| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 909159 = | 2128 (52.570) | 14 (0.370) | 13/240 | 1.8 | 0.71% | coding (136/1002 nt) | ltaE | L‑allo‑threonine aldolase, PLP‑dependent |
| ? | NC_000913 | 909184 = | 1899 (49.670) | coding (111/1002 nt) | ltaE | L‑allo‑threonine aldolase, PLP‑dependent | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 302 total aligned reads displayed.
GTCATAATAAGGACATGCCATGATTGATTTACGCAGTGATACCGTTACCCGACCAAGCCGCGCCATGCTCGAAGCGATGATGGCCGCCCCGGTTGGGGACGACGTTTACGGAGACGACCCTACCGTTAATGCTCTGCAGGACTACGCAGCAGAGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/909313‑909159‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcagagcATTAACGGTAGGGTCGTCTCCGTAAACGTCGTCCCCAACCGGGGCGGCCATCATCGCTTCGAGCATGGCGCGGCTTGGTCGGGTAACGGTATCACTGCGTAAATCAATCATGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTTT > NC_000913/909184‑909331 GTCATAATAAGGACATGCCATGATTGATTTACGCAGTGATACCGTTACCCGACCAAGCCGCGCCATGCTCGAAGCGATGATGGCCGCCCCGGTTGGGGACGACGTTTACGGAGACGACCCTACCGTTAATGCTCTGCAGGACTACGCAG < 1:130567/149‑1GTCATAATAAGGACATGCCATGATTGATTTACGCAGTGATACCGTTACCCGACCAAGCCGCGCCATGCTCGAAGCGATGATGGCCGCCCCGGTTGGGGACGACGTTTACGGAGACGACCCTACCGTTAATGCTCTGCAGGACTACGCAG < 1:154014/149‑1 TCATAATAAGGACATGCCATGATTGATTTACGCAGTGATACCGTTACCCGACCAAGCCGCGCCATGCTCGAAGCGATGATGGCCGCCCCGGTTGGGGACGACGTTTACGGAGACGACCCTACCGTTAATGCTCTGCAGGACTACGCAGC < 8:2550/149‑1 TCATAATAAGGACATGCCATGATTGATTTACGCAGTGATACCGTTACCCGACCAAGCCGCGCCATGCTCGAAGCGATGATGGCCGCCCCGGTTGGGGACGACGTTTACGGAGACGACCCTACCGTTAATGCTCTGCAGGACTACGCAG > 4:165271/1‑148 ATAATAAGGACATGCCATGATTGATTTACGCAGTGATACCGTTACCCGACCAAGCCGCGCCATGCTCGAAGCGATGATGGCCGCCCCGGTTGGGGACGACGTTTACGGAGACGACCCTACCGTTAATGCTCTGCAGGACTACGCAGCAG < 2:60180/149‑1 ATAATAAGGACATGCCATGATTGATTTACGCAGTGATACCGTTACCCGACCAAGCCGCGCCATGCTCGAAGCGATGATGGCCGCCCCGGTTGGGGACGACGTTTACGGAGACGACCCTACCGTTAATGCTCTGCAGGACTACGCAGCA < 3:93237/148‑1 ATAATAAGGACATGCCATGATTGATTTACGCAGTGATACCGTTACCCGACCAAGCCGCGCCATGCTCGAAGCGATGATGGCCGCCCCGGTTGGGGACGACGTTTACGGAGACGACCCTACCGTTAATGCTCTGCAGGACTACGCAGCA < 8:145658/148‑1 ATAATAAGGACATGCCATGATTGATTTACGCAGTGATACCGTTACCCGACCAAGCCGCGCCATGCTCGAAGCGATGATGGCCGCCCCGGTTGGGGACGACGTTTACGGAGACGACCCTACCGTTAATGCTCTGCAGGACTACGCAGCA < 8:19282/148‑1 ATAATAAGGACATGCCATGATTGATTTACGCAGTGATACCGTTACCCGACCAAGCCGCGCCATGCTCGAAGCGATGATGGCCGCCCCGGTTGGGGACGACGTTTACGGAGACGACCCTACCGTTAATGCTCTGCAGGACTACGCAG > 5:86041/1‑146 TAATAAGGACATGCCATGATTGATTTACGCAGTGATACCGTTACCCGACCAAGCCGCGCCATGCTCGAAGCGATGATGGCCGCCCCGGTTGGGGACGACGTTTACGGAGACGACCCTACCGTTAATGCTCTGCAGGACTACGCAGCAGA < 8:111541/149‑1 TAATAAGGACATGCCATGATTGATTTACGCAGTGATACCGTTACCCGACCAAGCCGCGCCATGCTCGAAGCGATGATGGCCGCCCCGGTTGGGGACGACGTTTACGGAGACGACCCTACCGTTAATGCTCTGCAGGACTACGCAGCAGA < 3:46860/149‑1 TAATAAGGACATGCCATGATTGATTTACGCAGTGATACCGTTACCCGACCAAGCCGCGCCATGCTCGAAGCGATGATGGCCGCCCCGGTTGGGGACGACGTTTACGGAGACGACCCTACCGTTAATGCTCTGCAGGACTACGCAGCAGA < 2:186488/149‑1 AATAAGGACATGCCATGATTGATTTACGCAGTGATACCGTTACCCGACCAAGCCGCGCCATGCTCGAAGCGATGATGGCCGCCCCGGTTGGGGACGACGTTTACGGAGACGACCCTACCGTTAATGCTCTGCAGGACTACGCAGCAGAG < 7:109338/149‑1 AATAAGGACATGCCATGATTGATTTACGCAGTGATACCGTTACCCGACCAAGCCGCGCCATGCTCGAAGCGATGATGGCCGCCCCGGTTGGGGACGACGTTTACGGAGACGACCCTACCGTTAATGCTCTGCAGGACTACGCAGCAGAG > 7:26719/1‑149 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GAGCATTAACGGTAGGGTCGTCTCCGTAAACGTCGTCCCCAACCGGGGCGGCCATCATCGCTTCGAGCATGGCGCGGCTTGGTCGGGTAACGG > 5:80698/1‑93 GAGCATTAACGGTAGGGTCGTCTCCGTAAACGTCGTCCCCAACCGGGGCGGCCATCATCGCTTCGAGCATGGCGCGGCTTGGTCGGGTAACG < 8:78018/92‑1 GAGCATTAACGGTAGGGTCGTCTCCGTAAACGTCGTCCCCAACCGGGGCGGCCATCATCGCTTCGAGCATGGCGCGGCTTGGTCGG > 4:154107/1‑86 GAGCATTAACGGTAGGGTCGTCTCCGTAAACGTCGTCCCCAACCGGGGCGGCCATCATCGCTGCGAGCATGGCGCGGCTTGGTCGGGTAACGGTATCACTGCGTAAATCAATCAAGGCATGTCCTGATTATGACGGGAACTGCCCCCCT > 7:128235/1‑149 AGCATTAACGGTAGGGTCGTCTCCGTAAACGTCGTCCCCAACCGGGGCGGCCATCATCGCTTCGAGCATGGCGCGGCTTGGTCGGGTAACGGTATCACTGCGTAAATCAATCATGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTT > 1:94833/1‑149 GCATTAACGGTAGGGTCGTCTCCGTAAACGTCGTCCCCAACCGGGGCGGCCATCATCGCTTCGAGCATGGCGCGGCTTGGTCGGGTAACGGTATCACTGCGTAAATCAATCATGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCGACCCTTT < 7:17962/149‑1 GCATTAACGGTAGGGTCGTCTCCGTAAACGTCGTCCCCAACCGGGGCGGCCATCATCGCTTCGAGCATGGCGCGGCTTGGTCGGGTAACGGTATCACTGCGTAAATCAATCATGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTT < 6:128035/149‑1 GCATTAACGGTAGGGTCGTCTCCGTAAACGTCGTCCCCAACCGGGGCGGCCATCATCGCTTCGAGCATGGCGCGGCTTGGTCGGGTAACGGTATCACTGCGTAAATCAATCATGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTT > 3:124921/1‑149 GCATTAACGGTAGGGTCGTCTCCGTAAACGTCGTCCCCAACCGGGGCGGCCATCATCGCTTCGAGCATGGCGCGGCTTGGTCGGGTAACGGTATCACTGCGTAAATCAATCATGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTT < 7:5739/149‑1 GCATTAACGGTAGGGTCGTCTCCGTAAACGTCGTCCCCAACCGGGGCGGCCATCATCGCTTCGAGCATGGCGCGGCTTGGTCGGGTAACGGTATCACTGCGTAAATCAATCATGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTT < 1:10010/149‑1 CATTAACGGTAGGGTCGTCTCCGTAAACGTCGTCCCCAACCGGGGCGGCCATCATCGCTTCGAGCATGGCGCGGCTTGGTCGGGTAACGGTATCACTGCGTAAATCAATCATGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTTT > 5:167385/1‑149 CATTAACGGTAGGGTCGTCTCCGTAAACGTCGTCCCCAACCGGGGCGGCCATCATCGCTTCGAGCATGGCGCGGCTTGGTCGGGTAACGGTATCACTGCGTAAATCAATCATGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTTT < 6:148264/149‑1 CATTAACGGTAGGGTCGTCTCCGTAAACGTCGTCCCCAACCGGGGCGGCCATCATCGCTTCGAGCATGGCGCGGCTTG < 6:35044/78‑1 GTCATAATAAGGACATGCCATGATTGATTTACGCAGTGATACCGTTACCCGACCAAGCCGCGCCATGCTCGAAGCGATGATGGCCGCCCCGGTTGGGGACGACGTTTACGGAGACGACCCTACCGTTAATGCTCTGCAGGACTACGCAGCAGAGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/909313‑909159‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcagagcATTAACGGTAGGGTCGTCTCCGTAAACGTCGTCCCCAACCGGGGCGGCCATCATCGCTTCGAGCATGGCGCGGCTTGGTCGGGTAACGGTATCACTGCGTAAATCAATCATGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTTT > NC_000913/909184‑909331 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |