| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3385184 | 48 (1.310) | 6 (0.170) | 6/232 | 2.9 | 11.5% | intergenic (+11/‑354) | argR/yhcN | l‑arginine‑responsive arginine metabolism regulon transcriptional regulator/cadmium and peroxide resistance protein, stress‑induced |
| ? | NC_000913 | = 3385197 | 46 (1.310) | intergenic (+24/‑341) | argR/yhcN | l‑arginine‑responsive arginine metabolism regulon transcriptional regulator/cadmium and peroxide resistance protein, stress‑induced | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GGTATTCTGGGCACCATCGCTGGCGATGACACCATCTTTACCACCCCTGCTAACGGTTTCACAGTCAAAGACCTGTACGAAGCGATTTTAGAGCTGTTCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAATTTAACGAATAGTGCGTTTTACTGCGACATGTCATTCACACAATGAATACATAAGGTAAAAAAAGCACATTATGCAAAATTCATTATCTAATT > NC_000913/3385060‑3385342 | ggTATTCTGGGCACCATCGCTGGCGATGACACCATCTTTACCACCCCTGCTAACGGTTTCACAGTCAAAGACCTGTACGAAGCGATTTTAGAGCTGTTCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATg > 1:70298/1‑149 (MQ=255) tATTCTGGGCACCATCGCTGGCGATGACACCATCTTTACCACCCCTGCTAACGGTTTCACAGTCAAAGACCTGTACGAAGCGATTTTAGAGCTGTTCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGtt < 5:85777/149‑1 (MQ=255) ttCTGGGCACCATCGCTGGCGATGACACCATCTTTACCACCCCTGCTAACGGTTTCACAGTCAAAGACCTGTACGAAGCGATTTTAGAGCTGTTCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTg < 2:70298/148‑1 (MQ=255) cTGGGCACCATCGCTGGCGATGACACCATCTTTACCACCCCTGCTAACGGTTTCACAGTCAAAGACCTGTACGAAGCGATTTTAGAGCTGTTCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCt > 6:17941/1‑148 (MQ=255) tGGCGATGACACCATCTTTACCACCCCTGCTAACGGTTTCACAGTCAAAGACCTGTACGAAGCGATTTTAGAGCTGTTCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAAccc > 1:104792/1‑149 (MQ=255) ccccTGCTAACGGTTTCACAGTCAAAGACCTGTACGAAGCGATTTTAGAGCTGTTCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAAtt > 1:132452/1‑149 (MQ=255) cTAACGGTTTCACAGTCAAAGACCTGTACGAAGCGATTTTAGAGCTGTTCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAATTTAAc < 5:17941/147‑1 (MQ=255) tCACAGTCAAAGACCTGTACGAAGCGATTTTAGAGCTGTTCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAATTTAACGAATAGTGCGt > 3:148622/1‑149 (MQ=255) cacaGTCAAAGACCTGTACGAAGCGATTTTAGAGCTGTTCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAATTTAACGAATAGTGCGtt > 8:3147/1‑149 (MQ=255) aGTCAAAGACCTGTACGAAGCGATTTTAGAGCTGTTCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAATTTAACGa > 1:41081/1‑136 (MQ=255) aGTCAAAGACCTGTACGAAGCGATTTTAGAGCTGTTCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAATTTAACGa < 2:41081/136‑1 (MQ=255) aGTCAAAGACCTGTACGAAGCGATTTTAGAGCTGTTCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAATTTAACGAATATTGAGtttt > 5:158564/1‑148 (MQ=255) aGTCAAAGACCTGTACGAAGCGATTTTAGAGCTGTTCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAATTTAACGAATAGTGCGTTTTa < 4:148622/149‑1 (MQ=255) tCAAAGACCTGTACGAAGCGATTTTAGAGCTGTTCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAATTTAACGAATAGTGCGTTTTACt < 1:120234/149‑1 (MQ=255) aaaGACCTGTACGAAGCGATTTTAGAGCTGTTCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAATTTAACGAATAGTGCGt < 1:129600/141‑1 (MQ=255) aaaGACCTGTACGAAGCGATTTTAGAGCTGTTCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAATTTAACGAATAGTGCGt > 2:129600/1‑141 (MQ=255) gACCTGTACGAAGCGATTTTAGAGCTGTTCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAATTTAACGAATAGTGCGTTTTACTGCGAc < 2:104792/149‑1 (MQ=255) cTGTACGAAGCGATTTTAGAGCTGTTCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAATTTAACGAATAGTGCGTTTTACTGCGACATg > 3:57441/1‑149 (MQ=255) tACGAAGCGATTTTAGAGCTGTTCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAATTTTACGAATAGTGCGTTTTACTGc > 2:186767/1‑140 (MQ=255) tACGAAGCGATTTTAGAGCTGTTCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAATTTTACGAATAGTGCGTTTTACTGc < 1:186767/140‑1 (MQ=255) aCGAAGATATTTTAGAGCTTTTCGACTAGTTGCTTTAATCTCTTCGTAGTAGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACACCCTGCTTTCAACTGCGATTAATTTAACGAATATTGCGTTTTACTGCGACATGTCa < 6:158564/148‑1 (MQ=255) gAAGCGATTTTAGAGCTGTTCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAATTTAACGAATAGTGCGTTTTACTGCGACATGTCAtt > 6:124690/1‑148 (MQ=255) aTTTTAGAGCTGTTCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAATTTAACGAATAGTGCGTTTTACTGCGACATGTCATTCACACaa < 2:132452/149‑1 (MQ=255) ttttAGAGCTGTTCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAATTTAACGAATAGTGCGTTTTACTGCGACATGTCATTCACACAAt < 4:57441/149‑1 (MQ=255) gagCTGTTCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAATTTAACGAATAGTGCGTTTTACTGCGACATGTCATTCACACAATGAAt < 7:3147/148‑1 (MQ=255) ttCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAAt > 8:149571/1‑95 (MQ=255) ttCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAAt < 7:149571/95‑1 (MQ=255) ttCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAATTTAACGAATAGTGCGTTTTACTGCGACATGTCATTCACACAATGAAt < 2:57173/142‑1 (MQ=255) ttCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAATTTAACGAATAGTGCGTTTTACTGCGACATGTCATTCACACAATGAAt > 1:57173/1‑142 (MQ=255) ggAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCttt > 3:11384/1‑73 (MQ=255) ggAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCttt < 4:11384/73‑1 (MQ=255) gAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAATTTAACGAATAGTGCGTTTTACTGCGACATGTCATTCACACAATGAATACATAAGGTaaaaaaa < 5:124690/149‑1 (MQ=255) cTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAATTTAACGAATAGTGCGTTTTACTGCGACATGTCATTCACACAATGAATACATAAGGTAAAAAAAGca > 5:111416/1‑149 (MQ=255) tttAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGcggggcagagattaaagctcctggtcgaacagctctaaaatcgcttcgtacaggtctttgactgtgaaaccgttagcaggggtggtaaagatggt < 8:115641‑M2/124‑96 (MQ=255) tttAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGcggggcagagattaaagctcctggtcgaacagctctaaaatcgcttcgtacaggtctttgactgtgaaaccgttagcaggggtggtaaagatggt > 7:115641‑M2/1‑29 (MQ=255) ttAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGcggggcagagattaaagctcctggtcgaacagctctaaaatcgcttcgtacaggtctttgactgt > 5:88366‑M2/1‑28 (MQ=255) ttAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGcggggcagagattaaagctcctggtcgaacagctctaaaatcgcttcgtacaggtctttgactgt < 6:88366‑M2/93‑66 (MQ=255) aTCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAATTTAACGAATAGTGCGTTTTACTGCGACATGTCATTCACACAATGAAt > 1:174003/1‑125 (MQ=255) aTCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAATTTAACGAATAGTGCGTTTTACTGCGACATGTCATTCACACAATGAAt < 2:174003/125‑1 (MQ=255) tctGCCCCGTCGTTTCTGACGGggcagagattaaagctcctggtcgaacagctctaaaatcgcttcgtacaggtctttgactgtgaaaccgttagcaggggtggtaaagatggtgtc > 6:127562‑M2/1‑22 (MQ=255) tctGCCCCGTCGTTTCTGACGGggcagagattaaagctcctggtcgaacagctctaaaatcgcttcgtacaggtctttgactgtgaaaccgttagcaggggtggtaaagatggtgtc < 5:127562‑M2/117‑96 (MQ=255) tctGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAAccccc < 7:4537/55‑1 (MQ=255) tctGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAAccccc > 8:4537/1‑55 (MQ=255) tGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAATTTAACGAATAGTGCGTTTTACTGCGACATGTCATTCACACAATGAATACATAAGGTAAAAAAAGCACATTATg < 6:111416/146‑1 (MQ=255) cccGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAATTTAACGAATAGTGCGTTTTACTGCGACATGTCATTCACACAATGAATACATAAGGTAAAAAAAGCACAtt < 4:147388/140‑1 (MQ=255) cccGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAATTTAACGAATAGTGCGTTTTACTGCGACATGTCATTCACACAATGAATACATAAGGTAAAAAAAGCACAtt > 3:147388/1‑140 (MQ=255) cccGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAATTTAACGAATAGTGCGATTTACTGCGACATGTCATTCACACAATGAATACATAAGGTAAAAAAAGCACATTATGCAAAAt > 7:5860/1‑149 (MQ=255) cgtcgtTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAATTTAACGAATAGTGCGTTTTACTGCGACATGTCATTCACACAATGAATACATAAGGTAAAAAAAGCACATTATGCAAAAtt > 5:47860/1‑148 (MQ=255) tttCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAATTTAACGAATAGTGCGTTTTACTGCGACATGTCAt < 1:163184/97‑1 (MQ=255) tttCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAATTTAACGAATAGTGCGTTTTACTGCGACATGTCAt > 2:163184/1‑97 (MQ=255) tttCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAATTTAACGAATAGTGCGTTTTACTGCGACATGTCATTCACACAATGAATACATAAGGTAAAAAAAGCACATTATGCAAAATTCATTAt > 5:149216/1‑149 (MQ=255) aCGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAATTTAACGAATAGTGCGTTTTACTGCGACATGTCATTCACACAATGAATACATAAGGTAAAAAAAGCACATTATGCAAAATTCATTATCTAAtt > 2:49532/1‑149 (MQ=255) | GGTATTCTGGGCACCATCGCTGGCGATGACACCATCTTTACCACCCCTGCTAACGGTTTCACAGTCAAAGACCTGTACGAAGCGATTTTAGAGCTGTTCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAATTTAACGAATAGTGCGTTTTACTGCGACATGTCATTCACACAATGAATACATAAGGTAAAAAAAGCACATTATGCAAAATTCATTATCTAATT > NC_000913/3385060‑3385342 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |