Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,213,789 | T→C | 5.6% | Q112R (CAG→CGG) | yjaB ← | GNAT‑family putative N‑acetyltransferase; acetyl coenzyme A‑binding protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,213,789 | 0 | T | C | 5.6% | 217.9 / 2.7 | 71 | Q112R (CAG→CGG) | yjaB | GNAT‑family putative N‑acetyltransferase; acetyl coenzyme A‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (36/31); new base C (2/2); total (38/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.73e-01 |
AAGTTCAGCCCACCGGGATGAGAAAAAATCGCCTACGCCCCCACATACGCCAGATTCAGCAACGGATACGGTTTCCCCAAATCGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGATCGATAAACAGCGCATCCATATGCTGCCCACTTAGCAACATAAAT > NC_000913/4213648‑4213932 | aaGTGCCGCCCACCGGGATGAGAAAAAATCGCCTACGCCCCCACATACGCCAGATTCAGCAACGGATACGGTTTCCCCAAAGCGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTATCCTTAAATCCCACCTTCTTATAGTACCCCACCGCCTGCTCa < 2:253835/147‑1 (MQ=39) aGTTCAGCCCACCGGGATGAGAAAAAATCGCCTACGCCCCCACATACGCCAGATTCAGCAACGGATACGGTTTCCCCAAATCGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCAtt < 8:160588/148‑1 (MQ=255) ccGGGATGAGAAAAAATCGCCTACGCCCCCACATACGCCAGATTCAGCAACGGATACGGTTTCCCCAAATCGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCATCCGCCTGCTCATTTTGCTc < 8:303714/143‑1 (MQ=255) ccGGGATGAGAAAAAATCGCCTACGCCCCCACATACGCCAGATTCAGCAACGGATACGGTTTCCCCAAATCGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCATCCGCCTGCTCATTTTGCTc > 7:303714/1‑143 (MQ=255) cGGGATGAGAAAAAATCGCCTACGCCCCCACATACGCCATATTCAGAAACGGCAACGGTTTCCACAAATCGTCCACCACAGAGCGTCCCGTAACCTTACACCCCACAGTCTGAGAGAACCCCCCCGCCTGATCATTTTGCTCATTagc > 2:319659/1‑146 (MQ=255) cGGGATGAGAAAAAATCGCCTACGCCCCCACATACGCCAGATTCAGCAACGGATACGGTTTCCCCAAATCGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAAc > 8:399190/1‑148 (MQ=255) cGGGATGAGAAAAAATCGCCTACGCCCCCACATACGCCAGATTCAGCAACGGATACGGTTTCCCCAAATCGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACACACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAAc > 5:278038/1‑148 (MQ=255) gggATGAGAAAAAATCGCCTACGCCCCCACATACGCCAGATTCAGCAACGGATACGGTTTCCCCAAATCGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACg < 8:134838/148‑1 (MQ=255) agaAAAAATCGCCTACGCCCCCACATACGCCAGATTCAGCAACGGATACGGTTTCCCCAAATCGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTACCCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACgttggtt > 4:193044/1‑148 (MQ=255) agaAAAAATCGCCTACGCCCCCACATACGCCAGATTCAGCAACGGATACGGTTTCCCCAAATCGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACgttggtt > 5:348006/1‑148 (MQ=255) gaAAAAATCGCCTACGCCCCCACATACGCCAGATTCAGCAACGGATACGGTTTCCCCAAATCGTCCAGCTCAGAGCTTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACgttggtt < 7:118830/147‑1 (MQ=255) aaaaaaTCGCCTACGCGCCCACATACGCCAGATTCAGCAACGGATACGGTGTCCCCAAATCGTCCACCACAGAGCGTCCCGTACCCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCACCCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACgttggttg > 2:390790/1‑147 (MQ=255) aaaaaaTCGCCTACGCCCCCACATACGCCAGATTCAGCAACGGATACGGTTTCCCCAAATCGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTg < 7:259866/130‑1 (MQ=255) aaaaaaTCGCCTACGCCCCCACATACGCCAGATTCAGCAACGGATACGGTTTCCCCAAATCGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTg > 8:259866/1‑130 (MQ=255) aaaaaTCGCCTACGCCCCCACATACGCCAGATTCAGCAACGGATACGGTTTCCCCAAATCGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTc < 7:109953/148‑1 (MQ=255) aaaaaTCGCCTACGCCCCCACATACGCCAGATTCAGCAACGGATACGGTTTCCCCAAATCGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTc < 4:71094/148‑1 (MQ=255) gCCTACGCCCCCACATACGCCAGATTCAGCAACGGATACGGTTTCCCCAAATCGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTcc < 6:348006/147‑1 (MQ=255) cacaTACGCCAGATTCAGCAACGGATACGGTTTCCCCAAATCGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCTGTGCCATCgag < 6:278038/148‑1 (MQ=255) cacaTACGCCAGATTCAGCAACGGATACGGTTTCCCCAAATCGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATc > 8:371139/1‑145 (MQ=255) aTACGCCAGATTCAGCAACGGATACGGTTTCCCCAAATCGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAgc > 2:135699/1‑148 (MQ=255) aTACGCCAGATTCAGCAACGGATACGGTTTCCCCAAATCGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAgc > 2:181634/1‑148 (MQ=255) cGCCAGATTCAGCAACGGATACGGTTTCCCAAACTCGTCCACCTCAGATCGGCCAGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTTTAGAACCGAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGGTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAgcga < 1:319659/147‑2 (MQ=255) cAGATTCAGCAACGGATACGGTTTCCCCAAATCGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATg > 2:154088/1‑147 (MQ=255) aTTCAGCAACGGATACGGTTTCCCCAAATCGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTc > 3:104525/1‑147 (MQ=255) ttCAGCAACGGATACGGTTTCCCCAAATCGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTcc > 2:320361/1‑147 (MQ=255) ttCAGCAACGGATACGGTTTCCCCAAATCGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTcc < 1:320361/147‑1 (MQ=255) gCAACGGATACGGTTTCCCCAAATCGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAg > 3:259274/1‑148 (MQ=255) cAACGGATACGGTTTCCCCAAATCGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGc < 1:181634/148‑1 (MQ=255) gATACGGTTTCCCCAAATCGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTATAACCCACATACTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCAGTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCCTCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCAccc > 2:265943/1‑147 (MQ=255) aCGGTTTCCCCAAATCGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGGTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGAcc > 8:396428/1‑148 (MQ=255) tatCCCCAAAACGTCCACCTCAGAGCGTCCAGTAAACTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCGCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTAcg < 4:50684/146‑1 (MQ=255) ttCCCCAAATCGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGa < 7:271653/141‑1 (MQ=255) ttCCCCAAATCGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGa > 8:271653/1‑141 (MQ=255) ttCCCCAAATCGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTAcgc > 1:242143/1‑148 (MQ=255) ccccAAATCGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTAcgcc < 7:247481/147‑1 (MQ=255) ccAAATCGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTcc > 5:270776/1‑101 (MQ=255) ccAAATCGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTcc < 6:270776/101‑1 (MQ=255) aaaTCGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACgt < 2:216051/85‑1 (MQ=255) aaaTCGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACgt > 1:216051/1‑85 (MQ=255) aaTCGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTcc < 4:124378/98‑1 (MQ=255) aaTCGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTcc > 3:124378/1‑98 (MQ=255) aTCGTCCACCTCAGAGCGGCCCGTCACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCTACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGCGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCcg < 8:151736/148‑1 (MQ=255) ccacAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACACACCTTCTTAAAGAACCCAACCGCCCGCTCATTTAGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCCGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCAACGCCGCAGCCGCGCACAt > 1:157424/4‑147 (MQ=255) ccTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCCGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACAt > 1:151856/1‑147 (MQ=255) agagCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTccacc < 4:40090/112‑1 (MQ=255) agagCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTccacc > 3:40090/1‑112 (MQ=255) agagCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGa < 1:390790/148‑1 (MQ=255) ccGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGATCGATaa < 4:259274/147‑1 (MQ=255) ccGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGATCGATaa < 7:371139/147‑1 (MQ=255) cGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGATCGATaaa > 7:276366/1‑147 (MQ=255) tAAGCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCCGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACGTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGATCGATAAACAg < 2:157424/148‑1 (MQ=255) tAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGATCGATAAACAg > 7:390045/1‑148 (MQ=255) tAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCCGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGATCGATAAACAg < 2:151856/148‑1 (MQ=255) aaCCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGATCGATAAACAgc > 2:22279/1‑148 (MQ=255) aaaaCCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGATCGATAAACAGCGCATc < 1:154088/147‑1 (MQ=255) aaCCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACAt > 4:300191/1‑123 (MQ=255) aaCCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACAt < 3:300191/123‑1 (MQ=255) cccACCTTCTTGTAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGATCGATAAACAGCGCATCCat > 8:189758/1‑146 (MQ=255) cccACCTTCTTCTAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGATCGATAAACAGCGCATCCat < 7:189758/146‑1 (MQ=255) ccACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGATCGATAAACAGCGCATCCATAtg > 5:85029/1‑148 (MQ=255) cACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGATCGATAAACAg < 6:63377/135‑1 (MQ=255) cACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGATCGATAAACAg > 5:63377/1‑135 (MQ=255) aCCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGATCGATAAACAGCGCATCCATAtgct > 8:14284/1‑148 (MQ=255) cttcttATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGATCGATAAACAGCGCATCCATAtgctgc < 3:193044/148‑1 (MQ=255) tcttATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGATCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGATCGATAAACAGCGCATCCATATGCTGcc > 2:218103/1‑147 (MQ=255) tataGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGCGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGATCGATAAACAGCGCATCCATATGCTGCCCACt > 2:55818/1‑148 (MQ=255) aGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGATCGATAAACAGCGCATCCATATGCTGCCCACTTAg > 3:369000/1‑148 (MQ=255) gAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGATCGATAAACAGCGCATCCATATGCTGCCCACTTAg < 8:390045/147‑1 (MQ=255) aCCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGATCGATAAACAGCGCATCCATATGCTGCCCACTTAGCAACATa > 2:255989/1‑147 (MQ=255) ccGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGATCGATAAACAGCGCATCCATATGCTGCCCACTTAGCAACATaaa < 7:399190/148‑1 (MQ=255) cGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGATCGATAAACAGCGCATCCATATGCTGCCCACTTAGCAACATAAAt > 4:179992/1‑148 (MQ=255) | AAGTTCAGCCCACCGGGATGAGAAAAAATCGCCTACGCCCCCACATACGCCAGATTCAGCAACGGATACGGTTTCCCCAAATCGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGATCGATAAACAGCGCATCCATATGCTGCCCACTTAGCAACATAAAT > NC_000913/4213648‑4213932 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |