| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,115,547 | A→G | 5.0% | L117P (CTG→CCG) | wcaM ← | colanic acid biosynthesis protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,115,547 | 0 | A | G | 5.0% | 251.9 / 2.5 | 79 | L117P (CTG→CCG) | wcaM | colanic acid biosynthesis protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (39/36); new base G (2/2); total (41/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.67e-01 | |||||||||||
GCGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGACCCGTTTGTTTTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGACAAATCGCCCTCTGCCGTTGCCGCGCAAGCTTCCAAGAATGTGTAACGTTTTACCGGGAGGGATAAAGATGCCGGTGTTGATATTGT > NC_000913/2115400‑2115694 | gCGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGACCCGTTTGTTTTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCa < 6:154648/148‑1 (MQ=255)gCGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGACCCGTTTGTTTTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAg < 6:251670/149‑1 (MQ=255) cGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGACCCGTTTGTTTTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAgg < 8:55278/149‑1 (MQ=255) cGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGACCCGTTTGTTTTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAgg > 7:235086/1‑149 (MQ=255) gTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATGAGGTTGCGCATGACCCGTTTGTTTTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAggg < 5:104640/149‑1 (MQ=255) gTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGACCCGTTTGTTTTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATTGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAggg < 5:263330/149‑1 (MQ=255) gTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGACCCGTTTGTTTTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAggg > 5:108274/1‑149 (MQ=255) aTTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGACCCGTTTGTTTTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAGGGt > 3:33162/1‑147 (MQ=255) aTTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGACCCGTTTGTTTTTGCCGCCGATATAAATCTGCGGCACCGGGCCAAAGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAGGGTGa < 1:246746/149‑1 (MQ=255) gCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGACCCGTTTGTTTTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGtt < 1:373775/149‑1 (MQ=255) gCTAACGGTCATGTTTTCTATGATCAGGTTTCTCATGACCCGTTTTTTTTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATGc < 6:354169/148‑1 (MQ=255) tAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGACCCGTTTGTTTTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCGGGGTGATGTTATGCATa > 7:158537/1‑149 (MQ=255) cGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGACCCGTTTGTTTTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTg < 5:73572/149‑1 (MQ=255) ggTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGACCCGTTTGTTTTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACAT‑CAGGGTGATGTTATGCATACTgcc > 7:138795/1‑149 (MQ=255) tCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGACCCGTTTGTTTTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTgccg < 8:235086/149‑1 (MQ=255) tCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGACCCGTTTGTTTTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTACAGTCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTgccg > 1:95477/1‑149 (MQ=255) tCGATGATCAGGTTGCGCATGACCCGTTTGTTTTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAg > 7:141174/1‑119 (MQ=255) tCGATGATCAGGTTGCGCATGACCCGTTTGTTTTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAg < 8:141174/119‑1 (MQ=255) cGATGATCAGGTTGCGCATGACCCGTTTGTTTTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCAtcctcc > 7:340763/1‑149 (MQ=255) cGATGATCAGGTTGCGCATGACCCGTTTGTTTTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCAtcctcc > 6:34121/1‑149 (MQ=255) gatgatCAGGTTGCGCATGACCCGTTTGTTTTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTccc < 5:146197/149‑1 (MQ=255) cAGGTTGCGCATGACCCGTTTGTTTTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATg > 6:302661/1‑123 (MQ=255) cAGGTTGCGCATGACCCGTTTGTTTTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATg < 5:302661/123‑1 (MQ=255) aTGACCCGTTTGTTTTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGcc > 5:355619/1‑149 (MQ=255) tGACCCGTTTGTTTTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCg > 7:307078/1‑149 (MQ=255) aCCCGTTTGTTTTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTACAGTCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTc < 2:95477/149‑1 (MQ=255) cGTTTGTTTTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTg < 4:345839/149‑1 (MQ=255) gtttgtttTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACAT‑CAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTGTa < 8:138795/149‑1 (MQ=255) tttttGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCGGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGAc < 8:158537/149‑1 (MQ=255) tttttGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATa > 5:145942/1‑105 (MQ=255) tttttGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATa < 6:145942/105‑1 (MQ=255) tttttGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGAc < 8:212738/149‑1 (MQ=255) gccgATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGACAAATCGcc < 4:33162/149‑1 (MQ=255) gccgATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGACAAATCGcc < 8:307078/149‑1 (MQ=255) ccgATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGACAAATCGccc > 7:237846/1‑149 (MQ=255) gATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGACAAATCGCCctc < 6:31535/149‑1 (MQ=255) aaTCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCAcc < 5:201077/112‑1 (MQ=255) aaTCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCAcc > 6:201077/1‑112 (MQ=255) aTCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGACAAATCGCCCTCTGCCGtt > 1:193130/1‑149 (MQ=255) tCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGACAAATCGCCCTCTGCCGTTg > 8:434469/1‑149 (MQ=255) tCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGACAAATCGCCCTCTGCCGTTg > 3:396671/1‑149 (MQ=255) cGTCACCGGGCCAAAGCCGCGCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGACAAATCGCCCTCTGCCGTTg < 4:7139/145‑1 (MQ=255) tCACCGGGCCAAAGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGACAAATCGCCCTCTGCCGTTGCcgcg > 6:64841/1‑148 (MQ=255) ccGGGCCAAAGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGACAAATCGCCCTCTGCCGTTGCCGCGCAAg > 5:51281/1‑149 (MQ=255) cGGGCCAAAGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGACAAATCGCCCTCTGCCGTTGCCGCGCAAGc > 4:401147/1‑149 (MQ=255) ggCCAAAGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGACAAATCGCCCTCTGCCGTTGCCGCGCAAGCtt > 6:217751/1‑149 (MQ=255) aaGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGACAAATCGCCCTCTGCCGTTGCCGCGCAAGCTTcc > 8:164945/1‑146 (MQ=255) aGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGACAAATCGCCCTCTGCCGTTGCCGCGCAAGCTTCCAAg > 1:27188/1‑148 (MQ=255) ccGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGACAAATCGCCCTCTGCCGTTGCCGCGCAAGCTTCCAAGAAt < 5:34121/149‑1 (MQ=255) gCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGAc < 6:163994/108‑1 (MQ=255) gCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGAc > 5:163994/1‑108 (MQ=255) tCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCGGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGACAAATCGCCCTCTGCCGTTGCCGCGCAAGCTTCCAAGAAtgtg > 5:183335/1‑148 (MQ=255) aGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGACAAATCGCCCTCTGCCGTTGCCGCGCAAGCTTCCAAGAATGTGTAACGttt > 6:61473/1‑148 (MQ=255) aGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGACAAATCGCCCTCTGCCGTTGCCGCGCAAGCTTCCAAGAATGTGTAACGttt > 1:428457/1‑148 (MQ=255) cccTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGACAAATCGCCCTCTGCCGTTGCCGCGCAAGCTTCCAAGAATGTGTAACGTTTTAc > 3:352199/1‑149 (MQ=255) cccTTAGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAGGCAGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCAGTAACACGAATAGCCCTATGCCGTTGCCGCGCAAGCTTCAAAGAAAGTGTAACTTTTTAc > 8:407149/1‑149 (MQ=255) cTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGACAAATCGCCCTCTGCCGTTGCCGCGCAAGCTTCCAAGAATGTGTAACGTTTTACCg > 2:237369/1‑149 (MQ=255) aTGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGACAAATCGCCCTCTGCCGTTGCCGCGCAAGCTTCCAAGAATGTGTAACGTTTTACCgggagg < 4:352199/149‑1 (MQ=255) tGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGACAAATCGCCCTCTGCCGTTGCCGCGCAAGCTTCCAAGAATGTGTAACGTTTTACCgggaggg < 5:61473/149‑1 (MQ=255) gTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGACAAATCGCCCTCTGCCGTTGCCGCGCAAGCTTCCAAGAATGTGTAACGTTTTACCGGGAGGGAt < 5:64841/149‑1 (MQ=255) cAGTCAGAACCACGCACATCCGGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGACAAATCGCCCTCTGCCGTTGCCGCGCAAGCTTCCAAGAATGTGTAACGTTTTACCGGGAGGGATaa < 6:183335/148‑1 (MQ=255) aGTCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGACAAATCGCCCTCTGCCGTTGCCGCGCAAGCTTCCAAGAATGTGTAACGTTTTACCGGGAGGGATAAAg < 1:237369/149‑1 (MQ=255) gTCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGACAAATCGCCCTCTGCCGTTGCCGCGCAAGCTTCCAAGAATGTGTAACGTTTTACCGGGAGGGATAAAGa < 6:355619/149‑1 (MQ=255) tCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGACAAATCGCCCTCTGCCGTTGCCGCGCAAGCTTCCAAGAATGTGTAACGTTTTACCGGGAGGGATAAAGAt < 5:217751/149‑1 (MQ=255) tCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGACAAATCGCCCTCTGCCGTTGCCGCGCAAGCTTCCAAGAATGTGTAACGTTTTACCGGGAGGGATAAAGAt > 3:236997/1‑149 (MQ=255) cAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGACAAATCGCCCTCTGCCGTTGCCGCGCAAGCTTCCAAGAAGGTGTAACGTTTTACCGGGAGGGATAAAGATg > 1:222043/1‑149 (MQ=255) gAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGACAAATCGCCCTCTGCCGTTGCCGCGCAAGCTTCCAAGAATGTGTAACGTTTTACCGGGAGGTATAAAGATGcc < 3:401147/149‑1 (MQ=255) ccACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGACAAATCGCCCTCTGCCGTTGCCGCGCAAGCTTCCAAGAATGTGTAACGTTTTACCGGGAGGGATAAAGATGCCGgt < 6:51281/149‑1 (MQ=255) ccACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTAACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGACAAATCGCCCTCTGCCGTTGCCGCGCAAGCTTCCAAGAATGTGTAACGTTTTACCGGGAGGGATAAAGATGCAGgt > 5:343367/1‑149 (MQ=255) cACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGACAAATCGCCCTCTGCCGTTGCCGCGCAAGCTTCCAAGAATGTGTAACGTTTTACCGGGAGGGATAAAGATGCCGgtg > 3:153569/1‑149 (MQ=255) aCGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGACAAATCGCCCTCTGCCGTTGCCGCGCAAGCTTCCAAGAATGTGTAACGTTTTAc > 2:345170/1‑125 (MQ=255) aCGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGACAAATCGCCCTCTGCCGTTGCCGCGCAAGCTTCCAAGAATGTGTAACGTTTTAc < 1:345170/125‑1 (MQ=255) cGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGACAAATCGCCCTCTGCCGTTGCCGCGCAAGCTTCCAAGAATGTGTAACGTTTTACCGGGAGGGATAAAGATGCCGGTGtt < 6:108274/149‑1 (MQ=255) cGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGACAAATCGCCCTCTGCCGTTGCCGCGCAAGCTTCCAAGAATGTGTAACGTTTTACCGGGAGGGATAAAGATGCCGGTGtt > 1:105863/1‑149 (MQ=255) gCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGACAAATCGCCCTCTGCCGTTGCCGCGCAAGCTTCCAAGAATGTGTAACGTTTTACCGGGAGGGATAAAGATGCCGGTGtt > 2:243977/1‑148 (MQ=255) gCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGACAAATCGCCCTCTGCCGTTGCCGCGCAAGCTTCCAAGAATGTGTAACGTTTTACCGGGAGGGATAAAGATGCCGGTGTTg < 7:434469/149‑1 (MQ=255) acaTCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGACAAATCGCCCTCTGCCGTTGCCGCGCAAGCTTCCAAGAATGTGTAACGTTTTACCGGGAGGGATAAAGATGCCGGTGTTGa > 5:252370/1‑148 (MQ=255) aTCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGACAAATCGCCCTCTGCCGTTGCCGCGCAAGCTTCCAAGAATGTGTAACGTTTTACCGGGAGGGATAAAGATGCCGGTGTTGatat > 1:295243/1‑149 (MQ=255) ccAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCCTCCTCCCCTGTCTCCTGGCTGCCGGCCTGTAAGACTAATCGCCCTCTGCCGTTGCCGCGCAAGCTTCCAAGAATGTGTAACGTTTTACCGGGAGGGATAAAGATGCCGGTGTTGatat < 1:150031/147‑1 (MQ=255) cAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTTTCACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGACAAATCGCCCTCTGCCGTTGCCGCGCAAGCTTCCAAGAATGTGTAACGTTTTACCGGGAGGGATAAAGATGCCGGTGTTGATATTGt > 6:325156/1‑149 (MQ=255) aGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGACAAATCGCCCTCTGCCGTTGCCGCGCAAGCTTCCAAGAATGTGTAACGTTTTACCGGGAGGGATAAAGATGCCGGTGTTGATATTGt > 4:191084/1‑148 (MQ=255) | GCGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGACCCGTTTGTTTTTGCCGCCGATATAAATCTGCGTCACCGGGCCAAAGCCGCTCATAGTCAGCCCTTTGATGGTGCAGTCAGAACCACGCACATCCAGGGTGATGTTATGCATACTGCCGCCATCCTCCCCTGTCACCTGGCTGCCGTCCTGTAAGACAAATCGCCCTCTGCCGTTGCCGCGCAAGCTTCCAAGAATGTGTAACGTTTTACCGGGAGGGATAAAGATGCCGGTGTTGATATTGT > NC_000913/2115400‑2115694 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |