| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 246146 | 66 (1.850) | 4 (0.120) | 4/224 | 3.2 | 6.5% | coding (94/279 nt) | yafQ | mRNA interferase toxin of toxin‑antitoxin pair YafQ/DinJ |
| ? | NC_000913 | = 246167 | 56 (1.740) | coding (73/279 nt) | yafQ | mRNA interferase toxin of toxin‑antitoxin pair YafQ/DinJ | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
AAAAGTTTATCGGTAAGTTTGTAAATCAGGATCCAGTCCGGTTCGACATGAGCATCGCGATAACCTTTCCATGAACCTTGCAGCGGGTGGTCTTTATAAACAGCTGGAAGCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAAATTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTAT > NC_000913/246004‑246288 | aaaaGTTTATCGGTAAGTTTGTAAATCAGGATCCAGTCCGGTTCGACATGAGCATCGCGATAACCTTTCCATGAACCTTGCAGCGGGTGGTCTTTATAAACAGCTGGAAGCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATAttt > 7:105676/1‑149 (MQ=255) gTTTATCGGTAAGTTTGTAAATCAGGATCCAGTCCGGTTCGACATGAGCATCGCGATAACCTTTCCATGAACCTTGCAGCGGGTGGTCTTTATAAACAGCTGGAAGCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAAt < 7:133531/149‑1 (MQ=255) tCGGTAAGTTTGTAAATCAGGATCCAGTCCGGTTCGACATGAGCATCGCGATAACCTTTCCATGAACCTTGCAGCGGGTGGTCTTTATAAACAGCTGGAAGGGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTAtt < 5:137583/149‑1 (MQ=255) gTAAGTTTGTAAATCAGGATCCAGTCCGGTTCGACATGAGCATCGCGATAACCTTTCCATGAACCTTGCAGCGGGTGGTCTTTATAAACAGCTGGAAGCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCa > 4:125155/1‑148 (MQ=255) aGTTTGTAAATCAGGATCCAGTCCGGTTCGACATGAGCATCGCGATAACCTTTCCATGAACCTTGCAGCGGGTGGTCTTTATAAACAGCTGGAAGCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCACATc < 6:96887/149‑1 (MQ=255) tAAATCAGGATCCAGTCCGGTTCGACATGAGCATCGCGATAACCTTTCCATGAACCTTGCAGCGGGTGGTCTTTATAAACAGCTGGAAGCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCat > 2:72595/1‑140 (MQ=255) tAAATCAGGATCCAGTCCGGTTCGACATGAGCATCGCGATAACCTTTCCATGAACCTTGCAGCGGGTGGTCTTTATAAACAGCTGGAAGCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCat < 1:72595/140‑1 (MQ=255) tAAATCAGGATCCAGTCCGGTTCGACATGAGCATCGCGATAACCTTTCCATGAACCTTGCAGCGGGTGGTCTTTATAAACAGCTGGAAGCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTAt < 2:199818/148‑1 (MQ=255) tAAATCAGGATCCAGTCCGGTTCGACATGAGCATCGCGATAACCTTTCCATGAACCTTGCAGCGGGTGGTCTTTATAAACAGCTGGAAGCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATg < 3:125155/149‑1 (MQ=255) aTCAGGATCCAGTCCGGTTCGACATGAGCATCGCGATAACCTTTCCATGAACCTTGCAGCGGGTGGTCTTTATAAACAGCTGGAAGCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGa > 6:113808/1‑120 (MQ=255) aTCAGGATCCAGTCCGGTTCGACATGAGCATCGCGATAACCTTTCCATGAACCTTGCAGCGGGTGGTCTTTATAAACAGCTGGAAGCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGa < 5:113808/120‑1 (MQ=255) tCCAGTCCGGTTCGACATGAGCATCGCGATAACCTTTCCATGAACCTTGCAGCGGGTGGTCTTTATAAACAGCTGGAAGCGGTAAAGTATTATTTATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTAtt < 2:195266/127‑1 (MQ=255) tCCAGTCCGGTTCGACATGAGCATCGCGATAACCTTTCCATGAACCTTGCAGCGGGTGGTCTTTATAAACAGCTGGAAGCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTAtt > 1:195266/1‑127 (MQ=255) aGTCCGGTTCGACATGAGCATCGCGATAACCTTTCCATGAACCTTGCAGCGGGTGGTCTTTATAAACAGCTGGAAGCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCa < 3:132218/149‑1 (MQ=255) aCATGAGCATCGCGATAACCTTTCCATGAACCTTGCAGCGGGTGGTCTTTATAAACAGCTGGAAGCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGat > 6:28412/1‑100 (MQ=255) aCATGAGCATCGCGATAACCTTTCCATGAACCTTGCAGCGGGTGGTCTTTATAAACAGCTGGAAGCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGat < 5:28412/100‑1 (MQ=255) cATCGCGATAACCTTTCCATGAACCTTGCAGCGGGTGGTCTTTATAAACAGCTGGAAGCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACa < 6:1452/140‑1 (MQ=255) cATCGCGATAACCTTTCCATGAACCTTGCAGCGGGTGGTCTTTATAAACAGCTGGAAGCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACa > 5:1452/1‑140 (MQ=255) aaCCTTTCCATGAACCTTGCAGCGGGTGGTCTTTATAAACAGCTGGAAGCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATc < 2:193042/103‑1 (MQ=255) aaCCTTTCCATGAACCTTGCAGCGGGTGGTCTTTATAAACAGCTGGAAGCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATc > 1:193042/1‑103 (MQ=255) aCCTTTCCATGAACCTTGCAGCGGGTGGTCTTTATAAACAGCTGGAAGCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTccc > 1:24644/1‑148 (MQ=255) tGAACCTTGCAGCGGGTGGTCTTTATAAACAGCTGGAAGCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGtttt > 2:173773/1‑118 (MQ=255) tGAACCTTGCAGCGGGTGGTCTTTATAAACAGCTGGAAGCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGtttt < 1:173773/118‑1 (MQ=255) aCCTTGCAGCGGGTGGTCTTTATAAACAGCTGGAAGCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAatat < 8:105676/149‑1 (MQ=255) cTTGCAGCGGGTGGTCTTTATAAACAGCTGGAAGCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATcc > 7:130906/1‑149 (MQ=255) gCAGCGGGTGGTCTTTATAAACAGCTGGAAGCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCttt < 2:153953/119‑1 (MQ=255) gCAGCGGGTGGTCTTTATAAACAGCTGGAAGCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCttt > 1:153953/1‑119 (MQ=255) gtggtCTTTATAAACAGCTGGAAGCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCatat > 3:42211/1‑77 (MQ=255) gtggtCTTTATAAACAGCTGGAAGCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCatat < 4:42211/77‑1 (MQ=255) gtggtCTTTATAAACAGCTGGAAGCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTcc < 2:66250/123‑1 (MQ=255) gtggtCTTTATAAACAGCTGGAAGCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTcc > 1:66250/1‑123 (MQ=255) tggtCTTTATAAACAGCTGGAAGCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCat < 2:24644/149‑1 (MQ=255) gtCTTTATAAACAGCTGGAAGCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCatat > 3:21427/1‑149 (MQ=255) tCTTTATAAACAGCTGGAAGCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCttt > 2:160101/1‑139 (MQ=255) tCTTTATAAACAGCTGGAAGCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCttt < 1:160101/139‑1 (MQ=255) tataAACAGCTGGAAGCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATAttt < 8:130906/146‑1 (MQ=255) tataAACAGCTGGAAGCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTaaa > 4:82197/1‑149 (MQ=255) ataAACAGCTGGAAGCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTaaa > 6:172509/1‑148 (MQ=255) ataAACAGCTGGAAGCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTaaa < 5:172509/148‑1 (MQ=255) aaaCAGCTGGAAGCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAAATTc > 3:70064/1‑149 (MQ=255) gAAGCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAAATTCCTAATTTAt > 5:181576/1‑149 (MQ=255) aaGCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAAATTCCTAATTTATc < 4:70064/149‑1 (MQ=255) aaGCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAAATTCCTAATTTATc < 3:82197/149‑1 (MQ=255) ggTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAAATTCCTAATTTATCaaa > 4:18918/1‑148 (MQ=255) ggTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAAATTCCTAATTTATCaaa < 3:18918/148‑1 (MQ=255) tAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATAtt > 6:87130/1‑92 (MQ=255) tAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATAtt < 5:87130/92‑1 (MQ=255) aaaGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAAATTCCTAATTTATCaaataaa > 4:31696/1‑149 (MQ=255) gTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTTTTc < 7:57144/101‑1 (MQ=255) gTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTc > 8:57144/1‑101 (MQ=255) tattGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAAATTCCTAATTTATCaaa > 2:198887/1‑138 (MQ=255) tattGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAAATTCCTAATTTATCaaa < 1:198887/138‑1 (MQ=255) attGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTa < 2:140456/93‑1 (MQ=255) attGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTa > 1:140456/1‑93 (MQ=255) gATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAAATTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTc > 3:42256/1‑149 (MQ=255) tAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAAATTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCtt < 4:42256/149‑1 (MQ=255) gaagCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGa < 4:9746/82‑1 (MQ=255) gaagCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGa > 3:9746/1‑82 (MQ=255) gCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTccc > 4:152935/1‑77 (MQ=255) gCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTccc < 3:152935/77‑1 (MQ=255) gTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAAATTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTa > 6:115398/1‑149 (MQ=255) tCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAAATTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTAt < 6:181576/149‑1 (MQ=255) cATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAAATTCCTAAtt > 2:149671/1‑115 (MQ=255) cATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAAATTCCTAAtt < 1:149671/115‑1 (MQ=255) aGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAAATTCCTAATTTATCAAATAAATCATCgg < 5:165440/129‑1 (MQ=255) aGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAAATTCCTAATTTATCAAATAAATCATCgg > 6:165440/1‑129 (MQ=255) | AAAAGTTTATCGGTAAGTTTGTAAATCAGGATCCAGTCCGGTTCGACATGAGCATCGCGATAACCTTTCCATGAACCTTGCAGCGGGTGGTCTTTATAAACAGCTGGAAGCGGTAAAGTATTATTGATAAGAAGCGTCATAAGATATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAAATTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTAT > NC_000913/246004‑246288 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |