| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2827680 = | 44 (0.810) | 3 (0.060) | 3/254 | NT | 6.8% | coding (319/372 nt) | srlB | glucitol/sorbitol‑specific enzyme IIA component of PTS |
| ? | NC_000913 | 2827700 = | 39 (0.740) | coding (339/372 nt) | srlB | glucitol/sorbitol‑specific enzyme IIA component of PTS | |||||
TATCCGGTGACCGCTGTTGGCAGCGTGGCGGAAGACAACCTTCGCGAACTGGGTCATGTCACCCTGCGCTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTCCTGTGCCACGGTCTGGCTGCCGAGGGGTATCGCGTCGCGGTTGTCGATATTCAGAGCGAC > NC_000913/2827554‑2827847 | tATCCGGTGACCGCTGTTGGCAGCGTGGCGGAAGACAACCTTCGCGAACTGGGTCATGTCACCCTGCGCTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATc > 6:170696/1‑149 (MQ=255)gcgacgcgatacccctcggcagccagaccgtggcacaggaacgcgcctaaggtttgcccaccaccgatgacaacggcaacctgattcattttttactccttaacagattcaaacttcaaaaccgatCCCGACGATATCGCGCCGGGATc > 7:48998‑M1/127‑149 (MQ=255) tCCGGTGACAGCTGTTGGCAGCGTGGCGGAATACTACCTTCGCTAACTGGGTAATGTCACCCTGCGTTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCTTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATc < 2:61649/147‑1 (MQ=255) tGACCGCTGTTGGCAGCGTGGCGGAAGACAACCTTCGCGAACTGGGTCATGTCACCCTGCGCTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTg < 6:239166/149‑1 (MQ=255) cGCTGTTGGCAGCGTGGCGGAAGACAACCTTCGCGAACTGGGTCATGTCACCCTGCGCTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGt > 2:63677/1‑149 (MQ=255) cAGCGTGGCGGAAGACAACCTTCGCGAACTGGGTCATGTCACCCTGCGCTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTg > 6:218538/1‑149 (MQ=255) tGGCGGAAGACAACCTTCGCGAACTGGGTCATGTCACCCTGCGCTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGAGCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAg > 2:247015/1‑149 (MQ=255) tGGCGGAAGACAACCTTCGCGAACTGGGTCATGTCACCCTGCGCTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGGCCTTGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAg < 7:92033/149‑1 (MQ=255) gCGGAAGACAACCTTCGCGAACTGGGTCATGTCACCCTGCGCTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGa < 8:224301/149‑1 (MQ=255) ggAAGACAACCTTCGCGAACTGGGTCATGTCACCCTGCGCTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAg > 3:182701/1‑148 (MQ=255) cacaggaacgcgcctaaggtttgcccaccaccgatgacaacggcaacctgattcattttttactccttaacagattcaaacttcaaaaccgatCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGt > 8:148242‑M1/94‑127 (MQ=255) cacaggaacgcgcctaaggtttgcccaccaccgatgacaacggcaacctgattcattttttactccttaacagattcaaacttcaaaaccgatCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGt < 7:148242‑M1/34‑1 (MQ=255) aaCCTTCGCGAACTGGGTCATGTCACCCTGCGCTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAAt < 4:228618/149‑1 (MQ=255) cgcgAACTGGGTCATGTCACCCTGCGCTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAAt < 7:131696/147‑1 (MQ=255) cgcgAACTGGGTCATGTCACCCTGCGCTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATc < 3:93062/148‑1 (MQ=255) gcgAACTGGGTCATGTCACCCTGCGCTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCa < 4:7824/148‑1 (MQ=255) aCCCTGCGCTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGa < 6:20589/104‑1 (MQ=255) aCCCTGCGCTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGa > 5:20589/1‑104 (MQ=255) aCCCTGCGCTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCgg < 1:63677/149‑1 (MQ=255) cccTGCGCTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCggt > 1:1162/1‑149 (MQ=255) ccTGCGCTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCggtg > 6:52975/1‑149 (MQ=255) ccTGCGCTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCggtg < 7:72878/149‑1 (MQ=255) ccTGCGCTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCggtg > 8:71698/1‑149 (MQ=255) gcgcTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGgtggtg < 4:166909/149‑1 (MQ=255) cgcTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCCCTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCggtggt < 5:218538/147‑1 (MQ=255) gcTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGtt > 1:232410/1‑86 (MQ=255) gcTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGtt < 2:232410/86‑1 (MQ=255) gATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCaacc > 7:252311/1‑147 (MQ=255) gTTTAAACGAAGGGGAATTTCCGTGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTACCCGACGATATGGGGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTa < 6:153004/149‑1 (MQ=255) gTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTGTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAACCCt > 5:122971/1‑147 (MQ=255) tttAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAg < 3:65419/149‑1 (MQ=255) aaCGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGgcgc > 5:41766/1‑149 (MQ=255) aaGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTc < 4:221486/149‑1 (MQ=255) ggAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTCCtgt > 1:153141/1‑149 (MQ=255) ggAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTCCtgt > 1:169871/1‑149 (MQ=255) cGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAAGCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGGTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTCCTGTGCCACGGt < 1:247015/149‑1 (MQ=255) aCTGTCCATGTGCCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCTGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGATAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAAACTTAGGCGCGTTCCTGTGCCACGCTCTGGc > 1:21292/1‑149 (MQ=255) cATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTCCTGTGCCACGGTCTGGCTGcc > 3:220962/1‑147 (MQ=255) tgGCAGGCCCGGTCCCCGACGATCTCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTGGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTGGCCGGTGGCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTCCTGTGCCACGGTCTGGCTGCCGAggg < 1:88998/148‑1 (MQ=255) acttcaaaaccgatcccggcgcgatatcgtcgggATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTCCtgtg < 7:148242‑M2/93‑1 (MQ=255) acttcaaaaccgatcccggcgcgatatcgtcgggATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTCCtgtg > 8:148242‑M2/35‑127 (MQ=255) gCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTCCTGTGCCACGGTCTGGCTGCCGAGGGGTa > 6:208927/1‑149 (MQ=255) gatcccggcgcgatatcgtcgggATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTCCTGTGCCACGGTCTGGCTGCCGAGGGGTAtcgcgtcgc > 7:48998‑M2/24‑149 (MQ=255) tCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAACTGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTCCTGTGCCACGGTCTGGCTGCCGAGGGGTAtcgcgtcgcg > 5:190064/1‑149 (MQ=255) tCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTCCTGTGCCACGGTCTGGCTGCCGAGGGGTAtcgcgtcgc < 5:170696/148‑1 (MQ=255) CCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTCCTGTGCCACGGTCTGGCTGCCGAGGGGTATCGCGTCGCGGt < 5:215259‑M1/149‑1 (MQ=255) CCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTCCTGTGCCACGGTCTGGCTGCCGAGGGGTATCGCGTCGCGGtt < 6:133041‑M1/149‑1 (MQ=255) CGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTCCTGTGCCACGGGCTGGCTGCCGAGGGGTATCGCGTCGCGGTTg > 5:52975‑M1/1‑149 (MQ=255) atCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATc < 2:74063/55‑1 (MQ=255) atCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATc > 1:74063/1‑55 (MQ=255) aTCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTCCTGTGCCACGGTCTGGCTGCCGAGGGGTATCGCGTCGCGGTTGTCGATATTCAGAGCGAc > 3:183255/1‑148 (MQ=255) aTCGGTTTTGAAGTTAGAATCGGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGCAAGCCGTTGTCATCGGTGGTCGGCAAACCTAAGGCGCGTTCCTGTGCCACTGTAAGGAAGCCTCGGTGTATAGCGTAGCTGTTTTCGATATACAGAGCTAc > 6:196301/1‑148 (MQ=255) | TATCCGGTGACCGCTGTTGGCAGCGTGGCGGAAGACAACCTTCGCGAACTGGGTCATGTCACCCTGCGCTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTCCTGTGCCACGGTCTGGCTGCCGAGGGGTATCGCGTCGCGGTTGTCGATATTCAGAGCGAC > NC_000913/2827554‑2827847 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |