New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 4349222 = | 125 (1.410) | 4 (0.050) | 4/242 | NT | 3.6% | intergenic (‑478/+93) | dcuB/dcuR | C4‑dicarboxylate transporter, anaerobic; DcuS co‑sensor/response regulator in two‑component regulatory system with DcuS |
? | NC_000913 | 4349263 = | 101 (1.250) | intergenic (‑519/+52) | dcuB/dcuR | C4‑dicarboxylate transporter, anaerobic; DcuS co‑sensor/response regulator in two‑component regulatory system with DcuS | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 153 total aligned reads displayed.
TCTGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAACACCGTTCACCTGAAGAGATATTAATTTTTAGCGATGATGGAGGGATAATTATATTTGATCTGGCACAAGTTTTACTGATGAAGGATGTAACTTGTGCCAGGGGTATTTTGCATTACGGTAATAATTATTACTTACAGATAACCAGCGATCCGTTATTGGCAATATTGTTTCAGTAGTGAGTAGTGTTCTGCCTGAATACGGTAACGG > NC_000913/4349074‑4349369 | ttcaccagtatccattatggcgtcacggggcgtccagtttaccgttaccgtattcaggcagaacactactcactactgaaacaatattgccaataacggatcgctggttatctgtaagtaataattattaccgtaatgcaaaatacccc < 8:184287‑M1/1‑1 (MQ=255) ttcaccagtatccattatggcgtcacggggcgtccagtttaccgttaccgtattcaggcagaacactactcactactgaaacaatattgccaataacggatcgctggttatctgtaagtaataattattaccgtaatgcaaaatacccc > 4:302160‑M1/149‑149 (MQ=255) ttcaccagtatccattatggcgtcacggggcgtccagtttaccgttaccgtattcaggcagaacactactcactactgaaacaatattgccaataacggatcgctggttatctgtaagtaataattattaccgtaatgcaaaatacccc < 6:256438‑M1/1‑1 (MQ=255) ttcaccagtatccattatggcgtcacggggcgtccagtttaccgttaccgtattcaggcagaacactactcactactgaaacaatattgccaataacggatcgctggttatctgtaagtaataattattaccgtaatgcaaaatacccc > 2:227564‑M1/149‑149 (MQ=255) tcaccagtatccattatggcgtcacggggcgtccagtttaccgttaccgtattcaggcagaacactactcactactgaaacaatattgccaataacggatcgctggttatctgtaagtaataattattaccgtaatgcaaaatacccCt < 7:64287‑M1/2‑1 (MQ=255) cacctgtatccattatggcttcacggggcgtccagtttaccgttaccgtattcaggcagaacactactcactactgatacaatattgccaatatcggttcgctggttatgtgtaagtaataattattaccgttatgcaaaatacccCt > 2:333994‑M1/147‑148 (MQ=255) caccagtatccattatggcgtcacggggcgtccagtttaccgttaccgtattcaggcagaacactactcactactgaaacaatattgccaataacggatcgctggttatctgtaagtaataattattaccgtaatgcaaaatacccCt > 5:65734‑M1/147‑148 (MQ=255) accagtatccattatggcgtcacggggcgtccagtttaccgttaccgtattcaggcagaacactactcactactgaaacaatattgccaataacggatcgctggttatctgtaagtaataattattaccgtaatgcaaaatacccCTg > 2:232770‑M1/146‑148 (MQ=255) accagtatccattatggcgtcacggggcgtccagtttaccgttaccgtattcaggcagaacactactcactactgaaacaatattgccaataacggatcgctggttatctgtaagaaataattattaccgtaatgcaaaatacccCTgg < 2:136348‑M1/4‑1 (MQ=255) ccagtatccattatggcgtcacggggcgtccagtttaccgttaccgtattcaggcagaacactactcactactgaaacaatattgccaataacggatcgctggttatctgtaagtaataattattaccgtaatgcaaaatacccCTgg < 5:135037‑M1/4‑1 (MQ=255) aTCTACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAACACCGTTCACCTGAAGAGATATTAATTTTTAGCGATGATGGAGGGATAATTATATTTGATCTg < 2:182808/147‑1 (MQ=255) tACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAACACCGTTCACCTGAAGAGATATTAATTTTTAGCGATGATGGAGGGATAATTATATTTGATCTGGcac > 4:357850/1‑148 (MQ=255) cccATTTGTGGGTAAAAATACCCATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAACACCGTTCACCTGAAGAGATATTAATTTTTAGCGATGATGGAGGGATAATTATATTTGATCTGGca < 2:292768/145‑1 (MQ=255) 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> NC_000913/4349074‑4349369 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |