New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 4238364 | 46 (1.350) | 6 (0.190) | 6/234 | 3.1 | 13.1% | coding (731/2097 nt) | yjbH | DUF940 family extracellular polysaccharide protein |
? | NC_000913 | = 4238390 | 37 (1.180) | coding (757/2097 nt) | yjbH | DUF940 family extracellular polysaccharide protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
TTTGGCGGCGTGGAATACCAGACGCCCTGGCAACCGCTGCGCCTGAAACTGGAGTATGAAGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGTTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCCGTCTTACAACGATAACGCCCGCCCGCAATATCAACCGCAGCCGCAGGATGCCATTT > NC_000913/4238243‑4238528 | tttGGCGGCGTGGAATACCAGACGCCCTGGCAACCGCTGCGCCTGAAACTGGAGTATGAAGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTggg < 7:20700/148‑1 (MQ=255) tttGGCGGCGTGGAATACCAGACGCCCTGGCAACCGCTGCGCCTGAAACTGGAGTATGAAGGAAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGc > 8:50501/1‑149 (MQ=255) cAGACGCCCTGGCAACCGCTGCGCCTGAAACTGGAGTATGAAGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGTTAACCTTAGCTa > 3:147501/1‑149 (MQ=255) aGACGCCCTGGCAACCGCTGCGCCTGAAACTGGAGTATGAAGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGTTAACCTTAGCTAt < 4:5604/149‑1 (MQ=255) ccTGGCAACCGCTGCGCCTGAAACTGGAGTATGAAGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGTTAACCTTAGCTATGAACGt > 7:99886/1‑149 (MQ=255) tGGCAACCGCTGCGCCTGAAACTGGAGTATGAAGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGTTAACCTTAGCTATGAACGTgg > 6:144141/1‑149 (MQ=255) gCAACCGCTGCGCCTTAAACTGGAGTATGAAGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGACGCTGGAGCAAAAACGTAAGTTTAACGGCGGGGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGTTAACCTTAGCTATGAACGTGGc < 5:123657/148‑1 (MQ=255) gCAACCGCTGCGCCTGAAACTGGAGTATGAAGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGTTAACCTTAGCTATGAACGTgg < 3:51519/147‑1 (MQ=255) aaCCGCTGCGCCTGAAACTGGAGTATGAAGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGTTAACCTTAGCTATGAACGTGGCaa > 7:52205/1‑148 (MQ=255) cTGAAACTGGAGTATGAAGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGTTAACCTTAGCTa < 7:87095/125‑1 (MQ=255) cTGAAACTGGAGTATGAAGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGTTAACCTTAGCTa > 8:87095/1‑125 (MQ=255) aaCTGGAGTATGAAGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGTTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGc < 8:38426/149‑1 (MQ=255) tATGAAGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGTTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGtt > 6:44647/1‑149 (MQ=255) gCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGTTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCAc > 4:43147/1‑148 (MQ=255) gCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGTTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCAc > 1:142480/1‑148 (MQ=255) ataatTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGTTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAAc > 5:160159/1‑149 (MQ=255) ttATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGTTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTa < 6:160159/149‑1 (MQ=255) aTCAGCAGTATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGTTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTaa < 7:50501/148‑1 (MQ=255) gcagGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGTTAACCTTAGc < 1:21113/91‑1 (MQ=255) gcagGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGTTAACCTTAGc > 2:21113/1‑91 (MQ=255) agGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGTTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTg > 3:107779/1‑149 (MQ=255) aTTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGTTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTgcgc < 4:107779/149‑1 (MQ=255) ggAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGTTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCCGTCTTAc < 8:52205/149‑1 (MQ=255) aaGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGTTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCCGTCTTACaa < 5:44647/149‑1 (MQ=255) aGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGTTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCCGTCTTACAAc < 3:43147/149‑1 (MQ=255) cTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGTTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCCGTCTTACAACGa < 1:8812/149‑1 (MQ=255) gAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGTTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCCGTCTTACAACGAt < 5:144141/147‑1 (MQ=255) aaaaaaGTAAGTTTAACGTTGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGTTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCCGTCTTACAACGATAAcgcc > 1:143583/1‑149 (MQ=255) aaaGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGTTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGa > 7:126743/1‑118 (MQ=255) aaaGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGTTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGa < 8:126743/118‑1 (MQ=255) agtaagtTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGTTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCCGTCTTACAACGATAACgcccgccc < 4:147501/149‑1 (MQ=255) gtTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGTTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCCGTCTTACAACGATAACGCCCGCCCGCaa > 3:146769/1‑148 (MQ=255) cGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGTTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCCGTCTTACAACGATAACGCCCGCCCGCAATATCAAc < 8:99886/149‑1 (MQ=255) gTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGTTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCCGTCTTACAACGATAACGCCCGCCCGCAATATCAAccgcag > 4:1003/1‑149 (MQ=255) ttATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGTTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCCGTCTTACAACGATAACGCCCGCCCGCAATATCAAccgcagccgcag < 2:142480/148‑1 (MQ=255) aTCGCGTTACCGATTGGGCCGACGTTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCCGTCTTACAACGATAACGCCCGCCCGCaa < 2:68068/128‑1 (MQ=255) aTCGCGTTACCGATTGGGCCGACGTTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCCGTCTTACAACGATAACGCCCGCCCGCaa > 1:68068/1‑128 (MQ=255) ttACCGATTGGGCCGACGTTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCCGTCTTACAACGATAACGCCCGCCCGCAATATCAACCGCAGCCGCAGGATGCCAtt < 2:143583/149‑1 (MQ=255) aCCGATTGGGCCGACGTTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCCGTCTTACAACGATAACGCCCGCCCGCAATATCAACCGCAGCCGCAGGATGCCAttt < 3:1003/148‑1 (MQ=255) | TTTGGCGGCGTGGAATACCAGACGCCCTGGCAACCGCTGCGCCTGAAACTGGAGTATGAAGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGTTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCCGTCTTACAACGATAACGCCCGCCCGCAATATCAACCGCAGCCGCAGGATGCCATTT > NC_000913/4238243‑4238528 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |