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cTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGAtgtg > 2:83453/1‑149 (MQ=255) tGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATgtgg > 8:52587/1‑149 (MQ=255) gATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAACACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTAtt > 6:116282/1‑110 (MQ=255) atatAGCTCAGTTGTTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATgtggt < 6:80462/148‑1 (MQ=255) aTAggcagattcgaactgccgacctcacccttaccaagggtgcgctctaccaactgagctatatcagcacatcttggagcgggcagcgggaatcgaacccgcatcatcagcttggaaggctgaggtaatagccattatacgatgcccg > 2:226753‑M1/1‑3 (MQ=255) aTAggcagattcgaactgccgacctcacccttaccaagggtgcgctctaccaactgagctatatcagcacatcttggagcgggcagcgggaatcgaacccgcatcatcagcttggaaggctgaggtaatagccattatacgatgccc < 1:390355‑M1/147‑145 (MQ=255) tataGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGa < 2:101025/149‑1 (MQ=255) tAggcagattcgaactgccgacctcacccttaccaagggtgcgctctaccaactgagctatatcagcacatcttggagcgggcagcgggaatcgaacccgcatcatcagcttggaaggctgaggtaatagccattatacgatgcccgca > 5:178451‑M1/1‑2 (MQ=255) ataGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGa > 7:57092/1‑148 (MQ=255) | AAGAGAGCTTCTCTCGATATTCAGTGCAGAATGAAAATCAGGTAGCCGAGTTCCAGGATGCGGGCATCGTATAATGGCTATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATGATGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCAAGATGTGCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTCCTCCCTGTTTTTTCCTTCTGTTTATTGCATTCAACAAGTCGGGCATGTTGCCTGGTTGATGTGGTGA > NC_000913/4175614‑4175907 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |