| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,196,376 | IS1 (+) +8 bp | 5.4% | intergenic (+3/+484) | icd → / ← ymfD | isocitrate dehydrogenase; e14 prophage attachment site; tellurite reductase/e14 prophage; putative SAM‑dependent methyltransferase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 257908 = | NA (NA) | 7 (0.070) | 6/264 | NT | 6.9% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 1196376 = | 88 (1.000) | intergenic (+3/+491) | icd/ymfD | isocitrate dehydrogenase; e14 prophage attachment site; tellurite reductase/e14 prophage; putative SAM‑dependent methyltransferase | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 1196383 | 88 (1.000) | 3 (0.030) | 3/264 | NT | 3.1% | intergenic (+10/+484) | icd/ymfD | isocitrate dehydrogenase; e14 prophage attachment site; tellurite reductase/e14 prophage; putative SAM‑dependent methyltransferase |
| ? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
CGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGCGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGTAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGT > NC_000913/1196237‑1196530 | cGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGCGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTg < 3:168676/149‑1 (MQ=255) aCTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGCGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAAt > 2:3337/1‑149 (MQ=255) aatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgtgcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCCGTAGTTTGTTAAatttt < 8:342025‑M2/19‑2 (MQ=255) aaTTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGCGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATttat > 7:274953/1‑149 (MQ=255) aTTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGCGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATttat < 5:105195/148‑1 (MQ=255) ttGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGCGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATttatta < 4:40119/149‑1 (MQ=255) aaaGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGCGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCAGCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACggg > 3:306699/1‑149 (MQ=255) aaGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGCGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGa < 1:18219/149‑1 (MQ=255) aaGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGCGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGa < 2:178227/149‑1 (MQ=255) aaGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGCGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGa < 1:87131/149‑1 (MQ=255) aGGTATGGAAGCCGCAAACAACGCGAAAACCGAAACCTATGACTACGAGCGTCTGATGGATGGCGCTACACTCCAGAAATCTACAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCCGAGTTTGATAAATTTAATAACCGGa > 5:156089/1‑148 (MQ=18) aGGTAGGGAAGGCGCAATCAACCCGAAATCCTGTACCTCTGACTTCGAGGGTGTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAATTGTTCTGTGTTTGGTGACGCGATCTTCGAAAACATGTATTGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACgg < 6:156089/146‑1 (MQ=255) ggAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGCGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAAc > 7:253057/1‑149 (MQ=255) 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aaCGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGCGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAAGGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAACCATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGGTGttt > 2:400886/1‑149 (MQ=255) aaCGCGAAAACCGTAACCTATGACTGCGAGCGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGTCGCGATCATCGAAAACATGAAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGGGGttt > 2:298489/1‑149 (MQ=25) aCGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGCGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGTAGCGTAACTATCCCGTTGtttt > 2:356070/1‑149 (MQ=255) aaaaCCGTAACCTATGACTTCTAGCCTCTGATGGATGGCTCTAAACTGCTGAAAATTTCAGAGTTTGGTTACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATAAACAGGCGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGtt < 4:46336/149‑1 (MQ=25) aaaCCGTAACCTATGACTTCGAGCGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgag < 8:419020‑M1/149‑48 (MQ=255) aaaCCGTAACCTATGACTTCGAGCGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTa < 8:274953/149‑1 (MQ=255) ccTATGACTTCGAGCGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTaa < 3:377481/149‑1 (MQ=255) cTATGACTTCGAGCGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAAc > 1:240554/1‑149 (MQ=255) tATGACTTCGAGCGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTccc < 7:406371/124‑1 (MQ=255) tATGACTTCGAGCGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTccc > 8:406371/1‑124 (MQ=255) tcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGt > 6:68921‑M2/82‑149 (MQ=255) tGACTTCGAGCGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACgg < 1:68491/148‑1 (MQ=255) tGACTTCGAGCGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACg < 8:67529/147‑1 (MQ=255) tGACTTCGAGCGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGt > 7:80769/1‑149 (MQ=255) aCTTCGAGCGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTa < 1:3337/149‑1 (MQ=255) aCTTCGAGCGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTa > 7:301063/1‑149 (MQ=255) 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NC_000913/1196237‑1196530 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |