| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 911,086 | IS2 (–) +5 bp | intergenic (‑37/+92) | poxB ← / ← hcr | pyruvate dehydrogenase, thiamine triphosphate‑binding, FAD‑binding/HCP oxidoreductase, NADH‑dependent |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 381260 = | NA (NA) | 58 (0.680) | 45/284 | 1.0 | 100% | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 911086 = | 0 (0.000) | intergenic (‑37/+96) | poxB/hcr | pyruvate dehydrogenase, thiamine triphosphate‑binding, FAD‑binding/HCP oxidoreductase, NADH‑dependent | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 382590 | NA (NA) | 76 (0.900) | 59/282 | 0.4 | 100% | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 911090 | 0 (0.000) | intergenic (‑41/+92) | poxB/hcr | pyruvate dehydrogenase, thiamine triphosphate‑binding, FAD‑binding/HCP oxidoreductase, NADH‑dependent | |||||
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GACTGTCACTAAGACCGTTCAGAGAGTCGCCTGTGACTCCCCAGATGCGTTTCACCCCTGCCGATTCGAGTGTTTTGGCGATATAAGCTGCAACCGTTTGTTTCATGGTTCTCCATCTCCTGAATGTGATAACGGTAACAAGTTTAGTTCATCTGACGGAGGGGGAAGGGATGGGAGAGAAAGGAGGCACTAACGGTTAAATAGCCCGATGAAAGGAATATCATCGGGCATAAGGCGATTATGCGAGAACCAAATCCCCCTGCGGATGGCAGGAGCAGGCCAGTACGTAACCTT > NC_000913/910944‑911237 | ttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTTTAg < 6:209267‑M2/5‑1 (MQ=255) cctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTTTAGTTc < 7:326629‑M2/8‑1 (MQ=255) tGTCACTAAGACCGTTCAGAGAGTCGCCTGTGACTCCCCAGATGCGTTTCACCCCTGCCGATTCGAGTGTTTTGGCGATATAAGCTGCAACCGTTTGTTTCATGGTTCTCCATCTCCTGAATGTGATAACGGTAACAAGTTTAGtggat < 6:176687‑M2/149‑6 (MQ=255) ctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTTTAGTTCa < 3:296306‑M2/9‑1 (MQ=255) tgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTTTAGTTCATc > 8:350091‑M2/139‑149 (MQ=255) tgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTTTAGTTCATCt < 4:254211‑M2/12‑1 (MQ=255) aCTAAGACCGTTCAGAGAGTCGCCTGTGACTCCCCAGATGCGTTTCACCCCTGCCGATTCGAGTGTTTTGGCGATATAAGCTGCAACCGTTTGTTTCATGGTTCTCCATCTCCTGAATGTGATAACGGTAACAAGTTTAGtggatttgc < 6:188430‑M2/149‑10 (MQ=255) aGACCGTTCAGAGAGTCGCCTGTGACTCCCCAGATGCGTTTCACCCCTGCCGATTCGAGTGTTTTGGCGATATAAGCTGCAACCGTTTGTTTCATGGTTCTCCATCTCCTGAATGTGATAACGGTAACAAGTTTAGtggatttgccc > 8:297718‑M2/1‑136 (MQ=255) 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cgtgtcaccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagactaaaaactagtattaagactatcacttttttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTTTAGTTCATCTGACGGAgg < 2:134690‑M2/20‑1 (MQ=255) tctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTTTAGTTCATCTGACGGAGGGGGAAGGGATgg < 3:273352‑M2/32‑1 (MQ=255) ccTGTGACTCCCCAGATGCGTTTCACCCCTGCCGATTCGAGTGTTTTGGCGATATAAGCTGCAACCGTTTGTTTCATGGTTCTCCATCTCCTGAATGTGATAACGGTAACAAGTTTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgt < 2:148484‑M2/149‑32 (MQ=255) tgACTCCCCAGATGCGTTTCACCCCTGCCGCTTCGAGTGTTTTGGCGATATAAGCTGCAACCGTTTGTTTCATGGTTCTCCATCTCCTGAATGTGATAACGGTAACAAGTTTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatc > 5:154096‑M2/1‑114 (MQ=255) tCCCCAGATGCGTTTCACCCCTGCCGATTCGAGTGTTTTGGCGATATAAGCTGCAACCGTTTGTTTCATGGTTCTCCATCTCCTGAATGTGATAACGGTAACAAGTTTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcact < 5:252031‑M2/148‑39 (MQ=255) tCCCCAGATGCGTTTCACCCCTGCCGATTCGAGTGTTTTGGCGATATAAGCTGCAACCGTTTGTTTCATGGTTCTCCATCTCCTGAATGTGATAACGGTAACAAGTTTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttat < 2:328809‑M2/144‑35 (MQ=255) agacatcaatcatctgtcctccaatgactagtctaaaacctagtattacgactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTTTAGTTCATCTGACGGAGGGGGAAGGGATGGGAGAGAAagga < 8:276325‑M2/43‑1 (MQ=255) cccAGATGCGTTTCACCCCTGCCGATTCGAGTGTTTTGGCGATATAAGCTGCAACCGTTTGTTTCATGGTTCTCCATCTCCTGAATGTGATAACGGTAACAAGTTTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaa > 4:153243‑M2/1‑108 (MQ=255) cccAGATGCGTTTCACCCCTGCCGATTCGAGTGTTTTGGCGATATAAGCTGCAACCGGTTGTTTCATGGTTCTCCATCTCCTGAATGTGATAACGGTAACAAGTTTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaa > 2:36033‑M2/1‑108 (MQ=255) ccAGATGCGTTTCACCCCTGCCGATTCGAGTGTTTTGGCGATATAAGCTGCAACCGTTTGTTTCATGGTTCTCCATCTCCTGAATGTGATAACGGTAACAAGTTTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaac > 3:239514‑M2/1‑107 (MQ=255) atcaatcatctgttctccaatgactagactaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTTTAGTTCATCTGACGGAGGGGGAAg < 3:86254‑M2/26‑1 (MQ=255) atcaatcatctgttctccaatgactagactaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTTTAGTTCATCTGACGGAGGGGGAAg > 4:86254‑M2/101‑126 (MQ=255) aTGCGTTTCACCCCTGCCGATTCGAGTGTTTTGGCGATATAAGCTGCAACCGTTTGTTTCATGGTTCTCCATCTCCTGAATGTGATAACGGTAACAAGTTTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccat > 5:176687‑M2/1‑103 (MQ=255) tttCACCCCTGCCGATTCGAGTGTTTTGGCGATATAAGCTGCAACCGTTTGTTTCATGGTTCTCCATCTCCTGAATGTGATAACGGTAACAAGTTTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaa > 7:277856‑M2/1‑98 (MQ=255) atctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTTTAGTTCATCTGACGGAGGGGGAAGGGATGGGAGAGAAAGGAGGCACTAACGGt > 7:205261‑M2/94‑148 (MQ=255) cttttctcctatgactagtctaaaaactagtattatgcctatgacttaattaagtgatattggttggctggagattcagggggccagtctaTTTAGTTCTTCTGACGGAGGGGGAAGGGATGGGAGAGAAAGGAGGCACTAACgg < 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GACTGTCACTAAGACCGTTCAGAGAGTCGCCTGTGACTCCCCAGATGCGTTTCACCCCTGCCGATTCGAGTGTTTTGGCGATATAAGCTGCAACCGTTTGTTTCATGGTTCTCCATCTCCTGAATGTGATAACGGTAACAAGTTTAGTTCATCTGACGGAGGGGGAAGGGATGGGAGAGAAAGGAGGCACTAACGGTTAAATAGCCCGATGAAAGGAATATCATCGGGCATAAGGCGATTATGCGAGAACCAAATCCCCCTGCGGATGGCAGGAGCAGGCCAGTACGTAACCTT > NC_000913/910944‑911237 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |