| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 4274423 | 73 (1.000) | 4 (0.060) | 3/254 | NT | 5.1% | coding (299/537 nt) | ssb | single‑stranded DNA‑binding protein |
| ? | NC_000913 | = 4274430 | 78 (1.120) | coding (306/537 nt) | ssb | single‑stranded DNA‑binding protein | |||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
GAACAGACTGAATGGCACCGCGTTGTGCTGTTCGGCAAACTGGCAGAAGTGGCGAGCGAATATCTGCGTAAAGGTTCTCAGGTTTATATCGAAGGTCAGCTGCGTACCCGTAAATGGACCGATCAATCCGGTCAGGATCGCTACACCACAGAAGTCGTGGTGAACGTTGGCGGCACCATGCAGATGCTGGGTGGTCGTCAGGGTGGTGGCGCTCCGGCAGGTGGCAATATCGGTGGTGGTCAGCCGCAGGGCGGTTGGGGTCAGCCTCAGCAGCCGCAGGGTGGCAATCAGTTCAGC > NC_000913/4274275‑4274571 | gAACAGACTGAATGGCACCGCGTTGTGCTGTTCGGCAAACTGGCAGAAGTGGCGAGCGAATATCTGCGTAAAGGTTCTCAGGTTTATATCGAAGGTCAGCTGCGTACCCGTAAATGGACCGATCAATCCGGTCAGGATCGCTACACCAC > 2:25802‑M1/1‑149 (MQ=255) aGACTGAATGGCACCGCGTTGTGCTGTTCGGCAAACTGGCAGAAGTGGCGAGCGAATATCTGCGTAAAGGTTCTCAGGTTTATATCGAAGGTCAGCTGCGTACCCGTAAATGGACCGATCAATCCGGTCAGGATCGCTACACCACAGaa < 8:71890/149‑1 (MQ=255) aGACTGAATGGCACCGCGTTGTGCTGTTCGGCAAACTGGCAGAAGTGGCGAGCGAATATCTGCGTAAAGGTTCTCAGGTTTATATCGAAGGTCAGCTGCGTACCCGTAAATGGACCGATCAATCCGGTCAGGATCGCTACACCACAGaa < 4:221715/149‑1 (MQ=255) gAATGGCACCGCGTTGTGCTGTTCGGCAATCTGGCAGAAGTGGCGAGCGAATATCTGCGTAAAGGTTCGCAGGTTTATATCGAAGGTCAGCTGCGTACACGTAAATGGACCGATCAATCCGGTCAGGATCGCTACACCACAGAAGTCgt < 3:89571‑M2/149‑3 (MQ=255) aaTGGCACCGCGTTGTGCTGTTCGGCAAACTGGCAGAAGTGGCGAGCGAATATCTGCGTAAAGGTTCTCAGGTTTATATCGAAGGTCAGCTGCGTACCCGTAAATGGACCGATCAATCCGGTCCGGATCGCTACCCCACAGAAGTCgtt < 2:336759‑M2/149‑4 (MQ=255) aaTGGCACCGCGTTGTGCTGTTCGGCAAACTGGCAGAAGTGGCGAGCGAATATCTGCGTAAAGGTTCTCAGGTTTATATCGAAGGTCAGCTGCGTACCCGTAAATGGACCGATCAATCCGGTCAGGATCGCTACACCACAGAAGTCgtg > 3:69687‑M2/1‑146 (MQ=255) aaTGGCACCGAGTTGTGCTGTTCGGCAAACTTGCAGAAGTGGCTAGCGAATATCTGCGTATAGGTTCTCAGGTTTATATCGAATGTCAGCTGCGTACCCGTAAATGGACCGATCAATCCGGTCAGGATCGCTACACCACAGAAGTCgtg > 2:278059‑M2/1‑146 (MQ=255) aTGGCACCGCGTTGTGCTGTTCGGCAAACTGGCAGAAGTGGCGAGCGAATATCTGCGTAAAGGTTCTCAGGTTTATATCGAAGGTCAGCTGCGTACCCGTAAATGGACCGATCAATCCGGTCAGGATCGCTACACCACAGAAGTCgtgg > 1:234576‑M2/1‑145 (MQ=255) aTGGCACCGCGTTGTGCTGTTCGGCAAACTGGCAGAAGTGGCGAGCGAATATCTGCGTAAAGGTTCTCAGGTTTATATCGAAGGTCAGCTGCGTACCCGTAAATGGACCGATCAATCCGGTCAGGATCGCTACACCACAGAAGTCgtgg > 5:185555‑M2/1‑145 (MQ=255) cACCGCGTTGTGCTGTTCGGCAAACTGGCAGAAGTGGCGAGCGAATATCTGCGTAAAGGTTCTCAGGTTTATATCGAAGGTCAGCTGCGTACCCGTAAATGGACCGATCAATCCGGTCAGGATCGCTACACCCCAGAAGTCGTGGTGaa > 2:136720/1‑149 (MQ=255) cACCGCGTTGTGCTGTTCGGCAAACTGGCAGAAGTGGCGAGCGAATATCTGCGTAAAGGTTCTCAGGTTTATATCGAAGGTCAGCTGCGTACCCGTAAATGGACCGATCAATCCGGTCAGGATCGCTACACCACgacttctgtggtgta < 1:25802‑M1/149‑16 (MQ=255) cACCGCGTTGTGCTGTTCGGCAAACTGGCAGAAGTGGCGAGCGAATATCTGCGTAAAGGTTCTCAGGTTTATATCGAAGGTCAGCTGCGTACCCGTAAATGGACCGATCAATCCGGTCAGGATCGCTACACCACgacttctgtggtgta < 1:317358‑M1/149‑16 (MQ=255) cgcgTTGTGCTGTTCGGCAAACTGGCAGAAGTGGCGAGCGAATATCTGCGTAAAGGTTCTCAGGTTTATATCGAAGGGCAGCTGCGTACCCGTAAATGGACCGATCAATCCGGTCAGGATCGCTACACCACAGAAGTCGTGGTGAACGt < 3:52500/149‑1 (MQ=255) 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aTCGCTACACCACAGAAGTCGTGGTGAACGTTGGCGGCACCATGCAGATGCTGGGTGGTCGTCAGGGTGGTGGCGCTCCGGCAGGTGGCAATATCGGTGGTGGTCAGCCGCAGGGCGGTTGGGGTCAGCCTca < 5:287260/133‑1 (MQ=255) aTCGCTACACCACAGAAGTCGTGGTGAACGTTGGCGGCACCATGCAGATGCTGGGTGGTCGTCAGGGTGGTGGCGCTCCGGCAGGTGGCAATATCGGTGGTGGTCAGCCGCAGGGCGGTTGGGGTCAGCCTca > 6:287260/1‑133 (MQ=255) tCGCTACACCACAGAAGTCGTGGTGAACGTTGGCGGCACCATGCAGATGCTGGGTGGTCGTCAGGGTGGTGGCGCTCCGGCAGGTGGCAATATCGGTGGTGGTCAGCCGCAGGGCGGTTGGGGTCAGCCTCAGCAGCCGCAGGGTGGc > 7:11918/1‑148 (MQ=255) cTACACCACAGAAGTCgtggtgtagcgatcctgaccggattgatcggtccatttacgg > 3:76107‑M2/1‑16 (MQ=255) cTACACCACAGAAGTCgtggtgtagcgatcctgaccggattgatcggtccatttacgg < 4:76107‑M2/58‑43 (MQ=255) cTACACCACAGAAGTCGTGGTGAACGTTGGCGGCACCATGCAGATGCTGGGTGGTCGTCAGGGTGGTGGCGCTCCGGCAGGTGGCAATATCGGTGGTGGTCAGCCGCAGGGCGGTTGGGGTCAGCCTCAGCAGCCGCAGGGTGGCAATc < 6:88222/149‑1 (MQ=255) cTACACCACAGAAGGCGTGGTGAACGTTGGCGGCACCATGCAGATGCTGGGTGGTCGTCAGGGTGGTGGCGCTCCGGCAGGTGGCAATATCGGTGGTGGTCAGCCGCAGGGCGGTTGGGGTCAGCCTCAGCAGCCGCAGGGTGGCAATc < 8:174836/149‑1 (MQ=255) tACACCACAGAAGTCgtggtgtagcgatcctgaccggattgatcggtccatttacgggtacgcagctgaccttcgatataaacctgagaacctttacgcagatattcgctcgccacttctgccagtttgccgaacagcacaacgcggtg < 1:317358‑M2/149‑135 (MQ=255) tACACCACAGAAGTCgtggtgtagcgatcctgaccggattgatcggtccatttacgggtacgcagctgaccttcgatataaacctgagaacctttacgcagatattcgctcgccacttctgccagtttgccgaacagcacaacgcggtg < 1:25802‑M2/149‑135 (MQ=255) acacCACAGAAGTCGTGGTGAACGTTGGCGGCACCATGCAGATGCTGGGTGGTCGTCAGGGTGGTGGCGCTCCGGCAGGTGGCAATATCGGTGGTGGTCAGCCGCAGGGCGGTTGGGGTCAGCCTCAGCAGCCGCAGGGTGGCAATCAg > 2:134001/1‑149 (MQ=255) caccacAGAAGTCGTGGTGAACGTTGGCGGCACCATGCAGATGCTGGGTGGTCGTCAGGGTGGTGGCGCTCCGGCAGGTGGCAATATCGGTGGTGGTCAGCCGCAGGGCGGTTGGGGTCAGCCTCAGCAGCCGCAGGGTGGCAATCAg < 2:64244/148‑1 (MQ=255) ccacgacttctgtggtgtagcgatcctgaccggattgatcggtccatttacgggtacgcagctgaccttcgatataaacctgagaacctttacgcagatattcgctcgccacttctgccagtttgccgaacagcacaacgcggtgccat > 5:185555‑M1/1‑4 (MQ=255) ccacgacttctgtggtgtagcgatcctgaccggattgatcggtccatttacgggtacgcagctgaccttcgatataaacctgagaacctttacgcagatattcgctcgccacttctgccagtttgccgaacagcacaacgcggtgccat > 1:234576‑M1/1‑4 (MQ=255) ccacAGAAGGCGTGGTGAACGTTGGCGGCACCATGCAGATGCTGGGTGGTCGTCAGGGTGGTGGCGCTCCGGCAGGTGGCAATATCGGTGGTGGTCAGCCGCAGGGCGGTTGGGGTCAGCCTCAGCAGCCGCAGGGTGGCAATCAGTTc < 1:21091/149‑1 (MQ=255) cacgacttctgtggtgtagcgatcctgaccggattgatcggtccatttacgggtacgcagctgaccttcgatataaacctgagaacctttacgcagatattcgctcgccacttctgccagtttgccgaacagcacaacgcggtgccatt > 3:69687‑M1/1‑3 (MQ=255) cacgacttctgtggtgtagcgatcctgaccggattgatcggtccatttacgggtacgcagctgacattcgatataaacctgagaacctatacgcagatattcgctagccacttctgcaagtttgccgaacagcacaactcggtgccatt > 2:278059‑M1/1‑3 (MQ=255) cacaGAAGTCGTGGTGAACGTTGGCGGCACCATGCAGATGCTGGGTGGTCGTCAGGGTGGTGGCGCTCCGGCAGGTGGCAATATCGGTGGTGGTCAGCCGCAGGGCGGTTGGGGTCAGCCTCAGCAGCCGCAGGGTGGCAATCAGTTCa < 1:165763/149‑1 (MQ=255) cacaGAAGTCGTGGTGAACGTTGGCGGCACCATGCAGAACCTGGGTGGACGTCAGGGTGGTGGCGCTCCGGCAGGTGGCAATATCGGTGGTGGTCAGCCGCAGGGCGGTTGGGGTCAGCCTCAGCAGCCGCAGGGTGGCAATCAGTTCa > 1:81155/1‑149 (MQ=255) cacaGAAGTCGTGGTGAACGTTGGCGGCACAATGCAGATGCTGGGTGGTCGTCAGGGTGGTGGCGCTCCGGCAGGTGGCAATATCGGTGGTGGTCAGCCGCAGGGCGGTTGGGGTCAGCCTCAGCAGCCGCAGGGTGGCAATCAGtt > 4:15537/1‑147 (MQ=255) aacgacttctgtggggtagcgatccggaccggattgatcggtccatttacgggtacgcagctgaccttcgatataaacctgagaacctttacgcagatattcgctcgccacttctgccagtttgccgaacagcacaacgcggtgccatt < 2:336759‑M1/148‑147 (MQ=255) acgacttctgtggtgtagcgatcctgaccggattgatcggtccatttacgtgtacgcagctgaccttcgatataaacctgcgaacctttacgcagatattcgctcgccacttctgccagattgccgaacagcacaacgcggtgccattc < 3:89571‑M1/149‑148 (MQ=255) acaGTAGTCGTGGTGAACGTTGGCGGCACCATGCAGATGCTGGGTGGTCGTCAGGGTGGTGGCGCTCCGGCAGGTGGCAATATCGGTGGTGGTCAGCCGCAGGGCGGTTGGGGTCAGCCTCAGCAGCCGCAGGGTGGCAATCAGTTCAg < 2:138184/149‑1 (MQ=255) acaGAAGTCGTGGTGAACGTTGGCGGCACCATGCAGATGCTGGGTGGTCGTCAGGGTGGTGGCGCTCCGGCAGGTGGCAATATCGGTGGTGGTCAGCCGCAGGGCGGTTGGGGTCAGCCTCAGCAGCCGCAGGGTGGCAATCAGTTCAg > 5:291720/1‑149 (MQ=255) cgacttctgtggtgtagcgatcctgaccggattgatcggtccatttacgggtacgcagctgaccttcgatataaacctgagaacctttacgcagatattcgctcgccacttctgccagtttgccgaacagcacaacgcggtgccattca < 4:290969‑M1/149‑149 (MQ=255) | GAACAGACTGAATGGCACCGCGTTGTGCTGTTCGGCAAACTGGCAGAAGTGGCGAGCGAATATCTGCGTAAAGGTTCTCAGGTTTATATCGAAGGTCAGCTGCGTACCCGTAAATGGACCGATCAATCCGGTCAGGATCGCTACACCACAGAAGTCGTGGTGAACGTTGGCGGCACCATGCAGATGCTGGGTGGTCGTCAGGGTGGTGGCGCTCCGGCAGGTGGCAATATCGGTGGTGGTCAGCCGCAGGGCGGTTGGGGTCAGCCTCAGCAGCCGCAGGGTGGCAATCAGTTCAGC > NC_000913/4274275‑4274571 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |