Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 323,062 | A→G | 7.8% | E242G (GAG→GGG) | ykgF → | ferridoxin‑like LutB family protein; putative electron transport chain YkgEFG component |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 323,062 | 0 | A | G | 7.8% | 184.4 / 4.0 | 63 | E242G (GAG→GGG) | ykgF | ferridoxin‑like LutB family protein; putative electron transport chain YkgEFG component |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (28/30); new base G (3/2); total (31/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.72e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CGAAGATTTCCTCAGTGCTGAAATAGGTATTACCGGCTGTAATTTCGCGGTGGCAGAGACCGGTTCGGTATGCCTGGTGACCAATGAAGGTAATGCGCGAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAGGTAGATGTATTGATCACCATGCTGGCGCGCAGTGCCGTTGGTGCACGTTTGACGGGATACAACACCTGGCTGACAGGACCGCGCGAAGCTGGGCACGTTGATGGTCCTGAAGAGTTTCATCT > NC_000913/322916‑323209 | cgAAGATTTCCTCAGTGCTGAAATAGGTATTACCGGCTGTAATTTCGCGGTGGCAGAGACCGGTTCGGTATGCCTGGTGACCAATGAAGGTAATGCGCGAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGc < 8:367275/149‑1 (MQ=255) aGATTTCCTCAGTGCTGAAATAGGTATTACCGGCTGTAATTTCGCGGTGGCAGAGACCGGTTCGGTATGCCTGGTGACCAATGAAGGTAATGCGCGAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGCGTa < 7:360320/149‑1 (MQ=255) aTTTCCTCAGTGCTGAAATAGGTATTACCGGCTGTAATTTCGCGGTGGCAGAGACCGGTTCGGTATGCCTGGTGACCAATGAAGGTAATGCGCGAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGCGTAtt > 1:226759/1‑149 (MQ=255) ttCCTCAGTGCTGAAATAGGTATTACCGGCTGTAATTTCGCGGTGGCAGAGACCGGTTCGGTATGCCTGGTGACCAATGAAGGTAATGCGCGAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGGGATGGGAATGGAGCGTATTGc > 1:343687/1‑149 (MQ=255) tCCTCAGTGCTTAAATAGGTATTACCTGCTGTAATTTCGCGTTGGCAGAGACCTGTTCGGTATGCCTGGTGACCAATGAAGGTAATGCGCGAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGCGTATTGc < 6:163440/148‑1 (MQ=255) cTCAGTGCTGAAATAGGTATTACCGGCTGTAATTTCGCGGTGGCAGAGACCGGTTCGGTATGCCTGGTGACCAATGAAGGTAATGCGCGAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGGGCGTATTGcccc > 6:361859/1‑149 (MQ=255) cTCAGTGCTGAAATAGGTATTACCGGCTGTAATTTCGCGGTGGCAGAGACCGGTTCGGTATGCCTGGTGACCAATGAAGGTAATGCGCGAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGc > 7:412317/1‑139 (MQ=255) cTCAGTGCTGAAATAGGTATTACCGGCTGTAATTTCGCGGTGGCAGAGACCGGTTCGGTATGCCTGGTGACCAATGAAGGTAATGCGAGAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGc < 8:412317/139‑1 (MQ=255) aGTGCTGAAATAGGTATTACCGGCTGTAATTTCGCGGTGGCAGAGACCGGTTCGGTATGCCTGGTGACCAATGAAGGTAATGCGCGAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGCGTATTGCCCCCAc > 1:107550/1‑149 (MQ=255) cTGAAATAGGTATTACCGGCTGTAATTTCGCGGTGGCAGAGACCGGTTCGGTATGCCTGGTGACCAATGAAGGTAATGCGCGAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGCGTATTGCCCCCACGttt > 5:309433/1‑149 (MQ=255) aTAGGTATTACCGGCTGTAATTTCGCGGTGGCAGAGACCGGTTCGGTATGCCTGGTGACCAATGAAGGTAATGCGCGAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGCGTATTGCCCCCACGTTTGcc > 4:370137/1‑147 (MQ=255) aTAGGTATTACCGGCTGTAATTTCGCGGTGGCAGAGACCGGTTCGGTATGCCTGGTGACCAATGAAGGTAATGCGCGAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGa < 3:186514/149‑1 (MQ=255) aTAGGTATTACCGGCTGTAATTTCGCGGTGGCAGAGACCGGTTCGGTATGCCTGGTGACCAATGAAGGTAATGCGCGAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGa < 7:36918/149‑1 (MQ=255) tAGGTATTACCGGCTGTAATTTCGCGGTGGCAGAGACCGGTTCGGTATGCCTGGTGACCAATGAAGGTAATGCGCGAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAg < 6:309433/149‑1 (MQ=255) ggTATTACCGGCTGTAATTTCGCGGTGGCAGAGACCGGTTCGGTATGCCTGGTGACCAATGAAGGTAATGCGCGAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAGGt < 8:38871/149‑1 (MQ=255) ggTATTACCGGCTGTAAATTCGCGGTGGCAGAGACCTGTTCGGTATGCCTGGGGACCAATGAAGGTAATGCGCGAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAGGt < 5:238854/149‑1 (MQ=255) gTATTACCGGCTGTAATTTCGCGGTGGCAGAGACCGGTTCGGTATGCCTGGTGACCAATGAAGGTAATGCGCGAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAgg > 1:286163/1‑147 (MQ=255) tATTACCGGCTGTAATTTCGCGGTGGCAGAGACCGGTTCGGTATGCCTGGTGACCAATGAAGGTAATGCGCGAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAgg > 3:380061/1‑146 (MQ=255) aTTACCGGCTGTAATTTCGCGGTGGCAGAGACCGGTTCGGTATGCCTGGTGACCAATGAAGGTAATGCGCGAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAgg > 7:141329/1‑145 (MQ=255) ttACCGGCTGTAATTTCGCGGTGGCAGAGACCGGTTCGGTATGCCTGGTGACCAATGAAGGTAATGCGCGAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAGGTAGAt < 7:80817/149‑1 (MQ=255) ttACCGGCTGTAATTTCGCGGTGGCAGAGACCGGTTCGGTATGCCTGGTGACCAATGAAGGTAATGCGCGAATGGGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAGGTAGAt < 2:337350/149‑1 (MQ=255) tGTAATTTCGCGGTGGCAGAGACCGGTTCGGTATGCCTGGTGACCAATGATGGTAATGCGCGAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGc > 8:333481/1‑112 (MQ=255) tGTAATTTCGCGGTGGCAGAGACCGGTTCGGTATGCCTGGTGACCAATGATGGTAATGCGCGAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGc < 7:333481/112‑1 (MQ=255) tAATTTCGCGGTGGCAGAGACCGGTTCGGTATGCCTGGTGACCAATGAAGGTAATGCGCGCATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAGGTAGATGTATTGAt < 5:394239/147‑1 (MQ=255) tAATTTCGCGGTGGCAGAGACCGGTTCGGTATGCCTGGTGACCAATGAAGGTAATGCGCGAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAGGTAGATGTATTGATCa < 8:35131/149‑1 (MQ=255) tttCGCGGTGGCAGAGACCGGTTCGGTATGCCTGGTGACCAATGAAGGTAATGCGCGAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAGGTAGATGTATTGATCACCa > 1:207135/1‑149 (MQ=255) ttCGGTATGCCTGGTGACCAATGAAGGTAATGCGCGAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAGGTAGATGTATTGATCACCATGCTGGCGCGCAGTGCCGTTg < 3:370137/149‑1 (MQ=255) ttCGGTATGCCTGGTGACCAATGAAGGTAATGCGCGAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAGGTAGATGTATTGATCACCATGCTGGCGCGCAGTGCCGTTg < 3:156638/149‑1 (MQ=255) cGGTATGCCTGGTGACCAATGAAGGTAATGCGCGAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAGGTAGATGTATTGATCACCATGCTGGCGCGCAGTGCCGTTgg < 2:286163/148‑1 (MQ=255) ggTATGCCTGGTGACCAATGAAGGTAATGCGCGAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAGGTAGATGTATTGATCACCATGCTGGCGCGCAGTGCCGTTGGTg > 5:93389/1‑149 (MQ=255) tGCCTGGTGACCAATGAAGGTAATGCGCGAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAGGTAGATGTATTGATCACCATGCTGGCGCGCAGTGCCGTTGGTGCAc < 4:187090/148‑1 (MQ=255) tGCCTGGTGACCAATGAAGGTAATGCGCGAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAGGTAGATGTATTGATCACCATGCTGGCGCGCAGTGCCGTTGGTGCAc < 7:222814/148‑1 (MQ=255) cTGGTGACCAATGAAGGTAATGCGCGAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAGGTAGATGTATTGATCACCATGCTGGCGCGCa > 2:153112/1‑130 (MQ=255) cTGGTGACCAATGAAGGTAATGCGCGAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAGGTAGATGTATTGATCACCATGCTGGCGCGCa < 1:153112/130‑1 (MQ=255) gTGACCAATGAAGGTAATGCGCGAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAGGTAGATGTATTGATCACCATGCTGGCGCGCAGTGCCGTTGGTGCACGTTTGAc > 3:191130/1‑149 (MQ=255) tGACCAATGAAGGTAATGCGCGAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAGGTAGATGTATTGATCACCATGCTGGCGCGCAGTGCCGTTGGTGCACGTTTGACg < 6:179371/149‑1 (MQ=255) tGACCAATGAAGGTAATGCGCGAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAGGTAGATGTATTGATCACCATGCTGGCGCGCAGTGCCGTTGGTGCACGTTTGACg < 2:107550/149‑1 (MQ=255) gACCAATGCACGTAATTCACGAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATTGGAATGGAGCGTATTGCCCCTACGTTTGCCGAGGTAGATGGATTGATCACCATGCTGGCGCGCAGTGCCGTTGGTGCACGTTTGACgg < 6:322260/149‑1 (MQ=255) aCCAATGAAGGTAATGCGCGAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAGGTAGATGTATTGATCACCATGCTGGCGCGCAGTGCCGTTGGTGCACGTTTGACggg < 6:347235/149‑1 (MQ=255) cAATGAAGGTAATGCGCGAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGGGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAGGTAGATGTATTGATCACCATGCTGGCGCGCAGTGCCGTTGGTGCACGTTTGACGGGa > 6:325859/1‑148 (MQ=255) cAATGAAGGTAATGCGCGAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAGGTAGATGTATTGATCACCATGCTGGCGCGCAGTGCCGTTGGTGCACGTTTGACGGGa > 8:180764/1‑148 (MQ=255) aTGAAGGTAATGCGCGAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGGGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAGGTAGATGTATTGATCACCATGCTGGCGCGCAGTGCCGTTGGTGCACGTTTGACGGGATac < 5:361859/149‑1 (MQ=255) aTGAAGGTAATGCGCGAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAGGTAGATGTa < 8:17676/98‑1 (MQ=255) aTGAAGGTAATGCGCGAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAGGTAGATGTa > 7:17676/1‑98 (MQ=255) ggTAATGCGCGAATTTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAGGTAGATGTATTGATCACCATGCTGGCGCGCAGTGCCGTTGGTGCACGTTTGACGGGATACAacac < 2:239415/149‑1 (MQ=255) tAATGCGCGAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGGGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAGGTAGATGTATTGATCACCATGCTGGCGCGCAGTGCCGTTGGTGCACGTTTGACg < 1:270319/136‑1 (MQ=255) tAATGCGCGAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGGGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAGGTAGATGTATTGATCACCATGCTGGCGCGCAGTGCCGTTGGTGCACGTTTGACg > 2:270319/1‑136 (MQ=255) cgcgAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAGGTAGATGTATTGATCACCATGCTGGCGCGCAGTGCCGTTGGTGCACGTTTGACGGGATACAACACCTGGCt > 2:423042/1‑148 (MQ=255) gAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAGGTAGATGTATTGATCACCATGCTGGCGCGCAGTGCCGTTGGTGCACGTTTGACGGGATACAACACCTGGCTGa > 8:404776/1‑147 (MQ=255) gAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAGGTAGATGTATTGATCACCATGCTGGCGCGCAGTGCCGTTGGTGCACGTTTGACGGGATACAACACCTGGCTGa > 5:261603/1‑147 (MQ=255) ccACGCTGCCTAAAACGCATATTGAAGTGATGGGAATGGAGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAGGTAGATGTATTGCTCACCATGCTGGCGCGCAGTGCCGTTGGTGCACGTGTGACGGGATACAACACCTGGCTGACAGGACcgcgc > 6:392958/1‑149 (MQ=255) cGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAGGTAGATGTATTGATCACCATGCTGGCGCGCAGTGCCGTTGGTGCACGTTTGACGGGATACAACACCTGGCTGACAGGACcgcgcg > 8:183098/1‑147 (MQ=255) ccTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAGGTAGATGTATTGATCACCATGCTGGCGCGCAGTGCCGTTGGTGCACGTTTGACGGGATACAACACCTGGCTGACAGGACCGCGCGAAGCTgg > 3:137614/1‑149 (MQ=255) tAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAGGTAGATGTATTGATCACCATGCTGGCGCGCAGTGCCGTTGGTGCACGTTTGACGGGATACAACACCTGGCTGACAGGACCGCGCGAAGCTGGGc > 1:82421/1‑149 (MQ=255) cGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAGGTAGATGTATTGATCACCATGCTGGCGCGCAGTGCCGTTGGTGCACGTTTGACGGGATACAACACCTGGCTGACAGGACCGCGCGAAGCTGGGCACGtt > 4:306255/1‑149 (MQ=255) cGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAGGTAGATGTATTGATAACCATGCTGGCGCGCAGTGCCGTTGGTGCACGTTTGACGGGATACCACACCTGGCAGACAGGACCGCGCGACCCTGGGCACGtt > 2:76909/1‑149 (MQ=255) tatTGCAGTGATGGGAATGGAGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAGGTAGATGTATTGATCACCATGCTGGCGCGCAGTGCCGTTGGTGCACGTTTGACGGGATACAACACCTGGCTGACAGGACCGCGCGAAGCTGGGCACGTTGATg < 1:423042/149‑1 (MQ=255) gCAGTGATGGGAATGGAGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAGGTAGATGTATTGATCACCATGCTGGCGCGCAGTGCCGTTGGTGCACGTTTGACGGGATACAACACCTGGCTGACAGGACCGCGCGAAGCTGGGCACGTTGATGGTcc > 3:78232/1‑149 (MQ=255) gCAGTGATGGGAATGGAGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAGGTAGATGTATTGATCACCATGCTGGCGCGCAGTGCCGTTGGTGCACGTTTGACGGGATACAACACCTGGCTGACAGGACCGCGCGAAGCTGGGCACGTTGATGGTc < 2:207135/148‑1 (MQ=255) gggAATGGAGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAGGTAGATGTATTGATCACCATGCTGGCGCGCAGTGCCGTTGGTGCACGTTTGACGGGATACAACACCTGGCTGACAGGACCGCGCGAAGCTGGGCACGTTGATGGTCCTGAAGAGt > 7:275659/1‑149 (MQ=255) gggAATGGAGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAGGTAGATGTATTGATCACCATGCTGGCGCGCAGTGCCGTTGGTGCACGTTTGACGGGATACAACACCTGGCTGACAGGACCGCGCGAAGCTGGGCACGTTGATGGTCCTGAAGAGt > 7:232887/1‑149 (MQ=255) gAGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAGGTAGATGTATTGATCACCATGCTGGCGCGCAGTGCCGTTGGTGCACGTTTGACGGGATACAACACCTGGCTGACAGGACCGCGCGAAGCTGGGCACGTTGATGGTCCTGAAGAGTTTCATCt < 4:191130/149‑1 (MQ=255) gAGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAGGTAGATGTATTGATCACCATGCTGGCGCGCAGTGCCGTTGGTGCACGTTTGACGGGATACAACACCTGGCTGACAGGACCGCGCGAAGCTGGGCACGTTGATGGTCCTGAAGAGTTTCATCt < 6:191824/149‑1 (MQ=255) | CGAAGATTTCCTCAGTGCTGAAATAGGTATTACCGGCTGTAATTTCGCGGTGGCAGAGACCGGTTCGGTATGCCTGGTGACCAATGAAGGTAATGCGCGAATGTGTACCACGCTGCCTAAAACGCATATTGCAGTGATGGGAATGGAGCGTATTGCCCCCACGTTTGCCGAGGTAGATGTATTGATCACCATGCTGGCGCGCAGTGCCGTTGGTGCACGTTTGACGGGATACAACACCTGGCTGACAGGACCGCGCGAAGCTGGGCACGTTGATGGTCCTGAAGAGTTTCATCT > NC_000913/322916‑323209 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |