| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 4165497 | 106 (1.120) | 4 (0.040) | 4/248 | NT | 3.7% | coding (70/858 nt) | murI | glutamate racemase |
| ? | NC_000913 | = 4165519 | 107 (1.190) | coding (92/858 nt) | murI | glutamate racemase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
ACCTGACAGTTCGTGGTAAAATAGCCAACCTGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCACCGCGGTGCAA > NC_000913/4165371‑4165667 | aCCTGACAGTTCGTTGTAAAATAGCCAACCTGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGt < 3:290252/149‑1 (MQ=255) tGACAGTTCGTGGTAAAATAGCCAACCTGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTcgg < 7:144737‑M2/149‑4 (MQ=255) gACAGTTCGTGGTAAAATAGCCAACCTGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTcggt < 7:240869‑M2/149‑5 (MQ=255) 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gACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCAc > 1:319997/1‑149 (MQ=255) gACTCCGGCGTCGGTGGGGTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCa < 6:378069/148‑1 (MQ=255) tCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCACcgc > 8:212427/1‑149 (MQ=255) tCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCACcgc > 7:326136/1‑149 (MQ=255) ggCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCACCGCGGt > 5:345643/1‑149 (MQ=255) cGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTATCACCGCGGTGc < 3:367942/149‑1 (MQ=255) cGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATACGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTAAGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCACCGCGGTGc < 8:385108/149‑1 (MQ=255) | ACCTGACAGTTCGTGGTAAAATAGCCAACCTGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCACCGCGGTGCAA > NC_000913/4165371‑4165667 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |