New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 3860610 = | 118 (1.250) | 3 (0.030) | 3/250 | NT | 2.6% | coding (328/894 nt) | yidL | AraC family putative transcriptional regulator |
? | NC_000913 | 3860638 = | 108 (1.200) | coding (356/894 nt) | yidL | AraC family putative transcriptional regulator | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 140 total aligned reads displayed.
GATGTGGGAAAATTCTTTTAAAGAATGGCGAACAAATAACACTGCATGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCACCAGAAGCAATAAAAAATAATCTGGCAGTCGCTTTTCTGACGAAAATTATTTATCA > NC_000913/3860491‑3860785 | gATGTGGGAAAATTCTTTTAAAGAATGGCGAACAAATAACACTGCATGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTat > 7:191691/1‑148 (MQ=255) tgGGAAAATTCTTTTAAAGAATGGCGAACAAATAACACTGCATGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTatgat < 6:258749/147‑1 (MQ=255) gggAAAATTCTTTTAAAGAATGGCGAACAAATAACACTGCATGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGa > 4:127176/1‑149 (MQ=255) gggAAAATTCTTTTAAAGAATGGCGAACAAATAACACTGCATGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGa > 5:22304/1‑149 (MQ=255) gggAAAATTCTTTTAAAGAATGGCGAACAAATAACACTGCATGCCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGa > 1:157605/1‑149 (MQ=255) tattttttattgcttctggtgaagttattaactcagcaacttcggtgagttcctgattataaatttcgccattataaataacgctttgctgaccaacgggaatatccatcaTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGata > 2:85351‑M1/112‑148 (MQ=255) aaaaTTCTTTTAAAGAATGGCGAACAAATAACACTGCATGGCAACAGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGatat > 8:245627/1‑149 (MQ=255) ttCTTTTAAAGAATGGCGAACAAATAACACTGCATGCCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATTTTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTccc > 7:375818/1‑149 (MQ=255) ttttAAAGAATGGCGAACAAATAACACTGCATGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGtt > 6:219346/1‑149 (MQ=255) ttAAAGAATGGCGAACAATTAACACTGCATGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTg < 7:158554/148‑1 (MQ=255) ttAAAGAATGGCGAACAAATAACACTGCATGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGt < 2:403386/146‑1 (MQ=255) ttAAAGAATGGCGAACAAATAACACTGCATGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTCTGAAGGTTTAGTCTCGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTg < 6:346402/148‑1 (MQ=255) ttAAAGAATGGCGAACAAATAACACTGCATGCCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTg < 2:157605/148‑1 (MQ=255) aaGAATTGCGAAAAAATAACACTTCATGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATTGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGTATATTCCCGTTGGTCa < 6:289198/149‑1 (MQ=255) aaGAATGGCGAACAAATAACACTGCATGGCAACAGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCa < 7:245627/149‑1 (MQ=255) aGAATGGCGAACAAATAACACTGCATGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAg < 7:436753/149‑1 (MQ=255) gAACAAATAACACTGCATGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGt < 8:65703/149‑1 (MQ=255) aaCAAATAACACTGCATGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGt > 2:394437/1‑148 (MQ=255) aCAAATAACACTGCATGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCa < 4:344353/141‑1 (MQ=255) aCAAATAACACTGCATGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCa > 3:344353/1‑141 (MQ=255) ttattaactcagcaacttcggtgagttcctgattataaatttcgccattataaataacgctttgctgaccaacgggaatatccatcaTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTatgatg < 5:69993‑M1/33‑1 (MQ=255) ttattaactcagcaacttcggtgagttcctgattataaatttcgccattataaataacgctttgctgaccaacgggaatatccatcaTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTatgatg > 6:69993‑M1/88‑120 (MQ=255) aTAACACTGCATGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGttattta > 3:228584/1‑149 (MQ=255) tAACACTGCATGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCtttattta > 4:170341/1‑148 (MQ=255) tGCATGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAACGCGTTATTTATATTGGc > 2:288711/1‑149 (MQ=255) tGCATGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGc > 1:70281/1‑149 (MQ=255) cAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAAttt < 1:341637/149‑1 (MQ=255) aaCTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTta < 8:259784/149‑1 (MQ=255) aCTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTtat < 8:191691/149‑1 (MQ=255) cTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTtata < 3:134333/149‑1 (MQ=255) tattatATTCTTAAAGCCAATTGATATTCACACATATCACTCTCAATGTTTAGTCTGCGAACAGTACTGCATGGAATTTACAACCACAAGTATCATGGATATTCCCGTTCGTCAGAAAAGCGTTATTTATAATGACTAAATTTATaaa > 6:139776/1‑147 (MQ=255) tattatATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATc < 4:173584/149‑1 (MQ=255) ttatATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCa < 4:68010/148‑1 (MQ=255) ttatATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAg < 6:20097/149‑1 (MQ=255) atatTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAgg < 1:394437/148‑1 (MQ=255) atatTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAgg < 7:8834/148‑1 (MQ=255) tatTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGaa > 5:182500/1‑149 (MQ=255) tatTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGaa < 8:4726/149‑1 (MQ=255) tatTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGaa < 8:202361/149‑1 (MQ=255) tatTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGaa > 2:118479/1‑149 (MQ=255) tCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACt > 1:115556/1‑148 (MQ=255) aaaGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCAcc > 8:336104/1‑148 (MQ=255) aGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGaa < 2:38522/149‑1 (MQ=255) gCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAg < 3:295033/149‑1 (MQ=255) gCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAg > 4:98770/1‑149 (MQ=255) cAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATc < 3:130108/132‑1 (MQ=255) cAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATc > 4:130108/1‑132 (MQ=255) cAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGtt > 6:96021/1‑149 (MQ=255) gATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGa < 2:115556/149‑1 (MQ=255) tatTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGt < 4:228584/149‑1 (MQ=255) tatTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGt < 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tCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGGCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCAc < 5:129281/149‑1 (MQ=255) cACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCAc > 5:264147/1‑148 (MQ=255) aCTGTTAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCTCCAGTTTGTTGGATATTCCCGTTGGTCAGCTAAGCGTTATTTATAATTGCGAAATTTATAATCAGGAACTGACCGAAGTTGCTGAGTTAATTACTTCACCa < 6:170964/149‑1 (MQ=255) cTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCAc > 7:81035/1‑146 (MQ=255) agAAGGTTTACTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATATATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCACCAGaa < 6:242449/147‑1 (MQ=255) aaGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCACCAGAAGc > 1:370984/1‑148 (MQ=255) gTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCAc < 5:288810/138‑1 (MQ=255) gTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCAc > 6:288810/1‑138 (MQ=255) gTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAAt < 7:279775/81‑1 (MQ=255) tCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCACCAGAAGCAATaaaaaa > 3:305913/1‑148 (MQ=255) tatccatcatactggtgggggtaaattccatccagtaTGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCACCAGAAGCAATAAAAaata > 2:85351‑M2/38‑148 (MQ=255) tGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTtaa < 4:389417/121‑1 (MQ=255) tGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTtaa > 3:389417/1‑121 (MQ=255) tGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCACCAGAAGCAATAAAAaataa > 8:180287/1‑149 (MQ=255) gggAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCACCAGAAGCAATAAAAaataat > 1:5106/1‑149 (MQ=255) ggAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGa < 3:346273/114‑1 (MQ=255) ggAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGa > 4:346273/1‑114 (MQ=255) catcatactggtgggggtaaattccatccagtaTGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTtaataa < 5:69993‑M2/87‑1 (MQ=255) aaCAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCACCAGAAGCAATAAAAAATAATCTg > 2:6770/1‑149 (MQ=255) aCAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCACCAGAAGCAATAAAAAATAATCTgg < 1:71091/149‑1 (MQ=255) aCAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGAGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCACCAGAAGCAATAAAAAATAATCTgg < 5:139776/149‑1 (MQ=255) aGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCACCAGAAGCAATAAAAAATAATCTGGCa < 6:182500/149‑1 (MQ=255) TACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCACCAGAAGCAATaaaaaa > 1:170228‑M1/1‑137 (MQ=255) TACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCACCAGAAGCAATaaaaaa < 2:170228‑M1/137‑1 (MQ=255) TACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCACCAGAAGCAATAAAAAATAATCTGGCAGt > 2:5106‑M1/1‑149 (MQ=255) TACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCACCAGAAGCAATAAAAAATAATCTGGCAGt < 2:170973‑M1/149‑1 (MQ=255) CTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGc < 1:75436‑M1/102‑1 (MQ=255) CTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGc > 2:75436‑M1/1‑102 (MQ=255) GATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCACCAGAAGCAATAAAAAATAATCTGGCAGTCGCtt < 4:187665‑M1/149‑1 (MQ=255) GATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCACCAGAAGCAATAAAAAATAATCTGGCAGTCGCtt < 7:345318‑M1/149‑1 (MQ=255) tggaATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCACCAGAAGCAATAAAAAATAATCTGGCAGTCGCttt > 8:281536/1‑148 (MQ=255) gaATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCACCAGAAGCAATAAAAAATAATCTGGCAGTCGCTTTTc < 1:118479/148‑1 (MQ=255) gaATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCACCAGAAGCAATAAAAAATAATCTGGCAGTCGCTTTTCt < 4:374179/149‑1 (MQ=255) aaTTTCCCCCCACCAGTATGATGTATATTCCCTTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTAGAAGGGCGAAATTGATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCTCCAGAAGCAATCAAAAATAATCTGGCAGTCGCTTTTCTg > 5:289992/1‑149 (MQ=255) aTTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCACCAGAAGCAATAAAAAATAATCTGGCAGTCGCTTTTCTGa > 6:269491/1‑149 (MQ=255) aTTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCACCAGAAGCAATAAAAAATAATCTGGCAGTCGCTTTTCTGa < 1:421915/149‑1 (MQ=255) ttACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCACCAGAAGCAATAAAAAATAATCTGGCAGTCGCTTTTCTGAc > 1:1382/1‑148 (MQ=255) tACCCCCTCCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTAAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCACCAGAAGCAATAAAAAATAATCTGGCAGTCGCTTTTCTGACg < 6:394481/148‑1 (MQ=255) cccccACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCACCAGAAGCAATAAAAAATAATCTGGCAGTCGCTTTTCTGACGaaa < 8:292558/149‑1 (MQ=255) ccccACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCACCAGAAGCAATAAAAAATAATCTGGCAGTCGCTTTTCTGACGaaaa > 2:39419/1‑149 (MQ=255) ccaccaGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCACCAGAAGCAATAAAAAATAATCTGGCAGt < 3:380406/130‑1 (MQ=255) accaGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCACCAGAAGCAATAAAAAATAATCTGGCAGTCGCTTTTCTGACTAAAattat > 4:406166/1‑149 (MQ=255) cagtaTGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCACCAGAAGCAATAAAAAATAATCTGGCAGTCGCTTTTCTGACGAAAattatt > 5:192354‑M2/6‑148 (MQ=255) tgatgGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCACCAGAAGCAATAAAAAATAATCTGGCAGTCGCTTTTCTGACGAAAATTATTTATCa < 4:225319/148‑1 (MQ=255) | GATGTGGGAAAATTCTTTTAAAGAATGGCGAACAAATAACACTGCATGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCACCAGAAGCAATAAAAAATAATCTGGCAGTCGCTTTTCTGACGAAAATTATTTATCA > NC_000913/3860491‑3860785 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |