Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 523,077 | IS2 (+) +5 bp | 25.9% | intergenic (+247/‑180) | ybbP → / → rhsD | putative ABC transporter permease/Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | 381260 = | NA (NA) | 20 (0.230) | 19/256 | NT | 19.4% | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
? | NC_000913 | = 523081 | 80 (0.960) | intergenic (+251/‑180) | ybbP/rhsD | putative ABC transporter permease/Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
* | ? | NC_000913 | 523077 = | 80 (0.950) | 36 (0.410) | 32/258 | NT | 30.2% | intergenic (+247/‑184) | ybbP/rhsD | putative ABC transporter permease/Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
? | NC_000913 | 1467910 = | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
Only 100 of 154 total aligned reads displayed.
TATCTTTCTATTGCTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGTGCTAAAAATGTTAGTTTAATAAAATATTGAAAGTGACCTGTAATAACAGTTGTTGTTGATTGAGAACAAATAAGTTTATGTGAAAAATATATAAATACATTAGCTGGTCTTGTGTGTCATTTTATTTTTTTTTGTTGCTAA > NC_000913/522929‑523223 | caaagaaccttgcagaggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaa > 8:383445‑M1/149‑149 (MQ=255) aaagaaccttgcagcggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttggaatggggtaagtgataacagctgtctggaaatataggggcaaatccaa < 3:284524‑M1/1‑1 (MQ=255) aaagaaccttgcagaggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaAt > 1:20508‑M1/148‑149 (MQ=255) aTCTTTCTATTGCTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCAt > 6:349983/1‑149 (MQ=255) tCTTTCTATTGCTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCAt < 7:40408/148‑1 (MQ=255) tCTTTCTATTGCTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATc > 4:374096/1‑149 (MQ=255) aagaaccttgcagaggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaAt < 3:60236‑M1/2‑1 (MQ=255) tacctttcataggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcagagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaATCtgt > 6:50722‑M1/144‑149 (MQ=255) aaccttgcagaggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaATCtgt < 2:62869‑M1/6‑1 (MQ=255) aaccttgcagaggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaATCtgt > 5:363765‑M1/144‑149 (MQ=255) gCTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGtagactg > 1:205853‑M2/1‑141 (MQ=255) cTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGTGCTaaaaa > 6:145366/1‑149 (MQ=255) cTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGTGCTaaaaa < 4:181568/149‑1 (MQ=255) cTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGTGCTaaaaa < 7:80636/149‑1 (MQ=255) agaggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaATCTGTGCTaaaaa < 8:191043‑M1/14‑1 (MQ=255) tGATATTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGTGCTAAAAAt > 3:123287/1‑149 (MQ=255) tGATATTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATATGTGCTAAAAAt > 7:321911/1‑149 (MQ=255) atatTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGTGCTAAAAATGt > 8:158215/1‑149 (MQ=255) atatTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGCATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGTGCTAAAAAt < 3:61133/147‑1 (MQ=255) ttAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGTGCTAAAAATGTTa < 1:115116/148‑1 (MQ=255) aaTCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGTGCTAAAAATGTTAGtt > 2:277751/1‑149 (MQ=255) aTCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGtagactggccccct < 4:236674‑M2/145‑15 (MQ=255) aTCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGtagactggccccct > 3:236674‑M2/1‑131 (MQ=255) 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atccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaATCTGTGCTAAAAATGTTAGTTTAATAAAATATTGAAAGTGAc > 4:246463‑M1/107‑149 (MQ=255) gATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcact > 2:387783‑M2/1‑109 (MQ=255) ttttAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGTGCTAAAAATGTTAGTTTAATAAAATATTGAAAGTGACCTg > 8:255981/1‑148 (MQ=255) ttAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGTGCTAAAAATGTTAGTTTAATAAAATATTGAAAGTGACCTGtaa > 1:256912/1‑149 (MQ=255) agtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaATCTGTGCTAAAAATGTTAGTTTAATAAAATATTGAAAGTGACCTGtaat < 6:1104‑M1/50‑1 (MQ=255) 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4:366385‑M2/149‑134 (MQ=255) tgatgaATTCATCTGGGATAAAAAGGTTAGTTTAATAAATTATTGAAAGTGACCTGTAATAAAAGTTGTTGTTGATTGAGAACAAATAAGTTTATGTGAAAAATATATAAATACATTAGCTGGTCTTGTGTGTCATTTTAttttttttt < 6:84312/149‑1 (MQ=255) tccaATCTGTGCTAAAAATGTTAGTTTAATAAAATATTGAAAGTGACCTGTAATAACAGTTGTTGTTGATTGAGAACAAATAAGTTTATGTGAAAAATATATAAATACATTAGCTTGTCTTGTGTGTCATTTTATTTTTTTTTGTTGc < 5:20822‑M1/144‑1 (MQ=255) ccaATCTGTGCTAAAAATGTTAGTTTAATAAAATATTGAAAGTGACATGTAATAACAGTTGTTGTTGATTGAGAACAAATAAGTTTATGTGAAAAATATATAAATACATTAGCTGGTATTGTGTGTCATTTTATTTTAtattgttgat < 4:5235‑M1/145‑3 (MQ=255) cATCTGTGCTAAAAATGTTAGTTTAATAAAATATTGAAAGTGACCTGTAATAACAGTTGTTGTTGATTGAGAACAAATAAGTTTATGTGAAAAATATATAAATACATTAGCTGGTCTTGTGTGTCATTTTATTTTTTTTTGTTGCTaa < 3:201815/148‑1 (MQ=255) aATCTGTGCTAAAAATGTTAGTTTAATAAAATATTGAAAGTGACCTGTAATAACAGTTGTTGttgattg > 7:326184‑M1/2‑69 (MQ=255) aATCTGTGCTAAAAATGTTAGTTTAATAAAATATTGAAAGTGACCTGTAATAACAGTTGTTGttgattg < 8:326184‑M1/68‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |