| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 3,560,930 | IS5 (+) +4 bp | 100% | coding (520‑523/831 nt) | glpG ← | rhomboid intramembrane serine protease |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3560930 = | 0 (0.000) | 83 (1.010) | 66/264 | NT | 100% | coding (523/831 nt) | glpG | rhomboid intramembrane serine protease |
| ? | NC_000913 | 3652036 = | NA (NA) | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 3560933 | 0 (0.000) | 80 (0.970) | 63/264 | NT | 100% | coding (520/831 nt) | glpG | rhomboid intramembrane serine protease |
| ? | NC_000913 | = 3653230 | NA (NA) | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region | |||||
CCATTCGATCCAACACTGAAATTTGAGTTCTGGCGTTACTTCACCCACGCGTTAATGCACTTCTCGCTGATGCATATCCTCTTTAACCTGCTCTGGTGGTGGTATCTCGGCGGTGCGGTGGAAAAACGCCTCGGTAGCGGTAAGCTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3561077‑3560930‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGTTTCTTCGCCATTTAAGGCGTTATCCCCAGTTTT > NC_000913/3652036‑3652182 CCATTCGATCCAACACTGAAATTTGAGTTCTGGCGTTACTTCACCCACGCGTTAATGCACTTCTCGCTGATGCATATCCTCTTTAACCTGCTCTGGTGGTGGTATCTCGGCGGTGCGGTGGAAAAACGCCTCGGTAGCGGTAAGCTAAG < 3:235871/149‑1CCATTCGATCCAACACTGAAATTTGAGTTCTGGCGTTACTTCACCCACGCGTTAATGCACTTCTCGCTGATGCATATCCTCTTTAACCTGCTCTGGTGGTGGTATCTCGGCGGTGCGGTGGAAAAACGCCTCGGTAGCGGTAAGCTAAG < 5:1613/149‑1 CATTCGATCCAACACTGAAATTTGAGTTCTGGCGTTACTTCACCCACGCGTTAATGCACTTCTCGCTGATGCATATCCTCTTTAACCTGCTCTGGTGGTGGTATCTCGGCGGTGCGGTGGAAAAACGCCTCGGTAGCGGTAAGCTAAG > 5:117876/1‑148 CGATCCAACACTGAAATTTGAGTTCTGGCGTTACTTCACCCACGCGTTAATGCACTTCTCGCTGATGCATATCCTCTTTAACCTGCTCTGGTGGTGGTATCTCGGCGGTGCGGTGGAAAAACGCCTCGGTAGCGGTAAGCTAAGGAAG < 3:289495/148‑1 CGATCCAACACTGAAATTTGAGTTCTGGCGTTACTTCACCCACGCGTTAATGCACTTCTCGCTGATGCATATCCTCTTTAACCTGCTCTGGTGGTGGTATCTCGGCGGTGCGGTGGAAAAACGCCTCGGTAGCGGTAAGCTAAGGAAG < 6:328361/148‑1 GATCCAACACTGAAATTTGAGTTCTGGCGTTACTTCACCCACGCGTTAATGCACTTCTCGCTGATGCATATCCTCTTTAACCTGCTCTGGTGGTGGTATCTCGGCGGTGCGGTGGAAAAACGCCTCGGTAGCGGTAAGCTAAGGAAGGT > 6:317231/1‑149 TCCAACACTGAAATTTGAGTTCTGGCGTTACTTCACCCACGCGTTAATGCACTTCTCGCTGATGCATATCCTCTTTAACCTGCTCTGGTGGTGGTATCTCGGCGGTGCGGTGGAAAAACGCCTCGGTAGCGGTAAGCTAAGGAAGGTGC < 2:182780/149‑1 CAACACTGAAATTTGAGTTCTGGCGTTACTACACCCACGCGTTAATGCACTTCTCGCTGATGCATATCCTCTTTAACCTGCTCTGGTGGTGGAATCTCGGCGGGCCGGTGGAAAAACGCCTCCGTAGCGGTAAGCTAAGGAAGGTGCG > 5:92741/1‑148 AACACTGAAATTTGAGTTCTGGCGTTACTTCACCCACGCGTTAATGCACTTCTCGCTGATGCATATCCTCTTTAACCTGCTCTGGTGGTGGTATCTCGGCGGTGCGGTGGAAAAACGCCTCGGTAGCGTTAAGCTAAGGAAGGTGCGAA < 1:32947/149‑1 AAATTTGAGTTCTGGCGTTACTTCACCCACGCGTTAATGCACTTCTCGCTGATGCATATCCTCTTTAACCTGCTCTGGTGGTGGTATCTCGGCGGTGCGGTGGAAAAACGCCTCGGTAGCGGTAAGCTAAGGAAGGTGCGAATAAGCGG < 3:249015/149‑1 AAATTTGAGTTCTGGCGTTACTTCACCCACGCGTTAATGCACTTCTCGCTGATGCATATCCTCTTTAACCTGCTCTGGTGGTGGTATCTCGGCGGTGCGGTGGAAAAACGCCTCGGTAGCGGTAAGCTAAGGAAGGTGCGAATAAGC < 3:115224/147‑1 TTTGAGTTCTGGCGTTACTTCACCCACGCGTTAATGCACTTCTCGCTGATGCATATCATCTTTAACCTGCTCTGGTGGTGGTATCTCGGCGGTGAGGTGGAAAAACGCCACGGTAGCGGTAAGCTAAGGAAGGTGCGAATAAGCGGGc > 8:328375/1‑147 TGAGTTCTGGCGTTACTTCACCCACGCGTTAATGCACTTCTCGCTGATGCATATCCTCTTTAACCTGCTCTGGTGGTGGTATCTCGGCGGTGCGGTGGAAAAACGCCTCGGTAGCGGTAAGCTAAGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAA > 2:209187/1‑149 GAGTTCTGGCGTTACTTCACCCACGCGTTAATGCACTTCTCGCTGATGCATATCCTCTTTAACCTGCTCTGGTGGTGGTATCTCGGCGGTGCGGTGGAAAAACGCCTCGGTAGCGGTAAGCTAAGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAA < 5:317231/148‑1 TTCTGGCGTTACTTCACCCACGCGTTAATGCACTTCTCGCTGATGCATATCCTCTTTAACCTGCTCTGGTGGTGGTATCTCGGCGGTGCGGTGGAAAAACGCCTCGGTAGCGGTAAGCTAAGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCT > 2:206439/1‑149 TTCTGGCGATACTTCACCCACGCGTTAATGCACTTCTCGCTGATGCATATCCTCTTTAACCTGCTCTGGTGGTGGTATCTCGGCGGTGCGGTGGAAAAACGCCTCGGTAGCGGTAAGCTAAGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCT > 2:212082/1‑149 GCGTTACTTCACCCACGCGTTAATGCACTTCTCGCTGATGCATATCCTCTTTAACCTGCTCTGGTGGTGGTATCTCGGCGGTGCGGTGGAAAAACGCCTCGGTAGCGGTAAGCTAAGGAAGGTGC < 2:185963/125‑1 GCGTTACTTCACCCACGCGTTAATGCACTTCTCGCTGATGCATATCCTCTTTAACCTGCTCTGGTGGTGGTATCTCGGCGGTGCGGTGGAAAAACGCCTCGGTAGCGGTAAGCTAAGGAAGGTGC > 1:185963/1‑125 CACCCACGCGTTAATGCACTTCTCGCTGATGCATATCCTCTTTAACCTGCTCTGGTGGTGGTATCTCGGCGGTGCGGTGGAAAAACGCCTCGGTAGCGGTAAGCTAAGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGG > 3:79543/1‑141 CACCCACGCGTTAATGCACTTCTCGCTGATGCATATCCTCTTTAACCTGCTCTGGTGGTGGTATCTCGGCGGTGCGGTGGAAAAACGCCTCGGTAGCGGTAAGCTAAGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGG < 4:79543/141‑1 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TTAATGCACTTCTCGCTGATGCATATCCTCTTTAACCTGCTCTGGTGGTGGTATCTCGGCGGTGCGGTGGAAAAACGCCTCGGTAGCGGTAAGCTAAGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTT < 1:79989/126‑1 TTAATGCACTTCTCGCTGATGCATATCCTCTTTAACCTGCTCTGGTGGTGGTATCTCGGCGGTGCGGTGGAAAAACGCCTCGGTAGCGGTAAGCTAAGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTT > 2:79989/1‑126 AATGCACTTCTCGCTGATGCATATCCTCTTTAACCTGCTCTGGTGGTGGTATCTCGGCGGTGAGGTGGAAAAACGCCTCGGTAGCGGTAAGCTAAGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTT > 6:159013/1‑149 ATGCACTTCTCGCTGATGCATATCCTCTTTAACCTGCTCTGGTGGTGGTATCTCGGCGGTGCGGAGGAAAAACGCCTCGGTAGCGGTAAGCTAAGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTC > 4:161346/1‑149 GCACTTCTCGCTGATGCATATCCTCTTTATCCTGCTCTGGTGGTGGTATCTCGGCGGTGCGGTGGAAAAACGCCTCGGTAGCGGTAAGCTAAGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCT < 4:73149/123‑1 GCACTTCTCGCTGATGCATATCCTCTTTATCCTGCTCTGGTGGTGGTATCTCGGCGGTGCGGTGGAAAAACGCCTCGGTAGCGGTAAGCTAAGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCT > 3:73149/1‑123 GCACTTCTCGCTGATGCATATCCTCTTTAACCTGCTCTGGTGGTGGTATCTCGGCGGTGCGGTGGAAAAACGCCTCGGTAGCGGTAAGCTAAGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCT < 2:73227/128‑1 GCACTTCTCGCTGATGCATATCCTCTTTAACCTGCTCTGGTGGTGGTATCTCGGCGGTGCGGTGGAAAAACGCCTCGGTAGCGGTAAGCTAAGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCT > 1:73227/1‑128 GCACTTCTCGCTGATACATATCCTCTTTAACCTGCTCTGGTGGTGGTATCTCGGCGGTGCGGTGGAAAAACGCCTCGGTAGCGGTAAGCTAAGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCTTTTCATTTCTT > 1:139291/1‑149 ACTTCTCGCTGATGCATATCCTCTTTAACCTGCTCTGGTGGTGGTATCTCGGCGGTGCGGTGGAAAAACGCCTCGGTAGCGGTAAGCTAAGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCA > 8:375325/1‑149 ACTTCTCGCTGATGCATATCCTCTTTAACCTGCTCTGGTGGTGGTATCTCGGCGGTGCGGTGGAAAAACGCCTCGGTAGCGGTAAGCTAAGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCA > 5:354515/1‑149 ACTTCTCGCTGATGCATATCCTCTTTAACCTGCTCTGGTGGTGGTATCTCGGCGGTGCGGTGGAAAAACGCCTCGGTAGCGGTAAGCTAAGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCA < 1:209187/149‑1 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AAACGCCTCGGTAGCGCTAAGCTAAGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCATCTCGGCTGACTCACTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATT > 5:167136/1‑131 ACGCCTCGGTAGCGGTAAGCTAAGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGTTTCTTCGCCATT < 5:129156/149‑1 CGCCTCGGTAGCGGTAAGCTAAGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGTTTCTTCGCCATTT < 4:182021/149‑1 GTAGCGGTAAGCTAAGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGTTTCTTCGCCATTTAAGGCGT < 8:241021/149‑1 GTAGCGGTAAGCTAAGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGTTTCTTCGCCATTTAAGGCGT > 4:346137/1‑149 TAGCGGTAAGCTAAGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGTTTCTTCGCCATTTAAGGCGTT < 5:22878/149‑1 GCGGTAAGCTAAGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGTTTCTTCGCCATTTAAGGCGTTA < 5:279306/148‑1 GTAAGCTAAGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGTTTCTTCGCCATTTAAGGCGTTATCCC > 2:184231/1‑149 TAAGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGTTTCTTCGCCATTTAAGGCGTTATCCCCAGTTT > 5:285236/1‑149 TAAGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGTTTCTTCGCCATTTAAGGCGTTATCCCCAGTTT > 1:38599/1‑149 AAGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTAATTTCATTTCTTCATGTTTGAGACGATTTTTTCTCCCGTAAATGACTTGAATCAGCCTATTTAGACCGTTTCTTCGCCATTTAAGGCGTTATCCCCAGTTTT > 7:70728/1‑149 AGGAAGGTGCTAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGTTTCTTCGCCATTTAAGGCGTTATCCCCAGTTTT < 7:314365/148‑1 CCATTCGATCCAACACTGAAATTTGAGTTCTGGCGTTACTTCACCCACGCGTTAATGCACTTCTCGCTGATGCATATCCTCTTTAACCTGCTCTGGTGGTGGTATCTCGGCGGTGCGGTGGAAAAACGCCTCGGTAGCGGTAAGCTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3561077‑3560930‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGTTTCTTCGCCATTTAAGGCGTTATCCCCAGTTTT > NC_000913/3652036‑3652182 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |