| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2643100 | 39 (1.070) | 9 (0.280) | 9/230 | 2.3 | 18.8% | intergenic (‑256/+29) | rodZ/rlmN | MreB assembly cytoskeletal protein/dual specificity 23S rRNA m(2)A2503, tRNA m(2)A37 methyltransferase, SAM‑dependent |
| ? | NC_000913 | = 2643110 | 43 (1.320) | intergenic (‑266/+19) | rodZ/rlmN | MreB assembly cytoskeletal protein/dual specificity 23S rRNA m(2)A2503, tRNA m(2)A37 methyltransferase, SAM‑dependent | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TGTGCTCGTGACAAAGCCCACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACCACAGGCAGCATCGATATCATCACCAC > NC_000913/2642956‑2643244 | tgtgCTCGTGACAAATCAAACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTa < 8:6754/146‑1 (MQ=255) cTCGTGACAAAGCCCACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTtactttat > 3:33165‑M1/1‑141 (MQ=255) aaaGCCCACTTTCACTAAGTCTAAATTACTGTTGCATCTTTACATACTGCCTTAAAGTCAGAAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAaccgtg > 8:47887‑M2/1‑143 (MQ=255) aaaGCCCACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTtactttatgtaccgtg < 4:33165‑M1/149‑17 (MQ=255) aaGCCCACATTCAGTTAGGCTAACGTACTGTTGCAGCGTTACATACTGCCTTAATGGCAGCAAAATCGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAACACATTACGCCACTGTtactttatgtaccgtgg < 8:119264‑M1/149‑18 (MQ=255) aaGCCCACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTtactttatgtaccgtgg > 6:167115‑M1/1‑132 (MQ=255) gCCCACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTtactttatgtaccgtggcg < 5:167115‑M1/149‑20 (MQ=255) aTTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATgg > 5:40130/1‑149 (MQ=255) tAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTtactttatgtaccgtggcgtaatgttttat > 1:104394‑M1/1‑118 (MQ=255) ttACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCttt > 8:73038/1‑148 (MQ=255) ttGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGt < 7:73038/147‑1 (MQ=255) tCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAaccgt > 4:2213‑M2/1‑107 (MQ=255) tCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAaccgt < 3:2213‑M2/112‑6 (MQ=255) aTACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCAccc > 1:149341/1‑149 (MQ=255) tACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCt < 6:40130/149‑1 (MQ=255) aCTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTg > 1:916/1‑149 (MQ=255) ttAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCg > 7:27438/1‑149 (MQ=255) aaGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTtactttatgtaccgtggcgtaatgttttatgaatgaagtattaagttgcaattgtctggtcaatattaac < 2:104394‑M1/149‑71 (MQ=255) aGTCAGCTAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTa < 8:27438/149‑1 (MQ=255) gCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAg < 2:149341/149‑1 (MQ=255) cAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAgg > 4:157554/1‑149 (MQ=255) aaaaaCGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAggg > 7:115350/1‑149 (MQ=255) gCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAac > 7:8573‑M2/1‑75 (MQ=255) gCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAac < 8:8573‑M2/77‑3 (MQ=255) gCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGAt > 7:63182/1‑114 (MQ=255) gCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGAt < 8:63182/114‑1 (MQ=255) cGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCtt > 8:119868/1‑100 (MQ=255) cGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCtt < 7:119868/100‑1 (MQ=255) gTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAaccgtggcgtaatgttttatgaatgaagtattaagttgcaattgtctggtcaatattaacggtgcgtttttgctgactt < 2:104394‑M2/149‑80 (MQ=255) atatTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGt < 8:115350/149‑1 (MQ=255) aCCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGt > 2:141918/1‑95 (MQ=255) aCCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGt < 1:141918/95‑1 (MQ=255) aCAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATcg > 7:41552/1‑149 (MQ=255) aaTTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATcgcc < 3:157554/149‑1 (MQ=255) aaTACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCa > 5:37248/1‑63 (MQ=255) aaTACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCa < 6:37248/63‑1 (MQ=255) tACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACca > 7:17388/1‑149 (MQ=255) aCTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTtactttatgtaccgtggc > 8:89039‑M1/1‑29 (MQ=255) aCTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTtactttatgtaccgtggc < 7:89039‑M1/47‑19 (MQ=255) ttcattcaTAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTa < 8:35258/116‑1 (MQ=255) ttcattcaTAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTa > 7:35258/1‑116 (MQ=255) ttcattcaTAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACCACAg > 2:183756/1‑149 (MQ=255) attcatAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACCACAGgc < 2:916/148‑1 (MQ=255) atAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAaccgtggcgtaatgttttatgaatgaagtattaagttgcaattgtctggtcaatattaacggtgcgtttttgctgactttaaggcagtatgtaacgatgcaacagtaagttagcctta > 1:104394‑M2/1‑30 (MQ=255) tAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACCACTGGCAGCATc < 8:41552/149‑1 (MQ=255) aaaaCATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGCCCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCGTCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACCACAGGCAGCATc > 1:166127/1‑148 (MQ=255) 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ccACGGTACATAAAGTAaccgtggcgtaatgttttatgaatgaagtattaagttgcaattgtctggtcaatattaacggtgcgtttttgctgactttaaggcagtatgtaacgatgcaacagtaagttagccttagtgaatgtgggctt > 6:167115‑M2/1‑17 (MQ=255) ccACGGTACATAAAGTAacagtggcgtaatgtgttatgaatgaagtattaagttgcaattgtctggtcaatattaacggtgcgattttgctgccattaaggcagtatgtaacgctgcaacagtacgttagcctaactgaatgtgggctt < 8:119264‑M2/149‑133 (MQ=255) ccACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACCACAGGCAGCATCGATATCATcacc > 4:45102/1‑149 (MQ=255) cACGGTtactttatgtaccgtggcgtaatgttttatgaatgaagtattaagttgcaattgtctggtcaatattaacggtgcgttttttctgactttaaggcagtatgtaaagatgcaacagtaatttagacttagtgaaagtgggcttt > 8:47887‑M1/1‑6 (MQ=255) cACGGTACATAAAGTAaccgtggcgtaatgttttatgaatgaagtattaagttgcaattgtctggtcaatattaacggtgcgtttttgctgactttaaggcagtatgtaacgatgcaacagtaagttagccttagtgaatgtgggcttt < 4:33165‑M2/149‑134 (MQ=255) cACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATg > 2:84696/1‑50 (MQ=255) cACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACCACAGGCAGCATCGATATCATcacca > 4:64173/1‑149 (MQ=255) aCGGTtactttatgtaccgtggcgtaatgttttatgaatgaagtattaagttgcaattgtctggtcaatattaacggtgcgtttttgctgactttaaggcagtatgtaacga > 4:2213‑M1/1‑5 (MQ=255) aCGGTtactttatgtaccgtggcgtaatgttttatgaatgaagtattaagttgcaattgtctggtcaatattaacggtgcgtttttgctgactttaaggcagtatgtaacga < 3:2213‑M1/112‑108 (MQ=255) ggTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTAAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACCACAGGCAGCATCGATATCATcaccac > 2:93612/1‑147 (MQ=255) gTtactttatgtaccgtggcgtaatgttttatgaatgaagtattaagttgcaattgtctggtcaatattaacggtgc < 8:8573‑M1/77‑76 (MQ=255) gTtactttatgtaccgtggcgtaatgttttatgaatgaagtattaagttgcaattgtctggtcaatattaacggtgc > 7:8573‑M1/1‑2 (MQ=255) gTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACCACAGGCAGCATc > 2:100900/1‑132 (MQ=255) gTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACCACAGGCAGCATc < 1:100900/132‑1 (MQ=255) | TGTGCTCGTGACAAAGCCCACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACCACAGGCAGCATCGATATCATCACCAC > NC_000913/2642956‑2643244 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |