| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 754909 | 87 (0.930) | 8 (0.090) | 8/262 | NT | 9.8% | intergenic (‑441/‑268) | gltA/sdhC | citrate synthase/succinate dehydrogenase, membrane subunit, binds cytochrome b556 |
| ? | NC_000913 | 760172 = | 61 (0.660) | coding (1467/2802 nt) | sucA | 2‑oxoglutarate decarboxylase, thiamine triphosphate‑binding | |||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
ACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATCGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAGGTCTCCGGAACACCCTGCAATCCCGAGCCACCCAGCGTTGTAACGTGTCGTTTTCGCATCTGGAAGCAGTGTTTTGCATGACGCGCAGTTATAGAAAGGAC > NC_000913/754762‑755057 | aCTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATCGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTatat < 4:8263/149‑1 (MQ=255)aCTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATCGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTatat < 3:287088/149‑1 (MQ=255) cTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATCGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATg < 8:252269/149‑1 (MQ=255) aTAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATCGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAgg 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aTTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATCGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGa > 7:327291/1‑149 (MQ=255) aTTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATCGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGa > 6:24919/1‑149 (MQ=255) ttATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATCGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATAcaagctggagcaggaaaaag > 4:1649‑M1/1‑129 (MQ=255) atatGCTTTTCCTTGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATCGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGAtt < 3:113675/148‑1 (MQ=255) tatGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATCGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTg > 7:358667/1‑139 (MQ=255) tatGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATCGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTg < 8:358667/139‑1 (MQ=255) tatGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATCGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGAtttt < 8:73721/149‑1 (MQ=255) tatGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATCGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGAtttc < 7:393494/149‑2 (MQ=255) tGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATCGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTtgt < 5:30386/149‑1 (MQ=255) tGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATCGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTtgt < 4:141482/149‑1 (MQ=255) 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1:365188/1‑107 (MQ=255) tGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAGGTCTCCGGAACACCCTGCAATCCCGAGCCAcc < 2:365188/107‑1 (MQ=255) tGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAGGTCTCCGGAACACCCTGCAATCCCGAGCCACCCAGCGTTGTAACGTGTCGTTTTCGCATCTGGAAGCAGTGttt > 5:309579/1‑149 (MQ=255) ttCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAGGTCTCCGGAACACCCTGCAATCCCGAGCCACCCAGCGTTGTAACGTGTCGTTTTCGCATCTGGAAGCAGTGtttt < 6:309579/148‑1 (MQ=255) ttCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAGGTCTCCGGAACACCCTGCAATCCCGAGCCACCCAGCGTTGTAACGTGTCGTTTTCGCATCTGGAAGCAGTGTTTTg < 1:16860/149‑1 (MQ=255) ggATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAGGTCTCCGGAACACCCTGCAATCCCGAGCCACCCAGCGTTGTAACGTGTCGTTTTCGCATCTGGAAGCAGTGTTTTGCATg < 8:267995/149‑1 (MQ=255) 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8:327291/149‑1 (MQ=255) cTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAGGTCTCCGGAACACCCTGCAATCCCGAGCCACCCAGCGTTGTAACGTGTCGTTTTCGCATCTGGAAGCAGTGTTTTGCATGACGCGCAGTTATAGaaa < 8:68308/149‑1 (MQ=255) tataTGCAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAGGTCTCCGGAACACCCTGCAATCCCGAGCCACCCAGCGTTGTAACGTGTCGTTTTCGCATCTGGAAGCTGTGTTTTGCATGACGCGCAGTTATAGAAAg > 4:11971/1‑149 (MQ=255) tatGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAGGTCTCCGGAACACCCTGCAATCCCGAGCCACCCAGCGTTGTAACGTGTCGTTTTCGCATCTGGaa > 5:284750/1‑114 (MQ=255) tatGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAGGTCTCCGGAACACCCTGCAATCCCGAGCCACCCAGCGTTGTAACGTGTCGTTTTCGCATCTGGaa < 6:284750/114‑1 (MQ=255) acaagttggagcaggaaaaagtggcgacgctggaagatgccaccgagatggttaacctgtaccgcgatgcgctggatgctggcgattgcgtagtggcagagtggcgtccgatgaacatgcactctttcacctggtcgccgtacctcaac < 1:13631‑M1/149‑149 (MQ=255) acaagctggagcaggaaaaagtggcgacgctggaagatgccaccgagatggttaacctgtaccgcgatgcgctggatgctggcgattgcgtagtggcagagtggcgtccgatgaacatgcactctttcacctggtcgccgtacctcaac > 7:50914‑M1/1‑1 (MQ=255) acaagctggagcaggaaaaagtggcgacgctggaagatgccaccgagatggttaacctgtaccgcgatgcgctggatgctggcgattgcgtagtggcagagtggcgtccgatgaacatgcactctttcacctggtcgccgtacctca < 3:381141‑M1/147‑147 (MQ=255) | ACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATCGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAGGTCTCCGGAACACCCTGCAATCCCGAGCCACCCAGCGTTGTAACGTGTCGTTTTCGCATCTGGAAGCAGTGTTTTGCATGACGCGCAGTTATAGAAAGGAC > NC_000913/754762‑755057 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |