New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1443998 | 51 (0.580) | 3 (0.040) | 3/240 | NT | 5.8% | coding (948/2640 nt) | ydbH | putative membrane‑anchored protein, function unknown |
? | NC_000913 | = 1444006 | 51 (0.640) | coding (956/2640 nt) | ydbH | putative membrane‑anchored protein, function unknown |
GCCGTATGCAGGTTTTCCTTTGAGTGGCCGACTGGGTGTCAAAGTCGACAACTGGCAGGCAGGGCTTGAGAACGCTCTGGTCAGCGGACGACTGAGTGTGCTGACCCAGGGGCAAGCGGGTAAGGGCAACGCGGTGCTTAATTTTGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACAGTCAGCTGCCTCTGCAGCTGACCGGTGAAGCGAAACAGGCGGACCTCATTTTATATGCCCGTTTACCTGCGCAGCTAAGTGGAAGTCTGTCTGACCCAACGCTGACCTTTGAGCCAGGC > NC_000913/1443854‑1444145 | gCCGTATGCAGGTTTTCCTTTGAGTGGCCGACTGGGTGTCAAAGTCCACAACTGGCAGGCAGGGCTTGAGAACGCTCTGGTCAGCGGACGACTGAGTGTGCTGACCCAGGGGCAAGCGGGTAAGGGCAACGCGGTGCTTAATTTTGGcc < 7:33020/149‑1 (MQ=255) cGTATGCAGGTTTTCCTTTGAGTGGCCGACTGGGTGTCAAAGTCGACAACTGGCAGGCAGGGCTTGAGAACGCTCTGGTCAGCGGACGACTGAGTGTGCTGACCCAGGGGCAAGCGGGTAAGGGCAACGCGGTGCTTAATTTTGGCCCa < 8:283671/149‑1 (MQ=255) cAGGTTTACCTTTGAGTGGCCGACTGGGTGTCAAAGACGACAACTGGCAGGCAGGGCTTGATAACGCTCTCGTCAGCGGACGACTGACTGTGCTGACCCAGTGTCAAGCGGGTAAGGGCAACGCGGTGCTTAATTTTGTCACAGGaaaa < 5:368040‑M2/149‑5 (MQ=255) ggTTTTCCTTTGAGTGGCCGACTGGGTGGCAAAGTCGACAACTGGCAGGCAGGGCTTGAGAACGCTCTGGTCAGCGGACGACTGAGTGTGCTGACCCAGGGGCAAGCGGGTAAGGGCAACGCGGTGCTTAATTTTGGCCCAGGaaaatt > 1:143016‑M2/1‑143 (MQ=255) cTTTGAGTGGCCGACTGGGTGTCAAAGTCGACAACTGGCAGGCAGGGCTTGAGAACGCTCTGGTCAGCGGACGACTGAGTGTGCTGACCCAGGGGCAAGCGGGTAAGGGCAACGCGGTGCTTAATTTTcctgggccaaaattaagcac < 7:343963‑M1/148‑21 (MQ=255) tGGCCGTCTGGGTGTCAAAGTCGACAACTGGAAGTCAGGGCTTGAGAACGATCTGGTCATCGGACGACTGAGTGTGCTGACCCAGGGGGAAGCGGGTAAGGGCAACGCGGTGGTTAATTTTGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACa < 4:231622/149‑1 (MQ=255) tGGCCGACTGGGTGTCAAAGTAGACATCTGGCAGGCAGGGCTTGAGAACGCTCTGGTCAGCGGACGACTGAGTGTGCTGACCCAGGGGCAAGCGGGTAAGGGCAACGCGGTGCTTAATTTTGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACa < 6:368040/149‑1 (MQ=255) cGACTGGGTGTCAAAGTCGACAACTGGCAGGCAGGGCTTGAGAACGCTCTGGTCAGCGGACGACTGAGTGTGCTGACCCAGGGGCAAGAGGGTAAGGGCAACGCGGTGCTTAATTTTGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACAGt > 6:305756/1‑147 (MQ=255) aCTGGGTGTCAAAGTCGACAACTGGCAGGCAGGGCTTGAGAACGCTCTGGTCAGCGGACGACTGAGTGTGCTGACCCAGGGGCAAGCGGGTAAGGGCAACGCGGTGCTTAATTTTGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACAGTCAGc < 3:6774/149‑1 (MQ=255) cTGGGTGTCAAAGTCGACAACTGGCAGGCAGGGCTTGAGAACGCTCTGGTCAGCGGACGACTGAGTGTGCTGACCCAGGGGCAAGCGGGTAAGGGCAACGCGGTGCTTAATTTTGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACAGTCAGCt < 1:200777/149‑1 (MQ=255) cAAAGTCGACAACTGGCAGGCAGGGCTTGAGAACGCTCTGGTCAGCGGACGACTGAGTGTGCTGACCCAGGGGCAAGCGGGTAAGGGCAACGCGGTGCTTAATTTTGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACAGTCAGCTGCCTCTg > 7:270130/1‑148 (MQ=255) aaaGTCGACAACTGGCAGGCAGGGCTTGAGAACGCTCTGGTCAGCGGACGACTGAGTGTGCTGACCCAGGGGCAAGCGGGTAAGGGCAACGCGGTGCTTAATTTTGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACAGTCAGCTGCCTCTg > 6:124316/1‑147 (MQ=255) gACAACTGGCAGGCAGGGCTTGAGAACGCTCTGGTCAGCGGACGACTGAGTGTGCTGACCCAGGGGCAAGCGGGTAAGGGCAACGCGGTGCTTAATTTTGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACAGTCAGCTGCCTCTGCAGCTGAc > 4:372641/1‑149 (MQ=255) gACAACTGGCAGGCAGGGCTGGCGAACGCTCTGGTCAGCGGACGACTGAGTGTGCTGACCCAGGGGCAAGCGGGTAAGGGCACCGCGGTGCTTAATTTTGGCCCAGGAAAATTTAGCATGGATAACCGTCAGCTGCCTCTGCAGCTgcc > 3:204093/1‑147 (MQ=255) aaCTGGCAGGCAGGGCTTGAGAACGCTCTGGTCAGCGGACGACTGAGTGTGCTGACCCAGGGGCAAGCGGGTAAGGGCAACGCGGTGCTTAATTTTGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACAGTCAGCTGCCTCTGCAGCTGACCgg < 4:249179/149‑1 (MQ=255) cTGGCAGGCAGGGCTTGAGAACGCTCTGGTCAGCGGACGACTGAGTGTGCTGACCCAGGGGCAAGCGGGTAAGGGCAACGCGGTGCTTAATTTTGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACAGTCAGCTGCCTCTGCAGCTGACCGGTg < 4:171262/149‑1 (MQ=255) gcaggcagGGCTTGAGAACGCTCTGGTCAGCGGACGACTGAGTGTGCTGACCCAGGGGCAAGCGGGTAAGGGGAACGCGGTGCTTAATTTTGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACAGTCAGCTGCCTCTGCAGCTGACCGGTGaa < 6:177211/148‑1 (MQ=255) gcaggcagGGCTTGAGAACGCTCTGGTCAGCGGACGACTGAGTGTGCTGACCCAGGGGCAAGCGGGTAAGGGCAACGCGGTGCTTAATTTTGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACAGTCAGCTGCCTCTGCAGCTGACCGGTGa < 3:306772/147‑1 (MQ=255) gcaggGCTTGAGAACGCTCTGGTCAGCGGACGACTGAGTGTGCTGACCCAGGGGCAAGCGGGTAAGGGCAACGCGGTGCTTAATTTTGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACAGTCAGCTGCCTCTGCAGCTGACCGGTGAAGCGa > 4:356349/1‑148 (MQ=255) gagaACGCTCTGGTCAGCGGACGACTGAGTGTGCTGACCCAGGGGCAAGCGGGTAAGGGCAACGCGGTGCTTAATTTTGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACAGTCAGCTGCCTCTGCAGCTGACCGGTGAAGCGAAACAGGCGGa > 5:181474/1‑149 (MQ=255) cGCTCTGGTCAGCGGACGACTGAGTGTGCTGACCCAGGGGCAAGCGGGTAAGGGCAACGCGGTGCTTAATTTTGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACAGTCAGCTGCCTCTGCAGCTGACCGGTGAAGCGAAACAGGCGGACCTCa > 3:352958/1‑149 (MQ=255) ctctGGTCAGCGGACGACTGAGTGTGCTGACCCAGGGGCAAGCGGGTAAGGGCAACGCGGTGCTTAATTTTGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACAGTCAGCTGCCTCTGCAGCTGACCGGTGAAGCGAAACAGGCGGACCTCAtt < 2:119177/149‑1 (MQ=255) ctctGGGCAGCGGACGACTGAGTGTGCTGACCCAGGGGCAAGCGGGTAAGGGCAACGCGGTGCTTAATTTTGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACAGTCAGCTGCCTCTGCAGCTGACCGGTGAAGCGAAACAGGCGGACCTCAtt < 1:203490/149‑1 (MQ=255) gTCAGCGGACGACTTAGTGTGCTGACCCAGGGGCAAGCGGGTAAGGGCAACGCGGTTCTTAATTTTGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACAGTCAGCTGCCTCTGCAGCTGACCGGTGAAGCGAAACAGGCGGACCTCAtttt < 7:370610/146‑1 (MQ=255) gTCAGCGGACGACTGAGTGTGCTGACCCAGGGGCAAGCGGGTAAGGGCAACGCGGTGCTTAATTTTGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACAGTCAGCTGCCTCTGCAGCTGACCGGTGAAGCGAAACAGGCGGACCTCATTTta < 6:373669/147‑1 (MQ=255) acgacTGAGTGTGCTGACCCAGGGGCAAGCGGGTAAGGGCAACGCGGTGCTTAATTTTGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACAGTCAGCTGCCTCTGCAGCTGACCGGTGAAGCGAAACAGGCGGACCTCATTTTATATGCCCGtt < 4:352958/149‑1 (MQ=255) gacTGAGTGTGCTGACCCAGGGGCAAGCGGGTAAGGGCAACGCGGTGCTTAATTTTcctgggccaaaattaagc > 7:230974‑M1/1‑56 (MQ=255) gacTGAGTGTGCTGACCCAGGGGCAAGCGGGTAAGGGCAACGCGGTGCTTAATTTTcctgggccaaaattaagc < 8:230974‑M1/74‑19 (MQ=255) acTGAGTGTGCTGACCCAGGGGCAAGCGGGTAAGGGCAACGCGGTGCTTAATTTTGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACAGTCAGCTGCCTCTGCAGCTGACCGGTGAAGCGAAACAGGCGGACCTCATTTTATATGCCCGTTTAc < 6:181474/149‑1 (MQ=255) cTGAGTGTGCTGACCCAGGGGCAAGCGGGTAAGGGCAACGCGGTGCTTAATTTTGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACAGTCAGCTGCCTCTGCAGCTGACCGGTGAAGCGAAACAGGCGGACCTCAtttt < 2:229938/134‑1 (MQ=255) cTGAGTGTGCTGACCCAGGGGCAAGCGGGTAAGGGCAACGCGGTGCTTAATTTTGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACAGTCAGCTGCCTCTGCAGCTGACCGGTGAAGCGAAACAGGCGGACCTCAtttt > 1:229938/1‑134 (MQ=255) cTGAGTGTGCTGACCCAGGGGCAAGCGGGTAAGGGCAACGCGGTGCTTAATTTTGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACAGTCAGCTGCCTCTGCAGCTGACCGGTGAAGCGAAACAGGCGGACCTCATTTtata > 6:95009/1‑137 (MQ=255) cTGAGTGTGCTGACCCAGGGGCAAGCGGGTAAGGGCAACGCGGTGCTTAATTTTGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACAGTCAGCTGCCTCTGCAGCTGACCGGTGAAGCGAAACAGGCGGACCTCATTTtata < 5:95009/137‑1 (MQ=255) tGAGTGTGCTGACCCAGGGGCAAGCGGGTAAGGGCAACGCGGTGCTTAATTTTGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACCGTCAGCTGCCTCTGCAGCTGACCGGTGAAGCGAAACAGGCGGACCTCATTTTATATGCCCGTTTACCt > 5:283272/1‑149 (MQ=255) aGTGTGCTGCCCCAGGGGCAAGCGGGTAAGGGCAACGCGGTGCTTAATTTTGGCCCTGGAAAATTAAGCATGGATAACAGTCAGCTGCCTCTGCAGCTGACCGGTGAAGCGAAACAGGCGGACCTCATTTTATATGCCCGTTTACCTgc > 6:58884/1‑149 (MQ=255) cTGACCCAGGGGCAAGCGGGTAAGGGCAACGCGGTGCTTAATTTTGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACAGTCAGCTGCCTCTGCAGCTGACCGGTGaa < 1:342435/102‑1 (MQ=255) cTGACCCAGGGGCAAGCGGGTAAGGGCAACGCGGTGCTTAATTTTGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACAGTCAGCTGCCTCTGCAGCTGACCGGTGaa > 2:342435/1‑102 (MQ=255) tGACCCAGGGGCAAGCGGGTAAGGGCAACGCGGTGCTTAATTTTGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACAGTCAGCTGCCTCTGCAGCTGACCGGTGAAGCGAAACAGGCGGACCTCa > 6:169162/1‑120 (MQ=255) tGACCCAGGGGCAAGCGGGTAAGGGCAACGCGGTGCTTAATTTTGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACAGTCAGCTGCCTCTGCAGCTGACCGGTGAAGCGAAACAGGCGGACCTCa < 5:169162/120‑1 (MQ=255) gACCCAGGGGCAAGCGGGTAAGGGCAACGCGGTGCTTAATTTTGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACAGTCAGCTGCCTCTGCAGCTGACCGGTGAAGCGAAACAGGCGGACCTCATTTTATATGCCCGTTTACCTGCGCAGCTaa > 8:347739/1‑149 (MQ=255) aCCCAGGGGCAAGCGGGTAAGGGCAACGCGGTGCTTAATTTTGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACAGTCAGCTGCCTCTGCAGCTGACCGGTGAAGCGAAACAGGCGGACCTCATTTTATATGCCCGTTTACCTGCGCAGCTAAg > 1:4349/1‑149 (MQ=255) ccAGGGGCAAGCGGGTAAGGGCAACGCGGTGCTTAATTTTGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACAGTCAGCTGCCTCTGCAGCTGACCGGTGAAGCGATACAGGCGGACCTCATTTTATATGCCCTTTTACCTGCGCAGCTAAGTg > 4:329878/1‑149 (MQ=255) ccAGGGGCAAGCGGGTAAGGGCAACGCGGTGCTTAATTTTGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACAGTCAGCTGCCTCTGCAGCTGACCGGTGAAGCGAAACAGGCGGACCTCATTTTATATGCCCGTTTACCTGCGCAGCTAAGTg > 3:23388/1‑149 (MQ=255) ccAGGGGCAAGCGGGTAAGGGCAACGCGGTGATTAATTTTGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACAGTCAGCTGCCTCTGCAGCTGACCGGTTAAGCGAAACAGGCGGACATCATTTTATATTCCCGTTTACCTGCGCAGCTAAGTg > 6:373404/1‑149 (MQ=255) ggggCAAGCGGGTAAGGGCAACGCGGTGCTTAATTTTGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACAGTCAGCTGCCTCTGCAGCTGACCGGTGAAGCGAAACAGGCGGACCTCATTTTATATGCCCGTTTACCTGCGCAGCTAAGTGGaa < 5:124316/149‑1 (MQ=255) gCAAGCGGGTAAGGGCAACGCGGTGCTTAATTTTGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACAGTCAGCTGCCTCTGCAGCTGACCGGTGAAGCGAAACAGGCGGACCTCATTTTATATGCCCGTTTACCTGCGCAGCTAAGTGGAAgtc > 2:53953/1‑149 (MQ=255) aGCGGGTAAGGGCAACGCGGTGCTTAATTTTGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACAGTCAGCTGCCTCTGCAGCTGACCGGTGAAGCGAAACAGGCGGACCTCATTTTATATGCCCGTTTACCTGCGCAGCTAAGTGGAAgtctgt < 3:67563/149‑1 (MQ=255) gTAAGGGCAACGCGGTGCTTAATTTTGGCCCAGGAAAAGTAAGCATGGATAACAGTCAGCTGCCTCTGCAGCTGACCGGTGAAGCGAAACAGGCGGACCTCATTTTATATGCCCGTTTCCCTGCGCAGCTAAGTGGAAGTCGGTCTGAc > 6:42060/1‑149 (MQ=255) aGGGCAACGCGGTGCTTAATTTTGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACAGTCAGCTGCCTCTGCAGCTGACCGGTGAAGCGAAACAGGCGGACCTCATTTTATATGCCCGTTTACCTGCGCAGCTAAGTGGAAGTCTGTCTGAccc > 5:334200/1‑148 (MQ=255) gggCAACGCGGTGCTTAATTTTGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACAGTCAGCTGCCTCTGCAGCTGACCGGTGAAGCGAAACAGGCGGACCTCATTTTATATGCCCGTTTACCTGCGCAGCTAAGTGGaa < 6:321814/134‑1 (MQ=255) gggCAACGCGGTGCTTAATTTTGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACAGTCAGCTGCCTCTGCAGCTGACCGGTGAAGCGAAACAGGCGGACCTCATTTTATATGCCCGTTTACCTGCGCAGCTAAGTGGaa > 5:321814/1‑134 (MQ=255) gggCAACGCGGTGCTTAATTTTGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACAGTCAGCTGCCTCTGCAGCTGACCGGTGAAGCGAAACAGGCGGACCTCATTTTATATGCCCGTTTACCTGCGCAGCTAAGTGGAAGTCTGTCTGACCCaa > 5:333610/1‑149 (MQ=255) gcgGTGCTTAATTTTGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACAGTCAGCTGCCTCTGCAGCTGACCGGTGAAGCGAAACAGGCGGACCTCATTTTATATGCCCGTTTACCTGCGCAGCTAAGTGGAAGTCTGTCTGACCCAACGCTGAc > 3:132091/1‑149 (MQ=255) gcgGTGCTTAATTTTCGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACAGTCAGCTGCCGCTGCAGCTGACCGGTGAAGCGAAACAGGCGGACCTCATTTTATATGCCCGTTTACCTGCGCAGCTAAGTGGAAGTCTGTCTGACCCAACGCTGAc < 6:188038/149‑1 (MQ=255) gTGCTTAATTTTGGCCCAGGaaaattaagcaccgcgttgcccttacccgcttgcccctgggtcagcacactcagtcgtccgctgaccagagcgttctcaagccctgcctgccagttgtcgactttgacacccagtcggccactcaaag < 7:343963‑M2/148‑129 (MQ=255) tGCTTAATTTTGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACAGTCAGCTGCCTCTGCAGCTGACCGGTGAAGCGAAACAGGCGGACCTCATTTTATATGCCCGTTTACCTGCGCAGCTAAGTGGAAGTCTGTCTGACCCAACGCTGACCttt < 6:333610/149‑1 (MQ=255) gCTTAATTTTGGCCCAGGaaaattaagcaccgcgttgcccttacccgcttgcccctgggtcagcacactcagtc > 7:230974‑M2/1‑18 (MQ=255) gCTTAATTTTGGCCCAGGaaaattaagcaccgcgttgcccttacccgcttgcccctgggtcagcacactcagtc < 8:230974‑M2/74‑57 (MQ=255) tAATTTTGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACAGTCAGCTGCCTCTGCAGCTGACCGGTGAAGCGAAACAGGCGGACCTCATTTTATATGCCCGTTTACCTGCGCAGCt < 2:347523/111‑1 (MQ=255) tAATTTTGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACAGTCAGCTGCCTCTGCAGCTGACCGGTGAAGCGAAACAGGCGGACCTCATTTTATATGCCCGTTTACCTGCGCAGCt > 1:347523/1‑111 (MQ=255) aaTTTTcctgggccaaaattaagcaccgcgttgcccttacccgcttgcccctgggtcagcacactcagtcgtccgctgaccagagcgttctcaagccctgcctgccagttgtcgactttgccacccagtcggccactcaaaggaaaacc > 1:143016‑M1/1‑6 (MQ=255) ttttcctgtgacaaaattaagcaccgcgttgcccttacccgcttgacactgggtcagcacagtcagtcgtccgctgacgagagcgttatcaagccctgcctgccagttgtcgtctttgacacccagtcggccactcaaaggtaaacctg < 5:368040‑M1/149‑146 (MQ=255) tGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACAGTCAGCTGCCTCTGCAGCTGACCGGTGAAGCGAAACAGGCGGACCTCATTTTATATGCCCGTTTACCTGCGCAGCTAAGTGGAAGTCTGTCTGACCCAACGCTGACCTTTGAGCCAGgc < 4:204093/148‑1 (MQ=255) | GCCGTATGCAGGTTTTCCTTTGAGTGGCCGACTGGGTGTCAAAGTCGACAACTGGCAGGCAGGGCTTGAGAACGCTCTGGTCAGCGGACGACTGAGTGTGCTGACCCAGGGGCAAGCGGGTAAGGGCAACGCGGTGCTTAATTTTGGCCCAGGAAAATTAAGCATGGATAACAGTCAGCTGCCTCTGCAGCTGACCGGTGAAGCGAAACAGGCGGACCTCATTTTATATGCCCGTTTACCTGCGCAGCTAAGTGGAAGTCTGTCTGACCCAACGCTGACCTTTGAGCCAGGC > NC_000913/1443854‑1444145 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |