New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 384679 = | 80 (1.480) | 3 (0.060) | 3/250 | NT | 3.8% | intergenic (‑63/‑553) | yaiS/tauA | putative PIG‑L family deacetylase/taurine ABC transporter periplasmic binding protein |
? | NC_000913 | 384694 = | 74 (1.430) | intergenic (‑78/‑538) | yaiS/tauA | putative PIG‑L family deacetylase/taurine ABC transporter periplasmic binding protein | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
ATATCGTCAGGATGTGCGCCAATAGCAAGGATACCCTTTCTTTTATTTGCCGAAGAAAGGAGGGCTGAATCTAAAACCTTATCCACTTAATGACACTCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAG > NC_000913/384531‑384819 | tacaatgtataaaacaaaataactatacataccaaacatacaaacacttaacatatgaattgcatagaaacattacccagtcgaacccacgggtctgaaagcccttgcttttcagttattagcaacatttaacatttataaattaacat < 4:62865‑M1/1‑1 (MQ=255) tacaatgtataaaacaaaataactatacataccaaacatacaaacacttaacatatgaattgcatagaaacattacccagtcgaacccacgggtctgaaagcccttgcttttcagttattagcaacatttaacatttataaattaacat < 1:235943‑M1/1‑1 (MQ=255) tCGTCAGGATGTGCGCCAATAGCAAGGATACCCTTTCTTTTATTTGCCGAAGAAAGGAGGGCTGAATCTAAAACCTTATCCACTTAATGACACTCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTg < 2:196820/149‑1 (MQ=255) aatgtataaaacaaaataactatacataccaaacatacaaacacttaacatatgaattgcatagaaacattacccagtcgaacccacgggtctgaaagcccttgcttttcagttattagcaacatttaacatttataaattaacaTCTg < 3:197272‑M1/4‑1 (MQ=255) tgtataaaacaaaataactatacataccaaacatacaaacacttaacatatgaattgcatagaaacattacccagtcgaacccacgggtctgaaagcccttgcttttcagttattagcaacatttaacatttataaattaacaTCTGgc > 2:67612‑M1/144‑149 (MQ=255) gTCAGGATGTGCGCCAATAGCAAGGATACCCTTTCTTTTATTTGCCGAAGAAAGGAGGGCTGAATCTAAAACCTTATCCACTTAATGACACTCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGgc > 4:101682/1‑149 (MQ=255) tctgCGCCAATAGCAAGGATACCCTTTCTTTTATTTGCCGAAGAAAGGAGGGCTGAATCTAAAACCTTATCCACTTAATGACACTCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAAAGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCatcaa > 4:164054/3‑145 (MQ=255) tgCGCCAATAGCAAGGATACCCTTTCTTTTATTTGCCGAAGAAAGGAGGGCTGAATCTAAAACCTTATCCACTTAATGACACTCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGc > 6:99339/1‑145 (MQ=255) aataactatacataccaaacatacaaacacttaacatatgaattgcatagaaacattacccagtcgaacccacgggtctgaaagcccttgcttttcagttattagcaacatttaacatttataaattaacaTCTGGCGCAGCCAGATGt > 2:228697‑M1/132‑149 (MQ=255) cAATAGCAAGGATACCCTTTCTTTTATTTGCCGAAGAAAGGAGGGCTGAATCTAAAACCTTATCCACTTAATGACACTCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGtt > 5:35070/1‑148 (MQ=255) aaTAGCAAGGATACCCTTTCTTTTATTTGCCGAAGAAAGGAGGGCTGAATCTAAAACCTTATCCACTTAATGACACTCCATTTTATTTATTATACTCCAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTaa > 4:50619/1‑149 (MQ=255) aaTAGCAAGGATACCCTTTCTTTTATTTGCCGAAGAAAGGAGGGCTGAATCTAAAACCTTATCCACTTAATGACACTCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGCGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTaa > 2:177115/1‑149 (MQ=255) aTAGCAAGGATACCCTTTCTTTTATTTGCCGAAGAAAGGAGGGCTGAATCTAATACCTTATCCACTTAATGACACTCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACATCGATTCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAAt < 5:92013/149‑1 (MQ=255) aTAGCAAGGATACCCTTTCTTTTATTTGCCGAAGAAAGGAGGGCTGAATCTAAAACCTTATCCACTTAATGACACTCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAAt < 2:1031/149‑1 (MQ=255) aTAGCAAGGATACCCTTTCTTTTATTTGCCGAAGAAAGGAGGGCTGAATCTAAAACCTTATCCACTTAATGACACTCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAAt < 8:3/149‑1 (MQ=255) tAGCAAGGATACCCTTTCTTTTATTTGCCGAAGAAAGGAGGGCTGAATCTAAAACCTTATCCACTTAATGACACTCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAAtt < 7:213051/149‑1 (MQ=255) cAAGGATACCCTTTCTTTTATTTGCCGAAGAAAGGAGGGCTGAATCTAAAACCTTCTCCACTTAATGACACTCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTtat < 5:175111/149‑1 (MQ=255) aGGATACCCTTTCTTTTATTTGCCGAAGAAAGGAGGGCTGAATCTAAAACCTTATCCACTTAATGACACTCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTAtaa < 3:102908/149‑1 (MQ=255) aCCCTTTCTTTTATTTGCCGAAGAAAGGAGGGCTGAATCTAAAACCTTATCCACTTAATGACACTCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGa < 7:184635/131‑1 (MQ=255) aCCCTTTCTTTTATTTGCCGAAGAAAGGAGGGCTGAATCTAAAACCTTATCCACTTAATGACACTCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGa > 8:184635/1‑131 (MQ=255) ccTTTCTTTTATTTGCCGAAGAAAGGAGGGCTGAATCTAAAACCTTATCCACTTAATGACACTCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTAtaaatgttaa < 5:99339/149‑1 (MQ=255) tttctttTATTTGCCGAAGAAAGGAGGGCTGAATCTAAAACCTTATCCACTTAATGACACTCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTAtaaatgttaaat > 8:224947/1‑149 (MQ=255) ttttATTTGCCGAAGAAAGGAGGGCTGAATCTAAAACCTTATCCACTTAATGACACTCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTg > 7:205065/1‑149 (MQ=255) tttATTTGCCGAAGAAAGGAGGGCTGAATCTAAAACCTTATCCACTTAATGACACTCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGc > 2:235943/1‑149 (MQ=255) aTTTGCCGAAGAAAGGAGGGCTGAATCTAAAACCTTATCCACTTAATGACACTCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATctct > 4:207557/1‑107 (MQ=255) aTTTGCCGAAGAAAGGAGGGCTGAATCTAAAACCTTATCCACTTAATGACACTCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATctct < 3:207557/107‑1 (MQ=255) acttaacatatgaattgcatagaaacattacccagtcgaacccacgggtctgaaagccctagcttttcagttattagcaacatttaacatttataaattaacaTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCtaa < 6:237194‑M1/45‑1 (MQ=255) tGCCGAAGAAAGGAGGGCTGAATCTAAAACCTTATCCACTTAATGACACTCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCtaata < 3:101682/148‑1 (MQ=255) gCCGAAGAAAGGAGGGCTGAATCTAAAACCTTATCCACTTAATGACACTCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCtaataa < 5:160612/148‑1 (MQ=255) ccGAAGAAAGGAGGGCTGAATCTAAAACCTTATCCACTTAATGACACTCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACt > 4:118912/1‑149 (MQ=255) aacatatgaattgcatagaaacattacccagtcgaacccacgggtctgaaagccctagcttttcagttattagcaacatttaacatttataaattaacaTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAAc > 5:237194‑M1/100‑148 (MQ=255) gaagaaAGGAGGGCTGAATCTAAAACCTTATCCACTTAATGACACTCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTg > 6:200213/1‑148 (MQ=255) gaaAGGAGGGCTGAATCTAAAACCTTATCCACTTAATGACACTCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGaaaa < 4:96082/149‑1 (MQ=255) aaTCTAAAACCTTATCCACTTAATGACACTCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCttt > 2:240060/1‑147 (MQ=255) aaTCTAAAACCTTATCCACTTAATGACACTCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCttt > 1:46701/1‑147 (MQ=255) aaTATAAAACCTTATCCACTTAATGACACTCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTTATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCttt < 3:164054/147‑1 (MQ=255) tCTAAAACCTTATCCACTTAATGACACTCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTg < 6:203049/120‑1 (MQ=255) aCCTTATCCACTTAATGACACTCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTg > 4:197272/1‑149 (MQ=255) ccTTATCCACTTAATGACACTCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGGAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTgg < 6:35070/149‑1 (MQ=255) ccTTATCCACTTAATGACACTCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTgg < 4:196083/149‑1 (MQ=255) cTTATCCACTTAATGACACTCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTggg > 2:246604/1‑149 (MQ=255) aCTTAATGACACTCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAgg < 6:226930/125‑1 (MQ=255) aCTTAATGACACTCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAgg > 5:226930/1‑125 (MQ=255) aCTTAATGACACTCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACt < 1:246604/149‑1 (MQ=255) aCTTAATGACACTCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACt > 4:212370/1‑149 (MQ=255) aaTGACACTCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACACGTGGGTTCGACTggg > 3:13035/1‑148 (MQ=255) aaTGACACTCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCAAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTggg < 7:224947/148‑1 (MQ=255) tGACACTCCATTTTATTTATTATACTATAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAg > 1:185500/1‑118 (MQ=255) 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(MQ=255) agagACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGgtatgt < 3:118912/149‑1 (MQ=255) agagACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGgtatg > 6:87813/1‑148 (MQ=255) gaCGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTg < 8:39565/140‑1 (MQ=255) gaCGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTg > 7:39565/1‑140 (MQ=255) aCGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAg < 1:177115/149‑1 (MQ=255) aCGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAg > 6:123965/1‑149 (MQ=255) TCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGgtatgta < 1:36212‑M1/138‑1 (MQ=255) TCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGgtatgta > 2:36212‑M1/1‑138 (MQ=255) TCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGgtat < 3:104634‑M1/135‑1 (MQ=255) TCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGgtat > 4:104634‑M1/1‑135 (MQ=255) | ATATCGTCAGGATGTGCGCCAATAGCAAGGATACCCTTTCTTTTATTTGCCGAAGAAAGGAGGGCTGAATCTAAAACCTTATCCACTTAATGACACTCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAG > NC_000913/384531‑384819 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |