| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 755,709 | Δ75 bp | coding (150‑224/348 nt) | sdhD → | succinate dehydrogenase, membrane subunit, binds cytochrome b556 |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 755709 | 755783 | 75 | 40 [0] | [0] 40 | sdhD | succinate dehydrogenase, membrane subunit, binds cytochrome b556 |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 755708 | 0 (0.000) | 38 (1.050) | 33/238 | 0.2 | 100% | coding (149/348 nt) | sdhD | succinate dehydrogenase, membrane subunit, binds cytochrome b556 |
| ? | NC_000913 | 755784 = | 0 (0.000) | coding (225/348 nt) | sdhD | succinate dehydrogenase, membrane subunit, binds cytochrome b556 | |||||
TAAGCAACGCCTCCGCATTAGGACGCAATGGCGTACATGATTTCATCCTCGTTCGCGCTACCGCTATCGTCCTGACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGTTTCTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGT > NC_000913/755564‑755855 | tAAGCAACGCCTCCGCATTAGGACGCAATGGCGTACATGATTTCATCCTCGTTCGCGCTACCGCTATCGTCCTGACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGcatg > 4:136828‑M1/1‑145 (MQ=255) aCGCCTCCGCATTAGGACGCAATGGCGTACATGATTTCATCCTCGTTCGCGCTACCGCTATCGTCCTGACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGcatgtggcag < 3:136828‑M1/149‑11 (MQ=255) cGCATTAGGACGCAATGGCGTACATGATTTCATCCTCGTTCGCGCTACCGCTATCGTCCTGACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGcatgtggcaggtgttga < 5:1945‑M1/149‑18 (MQ=255) tAGGACGCAATGGCGTACATGATTTCATCCTCGTTCGCGCTACCGCTATCGTCCTGACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGcatgtggcaggtgttgaccgac > 7:87447‑M1/1‑127 (MQ=255) aaTGGCGTACATGATTTCATCCTCGTTCGCGCTACCGCTATCGTCCTGACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGcatgtggcaggtgttgaccgactacgtta > 4:84379‑M1/1‑119 (MQ=255) aaTGGCGTACATGATTTCATCCTCGTTCGCGCTACCGCTATCGTCCTGACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGcatgtggcaggtgttgaccgactacgtta > 3:143644‑M1/1‑119 (MQ=255) ttCATCCTCGTTCGCGCTACCGCTATCGTCCTGACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGcatgtggcaggtgttgaccgactacgttaaaccgctggctttgc < 4:143644‑M1/148‑45 (MQ=255) cATCCTCGTTCGCGCTACCGCTATCGTCCTGACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGcatgtggcaggtgttgaccgactacgttaaaccgctggctttgcgc < 8:147614‑M1/148‑47 (MQ=255) 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8:87447‑M1/147‑63 (MQ=255) aCGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGcatgtggcaggtgttgaccgactacgttaaaccgctggctttgcgcctgatgctgcaactggtgattgtcgttgcac < 6:73194‑M1/148‑78 (MQ=255) aCGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGcatgtggcaggtgttgaccgactacgttaaaccgctggctttgcgcctgatgctgcaactggtgattgtcgttgcac < 6:156952‑M1/148‑78 (MQ=255) tctACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGcatgtggcaggtgttgaccgactacgttaaaccgctggctttgcgcctgatgctgcaactggtgattgtcgtt > 8:120488‑M1/1‑67 (MQ=255) tctACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGcatgtggcaggtgttgaccgactacgttaaaccgctggctttgcgcctgatgctgcaactggtgattgtcgtt < 7:120488‑M1/140‑74 (MQ=255) tACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGcatgtggcaggtgttgaccgactacgttaaaccgctggctttgcgcctgatgctgcaactggtgattgtcgttgcactggtggt > 1:122275‑M1/1‑65 (MQ=255) 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tACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGcatgtggcaggtgttgaccgactacgttaaaccgctggctttgcgcctgatgctgcaactggtgattgtcgttgcactggtggtttacgtgatttatggattcgttgtggtgt > 2:51495‑M1/1‑36 (MQ=255) cAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGcatgtggcaggtgttgaccgactacgttaaaccgctggctttgcgcctgatgctgcaactggtgattgtcgttgcactggtggtttacgtgatttatggattcgttgtggtgtggg < 5:120979‑M1/149‑117 (MQ=255) gCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGcatgtggcaggtgttgaccgactacgttaaaccgctggctttgcgcctgatgctgcaactggtgattgtcgttgcactggtggtttacgtgatttatggattcgttgtggtgtggggtgtg > 1:69979‑M1/1‑28 (MQ=255) aCATATGAAGTCTGGATCGGcatgtggcaggtgttgaccgactacgttaaaccgctggctttgcgcctgatgctgcaactggtgattgtcgttgcactggtggtttacgtgatttatggattcgttgtggtgtggggtgtgtgatga < 1:51495‑M1/147‑128 (MQ=255) tGAAGTCTGGATCGGcatgtggcaggtgttgaccgactacgttaaaccgctggctttgcgcctgatgctgcaactggtgattgtcgttgcactggtggtttacgtgatttatggattcgttgtggtgtggggtgtgtgatgaaattgcc < 2:69979‑M1/149‑135 (MQ=255) aaGTCTGGATCGGcatgtggcaggtgttgcccgcctacgttaaaccgctggctttgcgcctgatgctgcaactggtgattgtcgttgcactggtggtttacgtgatttatggattcgttgtggtgtggggtgtgtgatgaaattgccag > 4:32609‑M1/1‑13 (MQ=255) aGTCTGGATCGGcatgtggcaggtgttgaccgactacgttaaaccgctggctttgcgcctgatgctgcaactggtgattgtcgttgcactggtggtttacgtgatttatggattcgttgtggtgtggggtgtgtgatgaaattgccagt > 1:154095‑M1/1‑12 (MQ=255) tGGATCGGcatgtggcaggtgttgaccgactacgttaaaccgctggctttgcgcctgatgctgcaactggtgattgtcgttgcactggtggtttacgtgatttatggattcgttgtggtgtggggtgtgtgatgaaattgccagtca > 1:186362‑M1/1‑8 (MQ=255) ggcatgtggcaggtgttgaccgactacgttaaaccgctggctttgcgcctgatgctgcaactggtgattgtcgttgcactggtggtttacgtgatttatggattcgttgtggtgtggggtgtgtgatgaaattgccagtcagagaattt < 2:195091‑M1/149‑148 (MQ=255) | TAAGCAACGCCTCCGCATTAGGACGCAATGGCGTACATGATTTCATCCTCGTTCGCGCTACCGCTATCGTCCTGACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGTTTCTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGT > NC_000913/755564‑755855 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |