| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1570598 = | 112 (1.260) | 5 (0.060) +CCGTTACCGTTAAAC |
5/236 | NT | 4.7% | intergenic (‑109/+47) | gadC/gadB | glutamate:gamma‑aminobutyric acid antiporter/glutamate decarboxylase B, PLP‑dependent |
| ? | NC_000913 | 3666176 = | 115 (1.300) | intergenic (‑366/+4) | gadX/gadA | acid resistance regulon transcriptional activator; autoactivator/glutamate decarboxylase A, PLP‑dependent | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
AAGGTAATCGCTACATTTAATAAACATTCATATAACATATATCTTATCAACACGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCATTTCGAAGCCGCGACGACACATAATGCGCATCAC > NC_000913/3666028‑3666323 | aatgttaTCTCTACATTTAATAAACATTCATATAACATATATCTTATCAACACGATGAATAGAAAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACgttatg < 7:166844/143‑1 (MQ=255)aaGGTAATCGCTACATTTAATAAACATTCATATAACATATATCTTATCAACACGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACgttatg < 1:296277/149‑1 (MQ=255) gttAATCGCTACATTTAATAAACATTCATATAACATATATCTTATCAACACGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATAAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACgttatgtt < 6:263623/147‑1 (MQ=255) aaTCGCTACATTTAATAAACATTCATATAACATATATCTTATCAACACGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACgttatgttat > 8:346379/1‑148 (MQ=255) aaTCGCTACATTTAATAAACATTCATATAACATATATCTTATCAACACGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCAAGCTGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACgttatgttat > 1:26303/1‑148 (MQ=255) aTCGCTACATTTACTAAACATTCATATAACATATATCTTATCAACACGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCTATTAATAATCAACCGAATGCCCAGCTGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCa < 6:243543/149‑1 (MQ=255) aTCGCTACATTTAATAAACATTCATATAACATATATCTTATCAACACGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTATTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACgttatgttat > 7:266083/1‑148 (MQ=255) aTCGCTACATTTAATAAACATTCATATAACATATATCTTATCAACACGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCa < 5:14611/149‑1 (MQ=255) aTCGCTACATTTAATAAACATTCATATAACATATATCTTATCAACACGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCa > 4:45011/1‑149 (MQ=255) gCTACATTTAATAAACATTCATATAACATATATCTTATCAACACGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGgt < 3:330707/149‑1 (MQ=255) gCTACATTTAATAAACATTCATATAACATATATCTTATCAACACGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGgt < 3:325340/149‑1 (MQ=255) gCTACATTTAATAAACATTCATATAACATATATCTTATCAACACGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGgt > 5:71354/1‑149 (MQ=255) tACATTTAATAAACATTCATATAACATATATCTTATCAACACGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGgtgt > 5:273670/1‑149 (MQ=255) cATTTAATAAACATTCATATAACATATATCTTATCAACACGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGgtgtgt > 6:84116/1‑149 (MQ=255) aTTTAATAAACATTCATATAACATATATCTTATCAACACGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGtt > 5:259854/1‑149 (MQ=255) tttAATAAACATTCATATAACATATATCTTATCAACACGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGttt < 6:259854/149‑1 (MQ=255) tttAATAAACATTCATATAACATATATCTTATCAACACGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGttt < 3:103515/149‑1 (MQ=255) tttAATAAACATTCATATAACATATATCTTATCAACACGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGtt > 2:72706/1‑148 (MQ=255) ataaACATTCATATAACATATATCTTATCAACACGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAg < 5:275441/149‑1 (MQ=255) taaACATTCATATAACATATATCTTATCAACACGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGc > 7:126233/1‑149 (MQ=255) aaatatctcagcgatcacccgaaactgcagggtattgcccaacagaacagctttaaacatacctgataacgtttaacggtaacggtgtcccgaaacgaacccgtttcgggacaccgttaccgttaaacGTTATCAGGTATGTTTaaa < 4:232085‑M2/19‑1 (MQ=255) aCATTCATATAACATATATCTTATCAACACGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGt < 8:244771/149‑1 (MQ=255) cATTCATATAACATATATCTTATCAACACGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGtt < 7:68995/149‑1 (MQ=255) aTTCATATAACATATATCTTATCAACACGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTc < 6:71354/149‑1 (MQ=255) tataACATATATCTTATCAACACGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTctgctg > 8:306180/1‑149 (MQ=255) tataACATATATCTTATCAACACGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTctg > 7:302347/1‑146 (MQ=255) ttaCATATATCTTATCATCTCGAGGATTAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATTGCGAGATGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCTGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTTTTCTGCTgg < 6:241206/146‑1 (MQ=255) cATATATCTTATCAACACGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCaa > 3:42319/1‑149 (MQ=255) tatatCTTATCAACACGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTctgct > 5:84761/1‑141 (MQ=255) tatatCTTATCAACACGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTctgct < 6:84761/141‑1 (MQ=255) tatcatatcaACACGATGAATATACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATAcc < 6:366177/149‑1 (MQ=255) tCTTATCAACACGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCt > 3:94902/1‑149 (MQ=255) tCTTATCAACACGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCt > 7:171781/1‑149 (MQ=255) 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ccAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTggg > 2:327155/1‑115 (MQ=255) ccAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGata > 1:134589/1‑149 (MQ=255) ccAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGata < 2:152677/149‑1 (MQ=255) cAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGatat < 6:365586/149‑1 (MQ=255) atatatTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATAttt < 6:56261/149‑1 (MQ=255) atatatTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATAttt < 6:61810/149‑1 (MQ=255) tatatTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTc < 4:42319/149‑1 (MQ=255) tatatTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTc < 8:76676/149‑1 (MQ=255) tattatTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCa < 5:338536/148‑1 (MQ=255) ttattGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAgg < 8:171781/148‑1 (MQ=255) ttattGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAgg < 7:270486/148‑1 (MQ=255) ttGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAg < 7:52764/148‑1 (MQ=255) cGATTAATAAGCATCCGAATGCCCAGCTGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCt < 2:164459/148‑1 (MQ=255) cGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCTGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGTAGGCtt > 4:34020/1‑149 (MQ=255) gATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCaa < 7:345650/103‑1 (MQ=255) gATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGATGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCttt > 6:66339/1‑149 (MQ=255) ctgataacgtttaacggtaacggtgtcccgaaacgaacccgtttcgggacaccgttaccgttaaacGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTg < 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ttAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCa < 7:330911/148‑1 (MQ=255) tAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCAtt > 5:181525/1‑149 (MQ=255) aaaGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCAttt > 5:161573/1‑149 (MQ=255) aaaGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCAttt > 5:143683/1‑149 (MQ=255) aaGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCAttt < 5:84116/148‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGCATTAGGTTTTTACAACTTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGTTCAATACCAGGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTACAGAAACAGTTCAGCAAAGTCAAtt > 3:184532/1‑147 (MQ=17) aGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCATTTCg < 6:143683/149‑1 (MQ=255) gCTTGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTTAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTAAGGTAGGCTTTGTAGTCTTCCAGAAACAGTTCAGCAAAGTCAATTTCg > 3:11571/1‑147 (MQ=17) tGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTATGCTGGGCAATACACTGCAGTTTCTGGTGATCGATGAGATATTTCAGGGAGTCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCATTTCGAAGc > 6:288002/1‑149 (MQ=17) ggCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCATTTCGAAGCcg > 8:203138/1‑149 (MQ=255) cGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCATTTCGAAGCCGcgacga > 6:171015/1‑149 (MQ=255) ggTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCATTTCGAAGCCGcgacga > 1:392777/1‑148 (MQ=255) gTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCATTTCGAAGCCGCGACGaca < 7:306180/149‑1 (MQ=255) gTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCATTTCGAAGCCGCGACGaca < 7:346379/149‑1 (MQ=255) ttttACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCATTTCGAAGCCGCGACGacac < 8:255425/148‑1 (MQ=255) aCAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCATTTCGAAGCCGCGACGACACATaa < 6:83250/148‑1 (MQ=255) cGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCATTTCGAAGCCGCGACGACACATAATgcg > 4:228384/1‑148 (MQ=39) gttatCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCATTTCGAAGCCGCGACGACACATAATGCGCATcac > 5:162876/1‑148 (MQ=34) | AAGGTAATCGCTACATTTAATAAACATTCATATAACATATATCTTATCAACACGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTT‑TTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCATTTCGAAGCCGCGACGACACATAATGCGCATCAC > NC_000913/3666028‑3666323 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |