New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 2700077 | 128 (1.320) | 6 (0.070) | 6/246 | 10.0 | 4.7% | intergenic (+154/+40) | yfhL/shoB | putative 4Fe‑4S cluster‑containing protein/toxic membrane protein |
? | NC_000913 | = 2700087 | 127 (1.440) | intergenic (+164/+30) | yfhL/shoB | putative 4Fe‑4S cluster‑containing protein/toxic membrane protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
GAGTATTAATTATATTACTGGGAAGCCTTAACGCCATTATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAATCAGGTATCGGCAATCAGTCATTCGTTTTTCCTTAAACAAGGAATGCAGCCATTCAGAT > NC_000913/2699942‑2700234 | gTATTAATTATATTACTGGGAAGCCTTAACGCCATTATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGAc < 3:21475/149‑1 (MQ=255) aattaTATTACTGGGAAGCCTTAACGCCATTATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCAcc > 1:283833/1‑149 (MQ=255) aattaTATTACTGGGAAGCCTTAACGCCATTATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCAc < 8:260279/148‑1 (MQ=255) ttaTATTACTGGGAAGCCTTAACGCCATTATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCt > 8:93835/1‑148 (MQ=255) ttACTGGGAAGCCTTAACGCCATTATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTa > 7:51347/1‑149 (MQ=255) cTTAACGCCATTATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTtgtg > 8:160361/1‑149 (MQ=255) cTTAACGCCATTATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTtgtg < 7:93835/149‑1 (MQ=255) cTTAACGCCATTATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTtgtg < 7:290114/149‑1 (MQ=255) ttAACGCCATTATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAATGTGCGTCCTACTGGTTCACCGTACGCACCTTAAGTACGTTTCCTtgttt > 6:324099/1‑147 (MQ=255) aaCGCCATTATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTtgt > 3:235515/1‑145 (MQ=255) aaCGCCATTATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTgtgt < 7:160361/147‑1 (MQ=255) aaCCCCATTATATTTAATTAAATCAAGACATTACCATAATCATTCACTAAGTTAATATATATAGTATCAGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTtgt < 4:235515/145‑1 (MQ=255) aCGCCATTATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTta < 1:163936/148‑1 (MQ=255) cGCCATTATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTtata < 7:140466/149‑1 (MQ=255) gCCATTATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATaa < 1:350592/149‑1 (MQ=255) taTTATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAg < 5:324099/147‑1 (MQ=255) ttATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGaa > 5:37497/1‑148 (MQ=255) tataTTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTAc < 5:159166/127‑1 (MQ=255) tataTTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTAc > 6:159166/1‑127 (MQ=255) tatttattTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAg > 2:89948/1‑148 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aTTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAg > 1:300348/1‑149 (MQ=255) ttAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAg > 7:254793/1‑148 (MQ=255) gCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAat < 4:227105/149‑1 (MQ=255) cATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAatg < 2:283833/149‑1 (MQ=255) cATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAat > 5:242706/1‑148 (MQ=255) tAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAatgat > 5:150056/1‑149 (MQ=255) aaTCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAatgat > 8:248893/1‑148 (MQ=255) aaTCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAatgat > 2:294699/1‑148 (MQ=255) tCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAg < 5:40587/139‑1 (MQ=255) aTTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGAttt < 4:102512/149‑1 (MQ=255) ttCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGAtttt > 3:249901/1‑149 (MQ=255) aCTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGTTGATTTtgat < 2:133152/149‑1 (MQ=255) aCTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTtga < 8:377188/148‑1 (MQ=255) aCTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTtga < 2:423350/148‑1 (MQ=255) aGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGAc < 6:36194/148‑1 (MQ=255) 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ttatttatAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGc < 4:357282/89‑1 (MQ=255) ttatttatAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAATCAGGTATCGGCAATCAGTCAtt > 6:283073/1‑149 (MQ=255) atttatAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAATCAGGTATCGGCAATCAGTCATTc < 4:181016/148‑1 (MQ=255) tttatAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCaa > 2:412660/1‑99 (MQ=255) tttatAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAATCAGGTATCGGCAATCAGTCATTCGt > 2:371430/1‑149 (MQ=255) tttatAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAATCAGGTATCGGCAATCAGTCATTCGt < 2:167419/149‑1 (MQ=255) ttatAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAATCAGGTATCGGCAATCAGTCATTCGt < 4:215441/148‑1 (MQ=255) ataGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAATCAGGTATCGGCAATCAGTCATTCGtttt > 5:90646/1‑149 (MQ=255) gTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAATCAGGTATCGGCAATCAGTCATTCg < 6:341062/142‑1 (MQ=255) gTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAATCAGGTATCGGCAATCAGTCATTCGTTTTTcc < 5:283073/149‑1 (MQ=255) gTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAATCAGGTATCGGCAATCAGTCATTCGTTTTTcc > 2:398605/1‑149 (MQ=255) 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attaAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAATCAGGTATCGGCAATCAGTCATTCGTTTTTCCtt < 1:398605/148‑1 (MQ=255) ttaAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGATTAATCAGGTATCGGCAATCAGTCATTCTTTTTTACTTa > 2:358328/1‑148 (MQ=255) aaaGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAATCAGGTATCGGCAATCAGTCATTCGTTTTTCCTTaaa < 5:202065/148‑1 (MQ=255) aaGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAATCAGGTATCGGCAATCAGTCATTCGTTTTTCCTTAAAc > 8:136062/1‑148 (MQ=255) gCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAATCAGGTATCGGCAATCAGTCATTCGTTTTTCCTTAAACAAGGaa < 6:150056/149‑1 (MQ=255) cGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAATCAGGTATCGGCAATCAGTCATTCGTTTTTCCTTAAACAAGGaa < 6:242706/148‑1 (MQ=255) tCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGGTGATTTTGATGACCCGTTTAATCAGGTATCGGCAATCAGTCATTCGTTTTTCCTTAAACAAGGAATg > 4:129195/1‑148 (MQ=255) cGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAATCAGGTATCGGCAATCAGTCATTCGTTTTTCCTTAAACAAGGAATGCa < 2:248828/148‑1 (MQ=255) cGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAATCAGGTATCGGCAATCAGTCATTCGTTTTTCCTTAAACAAGGAATGCa < 7:136062/148‑1 (MQ=255) gACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAATCAGGTATCGGCAATCAGTCATTCGTTTTTCCTTAAACAAGGAATGCAGc > 4:313602/1‑149 (MQ=255) aCTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAATCAGGTATCGGCAATCAGTCATTCGTTTTTc < 1:162315/129‑1 (MQ=255) cTGGCTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTAGTGTTATAAGCACAGAAGGAGCAGCTGTAAAACCGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAATCAGGTCTCGGCAATCAGTCATTCGCTCTTCCTTAAACAAGGAATGCAGCCa < 2:95969/149‑1 (MQ=255) gTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAATCAGGTATCGGCAATCAGTCATTCGTTTTTCCTTAAACAAGGAATGCAGCCAtt < 1:114688/148‑1 (MQ=255) gTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAATCAGGTATCGGCAATCAGTCATTCGTTTTTCCTTAAACAAGGAATGCAGCCAtt > 5:140740/1‑148 (MQ=255) ttCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAATCAGGTATCGGCAATCAGTCATTCGTTTTTCCTTAAACAAGGAATGCAGCCATTCa < 6:189272/149‑1 (MQ=255) ttCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCATTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAATCAGGTATCGGCAATCAGTCATTCGTTTTTCCTTAAACAAGGAATg > 5:335534/1‑139 (MQ=255) aCCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAATCAGGTATCGGCAATCAGTCATTCGTTTTTCCTTAAACAAGGAATGCAGCCATTCAGa < 3:167606/148‑1 (MQ=255) aCCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAATCAGGTATCGGCAATCAGTCATTCGTTTTTCCTTAAACAAGGAATGCAGCCATTCAGAt < 6:69952/149‑1 (MQ=255) | GAGTATTAATTATATTACTGGGAAGCCTTAACGCCATTATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAATCAGGTATCGGCAATCAGTCATTCGTTTTTCCTTAAACAAGGAATGCAGCCATTCAGAT > NC_000913/2699942‑2700234 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |