Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 911,086 | IS2 (–) +5 bp | intergenic (‑37/+92) | poxB ← / ← hcr | pyruvate dehydrogenase, thiamine triphosphate‑binding, FAD‑binding/HCP oxidoreductase, NADH‑dependent |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | 381260 = | NA (NA) | 69 (0.740) | 55/278 | 0.7 | 100% | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
? | NC_000913 | 911086 = | 0 (0.000) | intergenic (‑37/+96) | poxB/hcr | pyruvate dehydrogenase, thiamine triphosphate‑binding, FAD‑binding/HCP oxidoreductase, NADH‑dependent | |||||
* | ? | NC_000913 | = 382590 | NA (NA) | 87 (0.950) | 69/276 | 0.3 | 100% | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
? | NC_000913 | = 911090 | 0 (0.000) | intergenic (‑41/+92) | poxB/hcr | pyruvate dehydrogenase, thiamine triphosphate‑binding, FAD‑binding/HCP oxidoreductase, NADH‑dependent |
Only 100 of 153 total aligned reads displayed.
GATTAAGACTGTCACTAAGACCGTTCAGAGAGTCGCCTGTGACTCCCCAGATGCGTTTCACCCCTGCCGATTCGAGTGTTTTGGCGATATAAGCTGCAACCGTTTGTTTCATGGTTCTCCATCTCCTGAATGTGATAACGGTAACAAGTTTAGTTCATCTGACGGAGGGGGAAGGGATGGGAGAGAAAGGAGGCACTAACGGTTAAATAGCCCGATGAAAGGAATATCATCGGGCATAAGGCGATTATGCGAGAACCAAATCCCCCTGCGGATGGCAGGAGCAGGCCAGTACGTAAC > NC_000913/910938‑911234 | gatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctat > 8:237732‑M2/149‑149 (MQ=255) aTTAAGACTGTCACTTAGACATTTCAGAGAGTCGCCTGTTACTCCCCAGATGGGTTTCAGCCCTGCCGATTCTAGTGTTTTGTCGTTATAAGCTGCAAGCGTTTGTTTCATGGTTCTCCATCTCCTGAATGTGATAACGGTTACAAGtt < 5:169335/149‑1 (MQ=255) ttAAGACTGTCACTAAGACCGTTCAGAGAGTCGCCTGTGACTCCCCAGATGCGTTTCCCCCCTGCCGATTCGAGTGTTTTGGCGATATAAGCTGCACCCGTTTGTTTCATGGTTCTCCATCTCCTGAATGTGATAACGGTAACAAGtt > 2:306515/1‑148 (MQ=255) aaGACTGTCACTAAGACCGTTCAGAGAGTCGCCTGTGACTCCCCAGATGCGTTTCACCCCTGCCGATTCGAGTGTTTTGGCGATATAAGCTGCAACCGTTTGTTTCATGGTTCTCCATCTCCTGAATGTGATAACGGTAACAAGTTTa < 1:109298/148‑1 (MQ=255) tttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTttatt > 6:211262‑M2/144‑147 (MQ=255) ttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTTTa < 4:20858‑M2/4‑1 (MQ=255) ttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTTTa < 7:54895‑M2/4‑1 (MQ=255) ttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTTTAg < 8:285644‑M2/5‑1 (MQ=255) ttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTTTAg < 7:221443‑M2/5‑1 (MQ=255) tgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTTTAGTTCATc < 3:317861‑M2/11‑1 (MQ=255) aCTAAGACCGTTCAGAGAGTCGCCTGTGACTCCCCAGATGCGTTTCACCCCTGCCGATTCGAGTGTTTTGGCGATATAAGCTGCAACCGTTTGTTTCATGGTTCTCCATCTCCTGAATGTGATAACGGTAACAAGTTTAGtggatttgc < 5:290927‑M2/149‑10 (MQ=255) aCTAAGACCGTTCAGAGAGTCGCCTGTGACTCCCCAGATGCGTTTCACCCCTGCCGATGCGAGTGTTTTGGCGATATAAGCTGCAACCGGTTGTTTCATGGTTCTCCATCTCCTGAATGTGATTACGGTAACAAGTTTAGtggatttgc < 6:58094‑M2/149‑10 (MQ=255) tggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTTTAGTTCATCTGAc < 7:256008‑M2/15‑1 (MQ=255) 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agagagTCGCCTGTGACTCCCCAGATGCGTTTCACCCCTGCCGATTCGAGTGTTTTGGCGATATAAGCTGCAACCGTTTGTTTCATGGTTCTCCATCTCCTGAATGTGATAACGGTAACAAGTTTAGtggatttgcccctatatttcca > 7:283460‑M2/1‑127 (MQ=255) agagagTCGCCTGTGACTCCCCAGATGCGTTTCACCCCTGCCGATTCGAGTGTTTTGGCGATATAAGCTGCAACCGTTTGTTTCATGGTTCTCCATCTCCTGAATGTGATAACGGTAACAAGTTTAGtggatttgcccctatatttcca > 5:6015‑M2/1‑127 (MQ=255) agagagTCGCCTGTGACTCCCCAGATGCGTTTCACCCCTGCCGATTCGAGTGTTTTGGCGATATAAGCTGCAACCGTTTGTTTCATGGTTCTCCATCTCCTGAATGTGATAACGGTAACAAGTTTAGtggatttgcccctatatttcc > 7:1846‑M2/1‑127 (MQ=255) gtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTTTAGTTCATCTGACGGAGGGGGAAGGGAt > 7:63715‑M2/120‑149 (MQ=255) tttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTTTAGTTCATCTGACGGAGGGGGAAGGGATg > 3:360399‑M2/119‑149 (MQ=255) tctccggccctaagacataaatcatctgttctccaatgactattctaaaaactagtattaagactataacttatttatgtgttattggttgtctggagattcagggggccagtctaTTTAGTTCATCTGACGGAGGGGGAAGGGATgg < 5:211262‑M2/32‑1 (MQ=255) cggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTTTAGTTCATCTGACGGAGGGGGAAGGGATGGga < 8:63715‑M2/34‑1 (MQ=255) taagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTTTAGTTCATCTGACGGAGGGGGAAGGGATg < 1:11362‑M2/31‑1 (MQ=255) taagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTTTAGTTCATCTGACGGAGGGGGAAGGGATg > 2:11362‑M2/107‑137 (MQ=255) agacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTTTAGGTCATCTGACGGAGGGGGAAGGGATGGGAGAGAAaggag < 7:237732‑M2/44‑1 (MQ=255) 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2:273821‑M2/149‑145 (MQ=255) | GATTAAGACTGTCACTAAGACCGTTCAGAGAGTCGCCTGTGACTCCCCAGATGCGTTTCACCCCTGCCGATTCGAGTGTTTTGGCGATATAAGCTGCAACCGTTTGTTTCATGGTTCTCCATCTCCTGAATGTGATAACGGTAACAAGTTTAGTTCATCTGACGGAGGGGGAAGGGATGGGAGAGAAAGGAGGCACTAACGGTTAAATAGCCCGATGAAAGGAATATCATCGGGCATAAGGCGATTATGCGAGAACCAAATCCCCCTGCGGATGGCAGGAGCAGGCCAGTACGTAAC > NC_000913/910938‑911234 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |