| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,223,210 | G→A | 5.2% | W193* (TGG→TAG) | ebgA → | evolved beta‑D‑galactosidase, alpha subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,223,210 | 0 | G | A | 5.2% | 232.5 / 2.2 | 76 | W193* (TGG→TAG) | ebgA | evolved beta‑D‑galactosidase, alpha subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (31/41); new base A (2/2); total (33/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.25e-01 | |||||||||||
AACGGTCAGTATGTGGGTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCGCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGCGTACCGACTTTGACGAAGCCTATTGCGATGCCACGCTTTCCTGCGAAGTGGTGCTGGAAAATCTCGCCGCCTCC > NC_000913/3223062‑3223355 | aaCGGTCAGTATGTGGGTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCGCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATgtggtg > 6:350746/1‑149 (MQ=255) ggTCAGTATGTGGGTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGCCCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCGCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTggtggt > 3:5437/1‑148 (MQ=255) gTCAGTATGTGGGTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCGCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTggtggt > 4:142782/1‑147 (MQ=255) tCAGTATGTGGGTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGGTGTGTGTGCGCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAg < 1:272276/149‑1 (MQ=255) tATGTGGGTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCGCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCggg < 2:300119/149‑1 (MQ=255) tgtgGGTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATTGTTAAAACCGTCGAGAACCTGTTGTGTGTGCGCGTTATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGa < 5:103709/149‑1 (MQ=255) gtgGGTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCGCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGAt > 3:123871/1‑149 (MQ=255) tgGGTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCGCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGAt < 3:142782/148‑1 (MQ=255) gggTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCGCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGc > 4:266680/1‑141 (MQ=255) gggTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCGCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGc < 3:266680/141‑1 (MQ=255) aGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCGCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCg < 8:382234/135‑1 (MQ=255) aGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCGCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCg > 7:382234/1‑135 (MQ=255) gCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCGCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGAt < 6:119826/149‑1 (MQ=255) cAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGAGAACCTGTTTTGTGTGCGCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGAt < 5:328137/148‑1 (MQ=255) cAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCGCGTGATGCAGTGGGCGTACTCTACCAACGTGGAAGCCCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGag > 6:328137/1‑147 (MQ=255) gggCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAACCCGGCGACACCCTGTTGTGTGTGCGCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGtt > 1:300838/1‑148 (MQ=255) cAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCGCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTTCCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATc < 2:32443/149‑1 (MQ=255) aGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCGCGTGATGCAGTGGGTGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCt < 5:39783/149‑1 (MQ=255) aGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCGCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCt > 8:389570/1‑149 (MQ=255) gCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCGCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGt < 3:44131/148‑1 (MQ=255) gCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCGCATGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGGCAGCGGGGAGCTTCCGCGATGTTTATCTGGt < 2:52127/148‑1 (MQ=255) ccTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCGCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTAGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCg > 7:277747/1‑149 (MQ=255) ccTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCGCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTAGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCg > 7:283267/1‑149 (MQ=255) ccGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCGCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGaaaa < 1:213259/149‑1 (MQ=255) cGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCGCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGaaaa > 6:136122/1‑148 (MQ=255) cAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCGCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGCTTATCTGGTCGGAAAacac > 2:77321/1‑149 (MQ=255) agagTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCGCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACAcc < 4:159776/149‑1 (MQ=255) gttGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCGCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGGCGGAAAACACCTAAc < 3:219032/148‑1 (MQ=255) aCATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCGCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCat < 7:389570/149‑1 (MQ=255) aCATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCGCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCa < 4:5437/148‑1 (MQ=255) aGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCGCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCTATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTaa < 4:123871/149‑1 (MQ=255) gATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCGCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTAGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGAtt < 8:283267/149‑1 (MQ=255) gATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCGCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTAGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACCCATATTAACGAtt < 8:277747/149‑1 (MQ=255) aaaCCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCGCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACtgtg < 5:350746/149‑1 (MQ=255) aCCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCGCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGCg > 2:200185/1‑149 (MQ=255) cAACCTGTTGTGTGTGCGCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGCGTACCGACt > 4:48370/1‑149 (MQ=255) aCCTGTTGTGTGTGCGCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGCGTACCGACttt < 3:69213/149‑1 (MQ=255) cTGTTGTGTGTGCGCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCt < 2:236988/110‑1 (MQ=255) tgttgtGTGTGCGCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACtgt > 1:38733/1‑133 (MQ=255) tgttgtGTGTGCGCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACtgt < 2:38733/133‑1 (MQ=255) tgttgtGTGTGCGCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGCGTACCGACATTGAc > 8:310049/1‑149 (MQ=255) gttgtGTGTGCGCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACGAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCCCtgtg < 1:322335/133‑1 (MQ=255) gttgtGTGTGCGCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACAAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACtgtg > 2:322335/1‑133 (MQ=255) tgtgtgtgCGCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAAc > 1:247964/1‑119 (MQ=255) tgtgtgtgCGCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAAc < 2:247964/119‑1 (MQ=255) tgtgtgCGCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGCGTACCGACTTTGACGAAGc < 3:255927/149‑1 (MQ=255) tgtgCGCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGATTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGCGTACCTACTTTGACGAAGcc > 7:163252/1‑148 (MQ=255) cgTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGCGTa < 4:151539/125‑1 (MQ=255) cgTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGCGTa > 3:151539/1‑125 (MQ=255) cgTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGCGTACCGACGTTGCCGAAGCCTATTGCg > 6:287423/1‑149 (MQ=255) gTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCg > 7:192779/1‑57 (MQ=255) gTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCg < 8:192779/57‑1 (MQ=255) gTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCGTATTAACGATTTCACTGTGCGTACCGACTTTGACGAAGCCTATTGCGa > 8:30484/1‑149 (MQ=255) gTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGCGTACCGACTTTGACGAAGCCTATTGCGa < 7:170503/149‑1 (MQ=255) tGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTAGGTGGAAGACCAGGTTATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGAt < 1:218336/110‑1 (MQ=255) tGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGTGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGCGTACCGACTTTGACGAAGCCTATTGCGATGcc < 1:200185/149‑1 (MQ=255) gCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGCGTACCGACTTTGACGAAGCCTATTGCGATGCCa > 2:233120/1‑149 (MQ=255) cAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGCGTACCGACTTTGACGAAGCCTATTGCGATGCCa < 6:138433/148‑1 (MQ=255) tGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGCGTACCGACTTTGACGAAGCCTATTGCGATGCCACGCt > 6:170871/1‑149 (MQ=255) gCGGACTCTACCTACGTGGAAGACGAGGATATGTGGTGGGCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTTTCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGCGTACCGACTTTGACGAAGCCTATTGCGATGCCACGCTTTc < 3:324793/149‑1 (MQ=255) cGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGGCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGCCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGCGTACCGACTTTGACGAAGCCTATTGCGATGCCACGCTTTcc < 6:177109/149‑1 (MQ=255) ggACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGCGTACCGACTTTGACGAAGCCTATTGCGATGCCACGCTTTCCt < 5:136122/149‑1 (MQ=255) ggACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGCTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGCGTACCGACTTTGACGAAGCCTATTGCGATGCCACGCTTTCCt < 1:77321/149‑1 (MQ=255) gACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGCGTACCGACTTTGACGAAGCCTATTGCGATGCCACGCTTTCCTg > 8:239519/1‑149 (MQ=255) tacctacGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGCGTACCGACTTTGACGAAGCCTATTGCGAt < 6:226898/130‑1 (MQ=255) tacctacGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGCGTACCGACTTTGACGAAGCCTATTGCGAt > 5:226898/1‑130 (MQ=255) tacctacGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGCGTACCGACTTTGACGAAGCCTATTGCGATGCCACGCTTTCCTGCGAAg > 1:166942/1‑149 (MQ=255) cctacGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGCGTACCGACTTTGACGAAGCCTATTGCGATGCCACGCTTTCCTGCGaa < 3:48370/146‑1 (MQ=255) cctacGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGCGTACCGACTTTGACGAAGCCTATTGCGATGCCACGCTTTCCTGCGAAgtg > 4:107153/1‑149 (MQ=255) cctacGAGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGCGTACCGACTTTGACGAAGCCTATTGCGATGCCACGCTTTCCTGCGAAgt < 8:394352/148‑1 (MQ=255) ctacGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGCGTACCGACTTTGACGAAGCCTATTGCGATGCCACGCTTTCCTGCGAAgtgg > 3:156509/1‑149 (MQ=255) ctacGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGCGTACCGACTTTGACGAAGCCTATTGCGATGCCACGCTTTCCTGCGAAgtgg > 7:146886/1‑149 (MQ=255) aCCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGCTGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGCGTACCGACTTTGACGAAGCCTATTGCGATGCCACGCTTTCCTGCGAAGTGGTGCTGGaaaa > 4:123793/1‑148 (MQ=255) aCCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGCGTACCGACTTTGACGAAGCCTATTGCGATGCCACGCTTTCCTGCGAAGTGGTGCTGGAAAAt > 2:165594/1‑149 (MQ=255) cAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGATAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGAGTACCGACTTTGACGAAGCCTCTTGCGATGCCACGCGTTCCTGCGAAGTGGTGCTGGAAAAtct > 8:136781/1‑149 (MQ=255) aGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAACCACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGCGTACCGACTTTGACGAAGCCTATTGCGATGCCACGCTTTCCTGCGAAGTGGTGCTGGAAAAtctc > 2:187533/1‑149 (MQ=255) aGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCGTATTAACGATTTCACTGTGCGTACCGACTTTGACGAAGCCTATTGCGATGCCACGCTTTCCTGCGAAGTGGTGCTGGAAAAtctc < 7:30484/149‑1 (MQ=255) atatGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGCGTACCGACTTTGACGAAGCCTATTGCGATGCCACGCTTTCCTGCGAAGTGGTGCTGGAAAATCTcgcc < 2:300838/149‑1 (MQ=255) atatGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGCGTACCGACATTGACGAAGCCTATTGCGATGCCACGCTTTCCTGCGAAGGGGTGCTGGAAAATCTcgcc < 7:310049/149‑1 (MQ=255) ggtggtCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGCGTACCGACTTTGACGAAGCCTATTGCGATGCCACGCTTTCCTGCGAAGTGGTGCTGGAAAATCTCGCCGCCTcc > 6:69798/1‑149 (MQ=255) ggtggtCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGCGTACCGACTTTGACGAAGCCTATTGCGATGCCACGCTTTCCTGCGAAGTGGTGCTGGAAAATCTCGCCGCCTc < 4:61521/148‑1 (MQ=255) ggtggtCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGCGTACCGACTTTGACGAAGCCTATTGCGATGCCACGCTTTCCTGAGAAGTGGTGCTGGAAAATCTCGCCGCCTc > 3:61521/1‑148 (MQ=255) tggtCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGCGTACCGACTTTGACGAAGCCTATTGCGAt > 6:364486/1‑102 (MQ=255) tggtCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGCGTACCGACTTTGACGAAGCCTATTGCGAt < 5:364486/102‑1 (MQ=255) | AACGGTCAGTATGTGGGTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCGCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGCGTACCGACTTTGACGAAGCCTATTGCGATGCCACGCTTTCCTGCGAAGTGGTGCTGGAAAATCTCGCCGCCTCC > NC_000913/3223062‑3223355 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |