| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,165,428 | C→T | 5.2% | P182P (CCG→CCA) | parC ← | DNA topoisomerase IV, subunit A |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,165,428 | 0 | C | T | 5.2% | 245.0 / 2.3 | 76 | P182P (CCG→CCA) | parC | DNA topoisomerase IV, subunit A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (27/45); new base T (2/2); total (29/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.33e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.31e-01 | |||||||||||
GATTTTACGGATCTCGGCGCGCGAAGTGATAATTTCCGCTTCAGTCGGATAATCCGGCCCCTGCACGATATCCAGCAGCTGATCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCGGTGGTGCCGTTAAGCAAAATGTTTGGCAGACGGGCAGGTAGCATTTTCGGCTCCTGCAAAGTGCCGTCGAAGTTTGGCACCCAGTCAGCCGTCCCCTGCCCCAGC > NC_000913/3165281‑3165569 | gATTTTACGGATCTCGGCGCGCGAAGTGATAATTTCCGCTTCAGTCGGATAATCCGGCCCCTGCACGATATCCAGCGGCTGATCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCg < 7:188509/149‑1 (MQ=255)gATTTTACGGATCTCGGCGCGCGAAGTGATAATTTCCGCTTCAGTCGGATAATCCGGCCCCTGCACGATATCCAGCAGCTGATCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGTTTAATGCGATTGCCGCCGGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCg > 7:275031/1‑149 (MQ=255) ttACGGATCTCGGCGCGCGAAGTGATAATTTCCGCTTCAGTCGGATAATCCGGCCCCTGCACGATATCCAGCAGCTGATCGAGCGTGGGTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTg < 4:318807/148‑1 (MQ=255) tACGGATCTCGGCGCGCGAAGTGATAATTTCCGCTTCAGTCGGATAATCCGGCCCCTGCACGATATCCAGCAGCTGATCCAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTgg > 3:231027/1‑148 (MQ=255) ggATCTCGGCGCGCGAAGTGATAATTTCCGCTTCAGTCGGATAATCCGGCCCCTGCACGATATCCAGCAGCTGATCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCAGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAata > 2:265804/1‑149 (MQ=255) gagctcGGCGCGCGAAGTGATAATTTCCGCTTCAGTCGGATAATCCGGCCCCTGCACGATATCCAGCAGCTGATCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGTAatat < 7:23461/146‑1 (MQ=255) gATCTCGGCGCGCGAAGTGATAATTTCCGCTTCAGTCGGATAATCCGGCCCCTGCACGATATCCAGCAGCTGATCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAatat < 8:142237/149‑1 (MQ=255) gATCTCGGCGCGCGAAGTGATAATTTCCGCTTCAGTCGGATAATCCGGCCCCTGCACGATATCCAGCAGCTGATCGAGCGTGGTTGTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTAACGCAGGTTATGCGGTGGAatat > 6:317351/1‑149 (MQ=255) ggCGCGCGAAGTGATAATTTCCGCTTCAGTCGGATAATCCGGCCCCTGCACGATATCCAGCAGCTGATCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTc < 7:425816/148‑1 (MQ=255) ggCGCGCGAAGTGATAATTTCCGCTTCAGTCGGATAATCCGGCCCCTGCACGATATCCAGCAGCTGATCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCg > 4:21795/1‑149 (MQ=255) gcgcgcGAAGTGATAATTTCCGCTTCAGTCGGATAATCCGGCACCTGCACGATATCCAGCAGCTGATCGAGCGTGGTTTTCGGCGGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACATCACGCAGGTGATGCGGTGGAATATCGGTCGc > 5:240579/1‑149 (MQ=255) cgcgAAGTGATAATTTCCGCTTCAGTCGGATAATCCGGCCCCTGCACGATATCCAGCAGCTGATCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGGCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCAt < 2:262415/149‑1 (MQ=255) gcgAAGTGATAATTTCCGCTTCAGTCGGATAATCCGGCCCCTGCACGATATCCAGCAGCTGATCGAGGGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATg > 7:343599/1‑149 (MQ=255) gcgAAGTGATAATTTCCGCTTCAGTCGGATAATCCGGCCCCTGCACGATATCCAGCAGCTGATCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGTGGTGGAATATCGGTCGCCATg > 8:186067/1‑149 (MQ=255) gcgAAGTGATAATTTCCGCTTCAGTCGGATAATCCGGCCCCTGCACGATATCCAGCAGCTGATCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATg < 2:381239/149‑1 (MQ=255) gAAGTGATAATTTCCGCTTCAGTCGGATAATCCGGCCCCTGCACGATATCCAGCAGCTGATCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATgac > 2:155010/1‑147 (MQ=255) gAAGTGATAATTTCCGCTTCAGTCGGATAATCCGGCCCCTGCACGATATCCAGCAGCTGATCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGcc > 2:10562/1‑149 (MQ=255) gATAATTTCCGCTTCAGTCGGATAATCCGGCCCCTGCACGATATCCAGCAGCTGATCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGCAGACgg > 2:320464/1‑149 (MQ=255) cGCTTCAGTCGGATAATCCGGCCCCTGCACGATATCCAGCAGCTGATCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCg < 7:286303/148‑1 (MQ=255) gCTTCAGTCGGATAATCCGGCCCCTGCACGATATCCAGCAGCTGATCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCggt < 8:343599/149‑1 (MQ=255) ttCAGTCGGATAATCCGGCCCCTGCACGATATCCAGCAGCTGATCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGc < 1:431797/131‑1 (MQ=255) ttCAGTCGGATAATCCGGCCCCTGCACGATATCCAGCAGCTGATCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGc > 2:431797/1‑131 (MQ=255) aGTCGGATAATCCGGCCCCTGCACGATATCCAGCAGCTGATCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCGgtggtg < 8:398975/148‑1 (MQ=255) aGTCGGATAATCCGGCCCCTGCACGATATCCAGCAGCTGATCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCGGTGGTGc < 3:95704/149‑1 (MQ=255) tCGGATAATCCGGCCCCTGCACGATATCCAGCAGCTGATCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCGGTGGTGCCg < 3:383179/149‑1 (MQ=255) tCGGATAATCCGGCCCCTGCACGATATCCAGCAGCTGATCGAGCGTAGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCGGTGGTGCCg > 3:326421/1‑149 (MQ=255) gATAATCCGGCCCCTGCACGATATCCAGCAGCTGATCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCGGTGGTGCCGtt > 6:166294/1‑148 (MQ=255) aTAATCCGGCCCCTGCACGATATCCAGCAGCTGATCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCGGTGGTGCCGTTaa < 3:178803/149‑1 (MQ=255) aTAATCCGGCCCCTGCACGATATCCAGCAGCTGATCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATGGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCGGTGGTGCCGTTaa < 1:332989/149‑1 (MQ=255) aTCCGGCCCCTGCACGATATCCAGCAGCTGATCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCGGTGGTGCCGTTAAGc < 2:55200/148‑1 (MQ=255) tCCGGCCCCTGCACGATATCCAGCAGCTGATCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGTGGTGGAATATCGGTCGCCAt > 7:119284/1‑116 (MQ=255) tCCGGCCCCTGCACGATATCCAGCAGCTGATCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGTGGTGGAATATCGGTCGCCAt < 8:119284/116‑1 (MQ=255) tCCGGCCCCTGCACGATATCCAGCAGCTGATCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAatat > 5:208433/1‑106 (MQ=255) tCCGGCCCCTGCACGATATCCAGCAGCTGATCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAatat < 6:208433/106‑1 (MQ=255) tCCGGCCCCTGCACGATATCCAGCAGCTGATCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCGGTGGTGCCGTTAAGCa > 3:97843/1‑148 (MQ=255) tCCGGCCCCTGCACGATATCCAGCAGCTGATCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCGGTGGTGCCGTTAAGCa > 6:400916/1‑148 (MQ=255) cctgCCCCTGCACGATTTCGAGCATCTGCTCGAGCGTGGGTTTCGGCTGGTCGATTAATCCGATTGCCGCCTGCGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGACTATCGGTCGCCCTGCCGACGGCAATACCGGTGGTGCCGTTAAGCaaa < 6:240579/146‑1 (MQ=255) cGGCCCCTGCACGATATCCAGCAGCTGATCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCGGTGGTGCCGTTAAGCaaa < 4:231027/148‑1 (MQ=255) ccTGCACGATATCCCGCAGCTGCTCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCGGTGGTGCCGTTAAGCAAAATGttt < 8:395676/149‑1 (MQ=255) ccTGCACGATATCCAGCAGCTGATCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCGGTGGTGCCGTTAAGCAAAATGttt < 5:94853/149‑1 (MQ=255) ccTGCACGATATCCAGCAGCTGATCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCGGTGGTGCCGTTAAGCAAAATGttt < 5:166294/149‑1 (MQ=255) ccTGCACGATATCCAGCAGCTGATCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCGGTGGTGCCGTTAAGCAAAATGttt < 3:21795/149‑1 (MQ=255) tGCACGATATCCAGCAGCTGATCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCGGTGGTGCCGTTAAGCAAAATGttt < 8:245388/147‑1 (MQ=255) tGCACGATATCCAGCAGCTGATCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCGGTGGTGCCGTTAAGCAAAATGttt > 7:245388/1‑147 (MQ=255) cACGATATCCAGCAGCTGATCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGTGGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCGGTGGTGCCGTTAAGCAAAATGTTTgg < 7:186067/147‑1 (MQ=255) cGATATCCAGCAGCTGATCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCGGTGGTGCCGTTAAGCAAAATGTTTGGCAGa > 4:248583/1‑149 (MQ=255) atatCCAGCAGCTGAGCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCGGTGGTGCCGTTAAGCAAAATGTTTGGCAGACg < 8:350142/149‑1 (MQ=255) atCCAGCAGCTGATCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGACGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCGGTGGTGCCGTTAAGCAAAATGTTTGGCAGACggg < 4:82906/149‑1 (MQ=255) gcagcTGATCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGGCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTTGCCATGCCGACGGCAATACCGGTGGTGCCGTTAAGCAAAATGTTTGGCAGACGGGCAGGt < 5:42273/149‑1 (MQ=255) cagcTGATCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCGGTGGTGCCGTTAAGCAAAATGTTTGGCAGACGGGCAGGTa < 5:400916/149‑1 (MQ=255) cagcTGATCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCGGTGGTGCCGTTAAGCAAAATGTTTGGCAGACGGGCAGGTa < 4:147640/149‑1 (MQ=255) cTGATCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGTAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCGgtggtg < 8:74660/112‑1 (MQ=255) cTGATCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCGgtggtg > 7:74660/1‑112 (MQ=255) cTGATCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCGGTGGTGCCGTTAAGCAAAATGTTTGGCAGACGGGCAGGTAGCa < 3:368433/149‑1 (MQ=255) aTCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGGGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCGGTGGTGCCGTTAAGCAAAATGTTTGGCAGACGGGCAGGTAGCAttt > 8:379825/1‑149 (MQ=255) aTCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCGGTGGTGCCGTTAAGCAAAATGTTTGGCAGACGGGCAGGTAGCAt < 1:22703/147‑1 (MQ=255) gAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCGGGGGTGCCGTTAAGCAAAATGTTTGGCAGACGGGCAGGTAGCATTTTc < 6:306959/148‑1 (MQ=255) ggTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCGGTGGTGCCGTTAAGCAAAATGTTTGGCAGACGGGCAg > 7:137777/1‑131 (MQ=255) ggTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCGGTGGTGCCGTTAAGCAAAATGTTTGGCAGACGGGCAg < 8:137777/131‑1 (MQ=255) ttttCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCGGTGGTGCCGTTAAGCAAAATGTTTGGCAGACGGGCAGGTAGCATTTTCGGCTCCTg > 2:324503/1‑148 (MQ=255) aTTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGACAATACCGGTGGTGCCGTTAAGCAAAATGTTTGGCAGACGGGCAGGTAGCATTTTCGGCTCCTGCAAAGTGCCGTCg > 6:393795/1‑147 (MQ=255) aTGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGACAATACCGGTGGTGCCGTTAAGCAAAATGTTTGGCAGACGGGCAGGTAGCATTTTCGGCTCCTGCAAAGTGCCGTCGAAGttt < 5:393795/149‑1 (MQ=255) cGATTGGCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCTGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCGGTGGTGCCGTTAAGCAAAATGTTTGGCAGACGGGCAGGTAGCATTTTCGGCTCCTGCAAAGTGCCGTCGAAGTTTGGc < 1:265804/149‑1 (MQ=255) cGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCGGTGGTGCCGTTAAGCAAAATGTTTGGCAGACGGGCAGGTAGCATTTTCGGCTCCTGCAAAGTGCCGTCGAAGTTTgg < 4:326421/148‑1 (MQ=255) cGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCGGTGGTGCCGTTAAGCAAAATGTTTGGCAGACGGGCAGGTAGCATTTTCGGCTCCTGCAAAGTGCCGTCGAAGTTTgg < 1:320464/148‑1 (MQ=255) cGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCGGTGGTGCCGTTAAGCAAAATGTTTGGCAGACGGGCAGGTAGCATTTTCGGCTCCTGCAAAGTGCCGTCGAAGTTTGGc < 4:97843/149‑1 (MQ=255) cGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCGGTGGTGCCGTTAAGCAAAATGTTTGGCAGACGGGCAGGTAGCATTTTCGGCTCCTGCAAAGTGCCGTCGAAGTTTGGc < 1:324503/149‑1 (MQ=255) aTTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCGGTGGTGCCGTTAAGCAAAATGTTTGGCAGACGGGCAGGTAGCATTTTCGGCTCCTGCAAAGTGCCGTCGAAGTTTGGCAc < 1:155010/149‑1 (MQ=255) ccTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCGGTGGTGCCGTTAAGCAAAATGTTTGGCAGACGGGCAGGTAGCATTTTCGGCTCCTGCAAAGTGCCGTCGAAGTTTGGCACCCAGt < 6:123212/147‑1 (MQ=255) ccTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCGGTGGTGCCGTTAAGCAAAATGTTTGGCAGACGGGCAGGTAGCATTTTCGGCTCCTGCAAAGTGCCGTCGAAGTTTGGCACCCAGt > 5:123212/1‑147 (MQ=255) cACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCGGTGGTGCCGTTAAGCAAAATGTTTGGCAGACGGGCAGGTAGCATTTTCGGCTCCTGCAAAGTGCCGTCGAAGTTTGGCACCCAGTCAGCCGTcc > 2:103530/1‑149 (MQ=255) cTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCGGTGGTGCCGTTAAGCAAAATGTTTGGCAGACGGGCAGGTAGCATTTTCGGCTCCTGCAAAGTGCCGTCGAAGTTTGGCACCCAGTCAGCCGTcccc > 4:332787/1‑149 (MQ=255) aCGCAGGTTATGCGGCGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCGGTGGTGCCGTTAAGCAAAATGTTTGGCAGACGGGCAGGTAGCATTTTCGGCTCCTGCAAAGTGCCGTCGAAGTTTGGCACCCAGTCAGCCGTCCCCTGc < 3:166797/148‑1 (MQ=255) ggTTATGCGGGGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCGGTGGTGCCGTTAAGCAAAATGTTTGGGAGACGGGCAGGTAGCATTTTCGGCTCCTGCAAAGTGCCGTCGAAGTTTGGCACCCAGTCAGCCGTCCCCTGCCCCAgc < 5:317351/149‑1 (MQ=255) gTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCGGTGGTGCCGTTAAGCAAAATGTTTGGCAGACGGGCAGGTAGCATTTTCGGCTCCTGCAAAGTGCCGTCGAAGTTTGGc > 2:276879/1‑121 (MQ=255) gTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCGGTGGTGCCGTTAAGCAAAATGTTTGGCAGACGGGCAGGTAGCATTTTCGGCTCCTGCAAAGTGCCGTCGAAGTTTGGc < 1:276879/121‑1 (MQ=255) | GATTTTACGGATCTCGGCGCGCGAAGTGATAATTTCCGCTTCAGTCGGATAATCCGGCCCCTGCACGATATCCAGCAGCTGATCGAGCGTGGTTTTCGGCTGGTCGATTAATGCGATTGCCGCCTGAGCCACTTCACGCAGGTTATGCGGTGGAATATCGGTCGCCATGCCGACGGCAATACCGGTGGTGCCGTTAAGCAAAATGTTTGGCAGACGGGCAGGTAGCATTTTCGGCTCCTGCAAAGTGCCGTCGAAGTTTGGCACCCAGTCAGCCGTCCCCTGCCCCAGC > NC_000913/3165281‑3165569 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |