| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 4058734 | 108 (1.310) | 3 (0.040) | 3/248 | NT | 2.8% | coding (328/1824 nt) | typA | GTP‑binding protein |
| ? | NC_000913 | = 4058751 | 106 (1.370) | coding (345/1824 nt) | typA | GTP‑binding protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
CCGCTATCAAATGGAATGATTACCGTATCAACATCGTTGATACCCCGGGGCACGCCGACTTCGGTGGTGAAGTTGAACGTGTAATGTCCATGGTAGACTCAGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGA > NC_000913/4058588‑4058882 | tCAAATGGAATGATTACCGTATCAACATCGTTGATACCCCGGGGCACGCCGACTTCGGTGGTGAAGTTGAACGTGTAATGTCCATGGTAGACTCAGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGt < 7:255872/148‑1 (MQ=255) aaaTGGAATGATTACCGTATCAACATCGTTGATACCCCGGGGCACGCCGACTTCGGTGGTGAAGTTGAACGTGTAATGTCCATGGTAGACTCAGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCTCTTCGTaa < 5:293427/148‑1 (MQ=255) aaaTGGAATGATTACCGTATCAACATCGTTGATACCCCGGGGCACGCCGACTTCGGTGGTGAAGTTGAACGTGTAATGTCCATGGTAGACTCAGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTaa < 4:21532/148‑1 (MQ=255) aaaTGGAATGATTACCGTATCAACATCGTTGATACCCCGGGGCACGCCGACTTCGGTGGTGAAGTTGAACGTGTAATGTCCATGGTAGACTCAGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAAc > 1:247556/1‑149 (MQ=255) aaaTGGAATGATTACCGTATCAACATCGTTGATACCCCGGGGCACGCCGACTTCGGTGGTGAAGTTGAACGTGTAATGTCCATGGTAGACTCAGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAAc > 7:26338/1‑149 (MQ=255) aaaTGGAATGATTACCGTATCAACATCGTTGATACCCCGGGGCACGCCGACTTCGGTGGTGAAGTTGAACGTGTAATGTCCATGGTAGACTCAGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAAc > 8:17928/1‑149 (MQ=255) taaTGTTTACCGTATCAACTTCGTTGATACCCCGGGGCACGCCGACTTCGGTGGTGAAGTTGAAGGGGTAATGTCCATGGTAGACTCAGTGCTGCTGGTGGTTGTCGCATTTGAAGGCCCGATGCCGCAAAGGAGCTTCGTAACCaaaa < 6:235134/148‑1 (MQ=255) gAATGATTACCGTATCAACATCGTTGATACCCCGGGGCACGCCGACTTCGGTGGTGAAGTTGAACGTGTAATGTCCATGGTAGACTCAGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCaaaa < 2:229320/149‑1 (MQ=255) gAATGATTACCGTATCAACATCGTTGATACCCCGGGGCACGCCGACTTCGGTGGTGAAGTTGAACGTGTAATGTCCATGGTAGACTCAGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCaaa > 3:19936/1‑148 (MQ=255) aaTGATTACCGTATCAACATCGTTGATACCCCGGGGCACGCCGACTTCGGTGGTGAAGTTGAACGTGTAATGTCCATGGTAGACTCAGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAATGCGCTTCGTAACCaaaa > 8:285164/1‑148 (MQ=255) aTGATTACCGTATCAACATCGTTGATACCCCGGGGCACGCCGACTTCGGTGGTGAATTTGAACGTGTAATGTCCATGGTAGACTCAGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCaaaaaa < 7:368652/149‑1 (MQ=255) tGATTACCGTATCAACATCGTTGATACCCCGGGGCACGCCGACTTCGGTGGTGAAGTTGAACGTGTAATGTCCATGGTAGACTCAGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAg < 6:103114‑M2/149‑2 (MQ=255) aCCGTATCAACTTCGTTGATACCCCGGGGCACGCCGACTTCGGTGGTGAAGTTGAACGTGTAATGTCCATGGTAGACTCAGTGCTGCTGGTGGTTGAGGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAgcgtt > 3:182519‑M2/1‑143 (MQ=255) ccGTATCAACATCGTTGATACCCCGGGGCACGCCGACTTCGGTGGTGAAGTTGAACGTGTAATGTCCATGGTAGACTCAGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAgcgtttg < 7:162859‑M2/149‑8 (MQ=255) ccGTATCAACATCGTTGATACCCCGGGGCACGCCGACTTCGGTGGTGAAGTTGAACGTGTAATGTCCATGGTAGACTCAGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAgcgttt > 3:327049‑M2/1‑142 (MQ=255) cGTATCAACATCGTTGATACCCCGGGGCACGCCGACTTCGCTGGTGAAGTTGAACGTGTAATGTCCATGGTAGACTCAGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAgcgtttgc < 4:173941‑M2/149‑9 (MQ=255) gTATCAACATCGTTGATACCCCGGGGCACGCCGACTTCGGTGGTGAAGTTGAACGTGTAATGTCCATGGTAGACTCAGTGCTGCTGGTGGGTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCttttttggttacgaagcgcggttgcg < 5:228568‑M1/149‑27 (MQ=255) tCAACATCGTTGATACCCCGGGGCACGCCGACTTCGGTGGTGAAGTTGAACGTGTAATGTCCATGGTAGACTCAGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTa < 2:48897/148‑1 (MQ=255) tCAACATCGTTGATACCCCGGGGCACGCCGACTTCGGTGGTGAAGTTGAACGTGTAATGTCCATGGTAGACTCAGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTa < 8:26338/148‑1 (MQ=255) 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ccGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAgcgtttgcggcatcgggccgtcaaatgcgtcaaccaccagcagcactgagtctaccatggacattacacgttcaacttcaccaccgaagtcggcgtgccccggg > 8:375664‑M2/1‑27 (MQ=255) ccGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACcgacga < 4:277451/149‑1 (MQ=255) cGCAACCGCGCTTCGTAACCAAAAAAgcgtttgcggcatcgggccgtcaaatgcgtcacccaccagcagcactgagtctaccatggacattacacgttcaacttcaccaccgaagtcggcgtgccccggggtatcaacgatgttgatac < 5:228568‑M2/149‑124 (MQ=255) cGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGag > 8:364444/1‑149 (MQ=255) gCAAACGCttttttggttacgaagcgcgtttgcggcatcgggccgtcaaatgcgtcaaccaccagcagcactgagtctaccatggacattacacgttcaacttcaccagcgaagtcggcgtgccccggggtatcaacgatgttgatacg < 4:173941‑M1/149‑142 (MQ=255) gCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGagc < 6:244546/149‑1 (MQ=255) cAAACGCttttttggttacgaagcgcgtttgcggcatcgggccgtcaaatgcgtcaaccaccagcagcactgagtctaccatggacattacacgttcaacttcaccaccgaagtcggcgtgccccggggtatcaacgatgttgatacgg < 7:162859‑M1/149‑143 (MQ=255) aaaCGCttttttggttacgaagcgcgtttgcggcatcgggccgtcaaatgcgtcaaccaccagcagcactgagtctaccatggacattacacgttcaacttcaccaccgaagtcggcgtgccccggggtatcaacgatgttgatacgg > 3:327049‑M1/1‑6 (MQ=255) aaaCGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGagcag < 6:25568/149‑1 (MQ=255) aaCGCttttttggttacgaagcgcgtttgcggcatcgggccgtcaaatgcctcaaccaccagcagcactgagtctaccatggacattacacgttcaacttcaccaccgaagtcggcgtgccccggggtatcaacgaagttgatacggt > 3:182519‑M1/1‑5 (MQ=255) gCttttttggttacgaagcgcgtttgcggcatcgggccgtcaaatgcgtcaaccaccagcagcactgagtctaccatggacattacacgttcaacttcaccaccgaagtcggcgtgccccggggtatcaacgatgttgatacggtaat > 1:42315‑M1/1‑2 (MQ=255) cttttttggttacgaagcgcgtttgcggcatcgggccgtcaaatgcgtcaaccaccagcagcactgagtctaccatggacattacacgttcaacttcaccaccgaagtcggcgtgccccggggtatcaacgatgttgatacggtaatca < 6:103114‑M1/149‑149 (MQ=255) cgcTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGa < 5:198981/149‑1 (MQ=255) cgcTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCGGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGa < 5:19233/149‑1 (MQ=255) | CCGCTATCAAATGGAATGATTACCGTATCAACATCGTTGATACCCCGGGGCACGCCGACTTCGGTGGTGAAGTTGAACGTGTAATGTCCATGGTAGACTCAGTGCTGCTGGTGGTTGACGCATTTGACGGCCCGATGCCGCAAACGCGCTTCGTAACCAAAAAAGCGTTTGCTTACGGCCTGAAGCCGATTGTTGTTATCAACAAAGTTGACCGCCCTGGCGCGCGTCCTGATTGGGTTGTGGATCAGGTATTCGATCTGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGA > NC_000913/4058588‑4058882 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |