| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 4231530 | 110 (0.940) | 5 (0.040) | 5/240 | NT | 4.3% | coding (102/273 nt) | yjbD | DUF3811 family protein |
| ? | NC_000913 | = 4231537 | 118 (1.050) | coding (95/273 nt) | yjbD | DUF3811 family protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 147 total aligned reads displayed.
ACCAGCTAAATGACGCTTCAGGATCCGGTTTATAAGCCTGCTTTTTCTTCAACTGGCGGGCTTTTTTCGCTTCAGCCTCACGCTCAACCATTAATTTATCGATGTAATCTTTCTTAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATCCAGCAGTGTTTTAAGTTCACGCTGCTCGCGTTCAGTCATCTCTTTTTGGGTAATACGGGGGAGTGCCATGATGGTGCCCTCAGTGAGCCAGAGAGTTCAGTGTACGGGAATTCGTTTGCGA > NC_000913/4231391‑4231683 | aCCAGCTAAATGACGCTTCAGGATCCGGTTTATAAGCCTGCTTTTTCTTCAACTGGCGGGCTTTTTTCGCTTCAGCCTCACGCTCAACCATTAATTTATCGATGTAATCTTTCTTAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCga > 3:331784‑M2/1‑147 (MQ=255) ccAGCTAAATGACGCTTCAGGATCCGGTTTATAAGCCTGCTTTTTCTTCAACTGGCGGGCTTTTTTCGCTTCAGCCTCACGCTCAACCATTAATTTATCGATGTAATCTTTCTTAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCgac < 7:270259‑M2/149‑4 (MQ=255) ccAGCTAAATGACGCTTCAGGATCCGGTTTATAAGCCTGCTTTTTCTTCAACTGGCGGGCTTTTTTCGCTTCAGCCTCACGCTCAACCATTAATTTATCGATGTAATCTTTCTTAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGAgac < 5:182948‑M2/149‑4 (MQ=255) cAGCTAAATGACGCTTCAGGATCCGGTTTATAAGCCTGCTTTTTCTTCAACTGGCGGGCTTTTTTCGCTTCAGCCTCACGCTCAACCATTAATTTATCGATGTAATCTTTCTTAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCgac < 8:42024‑M2/148‑4 (MQ=255) cAGCTAAATGACGCTTCAGGATCCGGTTTATAAGCCTGCTTTTTCTTCAACTGGCGGGCTTTTTTCGCTTCAGCCTCACGCTCAACCATTAATTTATCGATGTAATCTTTCTTAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCgac < 4:103786‑M2/148‑4 (MQ=255) gCTAAATGACGCTTCAGGATCCGGTTTATAAGCCTGCTTTTTCTTCAACTGGCGGGCTTTTTTCGCTTCAGCCTCACGCTCAACCATTAATTTATCGATGTAATCTTTCTTAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCAt > 1:213640/1‑149 (MQ=255) gATCCGGTTTATAAGCCTGCTTTTTCTTCAACTGGCGGGCTTTTTTCGCTTCAGCCTCACGCTCAACCATTAATTTATCGATGTAATCTTTCTTAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGa > 1:10936/1‑149 (MQ=255) gATCCGGTTTATAAGCCTGCTTTTTCTTCAACTGGCGGGCTTTTTTCGCTTCAGCCTCACGCTCAACCATTAATTTATCGATGTAATCTTTCTTAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGa > 1:505304/1‑149 (MQ=255) aTCCGGTTTATAAGCCTGCTTTTTCTTCAACTGGCGGGCTTTTTTCGCTTCAGCCTCACGCTCAACCATTAATTTATCGATGTAATCTTTCTTAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCga > 6:106011‑M2/1‑125 (MQ=255) aTCCGGTTTATAAGCCTGCTTTTTCTTCAACTGGCGGGCTTTTTTCGCTTCAGCCTCACGCTCAACCATTAATTTATCGATGTAATCTTTCTTAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCga < 5:106011‑M2/127‑3 (MQ=255) aTCCGGTTTATAAGCCTGCTTTTTCTTCAACTGGCGGGCTTTTTTCGCTTCAGCCTCACGCTCAACCATTAATTTATCGATGTAATCTTTCTTAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGAt > 1:388592/1‑149 (MQ=255) tCCGGTTTATAAGCCTGCTTTTTCTTCAACTGGCGGGCTTTTTTCGCTTCAGCCTCACGCTCAACCATTAATTTATCGATGTAATCTTTCTTAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATc > 2:147573/1‑149 (MQ=255) tttATAAGCCTTCTTTTTCTTCAACTGGCGGGCTTTTTTCGCTTCAGCCTCACGCTCAACCATTAATTTATCGATGTAATCTTTCTTAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTTGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATCcagca < 6:15356/149‑1 (MQ=255) tttATAAGCCTGCTTTTTCTTCAACTGGCGGGCTTTTTTCGCTTCAGCCTCACGCTCAACCATTAATTTATCGATGTAATCTTTCTTAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATCcag > 2:262605/1‑147 (MQ=255) ataAGCCTGCTTTTTCTTCAACTGGCGGGCTTTTTTCGCTTCAGCCTCACGCTCAACCATTAATTTATCGATGTAATCTTTCTTAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATCCAGCAgtg > 2:565956/1‑149 (MQ=255) aGCCTGCTTTTTCTTCAACTGGCGGGCTTTTTTCGCTTCAGCCTCACGCTCAACCATTAATTTATCGATGTAATCTTTCTTAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATCCAGCAGTGtt < 1:262605/148‑1 (MQ=255) gCCTGCTTTTTCTTCAACTGGCGGGCTTTTTTCGCTTCAGCCTCACGCTCAACCATTAATTTATCGATGTAATCTTTCTTAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATCCAGCAGTGtttt < 7:312581/149‑1 (MQ=255) tGCTTTTTCTTCAACTGGCGGGCTTTTTTCGCTTCAGCCTCACGCTCAACCATTAATTTATCGATGTAATCTTTCTTAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCgacc < 7:281612‑M2/113‑5 (MQ=255) tGCTTTTTCTTCAACTGGCGGGCTTTTTTCGCTTCAGCCTCACGCTCAACCATTAATTTATCGATGTAATCTTTCTTAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCgacc > 1:63526‑M2/1‑109 (MQ=255) tGCTTTTTCTTCAACTGGCGGGCTTTTTTCGCTTCAGCCTCACGCTCAACCATTAATTTATCGATGTAATCTTTCTTAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCgacc > 8:281612‑M2/1‑109 (MQ=255) tGCTTTTTCTTCAACTGGCGGGCTTTTTTCGCTTCAGCCTCACGCTCAACCATTAATTTATCGATGTAATCTTTCTTAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCgacc < 2:63526‑M2/113‑5 (MQ=255) tGCTTTTTCTTCAACTGGCGGGCTTTTTTCGCTTCAGCCTCACGCTCAACCATTAATTTATCGATGTAATCTTTCTTAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATCCAGCAGTGTTTTAAg > 7:283630/1‑149 (MQ=255) cTTTTTCTTCAACTGGCGGGCTTTTTTCGCTTCAGCCTCACGCTCAACCATTAATTTATCGATGTAATCTTTCTTAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATCCAGCAGTGTTTTAAg < 2:505304/147‑1 (MQ=255) tttCTTCAACTGGCGGGCTTTTTTCGCTTCAGCCTCACGCTCAACCATTAATTTATCGATGTAATCTTTCTTAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCTATCCAGCAgtg < 3:500068/137‑1 (MQ=255) tttCTTCAACTGGCGGGCTTTTTTCGCTTCAGCCTCACGCTCAACCATTAATTTATCGATGTAATCTTTCTTAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATCCAGCAGTGTTTTAAGTTCa < 8:270259/148‑1 (MQ=255) tGGCGGGCTTTTTTCGCTTCAGCCTCACGCTCAACCATTAATTTATCGATGTAATCTTTCTTAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCga < 1:111607‑M2/96‑3 (MQ=255) tGGCGGGCTTTTTTCGCTTCAGCCTCACGCTCAACCATTAATTTATCGATGTAATCTTTCTTAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCga > 2:111607‑M2/1‑94 (MQ=255) gCGGGCTTTTTTCGCTTCAGCCTCACGCTCAACCATTAATTTATCGATGTAATCTTTCTTAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATCCAGCAGTGTTTTAAGTTCACGCTGCTCGCGtt > 6:235111/1‑149 (MQ=255) gggCTTTTTTCGCTTCAGCCTCACGCTCAACCATTAATTTATCGATGTAATCTTTCTTAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATCcagcag < 2:537610/121‑1 (MQ=255) gggCTTTTTTCGCTTCAGCCTCACGCTCAACCATTAATTTATCGATGTAATCTTTCTTAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATCCAGCAGTGTTTTAAGTTCACGCTGCTCGCGtt > 4:341414/1‑147 (MQ=255) ggCTTTTTTCGCTTCAGCCTCACGCTCAACCATTAATTTATCGATGTAATCTTTCTTAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATCCAGCAGTGTTTTAAGTTCACGCTGCTCGCGTTCAg < 7:31526/149‑1 (MQ=255) ttttCGCTTCAGCCTCACGCTCAACCATTAATTTATCGATGTAATCTTTCTTAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATCCAGCAGTGTTTTAAGTTCACGCTGCTCGCGTTCAGTCAt < 1:565956/148‑1 (MQ=255) 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< 6:104182/149‑1 (MQ=255) ccTCACGCTCAACCATTAATTTATCGATGTAATCTTTCTTAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATCCAGCAGTGTTTTAAGTTCACGCTGCTCGCGTTCAGTCATCTCTTTTTGGGt > 3:238461/1‑148 (MQ=255) tCACGCTCAACCATTAATTTATCGATGTAATCTTTCTTAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCgaccaactccgaaaccaacagcattaagaaagattacatcgataaattaatggttgagcgtgaggctgaagcgaaaa < 4:511636‑M2/147‑78 (MQ=255) tCACGCTCAACCATTAATTTATCGATGTAATCTTTCTTAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATCCAGCAGTGTTTTAAGTTCACGCTGCTCGCGTTCAGTCATCTCtttt > 3:369443/1‑141 (MQ=255) tCACGCTCAACCATTAATTTATCGATGTAATCTTTCTTAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATCCAGCAGTGTTTTAAGTTCACGCTGCTCGCGTTCAGTCATCTCtttt < 4:369443/141‑1 (MQ=255) tCACGCTCAACCATTAATTTATCGATGTAATCTTTCTTAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATCCAGCAGTGTTTTAAGTTCACGCTGCTCGCGTTCAGTCATCTCTTTTTggg < 5:284955/145‑1 (MQ=255) 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ttcttAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATCCAGCAGTGTTTTAAGTTCACGCTGCTCGCGTTCAGTCATCTCTTTTTGGGTAATACGGGGGAGTGCCATGATGGTGCCCTCa < 4:471275/144‑1 (MQ=255) ttcttAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATCCAGCAGTGTTTTAAGTTCACGCTGCTCGCGTTCAGTCATCTCTTTTTGGGTAATACGGGGGAGTGCCATGATGGTGCCCTCa > 3:471275/1‑144 (MQ=255) cttAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATCCAGCAGTGTTTTAAGTTCACGCTGCTCGCGTTCAGTCATCTCTTTTTGGGTAATACGGGGGAGTGCCATGATGGTGCCCTCAGTGAGc > 1:483646/1‑148 (MQ=255) cttAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATCCAGCAGTGTTTTAAGTTCACGCTGCTCGCGTTCAGTCATCTCTTTTTGGGTAATACGGGGGAGTGCCATGATGGTGCCCTCAGTGAGc < 7:42024/148‑1 (MQ=255) ttAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATCCAGCAGTGTTTTAAGTTCACGCTGCTCGCGTTCAGTCATCTCTTTTTGGGTAATACGGGGGAGTGCCATGATgg > 1:397135/1‑133 (MQ=255) aaTGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATCCAGCAGTGTTTTAAGTTCACGCTGCTCGCGTTCAGTCATCTCTTTTTGGGTAATACGGGGGAGTGCCATGATGGTGCCCTCAGTGAGCCa < 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gAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATCCAGCAGTGTTTTAAGTTCACGCTGCTCGCGTTCa > 5:499745/1‑75 (MQ=255) ttGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATCCAGCAGTGTTTTAAGTTCACGCTGCTCGCGTTCAGTCATCTCTTTTTGGGTAATACGGGGGAGTGCCATGATGGTGCCCTCAg > 8:503998/1‑121 (MQ=255) ttGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATCCAGCAGTGTTTTAAGTTCACGCTGCTCGCGTTCAGTCATCTCTTTTTGGGTAATACGGGGGAGTGCCATGATGGTGCCCTCAGTGAGCCAGAGAGTTCAGTGTACGGGAAt > 1:338146/1‑149 (MQ=255) ggTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATCCAGCAGTGTTTTAAGTTCACGCTGCTCGCGTTCAGTCATCTCTTTTTGGGTAATACGGGGGAGTGCCATGATGGTGCCCTCAGTGAGCCAGAGAGTTCAGTGTACGGGAATTc > 7:173878/1‑149 (MQ=255) tCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATCCAGCAGTGTTTTAAGTTCACGCAGCTCGCGTTCAGTCATCTCTTTTTGGGAAAAACGGGGGAGTGCCATGATGGTGCCCTCAGTGAGCCAGAGAGTTCAGTGTACGGGAATTCGt > 7:408668/1‑149 (MQ=255) aaTACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATCCAGCAGTGTTTTAAGTTCACGCTGCTCGCGTTCAGTCATCTCTTTTTGGGTAATACGGGGGAGTGCCa > 1:192575/1‑100 (MQ=255) aaTACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATCCAGCAGTGTTTTAAGTTCACGCTGCTCGCGTTCAGTCATCTCTTTTTGGGTAATACGGGGGAGTGCCa < 2:192575/100‑1 (MQ=255) aaTACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATCCAGCAGTGTTTTAAGTTCACGCTGCTCGCGTTCAGTCATCTCTTTTTGGGTAATACGGGGGAGTGCCATGATGGTGCCCTCAg > 3:371300/1‑115 (MQ=255) aTACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATCCAGCAGTGTTTTAAGTTCACGCTGCTCGCGTTCAGTCATCTCTTTTTGGGTAATACGGGGGAGTGCCATGATGGTGCCCTCAGTGAGCCAGAGAGTTCAGTGTACGGGAATTCGTTTg > 3:159895/1‑149 (MQ=255) tACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATCCAGCAGTGTTTTAAGTTCACGCTGCTCGCGTTCAGTCATCTCTTTTTGGGTAATACGGGGGAGTGCCATGATGGTGCCCTCAGTGAGCCAGAGAGTTCAGTGTACGGGAATTCGTTTGc > 6:427041/1‑149 (MQ=255) tACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATCCAGCAGTGTTTTAAGTTCACGCTGCTCGCGTTCAGTCATCTCTTTTTGGGTAATACGGGGGAGTGCCATGATGGTGCCCTCAGTGAGCCAGAGAGTTCAGTGTACGGGAATTCGTTTGc < 7:533149/149‑1 (MQ=255) tACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATCCAGCAGTGTTTTAAGTTCACGCTGCTCGCGTTCAGTCATCTCTTTTTGGGTAATACGGGGGAGTGCCATGATGGTGCCCTCAGTGAGCCAGAGAGTTCAGTGTACGGGAATTCGTTTGc < 1:14660/149‑1 (MQ=255) tACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATCCAGCAGTGTTTTAAGTTCACGCTGCTCGCGTTCAGTCATCTCTTTTTGGGTAATACGGGGGAGTGCCATGATGGTGCCCTCAGTGAGCCAGAGAGTTCAGTGTACGGGAATTCGTTTGc < 2:338146/149‑1 (MQ=255) cgcgACCATGCGCAATCCGCGCCCGATCCAGCAGTGTTTTAAGTTCACGCTGCTCGCGTTCAGTCATCTCTTTTTGGGTAATACGGGGGAGTGCCATGATGGTGCCCTCAGTGAGCCAGAGAGTTCAGTGTACGGGAATTCGTTTGCGa < 2:437610/149‑1 (MQ=255) gcgACCATGCGCAATCCGCGCCCGATCCAGCAGTGTTTTAAGTTCACGCTGCTCGCGTTCAGTCATCTCTTTTTGGGTAATACGGGGGa < 6:112613/89‑1 (MQ=255) gcgACCATGCGCAATCCGCGCCCGATCCAGCAGTGTTTTAAGTTCACGCTGCTCGCGTTCAGTCATCTCTTTTTGGGTAATACGGGGGa > 5:112613/1‑89 (MQ=255) gcgACCATGCGCAATCCGCGCCCGATCCAGCAGTGTTTTAAGTTCACGCTGCTCGCGTTCAGTCATCTCTTTTTGGGTAATACGGGGGAGTGCCa > 6:62917/1‑95 (MQ=255) gcgACCATGCGCAATCCGCGCCCGATCCAGCAGTGTTTTAAGTTCACGCTGCTCGCGTTCAGTCATCTCTTTTTGGGTAATACGGGGGAGTGCCa < 5:62917/95‑1 (MQ=255) | ACCAGCTAAATGACGCTTCAGGATCCGGTTTATAAGCCTGCTTTTTCTTCAACTGGCGGGCTTTTTTCGCTTCAGCCTCACGCTCAACCATTAATTTATCGATGTAATCTTTCTTAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATCCAGCAGTGTTTTAAGTTCACGCTGCTCGCGTTCAGTCATCTCTTTTTGGGTAATACGGGGGAGTGCCATGATGGTGCCCTCAGTGAGCCAGAGAGTTCAGTGTACGGGAATTCGTTTGCGA > NC_000913/4231391‑4231683 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |