New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | = 2539674 | NA (NA) | 4 (0.050) | 4/248 | NT | NA | intergenic (‑91/+43) | cysM/cysA | cysteine synthase B (O‑acetylserine sulfhydrolase B)/sulfate/thiosulfate transporter subunit |
? | NC_000913 | = 2539688 | NA (NA) | intergenic (‑105/+29) | cysM/cysA | cysteine synthase B (O‑acetylserine sulfhydrolase B)/sulfate/thiosulfate transporter subunit |
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
TTCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGACCAACGAATAAACGCTCGCCACGCTGCGGGGCATCGTC > NC_000913/2539540‑2539836 | ttCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGcc > 4:324273/1‑149 (MQ=255) cAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCtccgg < 4:376331‑M2/149‑6 (MQ=255) gagGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCtccgggc < 4:365372‑M2/149‑8 (MQ=255) ggCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGt < 1:17583/149‑1 (MQ=255) gCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGTGAAGCGCCTCCGGGCGtt < 6:220661/149‑1 (MQ=255) tATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTaa < 8:351327/149‑1 (MQ=255) tATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTaa < 4:83452/149‑1 (MQ=255) ttGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACa < 8:320362/149‑1 (MQ=255) ttGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACa < 8:25529/149‑1 (MQ=255) tGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACa < 4:71753/148‑1 (MQ=255) cTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCa < 7:210965/149‑1 (MQ=255) tATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCAc > 4:141454/1‑149 (MQ=255) tgtttgttCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTc > 4:202335/1‑148 (MQ=255) tttgttCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAAc < 3:289624/149‑1 (MQ=255) tttgttCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAAc > 4:289624/1‑149 (MQ=255) tttgttCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAAc > 6:385912/1‑149 (MQ=255) cTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTAt > 7:281213/1‑147 (MQ=255) tAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAg > 5:238214/1‑149 (MQ=255) 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8:143377/148‑1 (MQ=255) tCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAg < 7:129069/149‑1 (MQ=255) ccATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCAGCTATACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGCCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAAGCGCTTTCTGCGAGAGCAAGt > 2:99160/1‑149 (MQ=255) tACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTcc > 2:236122/1‑149 (MQ=255) aCGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCt > 3:308141/1‑149 (MQ=255) cGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTc < 4:79641/149‑1 (MQ=255) gtggtgTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCa < 6:238214/149‑1 (MQ=255) gtgtTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATc < 7:44589/148‑1 (MQ=255) tgtTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTaa > 8:375268/1‑99 (MQ=255) cTGATGCGACGCTTGGGCGTCTTATCAGGTCTAGAGGTTACAAACCTTGCCATTTAAAAGGCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTGAACCTTTCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGttt < 1:99160/149‑1 (MQ=255) aTGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTc < 2:351379/147‑1 (MQ=255) tGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGa > 1:76107/1‑148 (MQ=255) 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cATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGAcc < 2:60569/142‑1 (MQ=255) cATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGAcc > 1:60569/1‑142 (MQ=255) aTTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCCACCTATCAGGCGCGTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGGCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGACCAACGAAt > 5:146276/1‑148 (MQ=255) aTTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGAt > 2:153303/1‑102 (MQ=255) aTTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGAt < 1:153303/102‑1 (MQ=255) ttAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCACATGTTGCAGACCAACGAATaa < 6:367809/149‑1 (MQ=255) aaaaaGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATcgc > 8:351100/1‑89 (MQ=255) aaaaaGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATcgc < 7:351100/89‑1 (MQ=255) aaaaaGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGACCAACGAATaaa < 6:182596/148‑1 (MQ=255) aaaGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTg > 5:180549/1‑130 (MQ=255) aaaGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTg < 6:180549/130‑1 (MQ=255) aaaGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGACCAACGAATAAACGc > 2:397635/1‑149 (MQ=255) cccGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGACCAACGAATAAACGCTCGc < 8:210195/149‑1 (MQ=255) cGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCAGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGACCAACGAATAAACGCTCGCCa < 4:323668/149‑1 (MQ=255) cgGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCTTCGCGGGTTTCGATACGCTCGTAGCCGGTATACAGCCGCGCATGTTGCAGACCAACGAATAATCGCTCGCCACGCTGCg < 6:257658/149‑1 (MQ=255) cgGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGACCAACGAATAAACGCTCGCCACGCTGCg > 8:254052/1‑149 (MQ=255) gggAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGACCAACGAATAAACGCTCGCCACGCTGCgg > 6:73202/1‑149 (MQ=255) gggAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGACCAACGAATAAACGCTCGCCACGCTGCgg < 1:150258/149‑1 (MQ=255) ggAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGACCAACGAATAAACGCTCGCCACGCTGCggg < 4:297835/149‑1 (MQ=255) gAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGACCAACGAATAAACGCTCGCCACGCTGCgggg < 8:287607/149‑1 (MQ=255) cTCCGGGCGTTTAACATTCACTCACCCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGACCAACGAATAAACGCTCGCCACGCTGCGGGGCAtcgtc > 6:260047/1‑149 (MQ=255) cTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGACCAACGAATAAACGCTCGCCACGCTGCgg > 7:326585/1‑140 (MQ=255) cTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGACCAACGAATAAACGCTCGCCACGCTGCgg < 8:326585/140‑1 (MQ=255) cTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGACCAACGAATAAACGCTCGCCACGCTGCGGGGCAtcgtc > 3:363916/1‑149 (MQ=255) | TTCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCACTCAACCTATCAGGCGCTTTGTGCGAGAGCAAGTTCCTCATCGCGGGTTTCGATACGCTCGTCGCCGTTATACAGCCGCGCATGTTGCAGACCAACGAATAAACGCTCGCCACGCTGCGGGGCATCGTC > NC_000913/2539540‑2539836 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |