:65976/149‑1 (MQ=255) ttCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGCCTGGCCCGATTATCTGGGGAGAACCAGGCACTAACGTTCAGCACGCGTTCTACCAGCTGATCCACCAGGGAACCAAAAt > 6:83010/1‑149 (MQ=255) ttCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGTCAGCACGCGTTCTACCAGCTGATCCACCAGGGAACCAAAAt > 8:326697/1‑149 (MQ=255) ttCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGTCAGCACGCGTTCTACCAGCTGATCCACCAGGGAACCAAAAt > 1:326573/1‑149 (MQ=255) ttCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGTCAGCACGCGTTCTACCAGCTGATCCACCAGGGAACCAAAAt > 3:328380/1‑149 (MQ=255) cagGGCAATATGGAGGCCAACGGTAAGTATGGTGACCGTACCGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGACTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGTCAGCACGCGTTCTACCAGCTGATCCACCAGGGAACCAAAATGGTAcc < 5:89422/149‑1 (MQ=255) tGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGTCAGCCCGCGTTCTACCAGCTGATCCACCAGGGAACCAAAATGGTACCGTGCGAttt > 6:308445/1‑148 (MQ=255) ggAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGAc > 5:353021/1‑54 (MQ=255) ggAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGAc < 6:353021/54‑1 (MQ=255) gAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCATACTGGCACGATTATCTGGGGTGAACAATGAACTAACGGTCAGCACGCGTTCTACCAGCTGATCCACCAGGGAACCAAAATGGTACCGTGCGATTTCAt < 1:121172/149‑1 (MQ=255) gAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGCCTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGTCAGCACGCGTTCTACCAGCTGATCCACCAGGGAACCAAAATGGTACCGTGCGATTTCAt < 7:199026/149‑1 (MQ=255) aGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAAAGTTTTGTATTACCATACTTGCACGATTATCTGGGTTTAACCAGGAACTAACGGTCAGAACTCGTTCTAACAGCTGATACACCAGGGAACCAAAATGGTACCGTGCGATTTCATc > 3:246598/1‑149 (MQ=255) gTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGTCAGCACGCGTTCTACCAGCTGATCCACCAGGGAACCAAAATGGTACCGTGCGAt > 6:106194/1‑142 (MQ=255) gTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGTCAGCACGCGTTCTACCAGCTGATCCACCAGGGAACCAAAATGGTACCGTGCGAt < 5:106194/142‑1 (MQ=255) tCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGTCAGCACGCGTTCTACCAGCTGATCCACCAGGGAACCAAAATGGTACCGTGCGATTTCATCGc > 4:174893/1‑149 (MQ=255) cAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGTCAGCACGCGTTCTACCAGCTGATCCACCAGGGAACCAAAAt < 1:216156/126‑1 (MQ=255) cAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGTCAGCACGCGTTCTACCAGCTGATCCACCAGGGAACCAAAAt > 2:216156/1‑126 (MQ=255) cAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGTCAGCACGCGTTCTACCAGCTGATCCACCAGGGAACCAAAATGGTACCGTGCGATTTCATCGCTc < 6:218289/149‑1 (MQ=255) cAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGTCAGCACGCGTTCTACCAGCTGATCCACCAGGGAACCAAAATGGTACCGTGCGATTTCATCGCTc > 5:260273/1‑149 (MQ=255) cAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGTCAGCACGCGTTCTACCAGCTGATCCACCAGGGAACCAAAATGGTACCGTGCGATTTCATCGCTc > 7:1159/1‑149 (MQ=255) aCGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGTCAGCACGCGTTCTACCAGCTGATCCACCAGGGa > 7:179815/1‑116 (MQ=255) aCGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGTCAGCACGCGTTCTACCAGCTGATCCACCAGGGa < 8:179815/116‑1 (MQ=255) cGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGTCAGCACGCGTTCTACCAGCTGGTCCACCAGGGAACCAAAATGGTACCGTGCGATTTCATCGCTCCgg > 1:216002/1‑149 (MQ=255) cGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGTCAGCACGCGTTCTACCAGCTGATCCACCAGGGAAc < 7:61406/117‑1 (MQ=255) cGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGTCAGCACGCGTTCTACCAGCTGATCCACCAGGGAAc > 8:61406/1‑117 (MQ=255) cGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGTCAGCACGCGTTCTACCAGCTGATCCACCAGGGAACCAAAATGGTACCGTGCGATTTCATCGCTCCgg < 2:209895/149‑1 (MQ=255) ggTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGTCAGCACGCGTTCTAc > 4:229336/1‑96 (MQ=255) aGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGTCAGCACGCGTTCTACCAGCTGATCCACCAGGGAACCAAAATGGTACCGTGCGATTTCATCGCTCCGGCTAt > 2:399115/1‑148 (MQ=255) gTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGTGTGAACCAGGCACTAACTGTCAGCACGCGGTCTACCAGCTGATCCACCAGGGAACCAAAATGGTACCGTGCGATTTCATCGCTCCGGCTATCa < 4:246598/149‑1 (MQ=255) ttGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGTCAGCACGCGTTCTACCAGCTGATCCACCAGGGAACCAAAATGGTACCGTGCGATTTCATCGCTCCGGCTAt > 5:302085/1‑142 (MQ=255) ttGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGTCAGCACGCGTTCTACCAGCTGATCCACCAGGGAACCAAAATGGTACCGTGCGATTTCATCGCTCCGGCTAt < 6:302085/142‑1 (MQ=255) tGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGTCAGCAcg > 2:95910/1‑77 (MQ=255) tGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGTCAGCAcg < 1:95910/77‑1 (MQ=255) aCCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGTCAGCACGCGTTCTACCAGCTGATCCACCAg > 7:401135/1‑98 (MQ=255) aCCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGTCAGCACGCGTTCTACCAGCTGATCCACCAg < 8:401135/98‑1 (MQ=255) ggtaacgTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGTCAGCACGCGTTCTACCAGCTGATCCACCAGGGAACCAAAATGGTACCGTGCGATTTCATCGCTCCGGCTATCACCCATAACCCGctcgc > 3:3984/1‑147 (MQ=255) acgTTGTGGATGACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGTCAGCACGCGGTCTACCAGCTGATCCACCAGGGAACCAAAATGGTACCGTGCGATTTCATCGCTCCGGCTATCACCCATAACCCGCTCTCTGat < 8:376277/149‑1 (MQ=255) | GCTGATTGGCATCTGGTACAACAATTTCTTTGGTGCGGAAACTGAAGCGATTCTGCCGTATGACCAGTATATGCACCGTTTCGCGGCGTACTTCCAGCAGGGCAATATGGAGTCCAACGGTAAGTATGTTGACCGTAACGGTAACGTTGTGGATTACCAGACTGGCCCGATTATCTGGGGTGAACCAGGCACTAACGGTCAGCACGCGTTCTACCAGCTGATCCACCAGGGAACCAAAATGGTACCGTGCGATTTCATCGCTCCGGCTATCACCCATAACCCGCTCTCTGAT > NC_000913/4234711‑4235002 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |