New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 2690411 | 60 (0.630) | 4 (0.050) | 4/246 | NT | 6.6% | coding (688/1428 nt) | glrK | sensor protein kinase regulating glmY sRNA in two‑component system with response regulator GlrR |
? | NC_000913 | = 2690416 | 56 (0.630) | coding (683/1428 nt) | glrK | sensor protein kinase regulating glmY sRNA in two‑component system with response regulator GlrR |
GTCAGCCAGTAATTCAGTGCCCTCGCGCATACTCGCCAGTGGCGTTTTTAATTCATGAGATAAATGTCTTAAAAATTGATGGCGTTGGGATTCCAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACGCTATTGCCCAGAGAACGCCCTTCCCCCAGACGGTTGATCATGCGCTCGATATTTTTCACCGGCCCGATAATCATCCGCGTGAAAAGCAGTACCATTACCAGACTCACCAGAAATAGCAC > NC_000913/2690268‑2690558 | gTCAGCCAGTAATTCAGTGCCCTCGCGCATACTCGCCAGTGGCGTTTTTAATTCATGAGATAAATGTCTTAAAAATTGATGGCGTTGGGATTCCAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAAct > 8:64556/1‑149 (MQ=255) gCCAGTAATTCAGTGCCCTCGCGCATACTCGCCAGTGGCGTTTTTAATTCATGAGATAAATGTCTTAAAAATTGATGGCGTTGGGATTCCAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTcgct > 1:244634‑M2/1‑145 (MQ=255) ccAGTAATTCAGTGCCCTCGCGCATACTCGCCAGTGGCGTTTTTAATTCATGAGATAAATGTCTTAAAAATTGATGGCGTTGGGATTCCAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTcgctc > 6:388187‑M2/1‑144 (MQ=255) ccAGTAATTCAGTGCCCTAGCGCATACTCGCCAGTGGCGTTTTTAATTCATGAGATAAATGTCTTAAAAATTGATGGCGTTGGGATTCCAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTcgctc > 8:396430‑M2/1‑144 (MQ=255) tAATTCAGTGCCCTCGCGCATACTCGCCAGTGGCGTTTTTAATTCATGAGATAAATGTCTTAAAAATTGATGGCGTTGGGATTCCAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTc > 7:20676/1‑149 (MQ=255) tAATTCAGTGCCCTCGCGCATACTCGCCAGTGGCGTTTTTAATTCATGAGATAAATGTCTTAAAAATTGATGGCGTTGGGATTCCAGCCATGACAGGCGCTCACATAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTc > 5:277607/1‑149 (MQ=255) ttCAGTGCCCTCGCGCATACTCGCCAGTGGCGTTTTTAATTCATGAGATAAATGTCTTAAAAATTGATGGCGTTGGGATTCCAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCAc < 4:225423/149‑1 (MQ=255) ttCAGTGCCCTCGCGCATACTCGCCAGTGGCGTTTTTAATTCATGAGATAAATGTCTTAAAAATTGATGGCGTTGGGATTCCAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCAc < 1:286144/149‑1 (MQ=255) cAGTGCCCTCGCGCATACTCGCCAGTGGCGTTTTTAATTCATGAGATAAATGTCTTAAAAATTGATGGCGTTGGGATTCCAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACt < 6:139309/148‑1 (MQ=255) cccTCGCGCATACTCGCCAGTGGCGTTTTTAATTCATGAGATAAATGTCTTAAAAATTGATGGCGTTGGGATTCCAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACga < 3:45884/149‑1 (MQ=255) tCGCGCATACTCGCCAGTGGCGTTTTTAATTCATGAGATAAATGTCTTAAAAATTGATGGCGTTGGGATTCCAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTACCTCGCTCGGTCCACTGAACGAGAc > 2:360629/1‑149 (MQ=255) gcgcATACTCGCCAGTGGCGTTTTTAATTCATGAGATAAATGTCTTAAAAATTGATGGCGTTGGGATTCCAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGCATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACGAGCCGc > 2:7976/1‑149 (MQ=255) gcgcATACTCGCCAGTGGCGTTTTTAATTCATGAGATAAATGTCTTAAAAATTGATGGCGTTGGGATTCCAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACg < 7:64556/148‑1 (MQ=255) tACTCGCCAGTGGCGTTTTTAATTCATGAGATAAATGTCTTAAAAATTGATGGCGTTGGGATTCCAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTcgct < 1:95910‑M2/124‑5 (MQ=255) tACTCGCCAGTGGCGTTTTTAATTCATGAGATAAATGTCTTAAAAATTGATGGCGTTGGGATTCCAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTcgct > 2:95910‑M2/1‑120 (MQ=255) gagaGTTGCGTTTTTAATTCATGAGATAAATGTCTTAAAAATTGATGGCTTTGGGATTCCAGCCATGACAGGCTCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTTACTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACGCTATTGCCCa < 2:256311/145‑1 (MQ=255) gCCAGTGGCGTTTTTAATTCATGAGATAAATGTCTTAAAAATTGATGGCGTTGGGATTCCAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACGCTATTGcc > 3:181337/1‑146 (MQ=255) gCCAGTGGCGTTTTTAATTCATGAGATAAATGTCTTAAAAATTGATGGCGTTGGGATTCCAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACGCTATTGcc > 8:233499/1‑146 (MQ=255) cAGTGGCGTTTTTAATTCATGAGATAAATGTCTTAAAAATTGATGGCGTTGGGATTCCAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACGCTATTGCCCa > 1:228390/1‑146 (MQ=255) tGGCGTTTTTAATTCATGAGATAAATGTCTTAAAAATTGATGGCGTTGGGATTCCAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACAAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACTAGACGCTATTGCCCAGAGAAc > 2:115400/1‑149 (MQ=255) gCGTTTTTAATTCATGAGATAAATGTCTTAAAAATTGATGGCGTTGGGATTCCAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCTAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACGCTATTGCCCAGAGAACGc < 6:240169/149‑1 (MQ=255) gTTTTTAATTCATGAGATAAATGTCTTAAAAATTGATGGCGTTGGGATTCCAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGaa < 3:393009/122‑1 (MQ=255) gTTTTTAATTCATGAGATAAATGTCTTAAAAATTGATGGCGTTGGGATTCCAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGaa > 4:393009/1‑122 (MQ=255) tttttAATTCATGAGATAAATGTCTTAAAAATTGATGGCGTTGGGATTCCAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACga < 2:144962/124‑1 (MQ=255) tttttAATTCATGAGATAAATGTCTTAAAAATTGATGGCGTTGGGATTCCAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACga > 1:144962/1‑124 (MQ=255) tAATTCATGAGATAAATGTCTTAAAAATTGATGGCGTTGGGATTCCAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACGCTATTGCCCAGAGAACGCCCTTccc > 5:219637/1‑149 (MQ=255) aaTTCATGAGATAAATGTCTTAAAAATTGATGGCGTTGGGATTCCAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACGCTATTGCCCAGAGAACGCCCTTccc < 8:20676/148‑1 (MQ=255) aTTCATGAGATAAATGTCTTAAAAATTGATGGCGTTGGGATTCCAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACGCTATTGCCCAGAGAACGCCCTTcccc < 4:378644/148‑1 (MQ=255) gaTAAATGTCTTAAAAATTGATGGCGTTGGGATTCCAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACGCTATTGCCCAGAGAACGCCCTTCCCCCAGACGGtt < 1:74734/149‑1 (MQ=255) tAAATGTCTTAAAAATTGATGGCGTTGGGATTCCAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACGCTATTGCCCAGAGAACGCCCTTCCCCCAGACGGTTGa < 4:181337/149‑1 (MQ=255) aaTCTCTTATAAATTTATTCCGTTGGGATTCCAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCAAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACGCTATTGCCCAGAGAACGCCCTTCCCCCAGACGGTTGAt < 6:72800/148‑1 (MQ=255) tCTTAAAAATTGATGGCGTTGGGATTCCAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACGCTATTGCCCAGAGAACGCCCTTCCCCCAGACg < 4:274870/138‑1 (MQ=255) tCTTAAAAATTGATGGCGTTGGGATTCCAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACGCTATTGCCCAGAGAACGCCCTTCCCCCAGACGGTTGATCATgc > 4:89583/1‑149 (MQ=255) ttAAAAATTGATGGCGTTGGGATTCCAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCACCCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACGCTATTGCCCAGAGAACGCCCTTCCCCCAGCCGGTTGATCCTgcgc > 1:319851/1‑149 (MQ=255) ttAAAAATTGATGGCGTTGGGATTCCAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACGCTATTGCCCAGAGAACGCCCTTCCCCCAGACGGTTGATCATgcgc > 7:337684/1‑149 (MQ=255) ttAAAAATTGATGGCGTTGGGATTCCAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACGCTATTGCCCAGAGAACGCCCTTCCCCCAGACGGTTGATCATgcgc > 3:244026/1‑149 (MQ=255) ttAAAAATTGATGGCGTTGGGATTCCAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACGCTATTGCCCAGAGAACGCCCTTCCCCCAGACGGTTGATCATgcgc > 3:224914/1‑149 (MQ=255) aTTGATGGCGTTGGGATTCCAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACGCTATTGCCCAGAGAACGCCCTTCCCCCAGACGGTTGATCATGCGCTCGata < 4:359835/149‑1 (MQ=255) tGGCGTTGGGATTCCAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACGCTATTGCCCAGAGAACGCCCTTCCCCCAGACGGTTGATCATGCGCTCGATAttttt < 1:295611/149‑1 (MQ=255) gCGTTGGGATTCCAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACGCTATTGCCCAGAGAACGCCCTTCCCCCAGACGGTTGATCATGCGCTCGATATTTTTCa < 3:89583/149‑1 (MQ=255) cGTTGGGATTCCAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACGCTATTGCCCAGAGAACGCCCTTCCCCCAGACGGTTGATCATGCGCTCGATATTTTTCAc < 5:371654/149‑1 (MQ=255) gggATTCCAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACGCTATTGCCCAGAGAACGCCCTTCCCCCAGACGGTTGATCATGCGCTCGATATTTTTCACCGGc > 6:75123/1‑149 (MQ=255) ggATTCCAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACGCTATTGCCCAGAGAACGCCCTTCCCCCAGACGGTTGATCATGCGCTCGATATTTTTCACCGGcc < 4:224914/149‑1 (MQ=255) ggATTCCAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACGCTATTGCCCAGAGAACGCCCTTCCCCCAGACGGTTGATCATGCGCTCGATATTTTTCACCGGcc < 8:337684/149‑1 (MQ=255) gATTCCAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACAGAACGAGACGCTATTGCCCAGAGAACGCCCTTCCCCCAGACGGTTGATCATGCGCTCGATATTTTTCACCGGccc > 2:1170/1‑149 (MQ=255) aTTCCAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACGCTATTGCCCAGAGAACGCCCTTCCCCCAGACGGTTGATCATGCGCTCGATAtt > 8:112843/1‑136 (MQ=255) aTTCCAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACGCTATTGCCCAGAGAACGCCCTTCCCCCAGACGGTTGATCATGCGCTCGATAtt < 7:112843/136‑1 (MQ=255) ccgCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACGCTATTGCCCAGAGAACGCCCTTCCCCCAGACGGTTGATCATGCGCTCGATATTTTTCACCGGCCCGATaa < 6:273105/147‑1 (MQ=255) cAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACGCTATTGCCCAGAGAACGCCCTTCCCCCAGACGGTTGATCATGCGCTCGATATTTTTCACCGGCCCGATa < 7:233499/148‑1 (MQ=255) cAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACGCTATTGCCCAGAGAACGCCCTTCCCCCAGACGGTTGATCATGCGCTCGATATTTTTCACCGGCCCGATa < 4:181573/148‑1 (MQ=255) aGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACGCTATTGCCCAGAGAACGCCCTTCCCCCAGACGGTTGATCATGCGCTCGATAATTTTCACCGGCCCGATAat > 2:407575/1‑149 (MQ=255) gCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACGCTATTGCCCAGAGAACGCCCTTCCCCCAGACGGTTGATCATGCGCTCGATATTTTTCACCGGCCCGATAatc < 6:219637/149‑1 (MQ=255) aTGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGACCGTAACACGCTCGGTCCACTGAAAGAGAAGCTATTGCCCAGAGAACGCCCTTCCCCCAGACGGTTGATCATGCGCTCGATATTTTTCACCGGCCCGATAataatc > 2:37056/1‑149 (MQ=255) aTGACAGGCGCTCACATAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACGCTATTGCCCAGAGAACGCCCTTCCCCCAGACGGTTGATCATGCGCTCGATATTTTTCACCGGCCCGATAatcatc < 6:277607/149‑1 (MQ=255) tGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACGCTATTGCCCAGAGAACGCCCTTCCCCCAGACGGTTGATCATGCGCTCGATATTTTTCACCGGCCCGATAATCATcc > 5:419149/1‑149 (MQ=255) gACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACGCTATTGCCCAGAGAACGCCCTTCCCCCAGACGGTTGATCATGCGCTCGATATTTTTCACCGGCCCGATAATCATCcg > 5:290554/1‑149 (MQ=255) aCAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACGCTATTGCCCAGAGAACGCCCTTCCCCCAGACGGTTGATCATGCGCTCGATATTTTTCACCGGCCCGATAATCATCcg < 2:228390/148‑1 (MQ=255) aGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACGCTATTGCCCAGAGAACGCCCTTCCCCCAGACGGTTGATCATGCGCTCGATATTTTTCACCGGCCCGATAATCATCCGCGt < 4:244026/149‑1 (MQ=255) aCTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACAGAACGAGACGCTATTGCCCAGAGAACGCCCTTCCCCCAGACGGTTGATCATGCGCTCGATATTTTTCACCGGCCCGATAATCATCCGCGTGAAAAg < 1:1170/147‑1 (MQ=255) cTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACGCTATTGCGCAGAGAACGCCCTTCCCCCAGACGGTTGATCATGCGCTCGATATTTTTCACCGGCCCGATAATCATCCGCGTGAAAAGCAg > 1:103383/1‑149 (MQ=255) cTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACGCTATTGCCCAGAGAACGCCCTTCCCCCAGACGGTTGATCATGCGCTCGATATTTTTCACCGGCCCGATAATCATCCGCGTGAAAAGCAg > 5:150117/1‑149 (MQ=255) ttAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACGCTATTGCCCAGAGAACGCCCTTCCCCCAGACGGTTGATCATGCGCTCGATATTTTTCACCGGCCCGATAATCATCCGCGTGAAAAGCAg > 5:116716/1‑148 (MQ=255) ttAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACGCTATTGCCCAGAGAACGCCCTTCCCCCAGACGGTTGATAATGCCCTCGATATTTTTCACCGGCCCGATAATCATCCGAGTGAAAAGCAg > 3:49225/1‑148 (MQ=255) aaCCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTcgctcggttgggcaacgtattctttggttaagtgagcgcctgtcatggctggaatcccaacgccatcaatttttaagacatttatctcatgaattaaaaacgccactggcgagt > 4:1025‑M2/1‑34 (MQ=255) aaCCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTcgctcggttgggcaacgtattctttggttaagtgagcgcctgtcatggctggaatcccaacgccatcaatttttaagacatttatctcatgaattaaaaacgccactggcgagt < 3:1025‑M2/148‑115 (MQ=255) aCCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACAGAACGAGACGCTATAGCCCAGAGAACGCCCTTCCCCCACACGGTTGATCATGCGCACCATATTATTCACCGGCCCGAAAAACATCCGCGTGAAAAGCAGTAc > 7:67388/1‑148 (MQ=255) ccAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTcgctcggttgggcaacgtattctttggttaagtgagcgcctgtcatggctggaatcccaacgccatcaatttttaagacatttatctcatga < 8:244196‑M2/124‑93 (MQ=255) ccAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACGCTATTGGCCAGAGAACGCCGTTCCGCCAGACGGTTGATCATGCGCTCGATATTTTTCACCGGCCCGATAATCATCCGCGTGAAAAGCAGTAGCATTACCAGACTCACCAg < 8:67388/149‑1 (MQ=255) aCCGAGCGTAACTcgctcggttgggcaacgtattctttggttaagtgagcgcctgtcatggctggaatcccaacgccatcaatttttaagacatttatctcatgaattaaaaacgccactggcgagtatgcgcgagggcactgaattac < 1:11881‑M2/149‑137 (MQ=255) aCCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACGCTATTGCCCAGAGAACGCCCTTCCCCCAGACGGTTGATCATGCGCTCGATATTTTTCAACGGCCCGATAATCATCCGCGTGAAAAGCAGTACCATTACCAGACTCACCAGaaa < 6:290554/149‑1 (MQ=255) cGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACGCTATTGCCCAGAGAACGCCCTACCCCCAGACGGTTGATCATGCGCTCGATATTTTTCACCGGCCCGATAATCATCCGCGTGAAAAGCAGTACCATTACCAGACTCACCAGAAATAGCAc > 2:245294/1‑149 (MQ=255) aCTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACGCTATTGCCCAGAGAACGCCCTTCCCCCAGACGGTTGATCATGCGCTCGATATTTTTCACCGGCCCGATAATCATCCGCGTGAAAAGCAGTACCATTACCAGACTCACCAGaaa < 6:319472/139‑1 (MQ=255) aCTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACGCTATTGCCCAGAGAACGCCCTTCCCCCAGACGGTTGATCATGCGCTCGATATTTTTCACCGGCCCGATAATCATCCGCGTGAAAAGCAGTACCATTACCAGACTCACCAGaaa > 5:319472/1‑139 (MQ=255) | GTCAGCCAGTAATTCAGTGCCCTCGCGCATACTCGCCAGTGGCGTTTTTAATTCATGAGATAAATGTCTTAAAAATTGATGGCGTTGGGATTCCAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACGCTATTGCCCAGAGAACGCCCTTCCCCCAGACGGTTGATCATGCGCTCGATATTTTTCACCGGCCCGATAATCATCCGCGTGAAAAGCAGTACCATTACCAGACTCACCAGAAATAGCAC > NC_000913/2690268‑2690558 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |