Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 617,560 | T→C | 5.3% | L1135P (CTG→CCG) | entF → | enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP‑dependent |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 617,560 | 0 | T | C | 5.3% | 230.1 / 3.0 | 75 | L1135P (CTG→CCG) | entF | enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP‑dependent |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (36/35); new base C (2/2); total (38/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.29e-01 |
GTTATCTCGATCCACAATGGTCGATTATCGGCATTCAGTCACCGCGCCCCAATGGCCCCATGCAGACGGCGGCAAACCTGGATGAAGTCTGCGAAGCGCATCTGGCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGACTGCGTGCCCGTGGCGAACAGGTGGCATTTCTTGGCTTGCTGGATACCTGGCCGCCAGAAACGCAAAACTGGCAGGAAAAAGAAGCTAATGGTCTG > NC_000913/617413‑617702 | gTTAGCTCGATCCACAATGGTCGATAATCGGCATTCAGTCACCGCGCCCCAATGGCCCCATGCAGACGGCGGCAAACCTGGATGAAGGCTGCGAAGCGCATCTGGCAACGTTACTTGAACAACAACTGCATGGCCCTTATTACctgctg < 1:154787/149‑1 (MQ=255) tcGATCCACAATGGTCGATTATCGGCATTCAGTCACCGCGCCCCAATGGCCCCATGCAGACGGCGGCAAACCTGGATGAAGTCTGCGAAGCGCATCTGGCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCCGGGGTAt > 7:174076/1‑149 (MQ=255) gATCCACAATGGTCGATTATCGGCATTCAGTCACCGCGCCGCAATGGCCCCATGCAGACGGCGGCAAACCTGGATGAAGTCTGCGAAGCGCATCTGGCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTAtt < 8:395833/148‑1 (MQ=255) gATCCACAATGGTCGATTATCGGCATTCAGTCACCGCGCCCCAATGGCCCCATGCAGACGGCGGCAAACCTGGATGAAGTCTGCGAAGCGCATCTGGCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTa < 6:167255/146‑1 (MQ=255) gATCCACAATGGTCGATTATCGGCATTCAGTCACCGCGCCCCAATGGCCCCATGCAGACGGCGGCAAACCTGGATGAAGTCTGCGAAGCGCATCTGGCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTAtt < 6:258033/148‑1 (MQ=255) aTCCACAATGGTCGATTATCGGCATTCAGTCACCGCGCCCCAATGGCCCCATGCAGACGGCGGCAAACCTGGATGAAGTCTGCGAAGCGCATCTGGCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTcc > 1:105890/1‑149 (MQ=255) aaTGGTCGATTATCGGCATTCAGTCACCGCGCCCCAATGGCCCCATGCAGACGGCGGCAAACCTGGATGAAGTCTGCGAAGCGCATCTGGCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGc < 4:384900/149‑1 (MQ=255) aTGGTCGATTATCGGCATTCAGTCACCGCGCCCCAATGGCCCCATGCAGACGGCGGCAAACCTGGATGAAGTCTGCGAAGCGCATCTGGCAACGTTACTTGAACAACAACAGCATGTCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCg < 8:310749/149‑1 (MQ=255) gATTATCGGCATTCAGTCACCGCGCCCCAATGGCCCCATGCAGACGGCGGCAAACCTGGATGAAGTCTGCGAAGCGCATCTGGCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGc > 2:117276/1‑149 (MQ=255) aTCGGCATTCAGTCACCGCGCCCCAATGGCCCCATGCAGACGGCGGCAAACCTGGATGAAGTCTGCGAAGCGCATCTGGCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTgg < 2:105890/148‑1 (MQ=255) tCGGCATTCAGTCACCGCGCCCCAATGGCCCCATGCAGACGGCGGCAAACCTGGATGAAGTCTGCGAAGCGCATCTGGCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGgcg < 8:434637/149‑1 (MQ=255) tCGGCATTCAGTCACCGCGCCCCAATGGCCCCATGCAGACGGCGGCAAACCTGGATGAAGTCTGCGAAGCGCATCTGGCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGgcg > 8:193754/1‑149 (MQ=255) tCGGCATTCAGTCACCGCGCCCCAATGGCCCCATGCAGACGGCGGCAAACCTGGATGAAGTCTGCGAAGCGCATCTGGCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGgcg > 3:277250/1‑149 (MQ=255) gCATTCAGTCACCGCGCCCCAATGGCCCCATGCAGACGGCGGCAAACCTGGATGAAGTCTGCGAAGCGCATCTGGCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAg > 4:388648/1‑149 (MQ=255) cATTCAGTCACCGCGCCCCAATGGCCCCATGCAGACGGCGGCAAACCTGGATGAAGTCTGCGAAGCGCATCTGGCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAgg < 1:117276/149‑1 (MQ=255) cATTCAGTCACCGCGCCCCAATGGCCCCATGCAGACGGCGGCAAACCTGGATGAAGTCTGCGAAGCGCATCTGGCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAgg < 7:193754/149‑1 (MQ=255) aTTCAGTCACCGCGCCCCAATGGCCCCATGCAGACGGCGGCAAACCTGGATGAAGTCTGCGAAGCGCATCTGGCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAggg < 1:438672/149‑1 (MQ=255) ttCAGTCACCGCGCCCCAATGGCCCCATGCAGACGGCGGCAAACCTGGATGAAGTCTGCGAAGCGCATCTGGCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTCTTCCATTGGCGGTACGCTGGCGCAgat > 2:228985/1‑146 (MQ=255) aCCGCGCCCCAATGGCCCCATGCAGACGGCGGCAAACCTGGATGAAGTCTGCGAAGCGCATCTGGCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGAGCAGGGTATTgcgg > 6:39967/1‑149 (MQ=255) cgcACCAATGGCCCCATGCAGACGGCGGCTAACCTTTATGAAGTCTGCTAAGCGCATCTGGCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGTCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCgg < 8:403564/122‑1 (MQ=255) cAATGGCCCCATGCAGACGGCGGCAAACCTGGATGAAGTCTGCGAAGCGCATCTGGCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGACTGc < 6:190388/149‑1 (MQ=255) ccATGCAGACGGCGGCAAACCTGGATGAAGTCTGCGAAGCGCATCTGGCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTgcggc < 7:344802/133‑1 (MQ=255) ccATGCAGACGGCGGCAAACCTGGATGAAGTCTGCGAAGCGCATCTGGCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTgcggc > 8:344802/1‑133 (MQ=255) ccATGCAGACGGCGGCAAACCTGGATGAAGTCTGCGAAGCGCATCTGGCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGACTGCGt > 7:82678/1‑143 (MQ=255) ccATGCAGACGGCGGCAAACCTGGATGAAGTCTGCGAAGCGCATCTGGCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGACTGCGt < 8:82678/143‑1 (MQ=255) cATGCAGACGGCGGCAAACCTGGATGAAGTCTGCGAAGCGCATCTGGCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGACTGCGTGCCCGTg > 3:64898/1‑149 (MQ=255) tGCAGACGGCGGCAAACCTGGCTGAAGTCTGCGAAGCGCAGCTGGCAACGGTACATGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTCCCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCGGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGACTGCGTGCCCGGGGc < 7:124304/149‑1 (MQ=255) tGCAGACGGCGGCAAACCTGGATGAAGTCTGCGAAGCGCATCTGGCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGAc < 1:107249/135‑1 (MQ=255) tGCAGACGGCGGCAAACCTGGATGAAGTCTGCGAAGCGCATCTGGCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGAc > 2:107249/1‑135 (MQ=255) aGACGGCGGCAAACCTGGATGAAGTCTGCGAAGCGCATCTGGGAACGTTACTTGAACCACAACCGCATGACCCTTATTACCTGCTGGGGTATCCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGTGTATTGCGGCGCGACTGCGTGCCCGTGGCGaa > 5:342045/1‑149 (MQ=255) aGACGGCGGCAAACCTGGATGAAGTCTGCGAAGCGCATCTGGCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTGCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGACTGCGTg < 4:148053/138‑1 (MQ=255) aGACGGCGGCAAACCTGGATGAAGTCTGCGAAGCGCATCTGGCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGACTGCGTg > 3:148053/1‑138 (MQ=255) aGACGGCGGCAAACCTGGATGAAGTCTGCGAAGCGCATCTGGCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGACTGCGTGCCCGTGGCGaa > 5:109446/1‑149 (MQ=255) aCGGCGGCAAACCTGGATGAAGTCTGCGAAGCGCATCAGGCAACGGTACATGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTc > 8:364060/1‑92 (MQ=255) gcggcAAACCTGGATGAAGTCTGCGAAGCGCATCTGGCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGACTGCGTGCCCGTGGCGAACAGGt < 2:370510/149‑1 (MQ=255) gcggcAAACCTGGATGAAGTCTGCGAAGCGCATCTGGCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCCGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGACTGCGTGCCCGTGGCGAACAGGt < 8:174076/149‑1 (MQ=255) cggcAAACCTGGATGAAGTCTGCGAAGCGCATCTGGCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGACTGCGTGCCCGTGGCGAACAGGTg < 6:109446/149‑1 (MQ=255) cggcAAACCTGGATGAAGTCTGCGAAGCGCATCTGGCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGACTGCGTGCCCGTGGCGAACAGGTg < 4:89430/149‑1 (MQ=255) aaCCTGGATGAAGTCTGCGAAGCGCATCTGGCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGACTGCGTGCCCGTGGCGAACAGGTGGCAtt > 7:35180/1‑149 (MQ=255) tGGATGAAGTCTGCGAAGCGCATCTGGCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGACTGCGTGCCCGTGGCGAACAGGTGGCATTTCtt > 4:267335/1‑149 (MQ=255) ggATGAAGTCTGCGAAGCGCATCTGGCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGACTGCGTGccc < 4:355874/125‑1 (MQ=255) ggATGAAGTCTGCGAAGCGCATCTGGCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGACTGCGTGccc > 3:355874/1‑125 (MQ=255) gATGAAGTCTTCGAAGCGCATCTGGCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGACTGCGTGCCCGTGGCGAACAGGTGGCATTTCTTg < 8:134156/148‑1 (MQ=255) gTCTGCGAAGCGCATCTGGCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGACTGCGTGCCCGTGGCGAACAGGTGGCATTTCTTGGCTTGCt < 3:388648/149‑1 (MQ=255) gAAGAGAATCTGGCAACGTTACTTGAACAACAAACGCATGAACCTTATTAACTGCTGGTGTATCCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGACTGCGTGCCCGTGGCGAACAGGTGGCATTTCTTGGCTTGCTGGATa < 6:342045/148‑1 (MQ=255) aGCGCATCTGGCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGACTGCGTGCCCGTGGCGAACAGGTGGCATTTCTTGGCTTGCTGGATACCt > 8:193287/1‑149 (MQ=255) gcgcATCTGGCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGACTGCGTGCCCGTGGCGAACAGGTGGCATTTCTTGGCTTGCTGGATACCTg < 1:109964/149‑1 (MQ=255) gcATCTGGCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCCGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGACTGCGTGCCCGTGGCGAACAGGTGGCATTTCTTGGCTTGCTGGATACCt < 2:42949/146‑1 (MQ=255) gcATCTGGCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCCGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGACTGCGTGCCCGTGGCGAACAGGTGGCATTTCTTGGCTTGCTGGATACCt > 1:42949/1‑146 (MQ=255) aTCTGGCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGACTGCGTGCCCGTGGCGAACAGGTGGCATTTCTTGGCTTGCTGGATACCTGgccg > 4:3161/1‑149 (MQ=255) tGGCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGACTGCGTGCCCGTGGCGAACAGGTGGCATTTCTTGGCTTGCTGGATACCTGgccgc > 2:288293/1‑147 (MQ=255) ggCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGACTGCGTGCCCGTGGCGAACAGGTGGCAt < 2:175759/119‑1 (MQ=255) ggCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGACTGCGTGCCCGTGGCGAACAGGTGGCAt > 1:175759/1‑119 (MQ=255) aaCGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGACTGCGTGCCCGTGGCGAACAGGTGGCATTTCTTGGCTTGCTGGATACCTGGCCGCCAGaaa > 7:36203/1‑149 (MQ=255) aaCGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGACTGCGTGCCCGTGGCGAACAGGTGGCATTTCTTGGCTTGCTGGATACCTGGCCGCCAGaaa > 4:210752/1‑149 (MQ=255) aCGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTTCTGGGGTATTCCCTTGGCGTTACGCTGGCGCAGGTTATTGCGGCTCGACTGCGTTACCGGGTCGAACAGTTGGCATTTCTTGGCTTGCTGGATACCTGGCCGCCAGAAAc < 8:275531/149‑1 (MQ=255) aCGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGACTGCGTGCCCGTGGCGAACAGGTGGCATTTCTTGGCTTGCTGGATACCTGGCCGCCAGAAAc < 7:193287/149‑1 (MQ=255) aCTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGACTGCGTGCCCGTGGCGAACAGGTGGCATTTCTTGGCTTGCTGGATACCTGGCCGCCAGAAACGCaa > 8:108278/1‑148 (MQ=255) ttGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGACTGCGTGCCCGTGGCGAACAGGTGGCATTTCTTGGCTTGCTGGATACCTGGCCGCCAGAAACGCAAAAc > 6:264916/1‑149 (MQ=255) ttGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGACTGCGTGCCCGTGGCGAACAGGTGGCATTTCTTGGCTTGCTGGATACCTGGCCGCCAGAAACGCAAAAc > 8:227649/1‑149 (MQ=255) ttGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGACTGCGTGCCCGTGGCGAACAGGTGGCATTTCTTGGCTTGCTGGATACCTGGCCGCCAGAAACGCAAAAc > 8:268473/1‑149 (MQ=255) ttGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGACTGCGTGCCCGTGGCGAACAGGTGGCATTTCTTGACTTGc > 3:315380/1‑120 (MQ=255) ttGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGACTGCGTGCCCGTGGCGAACAGGTGGCATTTCTTGACTTGc < 4:315380/120‑1 (MQ=255) ttGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGACTGCGTGCCAGTGGCGAACAGGTGGCATTTCTTGGCTTGCTGGATACCTGGCCGCCAGAAACGCAAAAc > 1:200667/1‑149 (MQ=255) 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aTGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGACTGCGTGCCCGTGGCGAACAGGTGGCATTTCTTGGCTTGCTGGATACCTGGCCGCCAGAAACGCAAAACTGGCAGGAAAaag > 6:72789/1‑147 (MQ=255) ccTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGACTGCGTGCCCGTGGCGAACAGGTGGCATTTCTTGGCTTGCTGGATACCTGGCCGCCAGAAACGCAAAACTGGCAGGAAAAAGAAGCTaa < 6:81413/149‑1 (MQ=255) ccTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGACTGCGTGCCCGTGGCGAACAGGTGGCATTTCTTGGCTTGCTGGATACCTGGCCGCCAGAAACGCAAAACTGGCAGGAAAAAGAAGCTaa > 4:82878/1‑149 (MQ=255) ttattaCCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGACTGCGTGCCCGTGGCGAACAGGTGGCATTTCTTGGCTTGCTGGATACCTGGCCGCCAGAAACGCAAAACTGGCAGGAAAAAGAAGCTAATg > 3:55844/1‑149 (MQ=255) ttaCCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGACTGCGTGCCCGTGGCGAACAGGTGGCATTTCTTGGCTTGCTGGATACCTGGCCGCCAGAAACGCAAAACTGGCAGGAAAAAGAAGCTAATGGTc < 3:3161/149‑1 (MQ=255) ccTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGACTGCGTGCCCGTGGCGAACAGGTGGCATTTCTTg < 6:151491/86‑1 (MQ=255) ccTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGACTGCGTGCCCGTGGCGAACAGGTGGCATTTCTTg > 5:151491/1‑86 (MQ=255) tgctgGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGACTGCGTGCCCGTGGCGAACAGGTGGCATTTCTTGGCTTGCTGGATACCTGGCCGCCAGAAACGCAAAACTGGCAGGAAAAAGAAGCTAATGGTCTg > 3:50669/1‑146 (MQ=255) tgctgGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGACTGCGTGCCCGTGGCGAACAGGTGGCATTTCTTGGCTTGCTGGATACCTGGCCGCCAGAAACGCAAAACTGGCAGGAAAAAGAAGCTAATGGTCTg < 4:50669/146‑1 (MQ=255) | GTTATCTCGATCCACAATGGTCGATTATCGGCATTCAGTCACCGCGCCCCAATGGCCCCATGCAGACGGCGGCAAACCTGGATGAAGTCTGCGAAGCGCATCTGGCAACGTTACTTGAACAACAACCGCATGGCCCTTATTACCTGCTGGGGTATTCCCTTGGCGGTACGCTGGCGCAGGGTATTGCGGCGCGACTGCGTGCCCGTGGCGAACAGGTGGCATTTCTTGGCTTGCTGGATACCTGGCCGCCAGAAACGCAAAACTGGCAGGAAAAAGAAGCTAATGGTCTG > NC_000913/617413‑617702 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |