| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4260142 | 173 (2.200) | 4 (0.050) | 4/240 | NT | 2.3% | intergenic (‑139/‑179) | zur/yjbL | transcriptional repressor, Zn(II)‑binding/uncharacterized protein |
| ? | NC_000913 | = 4260147 | 179 (2.390) | intergenic (‑144/‑174) | zur/yjbL | transcriptional repressor, Zn(II)‑binding/uncharacterized protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 213 total aligned reads displayed.
TTTTCCATCGGGCACCTCAAAGTGGGGGTTAAGAATGTCCTTACTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAGTTAACTCGCTATTTATTTAACTGGGTTTAAACGCATACCTGTAGTTCAGAAATTATGAGCGATTTTTGATAGTGACCAGATGGCAAAAGAATTATAAGGAG > NC_000913/4259996‑4260289 | ttttCCATCGGGCACCTCAAAGTGGGGGTTAAGAATGTCCTTACTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCaa > 7:135235/1‑149 (MQ=255) ttCCATCGGGCACCTCAAAGTGGGGGTTAAGAATGTCCTTACTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAac < 3:309302/148‑1 (MQ=255) tCCATCGGGCACCTCAAAGTGGGGGTTAAGAATGTCCTTACTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAaca < 5:63826/148‑1 (MQ=255) cATCGGGCACCTCAAAGTGGGGGTTAAGAATGTCCTTACTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACga < 7:161441‑M2/149‑3 (MQ=255) aatCGGGCCCCTCAAAGTGGGGGTTAAGAATGGCCTTACTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACga > 6:164773‑M2/2‑147 (MQ=255) tCGGGCACCTCAAAGTGGGGGTTAAGAATGTCCTTACTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACgata > 6:88500‑M2/1‑145 (MQ=255) ccTCAAAGTGGGGGTTAAGAATGTCCTTACTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGAtaataatta < 2:120191/149‑1 (MQ=255) cTCAAAGTGGGGGTTAAGAATGTCCTTACTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGAtaataattaa > 2:176448/1‑149 (MQ=255) tCAAAGTGGGGGTTAAGAATGTCCTTACTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGAtaataa > 1:5641/1‑144 (MQ=255) gTTAAGAATGTCCTTACTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGAtaataa > 5:72229/1‑133 (MQ=255) gTTAAGAATGTCCTTACTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGAtaataa < 6:72229/133‑1 (MQ=255) ttAAGAATGTCCTTACTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGGAACGGGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTta < 5:111835/149‑1 (MQ=255) aGAATGTCCTTACTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGATATGTTGCCTTGTCGTACCAATATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTtaaat < 3:187579/149‑1 (MQ=255) aTGTCCTTACTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTtaaataaa > 2:137669/1‑149 (MQ=255) tCCTTACTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAac < 6:215437/113‑1 (MQ=255) tCCTTACTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAAtt < 1:137669/148‑1 (MQ=255) ccTTACTTTACCATGTTCCGGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGc > 1:202085/1‑149 (MQ=255) ccTTACTTTACCATGTTCCAGGAAATACACCGAGAACCCTTATTGTTGCAGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTTTGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGc < 5:9972/149‑1 (MQ=255) cTTACTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCAttt > 4:279408/1‑135 (MQ=255) cTTACTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCt > 4:72441/1‑149 (MQ=255) cTTACTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCt > 8:266630/1‑149 (MQ=255) aCTTTACCATGTTCCAGGAATAACTCCGAGTCCCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGTTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTAACATTATCATCTCGATAATAATTTATATTTCATTTTTTAATATATTGCTTc < 4:224722/148‑1 (MQ=255) aCTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCtt < 7:100356/147‑1 (MQ=255) cTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCaa < 3:72441/149‑1 (MQ=255) tttACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTtaaa > 4:11917/1‑135 (MQ=255) 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aGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAGTTAACTCGCtatt < 1:286712/149‑1 (MQ=255) aGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCAATATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAGTTAACTCGCtatt > 3:132462/1‑149 (MQ=255) aGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTAGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTCTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTAAAATAAATTGCTTCAAGTTAACTCGCtatt > 2:77235/1‑149 (MQ=255) ggAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAGTTAACTCGCtattt < 8:161441/149‑1 (MQ=255) gAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAGTTAACTCGCtattta > 3:196257/1‑149 (MQ=255) gAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAGTTAACTCGCtattta < 1:176448/149‑1 (MQ=255) aaaaCACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCAATATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAGTTAACTCGCtatttatt < 4:132462/149‑1 (MQ=255) acCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCgtgttgataatggtacgacaaggcaacataacaccttacctacaaaaca < 6:335521‑M1/130‑50 (MQ=255) cGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAGTTAACTCGCTATTTATTTAACTgg > 7:16424/1‑149 (MQ=255) agaACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAGTTAACTCGCTATTTATTTAACTGGGt < 8:16424/149‑1 (MQ=255) 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aTCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAGTTAACTCGCTATTTATTTAACTGGGTTTAAACGCATACCTGTAGTTCAGAAATTATGAGCGATTTTTGATAGTGACCAGATGGCAAAAGAATTATAag > 3:126382/1‑147 (MQ=255) tCgtgttgataatggtacgacaaggcaacataacaccttacctacaaaacagaaaatcaacattaaggcaacaataagggttctcggtgtttttcctggaacatggtaaagtaaggacattcttaacccccactttgaggtgcccgatg > 1:30662‑M1/1‑2 (MQ=255) tCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAGTTAACTCGCTATTTATTTAACTGGGTTTAAACGCATACCTGTAGTTCAGAAATTATGAGCGATTTTTGATAGTGACCAGATGGCAAAAGAATTATAaggag < 5:220066/149‑1 (MQ=255) tCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAGTTAACTCGCTATTTATTTAACTGGGTTTAAACGCATACCTGTAGTTCAGAAATTATGAGCGATTTTTGATAGTGACCAGATGGCAAAAGAATTATAaggag < 1:267932/149‑1 (MQ=255) tCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAGTTAACTCGCTATTTATTTAACTGGGTTTAAACGCATACCTGTAGTTCAGAAATTATGAGCGATTTTTGATAGTGACCAGATGGCAAAAGAATTATAagga < 2:237524/148‑1 (MQ=255) tCAAAACTATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAGTTAACTCGCTATTTATTTAACTGTGTTTAAACGCATACCTGTAGTTCAGAAATTATGAGCGATTTTTGATAGTGACCAGATGGCAAAAGAATTATAagga < 8:268485/148‑1 (MQ=255) | TTTTCCATCGGGCACCTCAAAGTGGGGGTTAAGAATGTCCTTACTTTACCATGTTCCAGGAAAAACACCGAGAACCCTTATTGTTGCCGTAATGTTGATTTTCTGTTTTGTAGGTAAGGTGTTATGTTGCCTTGTCGTACCATTATCAACACGATAATAATTAATAATTCATTTTTAAATAAATTGCTTCAAGTTAACTCGCTATTTATTTAACTGGGTTTAAACGCATACCTGTAGTTCAGAAATTATGAGCGATTTTTGATAGTGACCAGATGGCAAAAGAATTATAAGGAG > NC_000913/4259996‑4260289 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |