| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4349081 = | 81 (1.500) | 3 (0.060) | 3/250 | NT | 3.7% | intergenic (‑337/+234) | dcuB/dcuR | C4‑dicarboxylate transporter, anaerobic; DcuS co‑sensor/response regulator in two‑component regulatory system with DcuS |
| ? | NC_000913 | 4349097 = | 77 (1.490) | intergenic (‑353/+218) | dcuB/dcuR | C4‑dicarboxylate transporter, anaerobic; DcuS co‑sensor/response regulator in two‑component regulatory system with DcuS | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TTCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTATAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAACACCGTTCACCTGAAGAGATATTAATTTTTAGCGATGATGGAGGGATAATTATATTTGATCTGG > NC_000913/4348935‑4349225 | catcagtaaaacttgtgccagatcaaatataattatccctccatcatcgctaaaaattaatatctcttcaggtgaacggtgtttttaatttcaaaacgctaacaaaagttaattaactattatgtcacccgcattatgtgtattttTa > 6:159897‑M1/147‑148 (MQ=255) atcagtaaaacttgtgccagatcaaatataattatccctccatcatcgctaaaaattaatatctcttcaggtgaacggtgtttttaatttcaaaacgctaacaaaagttaattaactattatgtcacccgcattatgtgtattttTAcc > 6:96204‑M1/146‑149 (MQ=255) atcagtaaaacttgtgccagatcaaatataattatccctccatcatcgctaaaaattaatatctcttcaggtgaacggtgtttttaatttcaaaacgctaacaaaagttaattaactattatgtcacccgcattatgtgtattttTAcc < 1:46729‑M1/4‑1 (MQ=255) atcagtaaaacttgtgccagatcaaatataattatccctccatcatcgctaaaaattaatatctcttcaggtgaacggtgtttttaatttcaaaacgctaacaaaagttaattaactattatgtcacccgcattatgtgtattttTAcc > 6:124332‑M1/146‑149 (MQ=255) atcagtaaaacttgtgccagatcaaatataattatccctccatcatcgctaaaaattaatatctcttcaggtgaacggtgtttttaatttcaaaacgctaacaaaagttaattaactattatgtcacccgcattatgtgtattttTAc > 7:169451‑M1/146‑148 (MQ=255) atcagtaaaacttgtgccagatcaaatataattatccctccatcatcgctaaaaattaatatctcttcaggtgaacggtgtttttaatttcaaaacgctaacaaaagttaattaactattatgtcacccgcattatgtgtattttTAc > 1:72499‑M1/146‑148 (MQ=255) atcagtaaaacttgtgccagatcaaatataattatccctccatcatcgctaaaaattaatatctcttcaggggaacggtgtttttaatttcaaaacgctaacaaaagttaattaactattatgacacccgcattatgtgtattttTAc > 6:233563‑M1/146‑148 (MQ=255) gagaAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTATAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCAttt < 1:53079/149‑1 (MQ=255) gaAAGACTCTCTGGCGATTGGTTTATAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCATTtgt < 1:212028/149‑1 (MQ=255) aaGACTCTCTGGCGATGGGTTTATAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGGCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCATTTGTgg < 5:217334/149‑1 (MQ=255) aGACTCTCTGGCGATGGGTTTATAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCATTTGTggg > 5:122373/1‑149 (MQ=255) tctGGCGATGGGTTTATAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCATTTGTGGGTaaaaa > 7:246937/1‑149 (MQ=255) tctGGCGATGGGTTTATAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGAGATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACACATTTGTGGGTaaaaa > 7:37120/1‑149 (MQ=255) tGGCGATGGGTTTATAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCATTTGTGGGTaaaaa < 1:164948/147‑1 (MQ=255) gCGATGGGTTTATAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATaca < 4:182081/149‑1 (MQ=255) gCGATGGGTTTATAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATa < 4:229767/147‑1 (MQ=255) atataattatccctccatcatcgctaaaaattaatatctcttccggtgaacggtgtttttaatttctaaactctaactaaagttaattaactattatgtcacccgcattatgtgtattttTACCCATTTGTGGGTAAAAATaca > 6:224844‑M1/121‑144 (MQ=255) gTTTATAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATg > 4:203014/1‑149 (MQ=255) gTTTATAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATg > 2:248028/1‑149 (MQ=255) gTTTATAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATg > 8:123767/1‑149 (MQ=255) ttATAGTTTGTACTGCGCAGATGTTTATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCg > 5:213447/1‑149 (MQ=255) ataGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCgg < 7:75410/148‑1 (MQ=255) taGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGt < 2:32493/149‑1 (MQ=255) taGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGt < 7:59107/149‑1 (MQ=255) tttGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGa > 4:5916/1‑148 (MQ=255) gcgcAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGt > 7:247458/1‑149 (MQ=255) gcAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATATACACATTTGTGGGTAAAAATAAAAATAATTCGGTTGACATAATAGtt > 3:165111/1‑148 (MQ=255) aGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGttaat > 1:223051/1‑149 (MQ=255) aaaattaatatctcttcaggtgaacggtgtttttaatttcaaaacgctaacaaaagttaattaactattatgtcacccgcattatgtgtattttTACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACataa < 5:25425‑M1/43‑1 (MQ=255) aaaattaatatctcttcaggtgaacggtgtttttaatttcaaaacgctaacaaaagttaattaactattatgtcacccgcattatgtgtattttTACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACataa > 6:25425‑M1/95‑137 (MQ=255) tAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACtt > 7:16176/1‑149 (MQ=255) aTGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACtttt > 4:199696/1‑149 (MQ=255) tgttttgtttGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTg > 1:125959/1‑149 (MQ=255) gttttgtttGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTCTTTTTTTTGCTCATTGGAGATGTCATAAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCTTTTGTGGGTAAAATTACACCTAATTCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTg < 3:169158/148‑1 (MQ=255) tttgCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGt > 5:238795/1‑149 (MQ=255) tttgCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGt > 5:235178/1‑149 (MQ=255) gCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGtttt > 1:93790/1‑149 (MQ=255) ttATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGaaa > 1:180940/1‑149 (MQ=255) tATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGAGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGaaa < 8:41925/148‑1 (MQ=255) ttATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTaaa < 3:203014/149‑1 (MQ=255) tATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTaaa > 7:210419/1‑148 (MQ=255) aTTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTaaaaa > 6:192058/1‑149 (MQ=255) aTTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATACAAATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTa < 8:246937/145‑1 (MQ=255) aTTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGGTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTaaa < 8:220193/147‑1 (MQ=255) ttGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAAtt > 5:77039/1‑143 (MQ=255) ttGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAAtt < 6:77039/143‑1 (MQ=255) ttGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTaaaaa < 7:152576/148‑1 (MQ=255) ttGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTaaaaa < 4:164476/148‑1 (MQ=255) ttGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGGCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGGGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTaaaaa < 2:37049/148‑1 (MQ=255) atatTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAacac < 7:123767/148‑1 (MQ=255) atatTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAACAcc < 7:5586/149‑1 (MQ=255) gtttATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATACTCATAATGCGGGTGACataata < 8:92142/106‑1 (MQ=255) atTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAACACCGt > 8:128608/1‑149 (MQ=255) tttATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAACACCGt < 1:248028/148‑1 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tCATTAGGTCTAGAGATTAATCTGAGCTACCAATTTGGGGGGAAAAAAACACATAATGCTGTTGACATAATAGTTAATTATCTTATGTTATAGTTTTGATATTAAAAACACCGTTCACCTGTAGAGATATTTATTTTTAGCgatgat < 6:149686/147‑1 (MQ=255) aTTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAACACCGTTCACCTGAAGAGATATTAATTTTTAGCGATGATGGa < 6:122373/148‑1 (MQ=255) aTTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAACACCGTTCACCTGAAGAGATATTAATTTTTAGCGATGATGGAg > 5:151075/1‑149 (MQ=255) aTTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAACACCGTTCACCTGAAGAGATATTAATTTTTAGCGATGATGGAg < 8:16176/149‑1 (MQ=255) ttAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAACACCGTTCACCTGAAGAGATATTAATTTTTAGCGATGATGGAgg > 5:160790/1‑149 (MQ=255) gATTAATCTGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAACACCGTTCACCTGAAGAGATATTAATTTTTAGCGATGATGGAGGGATAATTatat > 7:170373/1‑149 (MQ=255) aTTAATCTGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAACACCGTTCACCTGAAGAGATATTAATTTTTAGCGATGATGGAGGGATAATTATAtt > 5:183478/1‑149 (MQ=255) aTTAACCTGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAACACCGTTCACCTGAAGAGATATTAATTTTTAGCGATGATGGAGGGATAATTATAtt > 8:140716/1‑149 (MQ=255) tCTGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAACACCGTTCACCTGAAGAGATATTAATTTTTAGCGATGATGGAGGGATAATTATATTTGATc > 7:6623/1‑149 (MQ=255) tGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAACACCGTTCACCTGAAGAGATATTAATTTTTAGCGATGATGGAGGGATAATTATATTTGATCTg > 4:114674/1‑149 (MQ=255) aTCTACCCATTTGTTGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGAAATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAACACCGTTCACCTGAAGAGATATTAATTTTTAGCGATGATGGAGGGATAATTATATTTGATCTgg < 4:165111/148‑1 (MQ=255) aTCTACCCATTTGTTGCTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAACACCGTTCACCTGAAGAGATATTAATTTTTAGCGATGATGGAGGGATAATTATATTTGATCt < 8:177841/146‑1 (MQ=255) | TTCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTATAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAACACCGTTCACCTGAAGAGATATTAATTTTTAGCGATGATGGAGGGATAATTATATTTGATCTGG > NC_000913/4348935‑4349225 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |