| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 3950444 = | 121 (1.390) | 5 (0.060) | 5/248 | NT | 4.0% | intergenic (+24/‑63) | ilvL/ilvX | ilvG operon leader peptide/uncharacterized protein |
| ? | NC_000913 | 3950470 = | 126 (1.520) | intergenic (+50/‑37) | ilvL/ilvX | ilvG operon leader peptide/uncharacterized protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 140 total aligned reads displayed.
CGAACAAGATGCAAGAAAAGACAAAATGACAGCCCTTCTACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGTTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTT > NC_000913/3950297‑3950591 | cGAACAAGATGCAAGAAAAGACAAAATGACAGCCCTTCTACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGa < 5:281354/148‑1 (MQ=255)cGAACAAGATGCAAGAAAAGACAAAATGACAGCCCTTCTACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGa < 8:162218/148‑1 (MQ=255)aacggtgttcacaccctgtgcccgcaacgcatgtaccacccactgtgcgccattcatagttagttccccgtcctgaatcttgagaaacagaattttgtgctgttattcattgtctgctcctcggttatgtttttaaggtcaaaaaaaAc < 4:291705‑M1/2‑1 (MQ=255) gAACAAGATGCAAGAAAAGACAAAATGACAGCCCTTCTACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGAcc 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aaaaTGACAGCCCTTCTACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCgggg > 5:123525/1‑149 (MQ=255) aaTGACAGCCCTTCTACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGt > 4:276023/1‑149 (MQ=255) ccTTCTACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGTTTTTTTTGa > 2:142678/1‑149 (MQ=255) cTTCTACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGTTTTTTTTGAc < 8:50107/149‑1 (MQ=255) cTACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTCATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGTTTTTTTTGACCt < 3:283041/148‑1 (MQ=255) 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1:45772/149‑1 (MQ=255) cAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGTTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGca > 5:76684/1‑147 (MQ=255) cAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGTTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACAGAGGCCCAGCAAATGAATAACAGCACAAAATTATGTTTATAAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGca > 1:134838/1‑147 (MQ=255) aaGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGTTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGcaca < 7:379103/148‑1 (MQ=255) aGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGTTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTtct > 4:70295/1‑108 (MQ=255) cTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGTTTTTTTTGACCTTAAAACCATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTTTTTCGCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGAACAgtggg > 8:165594/1‑149 (MQ=255) aaCGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGTTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGCCAATGAATAACAGCACAAAATTGTGGTTCTCAAGATTCAGGACGGGGACCTAACTATGAATGGCGCACAgtgggtgg > 1:213571/1‑149 (MQ=255) cGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGTTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTa < 8:177191/149‑1 (MQ=255) gAACTAAGACCACCGCACCGTACTGTACGGGGGTTTTTTTTGACCTTAATTACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAATATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTAc < 1:377812/149‑1 (MQ=255) aCTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGTTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACAt < 1:390927/149‑1 (MQ=255) tAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGTTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGTACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGc > 2:229108/1‑149 (MQ=255) tAAGACCCACGCACCAAAAGGTCCGGGGGTTTTTTTTGCCCTTAAAACCATAACCGAGGAGCGCACAATGATTAACAGCCCAAAATTCTGTTATACAAGAGTATGGACGGGGACCTAACTATCATTGGCCAAAAGTGGGTGGTACATGc > 2:102615/1‑149 (MQ=255) aGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGTTTTTTATGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGCCAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTAAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGTTGGGACATGCga > 2:396668/1‑148 (MQ=255) gACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGTTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGtt > 6:310931/1‑149 (MQ=255) | CGAACAAGATGCAAGAAAAGACAAAATGACAGCCCTTCTACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGTTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTT > NC_000913/3950297‑3950591 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |