| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4304575 = | 124 (1.370) | 6 (0.070) | 4/240 | NT | 5.3% | intergenic (‑172/+37) | ytcA/yjcS | putative inner membrane efflux pump‑associated DUF1656 family protein/metallo‑beta‑lactamase superfamily protein |
| ? | NC_000913 | 4304603 = | 102 (1.230) | intergenic (‑200/+9) | ytcA/yjcS | putative inner membrane efflux pump‑associated DUF1656 family protein/metallo‑beta‑lactamase superfamily protein | |||||
Only 100 of 147 total aligned reads displayed.
CATTGAAGGCGTCAGTATGGCTATTTTCTTGATGAATAAAAATAGCTTTATTCAGCCACCGCATTCATAACTTATATATTTTATTTATTAATTGGCTGTATATATTTTTAAAATAAATACTTTTGGGGGCTTCAGCGCCCCCAAAAGCGAGTGACATTAATTTGGGGTTACGATATTCACCCACAAATCGAAATTATCCAGACAGGCGATAATTTCTTCCAGTTTCGCGCCATTGCCAATAATTTTGGCTTTCTTCGCTTTTACCAGATCCGCCATTTTGGCTTGTCCGGTCAGCA > NC_000913/4304456‑4304751 | cATTGAAGGCGTCAGTATGGCTATTTTCTTGATGAATAAAAATAGCTTTATTCAGCCACCGCATTCATAACTTATATATTTTATTTATTAATTGGCTGTATATATTTTTAAAATAAATACTTTTGGGGGCTTCAGCGCCCCCAAAAGc > 3:32304/1‑148 (MQ=255) aTTGAAGGCGTCAGTATGGCTATTTTCTTGATGAATAAAAATAGCTTTATTCAGCCACCGCATTCATAACTTATATAATTTATTTATTAATTGGCTGTATATATTTTTAAAATAAATACTTTTGGGGGCTTCAGCGCCCCCAAAAGCGa < 7:250771/149‑1 (MQ=255) aTTGAAGGCGGCAGTATGGCTATTTTCTTGATGAATAAAAATAGCTTTATTCAGCCACCGCATTCATCACTTATATATTTTATTTATTAATTGGCTGTATATATTTTTAAAATAAATACTTTTGGGGGCTTCAGCGCCCCCAAAAGCGa < 3:138781/149‑1 (MQ=255) 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GGCTTCAGCGCCCCCAAAAGCGAGTGACATTAATTTGGGGTTACGATATTCACCCACAAATCGAAATTATCCAGACAGGCGATAATTTCTTCCAGTTTCGCGCCATTGCCAATAATTTTGGCTTTCTTCGCTTTTACCAGATCCGCCAt < 4:379897‑M1/149‑1 (MQ=255) ttCAGCGCCCCCAAAAGCGAGTGACATTAATTTGGGGTTACGATATTCACCCACAAATCGAAATTATCCAGACAGGCGATAATTTCTTCCAGTTTCGCGCCATTGCCAATAAGTTTGGCTTTCTTCGCTTTTACCCGATCCGCCAtttt > 6:402523/1‑149 (MQ=255) aGCGCCCCCAAAAGCGAGTGACATTAATTTGGGGTTACGATATTCACCCACAAATCGAAATTATCCAGACAGGCGATAATTTCTTCCAGTTTCGCGCCATTGCCAATAATTTTGGCTTTCTTCGCTTTTACCAGATCCGCCATTTTgg < 4:247007/148‑1 (MQ=255) ctcacccaaaagCGAGTGACATTAATTTGGTGTTACGATATTCACCCACAAATCGAAATTATCCAGACAGGCTATAATTTCTTCCAGTTTCGCGCCATTGCCAATAATTTTGGCTTTCTTCGCTTTTACCAGATCCTCCATTTTGGCtt < 4:182328‑M2/137‑1 (MQ=255) caaaagCGAGTGACATTAATTTGGGGTTACGATATTCACCCACAAATCGAAATTATCCAGACAGGCGATAATTTCTTCCAGTTTCGCGCCATTGCCAATAATTTTGGCTTTCTTCGCTTTTACCAGa < 1:291669‑M2/121‑1 (MQ=255) caaaagCGAGTGACATTAATTTGGGGTTACGATATTCACCCACAAATCGAAATTATCCAGACAGGCGATAATTTCTTCCAGTTTCGCGCCATTGCCAATAATTTTGGCTTTCTTCGCTTTTACCAGATCCGCCATTTTGGCt > 3:116666‑M2/7‑142 (MQ=255) caaaagCGAGTGACATTAATTTGGGGTTACGATATTCACCCACAAATCGAAATTATCCAGACAGGCGATAATTTCTTCCAGTTTCGCGCCATTGCCAATAATTTTGGCTTTCTTCGCTTTTACCAGATCCGCCATTTTGGCTTGTCCgg < 3:261570‑M2/143‑1 (MQ=255) caaaagCGAGTGACATTAATTTGGGGTTACGATATTCACCCACAAATCGAAATTATCCAGACAGGCGATAATTTCTTCCAGTTTCGCGCCAATGCCAATAATTTTGGCTTTCTTCGCTTTTCCCAGATCCGCCATTTTGGCt < 4:116666‑M2/136‑1 (MQ=255) caaaagCGAGTGACATTAATTTGGGGTTACGATATTCACCCACAAATCGAAATTATCCAGACAGGCGATAATATCTTCCAGTTTCGCGCCATTGCCAAAAATTTTGGCTTTCTTCGCTTTTACCAGa > 2:291669‑M2/7‑127 (MQ=255) aaagCGAGTGACATTAATTTGGGGTTACGATATTCACCCACAAATCGAAATTATCCAGACAGGCGATAATTTCTTCCAGTTTCGCGCCATTGCCAATAATTTTGGCTTTCTTCGCTTTTACCAGATCCGCCATTTTGGCTTGTCCGGt > 8:37082‑M2/5‑148 (MQ=255) aaagCGAGTGACATTAATTTGGGGTTACGATATTCACCCACAAATCGAAATTATCCAGACAGGCGATAATTTCTTCCAGTTTCGCGCCATTGCCAATAATTTTGGCTTTCTTCGCTTTTACCAGATCCGCCATTTTGGCTTGTCCGGt < 7:37082‑M2/144‑1 (MQ=255) cGAGTGACATTAATTTGGGGTTACGATATTCACCCACAAATCGAAATTATCCAGACAGGCGATAATTTCTTCCAGTTTCGCGCCATTGCCAATAATTTTGGCTTTCTTCGCTTTTACCAGATCCGCCATTTTGGCTTGTCCGGTCAGCa < 6:218078/149‑1 (MQ=255) | CATTGAAGGCGTCAGTATGGCTATTTTCTTGATGAATAAAAATAGCTTTATTCAGCCACCGCATTCATAACTTATATATTTTATTTATTAATTGGCTGTATATATTTTTAAAATAAATACTTTTGGGGGCTTCAGCGCCCCCAAAAGCGAGTGACATTAATTTGGGGTTACGATATTCACCCACAAATCGAAATTATCCAGACAGGCGATAATTTCTTCCAGTTTCGCGCCATTGCCAATAATTTTGGCTTTCTTCGCTTTTACCAGATCCGCCATTTTGGCTTGTCCGGTCAGCA > NC_000913/4304456‑4304751 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |